Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491750
- Subject:
- NM_001316313.2
- Aligned Length:
- 2940
- Identities:
- 2675
- Gaps:
- 264
Alignment
Query 1 ATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTTCCGACCGAGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTTCCGACCGAGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACC 74
Query 75 CGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGTGCTGGCCCTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGTGCTGGCCCTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGC 148
Query 149 CGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGGAGGGGCCGGACGCGGGCACCGAAGAGCAGGGTCCCGGGCCGCCGCAGCTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGGAGGGGCCGGACGCGGGCACCGAAGAGCAGGGTCCCGGGCCGCCGCAGCTA 222
Query 223 CTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTGGGCTCCGGGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGGTGCGGCG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTGGGCTCCGGGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGGTGCGGCG 296
Query 297 GCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTCGCTGGGGCCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGGCCGCTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTCGCTGGGGCCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGGCCGCTGC 370
Query 371 TGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGACCGCGGGTGCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCAAGGGCTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGACCGCGGGTGCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCAAGGGCTG 444
Query 445 CTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTCCGCGGGCGGGCCAGACTGTGTCCAGAGTCTGGGGACAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTCCGCGGGCGGGCCAGACTGTGTCCAGAGTCTGGGGACAG 518
Query 519 CAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTTTGCGGTTTCTGGCACAGTGCGGCGACTCCAGGGAGTTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTTTGCGGTTTCTGGCACAGTGCGGCGACTCCAGGGAGTTC 592
Query 593 TGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGAGCTGTCTCCGTGGCCTTGGCCTCTTCCAGGGCGAATGG 666
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGG------------------------------------------------- 617
Query 667 GTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACTTCACAGCCGCACTTGGCTAGGGTGCAGGTCCTAGAACC 740
Sbjct 618 -------------------------------------------------------------------------- 617
Query 741 TCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTCTGGACCGCTGGGAGAGCCCCTCGCTGACGGACTGGCGC 814
Sbjct 618 -------------------------------------------------------------------------- 617
Query 815 TTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTGACCCCCTGGAAATGGGAGAGCTCAGAATTCAGAGGTAC 888
|||||||
Sbjct 618 -------------------------------------------------------------------GAGGTAC 624
Query 889 TTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGCTGCTCATTGCTGCCTGGGCCTCCATTTGCCAGAGAGTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 625 TTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGCTGCTCATTGCTGCCTGGGCCTCCATTTGCCAGAGAGTT 698
Query 963 ACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCACTAATGGAAATTATGACGGTGTTCTTTACCGGCACTTTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 699 ACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCACTAATGGAAATTATGACGGTGTTCTTTACCGGCACTTTC 772
Query 1037 AGATACCCAGGGTAGTCCAGGAAGGGGATGTTCTATGTGTGCCAACAATTGGGCAAGTAGAGATCCTGGAAGGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 AGATACCCAGGGTAGTCCAGGAAGGGGATGTTCTATGTGTGCCAACAATTGGGCAAGTAGAGATCCTGGAAGGA 846
Query 1111 AGTCCAGAGAAACTGCCCAGGTGGCGGGAAATGTTTTTTAAAGTGAAGAAAACAGTTGGGGAAGCTCCAGATGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 847 AGTCCAGAGAAACTGCCCAGGTGGCGGGAAATGTTTTTTAAAGTGAAGAAAACAGTTGGGGAAGCTCCAGATGG 920
Query 1185 ACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATACCTCCTTGTACATGGTGGGTTCTACCCTGAGCCCTGTTC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 921 ACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATACCTCCTTGTACATGGTGGGTTCTACCCTGAGCCCTGTTC 994
Query 1259 CATGGCTCCCTTCAGAGGAATCCACTCTCTGGAGCAGTTTGTCTCCTCCAGGCCTGGAGGCCTTGGTGTCTGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 CATGGCTCCCTTCAGAGGAATCCACTCTCTGGAGCAGTTTGTCTCCTCCAGGCCTGGAGGCCTTGGTGTCTGAA 1068
Query 1333 CTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGGGGTGCCCTGCTGACAGGAACTAGCAGTGTCCTTCTACG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069 CTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGGGGTGCCCTGCTGACAGGAACTAGCAGTGTCCTTCTACG 1142
Query 1407 GGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGCTGCTGCCTGTAGTCACCTTGGGCTCCACTTACTGAAGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143 GGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGCTGCTGCCTGTAGTCACCTTGGGCTCCACTTACTGAAGG 1216
Query 1481 TGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGGCTGTGGAGACAAAACTGCAGGCCATCTTCTCCCGGGCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1217 TGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGGCTGTGGAGACAAAACTGCAGGCCATCTTCTCCCGGGCC 1290
Query 1555 CGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCTGTGGACCTTCTGGGCCGGGACCGTGATGGGCTGGGTGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1291 CGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCTGTGGACCTTCTGGGCCGGGACCGTGATGGGCTGGGTGA 1364
Query 1629 GGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCTCCTCAATGAGGACCCCCTCAACAGCTGCCCTCCCCTCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1365 GGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCTCCTCAATGAGGACCCCCTCAACAGCTGCCCTCCCCTCA 1438
Query 1703 TGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGCCTGCTGATGTGCAGACAGCATTTCCTCATGAGCTCGAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 TGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGCCTGCTGATGTGCAGACAGCATTTCCTCATGAGCTCGAG 1512
Query 1777 GTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATCCTGCGGGCCCTCACTGCCCACCTTCCCCTGGGCCAGGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1513 GTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATCCTGCGGGCCCTCACTGCCCACCTTCCCCTGGGCCAGGA 1586
Query 1851 GGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGGCTTTGTGGTAGGGGATCTCTATGCCCTTCTGACCCACA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1587 GGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGGCTTTGTGGTAGGGGATCTCTATGCCCTTCTGACCCACA 1660
Query 1925 GCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGAACTCAGGTTTGGCAGGTGGCTTGACTGAGGAGGATGAGGGGGAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1661 GCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGAACTCAGGTTTGGCAGGTGGCTTGACTGAGGAGGATGAGGGGGAG 1734
Query 1999 CTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGACTTTGGGCAGGCACTGGAGCAACTGCAGACAGCTCACTC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 CTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGACTTTGGGCAGGCACTGGAGCAACTGCAGACAGCTCACTC 1808
Query 2073 CCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTCCTGGCATGATGTGGGTGGGCTGCAGGAGGTGAAGAAGG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1809 CCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTCCTGGCATGATGTGGGTGGGCTGCAGGAGGTGAAGAAGG 1882
Query 2147 AGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACCCTGAGCTACTGAGCCTGGGCCTGAGACGCTCAGGCCTT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1883 AGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACCCTGAGCTACTGAGCCTGGGCCTGAGACGCTCAGGCCTT 1956
Query 2221 CTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTTCTGGCCAAGGCAGTAGCCACTGAGTGCAGCCTTACCTT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1957 CTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTTCTGGCCAAGGCAGTAGCCACTGAGTGCAGCCTTACCTT 2030
Query 2295 CCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTATGTGGGCCAAAGTGAGGAGAATGTGCGGGAAGTATTTG 2368
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2031 CCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTATGTGGGCCAAAGTGAGGAGAATGTGCGGGAAGTGTTTG 2104
Query 2369 CCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCTTTGATGAACTGGACTCTTTGGCCCCAAGCCGGGGGCGA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2105 CCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCTTTGATGAACTGGACTCTTTGGCCCCAAGCCGGGGGCGA 2178
Query 2443 AGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTGTCTCAGCTCCTTGCCGAGCTAGATGGGCTGCACAGCAC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2179 AGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTGTCTCAGCTCCTTGCCGAGCTAGATGGGCTGCACAGCAC 2252
Query 2517 TCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACCAGATCTCCTGGACCCTGCCCTTCTGCGGCCTGGCAGAT 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 TCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACCAGATCTCCTGGACCCTGCCCTTCTGCGGCCTGGCAGAT 2326
Query 2591 TTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACCGGGCCTCCCAGCTACGCGTTCTAAGTGCCATCACACGC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2327 TTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACCGGGCCTCCCAGCTACGCGTTCTAAGTGCCATCACACGC 2400
Query 2665 AAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAACGTGCTAGATTGCTGCCCTCCCCAGCTGACGGGCGCGGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 AAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAACGTGCTAGATTGCTGCCCTCCCCAGCTGACGGGCGCGGA 2474
Query 2739 CCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGCCCTCAAACGCAGGGTTCATGACCTGGAGGAAGGGCTGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2475 CCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGCCCTCAAACGCAGGGTTCATGACCTGGAGGAAGGGCTGG 2548
Query 2813 AGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGGACTTGCTGCAGGCTGCCGCCCGGCTGCAACCCTCAGTC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2549 AGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGGACTTGCTGCAGGCTGCCGCCCGGCTGCAACCCTCAGTC 2622
Query 2887 AGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAGCGCAAGTTTGCTGCCTGC 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2623 AGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAGCGCAAGTTTGCTGCCTGC 2676