Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491660
• Subject: XM_006511008.2
• Aligned Length: 1401
• Identities: 1186
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGGACCATCCTAGTAGGGAAAAGGATGAAAGACAACGGACAACTAAACCCATGGCACAAAGGAGTGCACACTG  74
            |||||||||.|||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct    1  ATGGACCATTCTAATAGGGAAAAGGATGATAGACAACGGACAACTAAAACCATGGCACAAAGGAATACACACTG  74

Query   75  CTCTCGACCATCTGGCTCCTCATCGTCCTCTGGGGTTCTTATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA  148
            .||..|||||||||||.|.|||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCGAGACCATCTGGCACTTCAACATCCTCTGGGGTTCTCATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA  148

Query  149  TAGGATGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCAATCAAACTG  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  149  TAGGGTGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCCATTAAACTG  222

Query  223  GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAGCTTCATTTAGAGTACAGATTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAACTTCATTTAGAGTACAGGTTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA  296

Query  297  AGGTCTCCCACAGGTGTATTACTTTGGACCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA  370
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  AGGCCTCCCACAGGTTTATTACTTTGGACCATGTGGGAAGTACAATGCCATGGTGCTGGAACTCCTTGGCCCTA  370

Query  371  GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGCTG  444
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  371  GCTTGGAAGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACGTTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGTTG  444

Query  445  CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG  518
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||
Sbjct  445  CTTTCTCGAATGGAGTATGTACACTCAAAGAATCTTATTTACCGAGATGTCAAACCAGAGAACTTCTTGATTGG  518

Query  519  TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG  592
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||.||.|
Sbjct  519  CCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTAATACACATTATAGATTTTGGACTGGCCAAGGAATATGTTGATCCTG  592

Query  593  AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG  666
            ||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  593  AAACCAAAAAACACATACCTTACAGAGAGCACAAAAGTTTGACTGGAACTGCGAGATACATGTCTATCAACACA  666

Query  667  CATCTTGGCAAAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAAGCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGG  740
            |||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  667  CATCTAGGCAAAGAGCAAAGCCGGCGAGATGATTTGGAAGCCTTAGGCCATATGTTCATGTACTTCCTCCGAGG  740

Query  741  CAGCCTCCCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA  814
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  741  CAGCCTACCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGATACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATCGGTGATACCAAAAGGA  814

Query  815  ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG  888
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct  815  ATACTCCCATCGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGATTA  888

Query  889  GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||..|||||||||.||
Sbjct  889  GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGATCTGTTTGAACGGAAAGGCTATAC  962

Query  963  CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCACGTAGATTCTGGTG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGAAGGCCTATTCCTACTCCAGTAGGATCAGTTCATGTAGATTCTGGTG  1036

Query 1037  CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACATAGGGATCGGCCATCACAACAGCAGCCTCTTCGAAAT------  1104
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||      
Sbjct 1037  CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACACAGGGATCGGCCATCACAACAACAGCCTCTTAGAAATCAGACT  1110

Query 1105  --------------------------------------------------------------------------  1104
                                                                                      
Sbjct 1111  ACATCATCAGAGCGCCGAGGAGAGTGGGAAATCCAGCCCAGCCGGCAGACCAATACCTCATACCTGACGTCTCA  1184

Query 1105  -------------------------------CAGGTGGTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTTGATGATC  1147
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1185  CTTGGCCGCAGACCGCCATGGGGGTTCAGTACAGGTGGTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTCGATGACC  1258

Query 1148  CCACGGGAGCCCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCATGCCGAGGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAA-------  1214
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||       
Sbjct 1259  CCACTGGAGCTCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCATGCCGAAGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAACTGCCTG  1332

Query 1215  -----------------GTGCTGCTGTTTCTTTAAGAGGAAAAGGAAGAAGACTGCTCAGCGCCACAAG  1266
                             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1333  AAAATGCTCAACCTGTGGTGCTGCTGTTTCTTTAAGAGGAAAAGGAAGAAGACAGCCCAGCGACACAAG  1401