Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491750
- Subject:
- NM_145488.1
- Aligned Length:
- 2958
- Identities:
- 2503
- Gaps:
- 33
Alignment
Query 1 ATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTTCCGACCGAGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACC 74
||||||.||||||||.||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||.||||.||
Sbjct 1 ATGGCGTTGGCTGTCCTGCGCGTCCTGGACCCCTTCCCGACGGAGACACCACCGTTGGCGGTGCTGTTGCCTCC 74
Query 75 CGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGTGCTGGCCCTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGC 148
|||||||||||||||.|||.|||.||||||.|||||||||||.|||.||||.||..|.|||||.||.||...||
Sbjct 75 CGGGGGCCCGTGGCCAGCGACGGGGCTGGGGCTGGTGCTGGCACTGCGGCCGGCGAGCGAGAGTCCCGCGAAGC 148
Query 149 CGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGG-AGGGGCCGGACGC---GGGCACCGAAGAGCAG---GGTCCCGGGCCGCC 215
|.||||||||.|||||.|||.||| ||||.|||| ||| |||| |||||| ||.||.|||||.||
Sbjct 149 CCGCGCTGCTCGTGGCGGCCGTGGAAGGGTCCGG-CGCCCAGGGC------GAGCAGCGCGGGCCGGGGCCTCC 215
Query 216 GCAGCTACTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTGGGCTCCGGGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGG 289
||.|||.|||||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||..|||||||..|.||.||.||||||...|
Sbjct 216 GCCGCTGCTGGTGAGCCGCGCGCTGCTGCGGGTCCTAGCGCTGGGGCCCGGGGCGCGAGTACGAGCGCGGCTTG 289
Query 290 TGCGGCGGCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTCGCTGGGGCCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGG 363
|||||||.||||||||.||.||.|||||..||||||.|||..|.|.|||.||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct 290 TGCGGCGTCCCCCGGCCCTGGGCTGGGCGTTGCTTGCCACGGCTCCGGGACCCGGGCTAGGGCCTCGAGTCGGG 363
Query 364 CCGCTGCTGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGACCGCGGGTGCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCA 437
||||||.|||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||.||||.|||.||||||||||.|||||..||||
Sbjct 364 CCGCTGTTGGTGCGCCGCGGGGAGACCCTCCCCGTGCCCGGATCGCGAGTGTTGGAGACGCGACCGGCCCTGCA 437
Query 438 AGGGCTGCTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTCCGCGGGCGGGCCAGACTGTGTCC---AGAGT 508
.|||.||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||| |.|| |||||
Sbjct 438 GGGGTTGCTGGGCCCGGGGACACGGCTGGCCGTGACTGAGCTCCGCGGGCGGGCCAAACTG-GGCCAGGAGAGT 510
Query 509 CTGGGGA-CAGCAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTTTGCGGTTTCTGGCACAGTGCGGCGACT 581
| |||| || |||.|..|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|.|||...|.|.||.||||||||
Sbjct 511 C--GGGATCA-CAGCCATCCCCCGCCCCCGCCCGTAGTGTCGTCCTTTGCAGCTTCCCACTCGGTCCGGCGACT 581
Query 582 CC-AGGGAGTTCTGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGAGCTGTCTCCGTGGCCTTGGCCTCTTC 654
|| |||| |||||||||||||||||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||..|.||.||.||||||
Sbjct 582 CCGAGGG-GTTCTGGGAGGGACTGGAGATGCGCTGGGTGTGAGCCGGAGCTGTCTCCGGAGTCTCGGACTCTTC 654
Query 655 CAGGGCGAATGGGTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACTTCACAGCCGCACTTGGCTAGGGTGCA 728
||||||||||||||.|||||||||||||.|..|||||.|.|.|||.|.||.|||||||.|||||||...||.||
Sbjct 655 CAGGGCGAATGGGTCTGGGTGGCCCAGGTCGCAGAGTTACCCAACTCCTCGCAGCCGCGCTTGGCTCAAGTCCA 728
Query 729 GGTCCTAGAACCTCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTCTGG---ACCGCTGGGAGAGCCCCTCG 799
|||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||..|||.|| .|.||.|||||||||.||||
Sbjct 729 GGTTCTAGAACCGCGCTGGGAGCTGTCTGAGAGACTGGGACCCAACTCCGGGCAGCAGCCGGGAGAGCCACTCG 802
Query 800 CTGACGGACTGGCGCTTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTGACCCCCTGGAAATGGGAGAGCTC 873
||||||||||||.|.||.|.||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 803 CTGACGGACTGGTGTTTCTGCCCGCCACTCTGGCTTTTAATCTCGGCTGTGACCCCCTGGAAGTGGGAGAGCTC 876
Query 874 AGAATTCAGAGGTACTTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGCTGCTCATTGCTGCCTGGGCCTCC 947
||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|||...|||||.||||||||
Sbjct 877 AGAATTCAGAGGTATTTGGAAGGCTCCATCGCCCCAGAGAACAAAGGAAGCTGTTCACCACTGCCCGGGCCTCC 950
Query 948 ATTTGCCAGAGAGTTACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCACTAATGGAAATTATGACGGTGTTC 1021
.|||||..|||||||||||||.||.|||.||||.||.||.||||||||..|||||||||||||||||..|||.|
Sbjct 951 GTTTGCTCGAGAGTTACACATTGAGATTCTGTCCTCGCCTCACTACAGTGCTAATGGAAATTATGACCATGTCC 1024
Query 1022 TTTACCGGCACTTTCAGATACCCAGGGTAGTCCAGGAAGGGGATGTTCTATGTGTGCCAACAATTGGGCAAGTA 1095
|.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||.|||||..|||||||||.
Sbjct 1025 TGTACCGGCACTTTCAGACACCCAGGGTGGTCCAGGAAGGGGATGTGTTGTGTGTGTCAACAGCTGGGCAAGTT 1098
Query 1096 GAGATCCTGGAAGGAAGTCCAGAGAAACTGCCCAGGTGGCGGGAAATGTTTTTTAAAGTGAAGAAAACAGTTGG 1169
|||||||||||||||||.|..||||.||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1099 GAGATCCTGGAAGGAAGCCTGGAGAGACTGCCCAGGTGGCGGGAGATGTTTTTCAAAGTGAAGAAAACGGTTGG 1172
Query 1170 GGAAGCTCCAGATGGACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATACCTCCTTGTACATGGTGGGTTCTA 1243
.|||||.|||||.||.|||||||||||||...||||.||.||||||||.|||||.||.|||.|||..||..|..
Sbjct 1173 AGAAGCCCCAGAGGGGCCAGCCAGTGCCTTTCTGGCTGATACCACCCACACCTCTTTATACCTGGCTGGCACCG 1246
Query 1244 CCCTGAGCCCTGTTCCATGGCTCCCTTCAGAGGAA--TCCACTCTCTGGAGCAGTTTGTCTCCTCCAGGCCTGG 1315
|||||||.|.|||.||||.|||.||||| ||||| |||.|.|.||||..|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1247 CCCTGAGTCATGTGCCATCGCTGCCTTC--AGGAAGGTCCCCACCCTGGGACAGCTTGTCTCCTCCAGGCCTGG 1318
Query 1316 AGGCCTTGGTGTCTGAACTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGGGGTGCCCTGCTGACAGGAACT 1389
||||||||||...|||.||.||||||.||||||||||||.|||.|||||.||.||..|..||||.||||||||.
Sbjct 1319 AGGCCTTGGTAAATGAGCTGTGTGCTATCCTGAAGCCTCACCTGCAGCCCGGAGGAACATTGCTCACAGGAACC 1392
Query 1390 AGCAGTGTCCTTCTACGGGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGCTGCTGCCTGTAGTCACCTTGG 1463
|||.||||.|||||.|.|||.|||||||||.|.|||||||||||||..||..|.|||||.||.||.|.||||||
Sbjct 1393 AGCTGTGTGCTTCTGCAGGGTCCCCCAGGCAGCGGGAAGACCACAGCCGTCACGGCTGCATGCAGCCGCCTTGG 1466
Query 1464 GCTCCACTTACTGAAGGTGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGGCTGTGGAGACAAAACTGCAGG 1537
||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1467 GCTCCATTTGCTGAAGGTGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGACAGCAGTAGGGCCGTGGAGACAAAGCTGCAGG 1540
Query 1538 CCATCTTCTCCCGGGCCCGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCTGTGGACCTTCTGGGCCGGGAC 1611
|||.||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||..||.|.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1541 CCACCTTCTCCCGGGCCCGCCGCTGCAGGCCTGCAGTCCTCCTGTTGACAGCTGTGGACCTCCTGGGCCGGGAC 1614
Query 1612 CGTGATGGGCTGGGTGAGGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCTCCTCAATGAGGACCCCCTCAA 1685
||.||.||.||||||||||||||||||||...|||....||.|||||.||||||||..||||||||.|.||||.
Sbjct 1615 CGAGACGGACTGGGTGAGGATGCCCGTGTTGCGGCCACACTCCGTCATCTCCTCCTTGATGAGGACGCTCTCAG 1688
Query 1686 CAGCTGCCCTCCCCTCATGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGCCTGCTGATGTGCAGACAGCAT 1759
|||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|.||||||||||||..|.|||||||||||.||||
Sbjct 1689 CAGGTGCCCTCCTCTCATGGTGGTGGCTACCACAAGCCGTGTCCAGGACCTGCCCACCGATGTGCAGACGGCAT 1762
Query 1760 TTCCTCATGAGCTCGAGGTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATCCTGCGGGCCCTCACTGCCCAC 1833
|||||||||||||.||||||||.|..|||||.||||..||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1763 TTCCTCATGAGCTAGAGGTGCCAGTGCTGTCTGAGGCTCAACGGCTCAGTATCCTGCAGGCCCTCACTGCCCAC 1836
Query 1834 CTTCCCCTGGGCCAGGAGGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGGCTTTGTGGTAGGGGATCTCTA 1907
||||||.|.|||||||||||.|||.||.|.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1837 CTTCCCTTAGGCCAGGAGGTTAACCTGCCCCAGCTGGCACGGCGCTGTGCGGGCTTTGTGGTGGGGGACCTCTA 1910
Query 1908 TGCCCTTCTGACCCACAGCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGA-ACTCAGGTTTGGCAGGTGGCTTGACT 1980
|||||||||||||||.|.|.||||||||||||||||||||||| ||| .|||.||.|.|||||||||.||||.|
Sbjct 1911 TGCCCTTCTGACCCATACCTGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATC-AGAGCCTCGGGCTCGGCAGGTGGTTTGAGT 1983
Query 1981 GAGGAGGATGAGGGGGAGCTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGACTTTGGGCAGGCACTGGAGCA 2054
|||||||||||||||||.|||||||..||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||.|.||.||
Sbjct 1984 GAGGAGGATGAGGGGGACCTGTGTGTGGCTGGCTTTCCTTTGCTGGCTGAGGACTTCGGGCAGGCATTAGATCA 2057
Query 2055 ACTGCAGACAGCTCACTCCCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTCCTGGCATGATGTGGGTGGGC 2128
|||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||.||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 2058 ACTGCAGACAGCTCACTCCCAAGCTGTGGGAGCACCCAGGATCCCTTCAGTGTCCTGGCACGACGTGGGCGGGC 2131
Query 2129 TGCAGGAGGTGAAGAAGGAGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACCCTGAGCTACTGAGCCTGGGC 2202
|||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2132 TGCAGGATGTGAAGAAGGAGATCCTAGAAACCATCCAGCTGCCTCTGGAACACCCTGAGCTGCTCAGCCTGGGC 2205
Query 2203 CTGAGACGCTCAGGCCTTCTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTTCTGGCCAAGGCAGTAGCCAC 2276
||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 2206 CTAAGACGATCAGGCCTTCTGCTCCATGGGCCCCCAGGCACTGGCAAGACCCTGCTGGCCAAGGCCGTAGCCAC 2279
Query 2277 TGAGTGCAGCCTTACCTTCCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTATGTGGGCCAAAGTGAGGAGA 2350
||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2280 TGAGTGCAGCCTCACCTTCCTCAGTGTAAAGGGACCGGAGCTCATCAACATGTATGTGGGCCAAAGCGAGGAGA 2353
Query 2351 ATGTGCGGGAAGTATTTGCCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCTTTGATGAACTGGACTCTTTG 2424
||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 2354 ATGTCCGGGAAGTGTTTGCCAGGGCCAGGGCTGCTGCTCCCTGTATCATCTTCTTTGATGAACTGGATTCCTTA 2427
Query 2425 GCCCCAAGCCGGGGGCGAAGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTGTCTCAGCTCCTTGCCGAGCT 2498
||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2428 GCTCCAAGCCGCGGACGGAGTGGAGATTCTGGAGGGGTGATGGACAGAGTTGTGTCTCAGCTCCTAGCCGAGCT 2501
Query 2499 AGATGGGCTGCACAGCACTCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACCAGATCTCCTGGACCCTGCCC 2572
.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2502 GGATGGGCTCCACAGCACCCAGGATGTGTTTGTGATCGGAGCCACCAACAGACCAGACCTCCTGGACCCTGCCC 2575
Query 2573 TTCTGCGGCCTGGCAGATTTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACCGGGCCTCCCAGCTACGCGTT 2646
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 2576 TTCTGCGGCCTGGCAGATTTGACAAGCTGGTGTTTGTAGGGGCGAGTGAGGACCGGGCCTCCCAGCTGCGTGTG 2649
Query 2647 CTAAGTGCCATCACACGCAAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAACGTGCTAGATTGCTGCCCTCC 2720
||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||.|.|||||||||||||.|||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2650 CTGAGCGCCATCACACGGAAGTTCAAGCTGGAGGCCTCTGTGAGCCTGGCAAACGTGCTGGATTGCTGCCCACC 2723
Query 2721 CCAGCTGACGGGCGCGGACCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGCCCTCAAACGCAGGGTTCATG 2794
|||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||...|||||||||||||||||||||..|
Sbjct 2724 CCAGCTGACTGGTGCAGATCTCTATTCTCTCTGCTCTGACGCCATGATGACTGCCCTCAAACGCAGGGTTCGAG 2797
Query 2795 ACCTGGAGGAAGGGCTGGAGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGGACTTGCTGCAGGCTGCCGCC 2868
||||.|||||||||||.||||...|.||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||.|||
Sbjct 2798 ACCTAGAGGAAGGGCTAGAGCTGCGGAGCTCAGCACTGCTGCTCACCATGGAGGACCTGTTGCAGGCTGCAGCC 2871
Query 2869 CGGCTGCAACCCTCAGTCAGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAGCGCAAGTTTGCTGCCTGC 2940
||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 2872 CGGCTGCAGCCCTCAGTCAGTGAGCAGGAGCTGTTGCGATACAAGCGCATCCAACGCAAGTTTGCCGCCTGC 2943