Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491728
- Subject:
- XR_001749694.1
- Aligned Length:
- 3520
- Identities:
- 2340
- Gaps:
- 1180
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AGATGTGTTGGCTGCGGCCCCGACTTCAGCGGTTGGGCTAGGCTGTGCTGACTGTTTGGGTGGCGGACCCCGGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGTAAAACCTGTTGTCGATCCCTCAGCTTCCAGCTTGCGGCTTGCTGAGTGGCCACCTTCTTTCCGGTCCCCGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGCTGCGGGGAAAGATGGAACGGCACCAGCCGCGGCTGCACCACCCGGCCCAAGGCTCAGCCGCTGGGACTCCC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TACCCTTCCTCAGCCTCTCTCCGCGGCTGCCGGGAAAGCAAGATGCCGCGCAGGAAGGGCCCCCAACACCCTCC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GCCGCCCAGTGGCCCCGAGGAGCCTGGGGAGAAGCGCCCCAAGTTTCATTTAAATATTAGGACACTGACGGATG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 ATATGCTGGACAAATTTGCCAGCATAAGAATTCCAGGGAGCAAGAAAGAGAGACCTCCACTTCCCAACCTGAAG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 ACTGCATTTGCAAGCAGTGATTGCTCAGCAGCACCTTTAGAGATGATGGAGAACTTTCCAAAGCCACTGTCAGA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GAATGAACTCTTAGAACTTTTTGAAAAAATGATGGAAGATATGAATTTAAATGAAGATAAAAAGGCACCATTGC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GGGAAAAGGACTTCAGTATCAAAAAAGAAATGGTGATGCAGTACATTAATACTGCTTCTAAGACAGGAAGTCTT 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 AAGAGAAGCCGACAGATCTCACCTCAGGAATTCATTCATGAGCTGAAAATGGGGTCTGCAGATGAGAGACTTGT 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CACATGCCTGGAGTCTCTCCGAGTGTCTTTGACCAGCAATCCTGTGAGTTGGGTGGAAAGCTTTGGACATGAAG 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 GGCTTGGATTATTATTAGACATTTTGGAAAAACTGATTAGTGGAAAAATCCAAGAAAAAGTTGTAAAGAAAAAT 888
Query 1 ---------------------------------------------------------------ATGAGTGAGGA 11
|||||||||||
Sbjct 889 CAACATAAAGTCATACAGTGTCTAAAAGCCCTGATGAATACGCAGTATGGCTTGGAAAGAATTATGAGTGAGGA 962
Query 12 GAGGAGCCTTTCCTTATTGGCCAAAGCCGTGGATCCCAGACACCCCAATATGATGACAGATGTGGTTAAACTTC 85
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAGGAGCCTTTCCTTATTGGCCAAAGCCGTGGATCCCAGACACCCCAATATGATGACAGATGTGGTTAAACTTC 1036
Query 86 TCTCTGCGGTATGCATTGTAGGGGAAGAAAGCATCCTTGAAGAAGTTTTAGAAGCTTTAACTTCAGCTGGTGAA 159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCTCTGCGGTATGCATTGTAGGGGAAGAAAGCATCCTTGAAGAAGTTTTAGAAGCTTTAACTTCAGCTGGTGAA 1110
Query 160 GAAAAAAAAATTGACAGATTTTTTTGTATTGTGGAAGGCCTCCGGCACAATTCAGTTCAACTGCAAGTAGCTTG 233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAAAAAAAAATTGACAGATTTTTTTGTATTGTGGAAGGCCTCCGGCACAATTCAGTTCAACTGCAAGTAGCTTG 1184
Query 234 TATGCAGCTCATCAATGCCCTGGTTACATCTCCTGATGATTTGGATTTCAGGCTTCACATCAGAAATGAATTTA 307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TATGCAGCTCATCAATGCCCTGGTTACATCTCCTGATGATTTGGATTTCAGGCTTCACATCAGAAATGAATTTA 1258
Query 308 TGCGTTGTGGATTGAAAGAGATATTGCCAAATTTAAAATGCATTAAGAATGATGGCCTGGATATCCAACTTAAA 381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGCGTTGTGGATTGAAAGAGATATTGCCAAATTTAAAATGCATTAAGAATGATGGCCTGGATATCCAACTTAAA 1332
Query 382 GTCTTTGATGAGCATAAAGAAGAAGATTTGTTTGAGTTATCCCATCGCCTTGAAGATATTAGAGCTGAACTTGA 455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTCTTTGATGAGCATAAAGAAGAAGATTTGTTTGAGTTATCCCATCGCCTTGAAGATATTAGAGCTGAACTTGA 1406
Query 456 TGAAGCATATGATGTTTACAACATGGTGTGGAGCACAGTTAAAGAAACTAGAGCAGAGGGATATTTTATTTCTA 529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAAGCATATGATGTTTACAACATGGTGTGGAGCACAGTTAAAGAAACTAGAGCAGAGGGATATTTTATTTCTA 1480
Query 530 TTCTTCAGCATCTTTTGCTGATTCGAAATGATTATTTTATAAGGCAACAATACTTCAAATTAATTGATGAGTGT 603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTCTTCAGCATCTTTTGCTGATTCGAAATGATTATTTTATAAGGCAACAATACTTCAAATTAATTGATGAGTGT 1554
Query 604 GTATCCCAGATTGTATTGCATAGAGATGGAATGGATCCAGACTTCACATATCGAAAAAGACTAGATTTAGATTT 677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTATCCCAGATTGTATTGCATAGAGATGGAATGGATCCAGACTTCACATATCGAAAAAGACTAGATTTAGATTT 1628
Query 678 AACCCAGTTTGTAGACATTTGCATAGATCAAGCAAAACTAGAAGAGTTTGAAGAGAAAGCATCAGAACTTTACA 751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AACCCAGTTTGTAGACATTTGCATAGATCAAGCAAAACTAGAAGAGTTTGAAGAGAAAGCATCAGAACTTTACA 1702
Query 752 AGAAATTTGAAAAAGAGTTTACCGACCACCAAGAAACTCAGGCTGAATTGCAGAAAAAAGAGGCAAAGATTAAT 825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGAAATTTGAAAAAGAGTTTACCGACCACCAAGAAACTCAGGCTGAATTGCAGAAAAAAGAGGCAAAGATTAAT 1776
Query 826 GAGCTTCAAGCAGAGCTACAAGCTTTTAAGTCTCAGTTTGGTGCCTTGCCAGCTGATTGTAATATTCCTTTGCC 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAGCTTCAAGCAGAGCTACAAGCTTTTAAGTCTCAGTTTGGTGCCTTGCCAGCTGATTGTAATATTCCTTTGCC 1850
Query 900 TCCCTCTAAAGAAGGTGGAACTGGCCACTCAGCACTTCCTCCTCCGCCTCCACTGCCTTCTGGTGGAGGGGTGC 973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TCCCTCTAAAGAAGGTGGAACTGGCCACTCAGCACTTCCTCCTCCGCCTCCACTGCCTTCTGGTGGAGGGGTGC 1924
Query 974 CGCCTCCACCTCCTCCCCCACCACCTCCTCCACTTCCAGGAATGCGGATGCCATTCAGTGGTCCTGTGCCTCCA 1047
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CGCCTCCACCTCCTCCCCCACCACCTCCTCCACTTCCAGGAATGCGGATGCCATTCAGTGGTCCTGTGCCTCCA 1998
Query 1048 CCACCTCCCCTGGGATTCCTTGGAGGACAAAATTCTCCTCCTCTACCAATCCTGCCATTTGGGTTGAAACCAAA 1121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCACCTCCCCTGGGATTCCTTGGAGGACAAAATTCTCCTCCTCTACCAATCCTGCCATTTGGGTTGAAACCAAA 2072
Query 1122 GAAAGAATTTAAACCTGAAATCAGCATGAGAAGATTGAATTGGTTAAAGATCAGACCTCATGAAATGACTGAAA 1195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GAAAGAATTTAAACCTGAAATCAGCATGAGAAGATTGAATTGGTTAAAGATCAGACCTCATGAAATGACTGAAA 2146
Query 1196 ACTGTTTCTGGATAAAAGTAAATGAAAATAAGTATGAAAACGTGGATTTGCTTTGTAAACTTGAGAATACATTT 1269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ACTGTTTCTGGATAAAAGTAAATGAAAATAAGTATGAAAACGTGGATTTGCTTTGTAAACTTGAGAATACATTT 2220
Query 1270 TGTTGCCAACAAAAAGAGAGAAGAGAAGAGGAAGATATTGAAGAGAAGAAATCGATTAAGAAAAAAATTAAAGA 1343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TGTTGCCAACAAAAAGAGAGAAGAGAAGAGGAAGATATTGAAGAGAAGAAATCGATTAAGAAAAAAATTAAAGA 2294
Query 1344 ACTTAAGTTTTTAGATTCTAAAATTGCCCAGAACCTTTCAATCTTCCTGAGCTCTTTTCGGGTGCCATATGAGG 1417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ACTTAAGTTTTTAGATTCTAAAATTGCCCAGAACCTTTCAATCTTCCTGAGCTCTTTTCGGGTGCCATATGAGG 2368
Query 1418 AAATCAGAATGATGATATTGGAAGTAGATGAAACACGGTTGGCAGAGTCTATGATTC----------------- 1474
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AAATCAGAATGATGATATTGGAAGTAGATGAAACACGGTTGGCAGAGTCTATGATTCAGTTAACCAAGTTTTTG 2442
Query 1475 -----AGAACTTAATAAAGCATCTTCCTGATCAAGAGCAATTAAATTCATTGTCTCAGTTCAAGAGTGAATATA 1543
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TCCAAAGAACTTAATAAAGCATCTTCCTGATCAAGAGCAATTAAATTCATTGTCTCAGTTCAAGAGTGAATATA 2516
Query 1544 GCAACTTATGTGAACCTGAGCAGTTTGTGGTTGTGATGAGCAATGTGAAGAGACTACGGCCACGGCTCAGTGCT 1617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GCAACTTATGTGAACCTGAGCAGTTTGTGGTTGTGATGAGCAATGTGAAGAGACTACGGCCACGGCTCAGTGCT 2590
Query 1618 ATTCTCTTTAAGCTTCAGTTTGAAGAGCAGGTGAACAACATCAAACCTGACATCATGGCTGTCAGTACTGCCTG 1691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 ATTCTCTTTAAGCTTCAGTTTGAAGAGCAGGTGAACAACATCAAACCTGACATCATGGCTGTCAGTACTGCCTG 2664
Query 1692 CGAAGAGATAAAGAAGAGCAAAAGCTTTAGCAAGTTGCTGGAACTTGTATTGCTAATGGGAAACTACATGAATG 1765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CGAAGAGATAAAGAAGAGCAAAAGCTTTAGCAAGTTGCTGGAACTTGTATTGCTAATGGGAAACTACATGAATG 2738
Query 1766 CTGGCTCCCGGAATGCTCAAACCTTCGGATTTAACCTTAGCTCTCTCTGTAAACTAAAGGACACAAAATCAGCA 1839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CTGGCTCCCGGAATGCTCAAACCTTCGGATTTAACCTTAGCTCTCTCTGTAAACTAAAGGACACAAAATCAGCA 2812
Query 1840 GATCAGAAAACAACGCTACTTCATTTCCTGGTAGAAATATGTGAAGAGAAGTACCCTGATATACTGAATTTTGT 1913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GATCAGAAAACAACGCTACTTCATTTCCTGGTAGAAATATGTGAAGAGAAGTACCCTGATATACTGAATTTTGT 2886
Query 1914 GGATGATTTGGAACCTTTAGACAAAGCTAGTAAAGTCTCTGTAGAAACGCTGGAAAAGAATTTGAGGCAGATGG 1987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GGATGATTTGGAACCTTTAGACAAAGCTAGTAAAGTCTCTGTAGAAACGCTGGAAAAGAATTTGAGGCAGATGG 2960
Query 1988 GAAGGCAGCTTCAACAGCTTGAGAAGGAATTGGAAACCTTTCCCCCTCCTGAGGACTTGCATGACAAGTTTGTG 2061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GAAGGCAGCTTCAACAGCTTGAGAAGGAATTGGAAACCTTTCCCCCTCCTGAGGACTTGCATGACAAGTTTGTG 3034
Query 2062 ACAAAGATGTCCAGATTTGTTATCAGTGCAAAAGAACAATATGAGACACTTTCGAAGTTACACGAAAACATGGA 2135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 ACAAAGATGTCCAGATTTGTTATCAGTGCAAAAGAACAATATGAGACACTTTCGAAGTTACACGAAAACATGGA 3108
Query 2136 AAAGTTATACCAGAGTATAATAGGATACTATGCCATTGATGTGAAGAAGGTGTCTGTGGAAGACTTTCTTACTG 2209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 AAAGTTATACCAGAGTATAATAGGATACTATGCCATTGATGTGAAGAAGGTGTCTGTGGAAGACTTTCTTACTG 3182
Query 2210 ACCTGAATAACTTCAGAACCACATTCATGCAAGCAATAAAGGAGAATATCAAAAAAAGAGAAGCAGAGGAAAAA 2283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 ACCTGAATAACTTCAGAACCACATTCATGCAAGCAATAAAGGAGAATATCAAAAAAAGAGAAGCAGAGGAAAAA 3256
Query 2284 GAAAAACGTGTCAGAATAGCTAAAGAATTAGCAGAGCGAGAAAGACTCGAACGCCAACAAAAGAAAAAGCGTTT 2357
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 GAAAAACGTGTCAGAATAGCTAAAGAATTAGCAGAGCGAGAAAGACTCGAACGCCAA----------------- 3313
Query 2358 ATTAGAAATGAAGACTGAGGGTGATGAGACAGGAGTGATGGATAATCTGCTGGAGGCCTTGCAGTCCGGGGCTG 2431
Sbjct 3314 -------------------------------------------------------------------------- 3313
Query 2432 CCTTCCGCGACAGAAGAAAAAGGACACCGATGCCAAAAGATGTTCGGCAGAGTCTCAGTCCAATGTCTCAGAGG 2505
Sbjct 3314 -------------------------------------------------------------------------- 3313
Query 2506 CCTGTTCTGAAAGTTTGTAACCATGGTAATAAACCGTATTTA 2547
Sbjct 3314 ------------------------------------------ 3313
