Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491704
• Subject: XM_017015617.1
• Aligned Length: 3631
• Identities: 2899
• Gaps: 704

Alignment

Query    1  ATGGGAAAAGTTGGCGCCGGCGGCGGCTCCCAAGCCCGGCTGAGCGCGCTCCTCGCCGGCGCGGGGCTCTTGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTCTGCGCCCCGGGCGTCTGCGGCGGCGGCTCCTGCTGCCCCTCGCCGCACCCCAGCTCCGCTCCACGCTCGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCTCGACCCCTAGGGGCTTTTCCCACCAGGGGCGGCCAGGCAGGGCTCCTGCCACGCCCCTGCCCCTCGTAGTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CGTCCCCTGTTCTCAGTGGCCCCCGGGGACCGAGCGCTATCCCTGGAGCGGGCTCGGGGCACTGGGGCATCCAT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGCGGTTGCTGCACGCTCCGGCCGGAGGAGACGGAGCGGAGCGGATCAGGAGAAGGCAGAACGGGGAGAGGGCG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CGAGTCGGAGCCCCCGGGGAGTGCTAAGAGATGGAGGGCAGCAGGAGCCTGGGACTCGGGAGCGGGACCCGGAC  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  AAAGCCACCCGCTTCCGGATGGAGGAGCTGAGACTGACCAGCACCACGTTTGCGCTGACGGGAGACTCAGCACA  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  CAACCAAGCCATGGTCCACTGGTCTGGCCACAACAGCAGCGTGATTCTCATTTTGACAAAGCTCTATGACTATA  592
                                                 |..||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------ATGGTGATTCTCATTTTGACAAAGCTCTATGACTATA  37

Query  593  ACCTGGGGAGCATCACAGAGAGCTCGCTTTGGAGGTCAACCGATTATGGAACAACCTATGAGAAGCTGAATGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   38  ACCTGGGGAGCATCACAGAGAGCTCGCTTTGGAGGTCAACCGATTATGGAACAACCTATGAGAAGCTGAATGAT  111

Query  667  AAAGTTGGTTTGAAAACCATTTTGAGCTATCTCTATGTGTGTCCTACCAACAAGCGTAAGATAATGTTACTCAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  112  AAAGTTGGTTTGAAAACCATTTTGAGCTATCTCTATGTGTGTCCTACCAACAAGCGTAAGATAATGTTACTCAC  185

Query  741  AGACCCGGAGATTGAGAGCAGTTTATTGATCAGCTCAGATGAAGGGGCAACTTATCAAAAGTACCGGCTGAACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  186  AGACCCGGAGATTGAGAGCAGTTTATTGATCAGCTCAGATGAAGGGGCAACTTATCAAAAGTACCGGCTGAACT  259

Query  815  TCTACATTCAAAGCTTGCTTTTTCACCCCAAACAAGAAGACTGGATTCTGGCATACAGTCAAGACCAAAAGTTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  260  TCTACATTCAAAGCTTGCTTTTTCACCCCAAACAAGAAGACTGGATTCTGGCATACAGTCAAGACCAAAAGTTA  333

Query  889  TACAGCTCTGCTGAATTTGGGAGAAGATGGCAGCTTATCCAAGAAGGGGTTGTACCAAACAGGTTCTACTGGTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  334  TACAGCTCTGCTGAATTTGGGAGAAGATGGCAGCTTATCCAAGAAGGGGTTGTACCAAACAGGTTCTACTGGTC  407

Query  963  TGTGATGGGGTCAAATAAAGAACCAGACCTTGTGCATCTTGAGGCCAGAACTGTGGATGGTCATTCACATTATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  408  TGTGATGGGGTCAAATAAAGAACCAGACCTTGTGCATCTTGAGGCCAGAACTGTGGATGGTCATTCACATTATC  481

Query 1037  TAACTTGCCGAATGCAGAACTGTACAGAGGCCAACAGGAATCAGCCTTTTCCAGGCTACATTGACCCAGACTCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  482  TAACTTGCCGAATGCAGAACTGTACAGAGGCCAACAGGAATCAGCCTTTTCCAGGCTACATTGACCCAGACTCT  555

Query 1111  TTGATTGTTCAGGATCATTATGTGTTTGTTCAGCTGACATCAGGAGGGCGGCCACATTACTACGTGTCCTACCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  TTGATTGTTCAGGATCATTATGTGTTTGTTCAGCTGACATCAGGAGGGCGGCCACATTACTACGTGTCCTACCG  629

Query 1185  AAGGAATGCATTTGCCCAAATGAAGCTTCCGAAATATGCTTTGCCCAAGGACATGCATGTTATCAGCACCGATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  AAGGAATGCATTTGCCCAAATGAAGCTTCCGAAATATGCTTTGCCCAAGGACATGCATGTTATCAGCACCGATG  703

Query 1259  AGAATCAGGTGTTCGCAGCGGTCCAAGAATGGAACCAGAATGACACGTACAACCTCTACATCTCAGACACACGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  AGAATCAGGTGTTCGCAGCGGTCCAAGAATGGAACCAGAATGACACGTACAACCTCTACATCTCAGACACACGT  777

Query 1333  GGTGTCTACTTCACCCTGGCCTTGGAGAATGTCCAGAGCAGCAGAGGCCCTGAGGGCAACATCATGATCGACCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  GGTGTCTACTTCACCCTGGCCTTGGAGAATGTCCAGAGCAGCAGAGGCCCTGAGGGCAACATCATGATCGACCT  851

Query 1407  CTATGAGGTAGCAGGGATAAAGGGAATGTTCTTGGCTAACAAGAAGATTGACAACCAAGTGAAGACTTTCATCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  CTATGAGGTAGCAGGGATAAAGGGAATGTTCTTGGCTAACAAGAAGATTGACAACCAAGTGAAGACTTTCATCA  925

Query 1481  CATATAACAAAGGCAGAGACTGGCGTTTGCTGCAGGCGCCGGACACGGATCTAAGGGGGGACCCCGTGCACTGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  CATATAACAAAGGCAGAGACTGGCGTTTGCTGCAGGCGCCGGACACGGATCTAAGGGGGGACCCCGTGCACTGC  999

Query 1555  TTGCTGCCCTATTGCTCACTACACCTTCACCTGAAGGTCTCTGAGAATCCCTACACATCAGGGATCATTGCCAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  TTGCTGCCCTATTGCTCACTACACCTTCACCTGAAGGTCTCTGAGAATCCCTACACATCAGGGATCATTGCCAG  1073

Query 1629  CAAAGACACAGCTCCAAGCATCATAGTGGCATCAGGTAATATAGGTTCTGAATTGTCAGACACTGACATCAGCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  CAAAGACACAGCTCCAAGCATCATAGTGGCATCAGGTAATATAGGTTCTGAATTGTCAGACACTGACATCAGCA  1147

Query 1703  TGTTTGTCTCTTCAGATGCAGGGAACACCTGGAGACAGATCTTTGAAGAAGAGCACAGTGTTTTGTACCTGGAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  TGTTTGTCTCTTCAGATGCAGGGAACACCTGGAGACAGATCTTTGAAGAAGAGCACAGTGTTTTGTACCTGGAT  1221

Query 1777  CAAGGTGGAGTCCTGGTTGCTATGAAACACACATCTCTCCCAATTCGACATCTTTGGTTGAGTTTTGATGAAGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222  CAAGGTGGAGTCCTGGTTGCTATGAAACACACATCTCTCCCAATTCGACATCTTTGGTTGAGTTTTGATGAAGG  1295

Query 1851  GAGATCTTGGAGCAAATACAGTTTCACATCTATTCCACTTTTTGTGGATGGGGTTCTGGGTGAGCCTGGAGAAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1296  GAGATCTTGGAGCAAATACAGTTTCACATCTATTCCACTTTTTGTGGATGGGGTTCTGGGTGAGCCTGGAGAAG  1369

Query 1925  AGACTCTCATCATGACAGTGTTTGGACACTTCAGCCACCGCTCTGAATGGCAGCTGGTCAAAGTAGATTACAAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370  AGACTCTCATCATGACAGTGTTTGGACACTTCAGCCACCGCTCTGAATGGCAGCTGGTCAAAGTAGATTACAAG  1443

Query 1999  TCCATTTTTGATAGACGGTGTGCCGAAGAGGACTACAGACCTTGGCAGCTGCACAGCCAGGGGGAAGCATGTAT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1444  TCCATTTTTGATAGACGGTGTGCCGAAGAGGACTACAGACCTTGGCAGCTGCACAGCCAGGGGGAAGCATGTAT  1517

Query 2073  CATGGGAGCAAAAAGGATATATAAGAAGCGAAAATCAGAGCGGAAGTGTATGCAAGGAAAATATGCAGGAGCTA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518  CATGGGAGCAAAAAGGATATATAAGAAGCGAAAATCAGAGCGGAAGTGTATGCAAGGAAAATATGCAGGAGCTA  1591

Query 2147  TGGAATCTGAACCCTGTGTCTGCACTGAGGCTGATTTTGATTGCGACTATGGTTATGAGCGACACAGCAATGGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1592  TGGAATCTGAACCCTGTGTCTGCACTGAGGCTGATTTTGATTGCGACTATGGTTATGAGCGACACAGCAATGGC  1665

Query 2221  CAGTGCCTGCCGGCATTTTGGTTCAATCCATCCTCTCTGTCAAAGGATTGCAGCTTGGGACAGAGTTACCTCAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1666  CAGTGCCTGCCGGCATTTTGGTTCAATCCATCCTCTCTGTCAAAGGATTGCAGCTTGGGACAGAGTTACCTCAA  1739

Query 2295  TAGTACTGGGTACAGGAAGGTGGTTTCCAATAATTGCACTGATGGCGTAAGGGAACAGTACACTGCCAAACCGC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740  TAGTACTGGGTACAGGAAGGTGGTTTCCAATAATTGCACTGATGGCGTAAGGGAACAGTACACTGCCAAACCGC  1813

Query 2369  AGAAGTGCCCAGGGAAAGCCCCGCGGGGGCTGCGGATAGTCACGGCTGATGGAAAGCTGACAGCGGAACAAGGA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814  AGAAGTGCCCAGGGAAAGCCCCGCGGGGGCTGCGGATAGTCACGGCTGATGGAAAGCTGACAGCGGAACAAGGA  1887

Query 2443  CACAACGTCACTCTCATGGTGCAATTAGAAGAGGGTGATGTTCAGCGGACACTCATCCAAGTGGACTTTGGCGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1888  CACAACGTCACTCTCATGGTGCAATTAGAAGAGGGTGATGTTCAGCGGACACTCATCCAAGTGGACTTTGGCGA  1961

Query 2517  TGGTATCGCGGTGTCTTACGTCAATCTCAGCTCCATGGAAGATGGGATCAAACACGTCTATCAGAACGTGGGCA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962  TGGTATCGCGGTGTCTTACGTCAATCTCAGCTCCATGGAAGATGGGATCAAACACGTCTATCAGAACGTGGGCA  2035

Query 2591  TTTTCCGTGTGACCGTGCAGGTGGACAACAGTCTGGGTTCTGACAGCGCCGTCCTGTACTTACATGTAACTTGT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036  TTTTCCGTGTGACCGTGCAGGTGGACAACAGTCTGGGTTCTGACAGCGCCGTCCTGTACTTACATGTAACTTGT  2109

Query 2665  CCCTTGGAGCACGTGCACCTGTCTCTTCCCTTTGTCACCACAAAGAACAAAGAGGTCAATGCGACGGCAGTGCT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2110  CCCTTGGAGCACGTGCACCTGTCTCTTCCCTTTGTCACCACAAAGAACAAAGAGGTCAATGCGACGGCAGTGCT  2183

Query 2739  GTGGCCCAGCCAAGTGGGCACCCTCACTTATGTGTGGTGGTACGGAAACAACACGGAGCCTTTGATCACCTTGG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2184  GTGGCCCAGCCAAGTGGGCACCCTCACTTACGTGTGGTGGTACGGAAACAACACGGAGCCTTTGATCACCTTGG  2257

Query 2813  AGGGAAGCATATCCTTCAGATTTACTTCAGAAGGAATGAATACCATCACAGTGCAGGTCTCAGCTGGGAATGCC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2258  AGGGAAGCATATCCTTCAGATTTACTTCAGAAGGAATGAATACCATCACAGTGCAGGTCTCAGCTGGGAATGCC  2331

Query 2887  ATCCTACAAGACACAAAGACCATCGCAGTATATGAGGAATTCCGGTCTCTTCGCTTGTCCTTTTCTCCAAACCT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332  ATCCTACAAGACACAAAGACCATCGCAGTATATGAGGAATTCCGGTCTCTTCGCTTGTCCTTTTCTCCAAACCT  2405

Query 2961  GGATGACTACAACCCGGACATCCCTGAGTGGAGGAGGGACATCGGTCGAGTCATCAAAAAATCCCTGGTGGAAG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2406  GGATGACTACAACCCGGACATCCCTGAGTGGAGGAGGGACATCGGTCGAGTCATCAAAAAATCCCTGGTGGAAG  2479

Query 3035  CCACAGGGGTTCCAGGCCAGCACATCCTGGTGGCGGTGCTCCCTGGCTTACCCACCACTGCTGAACTCTTTGTC  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2480  CCACAGGGGTTCCAGGCCAGCACATCCTGGTGGCGGTGCTCCCTGGCTTACCCACCACTGCTGAACTCTTTGTC  2553

Query 3109  CTACCCTATCAGGATCCAGCTGGAGAAAACAAAAGGTCAACTGATGACCTGGAGCAGATATCAGAATTGCTGAT  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2554  CTACCCTATCAGGATCCAGCTGGAGAAAACAAAAGGTCAACTGATGACCTGGAGCAGATATCAGAATTGCTGAT  2627

Query 3183  CCACACGCTCAACCAAAACTCAGTACACTTCGAGCTGAAGCCAGGAGTCCGAGTCCTTGTCCATGCTGCTCACT  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2628  CCACACGCTCAACCAAAACTCAGTACACTTCGAGCTGAAGCCAGGAGTCCGAGTCCTTGTCCATGCTGCTCACT  2701

Query 3257  TAACAGCGGCCCCCCTGGTGGACCTCACTCCAACCCACAGTGGATCTGCCATGCTGATGCTGCTCTCAGTGGTG  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2702  TAACAGCGGCCCCCCTGGTGGACCTCACTCCAACCCACAGTGGATCTGCCATGCTGATGCTGCTCTCAGTGGTG  2775

Query 3331  TTTGTGGGGCTGGCAGTGTTCGTCATCTACAAGTTTAAAAGGA----------GAGTA--GCTTTA--CCC---  3387
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||.||  | ||||  |||   
Sbjct 2776  TTTGTGGGGCTGGCAGTGTTCGTCATCTACAAGTTTAAAAGGAAGATCCCGGGGATTAATG-TTTATGCCCAGA  2848

Query 3388  -------------------------------TCCCCTCCCTC----------------------CCCTTCTACT  3408
                                           |||..||..||                      ||||...|||
Sbjct 2849  TGCAGAATGAGAAAGAACAAGAGATGATCAGTCCAGTCAGTCACTCTGAAAGCAGGCCCAATGTCCCTCAGACT  2922

Query 3409  CAA---------CCTGG------------TGA-----------CTCATCTCTCCGA--TTGCAAAGAGCAAGAC  3448
            .||         |||||            |||           |.||.|||...||  ||.||||.|||||   
Sbjct 2923  GAACTAAGGAGGCCTGGCCAGCTTATAGATGAGAAGGTGGAATCCCAGCTCATAGAAGTTCCAAACAGCAA---  2993

Query 3449  ACGCCACTCCGCCTTCAACGCCAAAGCGGGGATCTGCTGGGGCA----------------CA-GTATGCAATT-  3504
                       |.||.|..||   ||.||||   |||| .||||                || |.||.|||.| 
Sbjct 2994  -----------CTTTGAGAGC---AGTGGGG---TGCT-TGGCAGCTGTTCTGTGTTTTCCAGGAATCCAACTG  3049

Query 3505  -----  3504
                 
Sbjct 3050  AGCAT  3054