Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491728
- Subject:
- XM_024449422.1
- Aligned Length:
- 3433
- Identities:
- 2541
- Gaps:
- 890
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAACGGCACCAGCCGCGGCTGCACCACCCGGCCCAAGGCTCAGCCGCTGGGACTCCCTACCCTTCCTCAGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTCTCTCCGCGGCTGCCGGGAAAGCAAGATGCCGCGCAGGAAGGGCCCCCAACACCCTCCGCCGCCCAGTGGCC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCGAGGAGCCTGGGGAGAAGCGCCCCAAGTTTCATTTAAATATTAGGACACTGACGGATGATATGCTGGACAAA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TTTGCCAGCATAAGAATTCCAGGGAGCAAGAAAGAGAGACCTCCACTTCCCAACCTGAAGACTGCATTTGCAAG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CAGTGATTGCTCAGCAGCACCTTTAGAGATGATGGAGAACTTTCCAAAGCCACTGTCAGAGAATGAACTCTTAG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AACTTTTTGAAAAAATGATGGAAGATATGAATTTAAATGAAGATAAAAAGGCACCATTGCGGGAAAAGGACTTC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 AGTATCAAAAAAGAAATGGTGATGCAGTACATTAATACTGCTTCTAAGACAGGAAGTCTTAAGAGAAGCCGACA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GATCTCACCTCAGGAATTCATTCATGAGCTGAAAATGGGGTCTGCAGATGAGAGACTTGTCACATGCCTGGAGT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 CTCTCCGAGTGTCTTTGACCAGCAATCCTGTGAGTTGGGTGGAAAGCTTTGGACATGAAGGGCTTGGATTATTA 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 TTAGACATTTTGGAAAAACTGATTAGTGGAAAAATCCAAGAAAAAGTTGTAAAGAAAAATCAACATAAAGTCAT 740
Query 1 -------------------------------------------------ATGAGTGAGGAGAGGAGCCTTTCCT 25
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACAGTGTCTAAAAGCCCTGATGAATACGCAGTATGGCTTGGAAAGAATTATGAGTGAGGAGAGGAGCCTTTCCT 814
Query 26 TATTGGCCAAAGCCGTGGATCCCAGACACCCCAATATGATGACAGATGTGGTTAAACTTCTCTCTGCGGTATGC 99
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TATTGGCCAAAGCCGTGGATCCCAGACACCCCAATATGATGACAGATGTGGTTAAACTTCTCTCTGCGGTATGC 888
Query 100 ATTGTAGGGGAAGAAAGCATCCTTGAAGAAGTTTTAGAAGCTTTAACTTCAGCTGGTGAAGAAAAAAAAATTGA 173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATTGTAGGGGAAGAAAGCATCCTTGAAGAAGTTTTAGAAGCTTTAACTTCAGCTGGTGAAGAAAAAAAAATTGA 962
Query 174 CAGATTTTTTTGTATTGTGGAAGGCCTCCGGCACAATTCAGTTCAACTGCAAGTAGCTTGTATGCAGCTCATCA 247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGATTTTTTTGTATTGTGGAAGGCCTCCGGCACAATTCAGTTCAACTGCAAGTAGCTTGTATGCAGCTCATCA 1036
Query 248 ATGCCCTGGTTACATCTCCTGATGATTTGGATTTCAGGCTTCACATCAGAAATGAATTTATGCGTTGTGGATTG 321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGCCCTGGTTACATCTCCTGATGATTTGGATTTCAGGCTTCACATCAGAAATGAATTTATGCGTTGTGGATTG 1110
Query 322 AAAGAGATATTGCCAAATTTAAAATGCATTAAGAATGATGGCCTGGATATCCAACTTAAAGTCTTTGATGAGCA 395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAAGAGATATTGCCAAATTTAAAATGCATTAAGAATGATGGCCTGGATATCCAACTTAAAGTCTTTGATGAGCA 1184
Query 396 TAAAGAAGAAGATTTGTTTGAGTTATCCCATCGCCTTGAAGATATTAGAGCTGAACTTGATGAAGCATATGATG 469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAAAGAAGAAGATTTGTTTGAGTTATCCCATCGCCTTGAAGATATTAGAGCTGAACTTGATGAAGCATATGATG 1258
Query 470 TTTACAACATGGTGTGGAGCACAGTTAAAGAAACTAGAGCAGAGGGATATTTTATTTCTATTCTTCAGCATCTT 543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTTACAACATGGTGTGGAGCACAGTTAAAGAAACTAGAGCAGAGGGATATTTTATTTCTATTCTTCAGCATCTT 1332
Query 544 TTGCTGATTCGAAATGATTATTTTATAAGGCAACAATACTTCAAATTAATTGATGAGTGTGTATCCCAGATTGT 617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTGCTGATTCGAAATGATTATTTTATAAGGCAACAATACTTCAAATTAATTGATGAGTGTGTATCCCAGATTGT 1406
Query 618 ATTGCATAGAGATGGAATGGATCCAGACTTCACATATCGAAAAAGACTAGATTTAGATTTAACCCAGTTTGTAG 691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ATTGCATAGAGATGGAATGGATCCAGACTTCACATATCGAAAAAGACTAGATTTAGATTTAACCCAGTTTGTAG 1480
Query 692 ACATTTGCATAGATCAAGCAAAACTAGAAGAGTTTGAAGAGAAAGCATCAGAACTTTACAAGAAATTTGAAAAA 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACATTTGCATAGATCAAGCAAAACTAGAAGAGTTTGAAGAGAAAGCATCAGAACTTTACAAGAAATTTGAAAAA 1554
Query 766 GAGTTTACCGACCACCAAGAAACTCAGGCTGAATTGCAGAAAAAAGAGGCAAAGATTAATGAGCTTCAAGCAGA 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAGTTTACCGACCACCAAGAAACTCAGGCTGAATTGCAGAAAAAAGAGGCAAAGATTAATGAGCTTCAAGCAGA 1628
Query 840 GCTACAAGCTTTTAAGTCTCAGTTTGGTGCCTTGCCAGCTGATTGTAATATTCCTTTGCCTCCCTCTAAAGAAG 913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCTACAAGCTTTTAAGTCTCAGTTTGGTGCCTTGCCAGCTGATTGTAATATTCCTTTGCCTCCCTCTAAAGAAG 1702
Query 914 GTGGAACTGGCCACTCAGCACTTCCTCCTCCGCCTCCACTGCCTTCTGGTGGAGGGGTGCCGCCTCCACCTCCT 987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTGGAACTGGCCACTCAGCACTTCCTCCTCCGCCTCCACTGCCTTCTGGTGGAGGGGTGCCGCCTCCACCTCCT 1776
Query 988 CCCCCACCACCTCCTCCACTTCCAGGAATGCGGATGCCATTCAGTGGTCCTGTGCCTCCACCACCTCCCCTGGG 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CCCCCACCACCTCCTCCACTTCCAGGAATGCGGATGCCATTCAGTGGTCCTGTGCCTCCACCACCTCCCCTGGG 1850
Query 1062 ATTCCTTGGAGGACAAAATTCTCCTCCTCTACCAATCCTGCCATTTGGGTTGAAACCAAAGAAAGAATTTAAAC 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ATTCCTTGGAGGACAAAATTCTCCTCCTCTACCAATCCTGCCATTTGGGTTGAAACCAAAGAAAGAATTTAAAC 1924
Query 1136 CTGAAATCAGCATGAGAAGATTGAATTGGTTAAAGATCAGACCTCATGAAATGACTGAAAACTGTTTCTGGATA 1209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CTGAAATCAGCATGAGAAGATTGAATTGGTTAAAGATCAGACCTCATGAAATGACTGAAAACTGTTTCTGGATA 1998
Query 1210 AAAGTAAATGAAAATAAGTATGAAAACGTGGATTTGCTTTGTAAACTTGAGAATACATTTTGTTGCCAACAAAA 1283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AAAGTAAATGAAAATAAGTATGAAAACGTGGATTTGCTTTGTAAACTTGAGAATACATTTTGTTGCCAACAAAA 2072
Query 1284 AGAGAGAAGAGAAGAGGAAGATATTGAAGAGAAGAAATCGATTAAGAAAAAAATTAAAGAACTTAAGTTTTTAG 1357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGAGAGAAGAGAAGAGGAAGATATTGAAGAGAAGAAATCGATTAAGAAAAAAATTAAAGAACTTAAGTTTTTAG 2146
Query 1358 ATTCTAAAATTGCCCAGAACCTTTCAATCTTCCTGAGCTCTTTTCGGGTGCCATATGAGGAAATCAGAATGATG 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATTCTAAAATTGCCCAGAACCTTTCAATCTTCCTGAGCTCTTTTCGGGTGCCATATGAGGAAATCAGAATGATG 2220
Query 1432 ATATTGGAAGTAGATGAAACACGGTTGGCAGAGTCTATGATTCAGAACTTAATAAAGCATCTTCCTGATCAAGA 1505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ATATTGGAAGTAGATGAAACACGGTTGGCAGAGTCTATGATTCAGAACTTAATAAAGCATCTTCCTGATCAAGA 2294
Query 1506 GCAATTAAATTCATTGTCTCAGTTCAAGAGTGAATATAGCAACTTATGTGAACCTGAGCAGTTTGTGGTTGTGA 1579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCAATTAAATTCATTGTCTCAGTTCAAGAGTGAATATAGCAACTTATGTGAACCTGAGCAGTTTGTGGTTGTGA 2368
Query 1580 TGAGCAATGTGAAGAGACTACGGCCACGGCTCAGTGCTATTCTCTTTAAGCTTCAGTTTGAAGAGCAGGTGAAC 1653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGAGCAATGTGAAGAGACTACGGCCACGGCTCAGTGCTATTCTCTTTAAGCTTCAGTTTGAAGAGCAGGTGAAC 2442
Query 1654 AACATCAAACCTGACATCATGGCTGTCAGTACTGCCTGCGAAGAGATAAAGAAGAGCAAAAGCTTTAGCAAGTT 1727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AACATCAAACCTGACATCATGGCTGTCAGTACTGCCTGCGAAGAGATAAAGAAGAGCAAAAGCTTTAGCAAGTT 2516
Query 1728 GCTGGAACTTGTATTGCTAATGGGAAACTACATGAATGCTGGCTCCCGGAATGCTCAAACCTTCGGATTTAACC 1801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GCTGGAACTTGTATTGCTAATGGGAAACTACATGAATGCTGGCTCCCGGAATGCTCAAACCTTCGGATTTAACC 2590
Query 1802 TTAGCTCTCTCTGTAAACTAAAGGACACAAAATCAGCAGATCAGAAAACAACGCTACTTCATTTCCTGGTAGAA 1875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TTAGCTCTCTCTGTAAACTAAAGGACACAAAATCAGCAGATCAGAAAACAACGCTACTTCATTTCCTGGTAGAA 2664
Query 1876 ATATGTGAAGAGAAGTACCCTGATATACTGAATTTTGTGGATGATTTGGAACCTTTAGACAAAGCTAGTAAAGT 1949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 ATATGTGAAGAGAAGTACCCTGATATACTGAATTTTGTGGATGATTTGGAACCTTTAGACAAAGCTAGTAAAGT 2738
Query 1950 CTCTGTAGAAACGCTGGAAAAGAATTTGAGGCAGATGGGAAGGCAGCTTCAACAGCTTGAGAAGGAATTGGAAA 2023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CTCTGTAGAAACGCTGGAAAAGAATTTGAGGCAGATGGGAAGGCAGCTTCAACAGCTTGAGAAGGAATTGGAAA 2812
Query 2024 CCTTTCCCCCTCCTGAGGACTTGCATGACAAGTTTGTGACAAAGATGTCCAGATTTGTTATCAGTGCAAAAGAA 2097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CCTTTCCCCCTCCTGAGGACTTGCATGACAAGTTTGTGACAAAGATGTCCAGATTTGTTATCAGTGCAAAAGAA 2886
Query 2098 CAATATGAGACACTTTCGAAGTTACACGAAAACATGGAAAAGTTATACCAGAGTATAATAGGATACTATGCCAT 2171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CAATATGAGACACTTTCGAAGTTACACGAAAACATGGAAAAGTTATACCAGAGTATAATAGGATACTATGCCAT 2960
Query 2172 TGATGTGAAGAAGGTGTCTGTGGAAGACTTTCTTACTGACCTGAATAACTTCAGAACCACATTCATGCAAGCAA 2245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TGATGTGAAGAAGGTGTCTGTGGAAGACTTTCTTACTGACCTGAATAACTTCAGAACCACATTCATGCAAGCAA 3034
Query 2246 TAAAGGAGAATATCAAAAAAAGAGAAGCAGAGGAAAAAGAAAAACGTGTCAGAATAGCTAAAGAATTAGCAGAG 2319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TAAAGGAGAATATCAAAAAAAGAGAAGCAGAGGAAAAAGAAAAACGTGTCAGAATAGCTAAAGAATTAGCAGAG 3108
Query 2320 CGAGAAAGACTCGAACGCCAACAAAAGAAAAAGCGTTTATTAGAAATGAAGACTGAGGGTGATGAGACAGGAGT 2393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CGAGAAAGACTCGAACGCCAACAAAAGAAAAAGCGTTTATTAGAAATGAAGACTGAGGGTGATGAGACAGGAGT 3182
Query 2394 GATGGATAATCTGCTGGAGGCCTTGCAGTCCGGGGCTGCCTTCCGCGACAGAAGAAAAAGGACACCGATGCCAA 2467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 GATGGATAATCTGCTGGAGGCCTTGCAGTCCGGGGCTGCCTTCCGCGACAGAAGAAAAAGGACACCGATGCCAA 3256
Query 2468 AAGATGTTCGGCAGAGTCTCAGTCCAATGTCTCAGAGGCCTGTTCTGAAAGTTTGTAACCATGGTAATAAA--- 2538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.|||
Sbjct 3257 AAGATGTTCGGCAGAGTCTCAGTCCAATGTCTCAGAGGCCTGTTCTGAAAGTTTGTAACCATG--AAGAAAAGC 3328
Query 2539 -----CCGTATTTA------------------------------------------------------------ 2547
|| |||.|
Sbjct 3329 AATGTCC--ATTCAGACGTGAGGAATTTGAACAAGAAGGAGATACACCATATACAAATAGAAACCGAGATTTGC 3400
Query 2548 ----------------------------- 2547
Sbjct 3401 AACTCAGAAATGTATTTAGCACAGAGGAG 3429