Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491671
- Subject:
- NM_001190837.1
- Aligned Length:
- 3813
- Identities:
- 3410
- Gaps:
- 396
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCACAGAGCAAGAGGCACGTGTACAGCCGGACGCCCAGCGGCAGCAGGATGAGTGCGGAGGCAAGCGCCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCCTCTGCGGGTGGGCTCCCGTGTAGAGGTGATTGGAAAAGGCCACCGAGGCACTGTGGCCTATGTTGGAGCCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CACTGTTTGCCACTGGCAAATGGGTAGGCGTGATTCTGGATGAAGCAAAGGGCAAAAATGATGGAACTGTTCAA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGCAGGAAGTACTTCACTTGTGATGAAGGGCATGGCATCTTTGTGCGCCAGTCCCAGATCCAGGTATTTGAAGA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGGAGCAGATACTACTTCCCCAGAGACACCTGATTCTTCTGCTTCAAAAGTCCTCAAAAGAGAGGGAACTGATA 370
Query 1 --------ATGATGAG---ACAGGCACCGACAGCCCGAAAGACCACAACTCGGCGACCCAAGCCCACGCGCCCA 63
|.||..|| ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAACTGCAAAGACTAGCAAACTGGCACCGACAGCCCGAAAGACCACAACTCGGCGACCCAAGCCCACGCGCCCA 444
Query 64 GCCAGTACTGGGGTGGCTGGGGCCAGTAGCTCCCTGGGCCCCTCTGGCTCAGCGTCAGCAGGTGAGCTGAGCAG 137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCAGTACTGGGGTGGCTGGGGCCAGTAGCTCCCTGGGCCCCTCTGGCTCAGCGTCAGCAGGTGAGCTGAGCAG 518
Query 138 CAGTGAGCCCAGCACCCCGGCTCAGACTCCGCTGGCAGCACCCATCATCCCCACGCCGGTCCTCACCTCTCCTG 211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGTGAGCCCAGCACCCCGGCTCAGACTCCGCTGGCAGCACCCATCATCCCCACGCCGGTCCTCACCTCTCCTG 592
Query 212 GAGCAGTCCCCCCGCTTCCTTCCCCATCCAAGGAGGAGGAGGGACTAAGGGCTCAGGTGCGGGACCTGGAGGAG 285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGCAGTCCCCCCGCTTCCTTCCCCATCCAAGGAGGAGGAGGGACTAAGGGCTCAGGTGCGGGACCTGGAGGAG 666
Query 286 AAACTAGAGACCCTGAGACTGAAACGGGCAGAAGACAAAGCAAAGCTAAAAGAGCTGGAGAAACACAAAATCCA 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAACTAGAGACCCTGAGACTGAAACGGGCAGAAGACAAAGCAAAGCTAAAAGAGCTGGAGAAACACAAAATCCA 740
Query 360 GCTGGAGCAGGTGCAGGAATGGAAGAGCAAAATGCAGGAGCAGCAGGCCGACCTGCAGCGGCGCCTCAAGGAGG 433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCTGGAGCAGGTGCAGGAATGGAAGAGCAAAATGCAGGAGCAGCAGGCCGACCTGCAGCGGCGCCTCAAGGAGG 814
Query 434 CGAGAAAGGAAGCCAAGGAGGCGCTGGAGGCAAAGGAACGCTATATGGAGGAGATGGCTGATACTGCTGATGCC 507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGAGAAAGGAAGCCAAGGAGGCGCTGGAGGCAAAGGAACGCTATATGGAGGAGATGGCTGATACTGCTGATGCC 888
Query 508 ATTGAGATGGCCACTTTGGACAAGGAGATGGCTGAAGAGCGGGCTGAGTCCCTGCAGCAGGAGGTGGAGGCACT 581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATTGAGATGGCCACTTTGGACAAGGAGATGGCTGAAGAGCGGGCTGAGTCCCTGCAGCAGGAGGTGGAGGCACT 962
Query 582 GAAGGAGCGGGTGGACGAGCTCACTACTGACTTAGAGATCCTCAAGGCTGAGATTGAAGAGAAGGGCTCAGATG 655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAAGGAGCGGGTGGACGAGCTCACTACTGACTTAGAGATCCTCAAGGCTGAGATTGAAGAGAAGGGCTCAGATG 1036
Query 656 GCGCTGCATCCAGTTATCAGCTCAAGCAGCTTGAGGAGCAGAATGCCCGCCTGAAGGATGCCCTGGTGAGGATG 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCGCTGCATCCAGTTATCAGCTCAAGCAGCTTGAGGAGCAGAATGCCCGCCTGAAGGATGCCCTGGTGAGGATG 1110
Query 730 CGGGATCTTTCTTCCTCAGAGAAGCAGGAGCATGTGAAGCTCCAGAAGCTCATGGAAAAGAAGAACCAAGAGCT 803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGGGATCTTTCTTCCTCAGAGAAGCAGGAGCATGTGAAGCTCCAGAAGCTCATGGAAAAGAAGAACCAAGAGCT 1184
Query 804 GGAAGTTGTGAGGCAACAGCGGGAGCGTCTGCAGGAGGAGCTAAGCCAGGCAGAGAGCACCATTGATGAGCTCA 877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGAAGTTGTGAGGCAACAGCGGGAGCGTCTGCAGGAGGAGCTAAGCCAGGCAGAGAGCACCATTGATGAGCTCA 1258
Query 878 AGGAGCAGGTGGATGCTGCTCTGGGTGCTGAGGAGATGGTGGAGATGCTGACAGATCGGAACCTGAATCTGGAA 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGGAGCAGGTGGATGCTGCTCTGGGTGCTGAGGAGATGGTGGAGATGCTGACAGATCGGAACCTGAATCTGGAA 1332
Query 952 GAGAAAGTGCGCGAGTTGAGGGAGACTGTGGGAGACTTGGAAGCGATGAATGAGATGAACGATGAGCTGCAGGA 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAGAAAGTGCGCGAGTTGAGGGAGACTGTGGGAGACTTGGAAGCGATGAATGAGATGAACGATGAGCTGCAGGA 1406
Query 1026 GAATGCACGTGAGACAGAACTGGAGCTGCGGGAGCAGCTGGACATGGCAGGCGCGCGGGTTCGTGAGGCCCAGA 1099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAATGCACGTGAGACAGAACTGGAGCTGCGGGAGCAGCTGGACATGGCAGGCGCGCGGGTTCGTGAGGCCCAGA 1480
Query 1100 AGCGTGTGGAGGCAGCCCAGGAGACGGTTGCAGACTACCAGCAGACCATCAAGAAGTACCGCCAGCTGACCGCC 1173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCGTGTGGAGGCAGCCCAGGAGACGGTTGCAGACTACCAGCAGACCATCAAGAAGTACCGCCAGCTGACCGCC 1554
Query 1174 AATCTACAGGATGTGAATCGGGAACTGACAAACCAGCAGGAAGCATCTGTGGAGAGGCAACAGCAGCCACCTCC 1247
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CATCTACAGGATGTGAATCGGGAACTGACAAACCAGCAGGAAGCATCTGTGGAGAGGCAACAGCAGCCACCTCC 1628
Query 1248 AGAGACCTTTGACTTCAAAATCAAGTTTGCTGAGACTAAGGCCCATGCCAAGGCAATTGAGATGGAATTGAGGC 1321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGAGACCTTTGACTTCAAAATCAAGTTTGCTGAGACTAAGGCCCATGCCAAGGCAATTGAGATGGAATTGAGGC 1702
Query 1322 AGATGGAGGTGGCCCAGGCCAATCGACACATGTCCCTGCTGACAGCCTTCATGCCTGACAGCTTCCTTCGGCCA 1395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGATGGAGGTGGCCCAGGCCAATCGACACATGTCCCTGCTGACAGCCTTCATGCCTGACAGCTTCCTTCGGCCA 1776
Query 1396 GGTGGGGACCATGACTGCGTTCTGGTGCTGTTGCTCATGCCTCGTCTCATTTGCAGGGCAGAGCTGATCCGGAA 1469
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGTGGGGACCATGACTGCGTTCTGGTGCTGTTGCTCATGCCTCGTCTCATTTGCAAGGCAGAGCTGATCCGGAA 1850
Query 1470 GCAGGCCCAGGAGAAGTTTGAACTAAGTGAGAACTGTTCAGAGCGGCCTGGGCTGCGAGGAGCTGCTGGGGAGC 1543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCAGGCCCAGGAGAAGTTTGAACTAAGTGAGAACTGTTCAGAGCGGCCTGGGCTGCGAGGAGCTGCTGGGGAGC 1924
Query 1544 AACTCAGCTTTGCTGCTGGACTGGTGTACTCGCTGAGCCTGCTGCAGGCCACGCTACACCGCTATGAGCATGCC 1617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AACTCAGCTTTGCTGCTGGACTGGTGTACTCGCTGAGCCTGCTGCAGGCCACGCTACACCGCTATGAGCATGCC 1998
Query 1618 CTCTCTCAGTGCAGTGTGGATGTGTATAAGAAAGTGGGCAGCCTGTACCCTGAGATGAGTGCCCATGAGCGCTC 1691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTCTCTCAGTGCAGTGTGGATGTGTATAAGAAAGTGGGCAGCCTGTACCCTGAGATGAGTGCCCATGAGCGCTC 2072
Query 1692 CTTGGATTTCCTCATTGAACTGCTGCACAAGGATCAGCTGGATGAGACTGTCAATGTGGAGCCTCTCACCAAGG 1765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CTTGGATTTCCTCATTGAACTGCTGCACAAGGATCAGCTGGATGAGACTGTCAATGTGGAGCCTCTCACCAAGG 2146
Query 1766 CCATCAAGTACTATCAGCATCTGTACAGCATCCACCTTGCCGAACAGCCTGAGGACTGTACTATGCAGCTGGCT 1839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCATCAAGTACTATCAGCATCTGTACAGCATCCACCTTGCCGAACAGCCTGAGGACTGTACTATGCAGCTGGCT 2220
Query 1840 GACCACATTAAGTTCACGCAGAGTGCTCTGGACTGCATGAGTGTGGAGGTAGGACGGCTGCGTGCCTTCTTGCA 1913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GACCACATTAAGTTCACGCAGAGTGCTCTGGACTGCATGAGTGTGGAGGTAGGACGGCTGCGTGCCTTCTTGCA 2294
Query 1914 GGGTGGGCAGGAGGCTACAGATATTGCCCTCCTGCTCCGGGATCTGGAAACTTCATGCAGTGACATCCGCCAGT 1987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GGGTGGGCAGGAGGCTACAGATATTGCCCTCCTGCTCCGGGATCTGGAAACTTCATGCAGTGACATCCGCCAGT 2368
Query 1988 TCTGCAAGAAGATCCGAAGGCGAATGCCAGGGACAGATGCTCCTGGGATCCCAGCTGCACTGGCCTTTGGACCA 2061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TCTGCAAGAAGATCCGAAGGCGAATGCCAGGGACAGATGCTCCTGGGATCCCAGCTGCACTGGCCTTTGGACCA 2442
Query 2062 CAGGTATCTGACACGCTCCTAGACTGCAGGAAACACTTGACGTGGGTCGTGGCTGTGCTGCAGGAGGTGGCAGC 2135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CAGGTATCTGACACGCTCCTAGACTGCAGGAAACACTTGACGTGGGTCGTGGCTGTGCTGCAGGAGGTGGCAGC 2516
Query 2136 TGCTGCTGCCCAGCTCATTGCCCCACTGGCAGAGAATGAGGGGCTACTTGTGGCTGCTCTGGAGGAACTGGCTT 2209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TGCTGCTGCCCAGCTCATTGCCCCACTGGCAGAGAATGAGGGGCTACTTGTGGCTGCTCTGGAGGAACTGGCTT 2590
Query 2210 TCAAAGCAAGCGAGCAGATCTATGGGACCCCCTCCAGCAGCCCCTATGAGTGTCTGCGCCAGTCATGCAACATC 2283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TCAAAGCAAGCGAGCAGATCTATGGGACCCCCTCCAGCAGCCCCTATGAGTGTCTGCGCCAGTCATGCAACATC 2664
Query 2284 CTCATCAGTACCATGAACAAGCTGGCCACAGCCATGCAGGAGGGGGAGTATGATGCAGAGCGGCCCCCCAGCAA 2357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CTCATCAGTACCATGAACAAGCTGGCCACAGCCATGCAGGAGGGGGAGTATGATGCAGAGCGGCCCCCCAGCAA 2738
Query 2358 GCCTCCACCGGTTGAACTGCGGGCTGCTGCCCTTCGTGCAGAGATCACAGATGCTGAAGGCCTGGGTTTGAAGC 2431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GCCTCCACCGGTTGAACTGCGGGCTGCTGCCCTTCGTGCAGAGATCACAGATGCTGAAGGCCTGGGTTTGAAGC 2812
Query 2432 TCGAAGATCGAGAGACAGTTATTAAGGAGTTGAAGAAGTCACTCAAGATTAAGGGAGAGGAGCTAAGTGAGGCC 2505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TCGAAGATCGAGAGACAGTTATTAAGGAGTTGAAGAAGTCACTCAAGATTAAGGGAGAGGAGCTAAGTGAGGCC 2886
Query 2506 AATGTGCGGCTGAGCCTCCTGGAGAAGAAGTTGGACAGTGCTGCCAAGGATGCAGATGAGCGCATCGAGAAAGT 2579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AATGTGCGGCTGAGCCTCCTGGAGAAGAAGTTGGACAGTGCTGCCAAGGATGCAGATGAGCGCATCGAGAAAGT 2960
Query 2580 CCAGACTCGGCTGGAGGAGACCCAGGCACTGCTGCGAAAGAAGGAGAAAGAGTTTGAGGAGACAATGGATGCAC 2653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CCAGACTCGGCTGGAGGAGACCCAGGCACTGCTGCGAAAGAAGGAGAAAGAGTTTGAGGAGACAATGGATGCAC 3034
Query 2654 TCCAGGCTGACATCGACCAGCTGGAGGCAGAGAAGGCAGAACTAAAGCAGCGTCTGAACAGCCAGTCCAAACGC 2727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TCCAGGCTGACATCGACCAGCTGGAGGCAGAGAAGGCAGAACTAAAGCAGCGTCTGAACAGCCAGTCCAAACGC 3108
Query 2728 ACGATTGAGGGACTCCGGGGCCCTCCTCCTTCAGGCATTGCTACTCTGGTCTCTGGCATTGCTGGT-------- 2793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 ACGATTGAGGGACTCCGGGGCCCTCCTCCTTCAGGCATTGCTACTCTGGTCTCTGGCATTGCTGGTGAAGAACA 3182
Query 2794 -------GGAGCCATCCCTGGGCAGGCTCCAGGGTCTGTGCCAGGCCCAGGGCTGGTGAAGGACTCACCACTGC 2860
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 GCAGCGAGGAGCCATCCCTGGGCAGGCTCCAGGGTCTGTGCCAGGCCCAGGGCTGGTGAAGGACTCACCACTGC 3256
Query 2861 TGCTTCAGCAGATCTCTGCCATGAGGCTGCACATCTCCCAGCTCCAGCATGAGAACAGCATCCTCAAGGGAGCC 2934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TGCTTCAGCAGATCTCTGCCATGAGGCTGCACATCTCCCAGCTCCAGCATGAGAACAGCATCCTCAAGGGAGCC 3330
Query 2935 CAGATGAAGGCATCCTTGGCATCCCTGCCCCCTCTGCATGTTGCAAAGCTATCCCATGAGGGCCCTGGCAGTGA 3008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 CAGATGAAGGCATCCTTGGCATCCCTGCCCCCTCTGCATGTTGCAAAGCTATCCCATGAGGGCCCTGGCAGTGA 3404
Query 3009 GTTACCAGCTGGAGCGCTGTATCGTAAGACCAGCCAGCTGCTGGAGACATTGAATCAATTGAGCACACACACGC 3082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 GTTACCAGCTGGAGCGCTGTATCGTAAGACCAGCCAGCTGCTGGAGACATTGAATCAATTGAGCACACACACGC 3478
Query 3083 ACGTAGTAGACATCACTCGCACCAGCCCTGCTGCCAAGAGCCCGTCGGCCCAACTTATGGAGCAAGTGGCTCAG 3156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 ACGTAGTAGACATCACTCGCACCAGCCCTGCTGCCAAGAGCCCGTCGGCCCAACTTATGGAGCAAGTGGCTCAG 3552
Query 3157 CTTAAGTCCCTGAGTGACACCGTCGAGAAGCTCAAGGATGAGGTCCTCAAGGAGACAGTATCTCAGCGCCCTGG 3230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 CTTAAGTCCCTGAGTGACACCGTCGAGAAGCTCAAGGATGAGGTCCTCAAGGAGACAGTATCTCAGCGCCCTGG 3626
Query 3231 AGCCACAGTACCCACTGACTTTGCCACCTTCCCTTCATCAGCCTTCCTCAGGGCCAAGGAGGAGCAGCAGGATG 3304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 AGCCACAGTACCCACTGACTTTGCCACCTTCCCTTCATCAGCCTTCCTCAGGGCCAAGGAGGAGCAGCAGGATG 3700
Query 3305 ACACAGTCTACATGGGCAAAGTGACCTTCTCATGTGCGGCTGGTTTTGGACAGCGACACCGGCTGGTGCTGACC 3378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 ACACAGTCTACATGGGCAAAGTGACCTTCTCATGTGCGGCTGGTTTTGGACAGCGACACCGGCTGGTGCTGACC 3774
Query 3379 CAGGAGCAGCTGCACCAGCTTCACATTCGCCTCATCTCC 3417
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 3775 CAGGAGCAGCTGCACCAGCTTCACAGTCGCCTCATCTCC 3813