Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000491746
Subject:
XM_006512595.3
Aligned Length:
684
Identities:
435
Gaps:
191

Alignment

Query   1  ATGGCCTGGAAATCCGGCGGCGCCAGCCACTCGGAGCTAATCCACAATCTCCGCAAAAATGGAATCATCAAGAC  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  AGATAAAGTATTTGAAGTGATGCTGGCTACAGACCGCTCCCACTATGCAAAATGTAACCCATACATGGATTCTC  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  CACAATCAATAGGTTTCCAAGCAACAATCAGTGCTCCACACATGCATGCATATGCGCTAGAACTTCTATTTGAT  222
                                                    |||||.||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct   1  -----------------------------------------ATGCACGCATATGCACTAGAACTTCTGTTTGAC  33

Query 223  CAGTTGCATGAAGGAGCTAAAGCTCTTGATGTAGGATCTGGAAGTGGAATCCTTACTGCATGTTTTGCACGTAT  296
           |||.||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct  34  CAGCTGCATGAAGGTGCTAAAGCCCTGGACGTGGGCTCTGGAAGTGGAATCCTCACCGCCTGTTTTGCACGGAT  107

Query 297  GGTTGGATGTACTGGAAAAGTCATAGGAATTGATCACATTAAAGAGCTAGTAGATGACTCAATAAATAATGTCA  370
           |||||||..||.||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 108  GGTTGGAAATAGTGGAAAAGTCATTGGAATTGATCACATTAAAGAACTAGTAGATGACTCAATAACTAATGTCA  181

Query 371  GGAAGGACGATCCAACACTTCTGTCTTCAGGGAGAGTACAGCTTGTTGTGGGGGATGGAAGAATGGGATATGCT  444
           ..|||||.||.||||..||.|||||.||.|||.||||.|.|||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 182  AAAAGGATGACCCAATGCTCCTGTCCTCGGGGCGAGTGCGGCTGGTGGTGGGTGATGGAAGAATGGGATACGCT  255

Query 445  GAAGAAGCCCCTTATGATGCCATTCATGTGGGAGCTGCAGCCCCTGTTGTACCACAGGCGCTAATAGATCAGTT  518
           ||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|||||||.|||||
Sbjct 256  GAAGAAGCCCCTTACGACGCTATTCATGTGGGAGCTGCAGCCCCAGTTGTGCCCCAGGCATTAATAGACCAGTT  329

Query 519  AAAGCCCGGAGGAAGATTGATATTGCCTGTTGGTCCTGCAGGCGGAAACCAAATGTTGGAGCAGTATGACAAGC  592
           ||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330  AAAGCCTGGTGGAAGATTGATATTGCCAGTCGGTCCTGCAGGAGGAAACCAAATGTTGGAGCAGTATGACAAGC  403

Query 593  TACAAGATGGCAGCATCAAAATGAAGCCTCTGATGGGGGTGATATACGTGCCTTTAACAGATAAAGAAAAGCAG  666
           |||||||||||||..||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404  TACAAGATGGCAGTGTCAAAATGAAACCTCTCATGGGGGTGATATACGTGCCTTTAACAGATAAAGAAAAGCAG  477

Query 667  TGGTCCAGG--TGGAAGG  682
           |||||||||  ||.|..|
Sbjct 478  TGGTCCAGGGATGAACTG  495