Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491704
- Subject:
- NM_001013031.3
- Aligned Length:
- 3631
- Identities:
- 3449
- Gaps:
- 164
Alignment
Query 1 ATGGGAAAAGTTGGCGCCGGCGGCGGCTCCCAAGCCCGGCTGAGCGCGCTCCTCGCCGGCGCGGGGCTCTTGAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGAAAAGTTGGCGCCGGCGGCGGCTCCCAAGCCCGGCTGAGCGCGCTCCTCGCCGGCGCGGGGCTCTTGAT 74
Query 75 CCTCTGCGCCCCGGGCGTCTGCGGCGGCGGCTCCTGCTGCCCCTCGCCGCACCCCAGCTCCGCTCCACGCTCGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTCTGCGCCCCGGGCGTCTGCGGCGGCGGCTCCTGCTGCCCCTCGCCGCACCCCAGCTCCGCTCCACGCTCGG 148
Query 149 CCTCGACCCCTAGGGGCTTTTCCCACCAGGGGCGGCCAGGCAGGGCTCCTGCCACGCCCCTGCCCCTCGTAGTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCTCGACCCCTAGGGGCTTTTCCCACCAGGGGCGGCCAGGCAGGGCTCCTGCCACGCCCCTGCCCCTCGTAGTG 222
Query 223 CGTCCCCTGTTCTCAGTGGCCCCCGGGGACCGAGCGCTATCCCTGGAGCGGGCTCGGGGCACTGGGGCATCCAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGTCCCCTGTTCTCAGTGGCCCCCGGGGACCGAGCGCTATCCCTGGAGCGGGCTCGGGGCACTGGGGCATCCAT 296
Query 297 GGCGGTTGCTGCACGCTCCGGCCGGAGGAGACGGAGCGGAGCGGATCAGGAGAAGGCAGAACGGGGAGAGGGCG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGCGGTTGCTGCACGCTCCGGCCGGAGGAGACGGAGCGGAGCGGATCAGGAGAAGGCAGAACGGGGAGAGGGCG 370
Query 371 CGAGTCGGAGCCCCCGGGGAGTGCTAAGAGATGGAGGGCAGCAGGAGCCTGGGACTCGGGAGCGGGACCCGGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGAGTCGGAGCCCCCGGGGAGTGCTAAGAGATGGAGGGCAGCAGGAGCCTGGGACTCGGGAGCGGGACCCGGAC 444
Query 445 AAAGCCACCCGCTTCCGGATGGAGGAGCTGAGACTGACCAGCACCACGTTTGCGCTGACGGGAGACTCAGCACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAGCCACCCGCTTCCGGATGGAGGAGCTGAGACTGACCAGCACCACGTTTGCGCTGACGGGAGACTCAGCACA 518
Query 519 CAACCAAGCCATGGTCCACTGGTCTGGCCACAACAGCAGCGTGATTCTCATTTTGACAAAGCTCTATGACTATA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAACCAAGCCATGGTCCACTGGTCTGGCCACAACAGCAGCGTGATTCTCATTTTGACAAAGCTCTATGACTATA 592
Query 593 ACCTGGGGAGCATCACAGAGAGCTCGCTTTGGAGGTCAACCGATTATGGAACAACCTATGAGAAGCTGAATGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACCTGGGGAGCATCACAGAGAGCTCGCTTTGGAGGTCAACCGATTATGGAACAACCTATGAGAAGCTGAATGAT 666
Query 667 AAAGTTGGTTTGAAAACCATTTTGAGCTATCTCTATGTGTGTCCTACCAACAAGCGTAAGATAATGTTACTCAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAAGTTGGTTTGAAAACCATTTTGAGCTATCTCTATGTGTGTCCTACCAACAAGCGTAAGATAATGTTACTCAC 740
Query 741 AGACCCGGAGATTGAGAGCAGTTTATTGATCAGCTCAGATGAAGGGGCAACTTATCAAAAGTACCGGCTGAACT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGACCCGGAGATTGAGAGCAGTTTATTGATCAGCTCAGATGAAGGGGCAACTTATCAAAAGTACCGGCTGAACT 814
Query 815 TCTACATTCAAAGCTTGCTTTTTCACCCCAAACAAGAAGACTGGATTCTGGCATACAGTCAAGACCAAAAGTTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTACATTCAAAGCTTGCTTTTTCACCCCAAACAAGAAGACTGGATTCTGGCATACAGTCAAGACCAAAAGTTA 888
Query 889 TACAGCTCTGCTGAATTTGGGAGAAGATGGCAGCTTATCCAAGAAGGGGTTGTACCAAACAGGTTCTACTGGTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACAGCTCTGCTGAATTTGGGAGAAGATGGCAGCTTATCCAAGAAGGGGTTGTACCAAACAGGTTCTACTGGTC 962
Query 963 TGTGATGGGGTCAAATAAAGAACCAGACCTTGTGCATCTTGAGGCCAGAACTGTGGATGGTCATTCACATTATC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTGATGGGGTCAAATAAAGAACCAGACCTTGTGCATCTTGAGGCCAGAACTGTGGATGGTCATTCACATTATC 1036
Query 1037 TAACTTGCCGAATGCAGAACTGTACAGAGGCCAACAGGAATCAGCCTTTTCCAGGCTACATTGACCCAGACTCT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TAACTTGCCGAATGCAGAACTGTACAGAGGCCAACAGGAATCAGCCTTTTCCAGGCTACATTGACCCAGACTCT 1110
Query 1111 TTGATTGTTCAGGATCATTATGTGTTTGTTCAGCTGACATCAGGAGGGCGGCCACATTACTACGTGTCCTACCG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTGATTGTTCAGGATCATTATGTGTTTGTTCAGCTGACATCAGGAGGGCGGCCACATTACTACGTGTCCTACCG 1184
Query 1185 AAGGAATGCATTTGCCCAAATGAAGCTTCCGAAATATGCTTTGCCCAAGGACATGCATGTTATCAGCACCGATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGGAATGCATTTGCCCAAATGAAGCTTCCGAAATATGCTTTGCCCAAGGACATGCATGTTATCAGCACCGATG 1258
Query 1259 AGAATCAGGTGTTCGCAGCGGTCCAAGAATGGAACCAGAATGACACGTACAACCTCTACATCTCAGACACACGT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGAATCAGGTGTTCGCAGCGGTCCAAGAATGGAACCAGAATGACACGTACAACCTCTACATCTCAGACACACGT 1332
Query 1333 GGTGTCTACTTCACCCTGGCCTTGGAGAATGTCCAGAGCAGCAGAGGCCCTGAGGGCAACATCATGATCGACCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGTGTCTACTTCACCCTGGCCTTGGAGAATGTCCAGAGCAGCAGAGGCCCTGAGGGCAACATCATGATCGACCT 1406
Query 1407 CTATGAGGTAGCAGGGATAAAGGGAATGTTCTTGGCTAACAAGAAGATTGACAACCAAGTGAAGACTTTCATCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTATGAGGTAGCAGGGATAAAGGGAATGTTCTTGGCTAACAAGAAGATTGACAACCAAGTGAAGACTTTCATCA 1480
Query 1481 CATATAACAAAGGCAGAGACTGGCGTTTGCTGCAGGCGCCGGACACGGATCTAAGGGGGGACCCCGTGCACTGC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CATATAACAAAGGCAGAGACTGGCGTTTGCTGCAGGCGCCGGACACGGATCTAAGGGGGGACCCCGTGCACTGC 1554
Query 1555 TTGCTGCCCTATTGCTCACTACACCTTCACCTGAAGGTCTCTGAGAATCCCTACACATCAGGGATCATTGCCAG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTGCTGCCCTATTGCTCACTACACCTTCACCTGAAGGTCTCTGAGAATCCCTACACATCAGGGATCATTGCCAG 1628
Query 1629 CAAAGACACAGCTCCAAGCATCATAGTGGCATCAGGTAATATAGGTTCTGAATTGTCAGACACTGACATCAGCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAAAGACACAGCTCCAAGCATCATAGTGGCATCAGGTAATATAGGTTCTGAATTGTCAGACACTGACATCAGCA 1702
Query 1703 TGTTTGTCTCTTCAGATGCAGGGAACACCTGGAGACAGATCTTTGAAGAAGAGCACAGTGTTTTGTACCTGGAT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGTTTGTCTCTTCAGATGCAGGGAACACCTGGAGACAGATCTTTGAAGAAGAGCACAGTGTTTTGTACCTGGAT 1776
Query 1777 CAAGGTGGAGTCCTGGTTGCTATGAAACACACATCTCTCCCAATTCGACATCTTTGGTTGAGTTTTGATGAAGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAAGGTGGAGTCCTGGTTGCTATGAAACACACATCTCTCCCAATTCGACATCTTTGGTTGAGTTTTGATGAAGG 1850
Query 1851 GAGATCTTGGAGCAAATACAGTTTCACATCTATTCCACTTTTTGTGGATGGGGTTCTGGGTGAGCCTGGAGAAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GAGATCTTGGAGCAAATACAGTTTCACATCTATTCCACTTTTTGTGGATGGGGTTCTGGGTGAGCCTGGAGAAG 1924
Query 1925 AGACTCTCATCATGACAGTGTTTGGACACTTCAGCCACCGCTCTGAATGGCAGCTGGTCAAAGTAGATTACAAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGACTCTCATCATGACAGTGTTTGGACACTTCAGCCACCGCTCTGAATGGCAGCTGGTCAAAGTAGATTACAAG 1998
Query 1999 TCCATTTTTGATAGACGGTGTGCCGAAGAGGACTACAGACCTTGGCAGCTGCACAGCCAGGGGGAAGCATGTAT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TCCATTTTTGATAGACGGTGTGCCGAAGAGGACTACAGACCTTGGCAGCTGCACAGCCAGGGGGAAGCATGTAT 2072
Query 2073 CATGGGAGCAAAAAGGATATATAAGAAGCGAAAATCAGAGCGGAAGTGTATGCAAGGAAAATATGCAGGAGCTA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CATGGGAGCAAAAAGGATATATAAGAAGCGAAAATCAGAGCGGAAGTGTATGCAAGGAAAATATGCAGGAGCTA 2146
Query 2147 TGGAATCTGAACCCTGTGTCTGCACTGAGGCTGATTTTGATTGCGACTATGGTTATGAGCGACACAGCAATGGC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGGAATCTGAACCCTGTGTCTGCACTGAGGCTGATTTTGATTGCGACTATGGTTATGAGCGACACAGCAATGGC 2220
Query 2221 CAGTGCCTGCCGGCATTTTGGTTCAATCCATCCTCTCTGTCAAAGGATTGCAGCTTGGGACAGAGTTACCTCAA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CAGTGCCTGCCGGCATTTTGGTTCAATCCATCCTCTCTGTCAAAGGATTGCAGCTTGGGACAGAGTTACCTCAA 2294
Query 2295 TAGTACTGGGTACAGGAAGGTGGTTTCCAATAATTGCACTGATGGCGTAAGGGAACAGTACACTGCCAAACCGC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TAGTACTGGGTACAGGAAGGTGGTTTCCAATAATTGCACTGATGGCGTAAGGGAACAGTACACTGCCAAACCGC 2368
Query 2369 AGAAGTGCCCAGGGAAAGCCCCGCGGGGGCTGCGGATAGTCACGGCTGATGGAAAGCTGACAGCGGAACAAGGA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AGAAGTGCCCAGGGAAAGCCCCGCGGGGGCTGCGGATAGTCACGGCTGATGGAAAGCTGACAGCGGAACAAGGA 2442
Query 2443 CACAACGTCACTCTCATGGTGCAATTAGAAGAGGGTGATGTTCAGCGGACACTCATCCAAGTGGACTTTGGCGA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CACAACGTCACTCTCATGGTGCAATTAGAAGAGGGTGATGTTCAGCGGACACTCATCCAAGTGGACTTTGGCGA 2516
Query 2517 TGGTATCGCGGTGTCTTACGTCAATCTCAGCTCCATGGAAGATGGGATCAAACACGTCTATCAGAACGTGGGCA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TGGTATCGCGGTGTCTTACGTCAATCTCAGCTCCATGGAAGATGGGATCAAACACGTCTATCAGAACGTGGGCA 2590
Query 2591 TTTTCCGTGTGACCGTGCAGGTGGACAACAGTCTGGGTTCTGACAGCGCCGTCCTGTACTTACATGTAACTTGT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TTTTCCGTGTGACCGTGCAGGTGGACAACAGTCTGGGTTCTGACAGCGCCGTCCTGTACTTACATGTAACTTGT 2664
Query 2665 CCCTTGGAGCACGTGCACCTGTCTCTTCCCTTTGTCACCACAAAGAACAAAGAGGTCAATGCGACGGCAGTGCT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CCCTTGGAGCACGTGCACCTGTCTCTTCCCTTTGTCACCACAAAGAACAAAGAGGTCAATGCGACGGCAGTGCT 2738
Query 2739 GTGGCCCAGCCAAGTGGGCACCCTCACTTATGTGTGGTGGTACGGAAACAACACGGAGCCTTTGATCACCTTGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GTGGCCCAGCCAAGTGGGCACCCTCACTTACGTGTGGTGGTACGGAAACAACACGGAGCCTTTGATCACCTTGG 2812
Query 2813 AGGGAAGCATATCCTTCAGATTTACTTCAGAAGGAATGAATACCATCACAGTGCAGGTCTCAGCTGGGAATGCC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AGGGAAGCATATCCTTCAGATTTACTTCAGAAGGAATGAATACCATCACAGTGCAGGTCTCAGCTGGGAATGCC 2886
Query 2887 ATCCTACAAGACACAAAGACCATCGCAGTATATGAGGAATTCCGGTCTCTTCGCTTGTCCTTTTCTCCAAACCT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 ATCCTACAAGACACAAAGACCATCGCAGTATATGAGGAATTCCGGTCTCTTCGCTTGTCCTTTTCTCCAAACCT 2960
Query 2961 GGATGACTACAACCCGGACATCCCTGAGTGGAGGAGGGACATCGGTCGAGTCATCAAAAAATCCCTGGTGGAAG 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GGATGACTACAACCCGGACATCCCTGAGTGGAGGAGGGACATCGGTCGAGTCATCAAAAAATCCCTGGTGGAAG 3034
Query 3035 CCACAGGGGTTCCAGGCCAGCACATCCTGGTGGCGGTGCTCCCTGGCTTACCCACCACTGCTGAACTCTTTGTC 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CCACAGGGGTTCCAGGCCAGCACATCCTGGTGGCGGTGCTCCCTGGCTTACCCACCACTGCTGAACTCTTTGTC 3108
Query 3109 CTACCCTATCAGGATCCAGCTGGAGAAAACAAAAGGTCAACTGATGACCTGGAGCAGATATCAGAATTGCTGAT 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CTACCCTATCAGGATCCAGCTGGAGAAAACAAAAGGTCAACTGATGACCTGGAGCAGATATCAGAATTGCTGAT 3182
Query 3183 CCACACGCTCAACCAAAACTCAGTACACTTCGAGCTGAAGCCAGGAGTCCGAGTCCTTGTCCATGCTGCTCACT 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 CCACACGCTCAACCAAAACTCAGTACACTTCGAGCTGAAGCCAGGAGTCCGAGTCCTTGTCCATGCTGCTCACT 3256
Query 3257 TAACAGCGGCCCCCCTGGTGGACCTCACTCCAACCCACAGTGGATCTGCCATGCTGATGCTGCTCTCAGTGGTG 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TAACAGCGGCCCCCCTGGTGGACCTCACTCCAACCCACAGTGGATCTGCCATGCTGATGCTGCTCTCAGTGGTG 3330
Query 3331 TTTGTGGGGCTGGCAGTGTTCGTCATCTACAAGTTTAAAAGG-AGAGTAGCTTTACCCTCCCCTCCCTCCCCTT 3403
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 3331 TTTGTGGGGCTGGCAGTGTTCGTCATCTACAAGTTTAAAAGGAAGA------------TCCC------------ 3380
Query 3404 CTACTCAACCTGGTGACTCATCT-----CTCCGATTGC--------AAAGAGCAAGA---------------CA 3449
||.||.|.||.| |.|.|| ||| |||||.||||| ||
Sbjct 3381 -----------GGGGATTAATGTTTATGCCCAGA-TGCAGAATGAGAAAGAACAAGAGATGATCAGTCCAGTCA 3442
Query 3450 CGCCACTCCG----------------CCTTCA-AC-----------------GCCA-------------AAGCG 3476
|.|||||.| ||.||| || |||| |||..
Sbjct 3443 -GTCACTCTGAAAGCAGGCCCAATGTCCCTCAGACTGAACTAAGGAGGCCTGGCCAGCTTATAGATGAGAAGGT 3515
Query 3477 GGGATC---------------------------TGCTGGG-------GCACA--------------GTATGCAA 3502
||.||| |||||.| ||||| .||||.||
Sbjct 3516 GGAATCCCAGCTCATAGGAAGTATTTCCATAGTTGCTGAGAATCAAAGCACAAAAGAAATCCCTACCTATGTAA 3589
Query 3503 TT--- 3504
.|
Sbjct 3590 ATGTT 3594