Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491739
• Subject: NM_011074.3
• Aligned Length: 1420
• Identities: 1217
• Gaps: 80

Alignment

Query    1  ------------------------------------AT--GCACG--------GTT-------ACTTTG-----  16
                                                ||  |||.|        |||       ||||||     
Sbjct    1  ATGTGCGACCTCATTGAACCGCAGCCGGCCGAGAAGATCGGCAAGATGAAGAAGTTGAGGAGAACTTTGTCCGA  74

Query   17  --------GCTGCAATGCTGCTGCAGAGCCCGGTTACTCTGCCTTCG-TGGGAACTCCACAGATATGTGTCACA  81
                    ||.|||..||| |||.|||....||  ||.|..||||.| ||          ||||||||||||||
Sbjct   75  GAGTTTCAGCCGCATCGCT-CTGAAGAAAGAGG--ACACCACCTTTGATG----------AGATATGTGTCACA  135

Query   82  AAGATGTCTACACGGAACTGCCAGGGAATGGACTCAGTGATCAAACCCCTGGACACAATTCCTGAGGATAAAAA  155
            |||||||||||.||||||||||||||.|..||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  136  AAGATGTCTACCCGGAACTGCCAGGGGACAGATTCAGTGATCAAGCACCTGGACACAATTCCTGAAGACAAGAA  209

Query  156  AGTCAGAGTTCAGAGGACACAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCTAATCAAGTAAAGAGGGTGCATT  229
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  210  AGTCAGGGTTCAGAGGACGCAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCCAACCAAGTCAAAAGGGTCCATT  283

Query  230  CTGAGAACAATGCTTGCATTAACTTTAAGACCTCCTCCACTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTAGGCGGCACTCC  303
            |||||||||||||.||||||||||||||..|||||||..|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  284  CTGAGAACAATGCATGCATTAACTTTAAATCCTCCTCTGCTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTCGGCGGCACTCC  357

Query  304  AGCCCCAGCTCGCCAACAAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATATGAAAAGCTGGAAAAACTAGGGGAAGG  377
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  358  AGCCCCAGCTCGCCAACGAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATACGAAAAACTGGAAAAACTGGGGGAAGG  431

Query  378  ATCTTATGCTACAGTATACAAAGGGAAAAGCAAGGTAAATGGGAAGTTGGTAGCTCTGAAGGTGATCAGGCTGC  451
            |||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||.|||||||||.||||||
Sbjct  432  ATCTTATGCAACAGTGTACAAAGGGAAAAGCAAAGTGAATGGGAAGCTGGTGGCTCTAAAGGTGATCCGGCTGC  505

Query  452  AGGAAGAAGAAGGGACACCTTTCACAGCTATCAGGGAAGCTTCTCTTTTAAAAGGACTAAAACATGCTAACATA  525
            ||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct  506  AGGAAGAAGAGGGCACACCTTTCACAGCCATCAGGGAAGCTTCCCTGTTGAAAGGACTAAAGCACGCCAACATC  579

Query  526  GTGCTACTTCATGACATCATCCATACCAAGGAGACGCTGACACTTGTGTTTGAATATGTGCACACTGATTTATG  599
            |||.|.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  580  GTGTTGCTTCACGACATCATCCACACTAAGGAAACCCTGACCCTTGTCTTTGAATACGTGCACACTGATTTATG  653

Query  600  TCAGTACATGGACAAGCACCCTGGGGGGCTGCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCAGTTGCTGCGAG  673
            ||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  654  TCAGTACATGGACAAGCACCCTGGAGGACTCCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCAGCTGCTGCGAG  727

Query  674  GTCTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCACAGAACCTTCTGATCAGTGACACG  747
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct  728  GACTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCGCAGAACCTTCTCATCAGCGATACG  801

Query  748  GGGGAGTTAAAGCTGGCAGATTTCGGTCTTGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATACTCCAACGAAGT  821
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  802  GGGGAGTTGAAGCTGGCAGATTTCGGTCTGGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATACTCCAATGAAGT  875

Query  822  GGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTCCTTCTAGGCTCAACAGAATATTCCACCTGCCTTGACATGTGGG  895
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  GGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTTCTTCTGGGCTCTACAGAATATTCCACCTGCCTTGACATGTGGG  949

Query  896  GAGTAGGTTGCATCTTTGTTGAAATGATCCAAGGAGTTGCTGCTTTTCCAGGAATGAAAGACATTCAGGATCAA  969
            ||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  GAGTTGGCTGTATCTTCGTTGAGATGATCCAAGGAGTTGCTGCGTTTCCAGGAATGAAAGACATTCAGGATCAA  1023

Query  970  CTTGAACGAATATTTCTGGTTCTTGGAACACCAAATGAGGACACATGGCCTGGAGTTCATTCTTTACCACATTT  1043
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  CTTGAACGGATATTTCTGGTTCTTGGAACACCGAATGAGGACACGTGGCCTGGAGTTCATTCTTTACCACATTT  1097

Query 1044  TAAGCCAGAACGCTTTACCCTGTACAGCTCTAAAAACCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAGCTATGTGAACC  1117
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1098  TAAGCCAGAACGCTTTACCGTGTACAGCTCTAAAAGCCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAGCTATGTAAATC  1171

Query 1118  ATGCAGAGGACCTGGCCTCCAAGCTCCTACAATGTTCCCCAAAGAACAGACTGTCGGCACAGGCTGCCTTGAGC  1191
            ||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1172  ATGCTGAAGACTTGGCCTCCAAGCTTCTCCAGTGTTCCCCAAAGAACAGGCTATCAGCACAGGCCGCCTTGAGC  1245

Query 1192  CACGAGTATTTTAGTGACCTGCCGCCACGGCTATGGGAACTCACCGACATGTCTTCTATTTTTACTGTCCCAAA  1265
            ||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1246  CATGAGTATTTCAGCGATCTGCCTCCACGGCTATGGGAGCTGACTGATATGTCTTCTATTTTTACCGTCCCAAA  1319

Query 1266  TGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAAAGCATGCGGGCCTTTGGGAAAAACAATAGTTATGGCAAAAGTCTAT  1339
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1320  TGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAGAGCATGAGGGCCTTTGGAAAAAACAATAGTTATGGGAAAAGCCTAT  1393

Query 1340  CAAACAGCAAGCAC  1353
            |.||||||||.|||
Sbjct 1394  CGAACAGCAAACAC  1407