Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491750
- Subject:
- XM_011514661.2
- Aligned Length:
- 2940
- Identities:
- 2855
- Gaps:
- 84
Alignment
Query 1 ATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTTCCGACCGAGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTTCCGACCGAGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACC 74
Query 75 CGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGTGCTGGCCCTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGTGCTGGCCCTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGC 148
Query 149 CGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGGAGGGGCCGGACGCGGGCACCGAAGAGCAGGGTCCCGGGCCGCCGCAGCTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGGAGGGGCCGGACGCGGGCACCGAAGAGCAGGGTCCCGGGCCGCCGCAGCTA 222
Query 223 CTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTGGGCTCCGGGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGGTGCGGCG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTGGGCTCCGGGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGGTGCGGCG 296
Query 297 GCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTCGCTGGGGCCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGGCCGCTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTCGCTGGGGCCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGGCCGCTGC 370
Query 371 TGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGACCGCGGGTGCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCAAGGGCTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGACCGCGGGTGCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCAAGGGCTG 444
Query 445 CTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTCCGCGGGCGGGCCAGACTGTGTCCAGAGTCTGGGGACAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTCCGCGGGCGGGCCAGACTGTGTCCAGAGTCTGGGGACAG 518
Query 519 CAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTTTGCGGTTTCTGGCACAGTGCGGCGACTCCAGGGAGTTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTTTGCGGTTTCTGGCACAGTGCGGCGACTCCAGGGAGTTC 592
Query 593 TGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGAGCTGTCTCCGTGGCCTTGGCCTCTTCCAGGGCGAATGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGAGCTGTCTCCGTGGCCTTGGCCTCTTCCAGGGCGAATGG 666
Query 667 GTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACTTCACAGCCGCACTTGGCTAGGGTGCAGGTCCTAGAACC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACTTCACAGCCGCACTTGGCTAGGGTGCAGGTCCTAGAACC 740
Query 741 TCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTCTGGACCGCTGGGAGAGCCCCTCGCTGACGGACTGGCGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTCTGGACCGCTGGGAGAGCCCCTCGCTGACGGACTGGCGC 814
Query 815 TTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTGACCCCCTGGAAATGGGAGAGCTCAGAATTCAGAGGTAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTGACCCCCTGGAAATGGGAGAGCTCAGAATTCAGAGGTAC 888
Query 889 TTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGCTGCTCATTGCTGCCTGGGCCTCCATTTGCCAGAGAGTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGCTGCTCATTGCTGCCTGGGCCTCCATTTGCCAGAGAGTT 962
Query 963 ACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCACTAATGGAAATTATGACGGTGTTCTTTACCGGCACTTTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCACTAATGGAAATTATGACGGTGTTCTTTACCGGCACTTTC 1036
Query 1037 AGATACCCAGGGTAGTCCAGGAAGGGGATGTTCTATGTGTGCCAACAATTGGGCAAGTAGAGATCCTGGAAGGA 1110
|||||
Sbjct 1037 AGATA--------------------------------------------------------------------- 1041
Query 1111 AGTCCAGAGAAACTGCCCAGGTGGCGGGAAATGTTTTTTAAAGTGAAGAAAACAGTTGGGGAAGCTCCAGATGG 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042 ---------------CCCAGGTGGCGGGAAATGTTTTTTAAAGTGAAGAAAACAGTTGGGGAAGCTCCAGATGG 1100
Query 1185 ACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATACCTCCTTGTACATGGTGGGTTCTACCCTGAGCCCTGTTC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 ACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATACCTCCTTGTACATGGTGGGTTCTACCCTGAGCCCTGTTC 1174
Query 1259 CATGGCTCCCTTCAGAGGAATCCACTCTCTGGAGCAGTTTGTCTCCTCCAGGCCTGGAGGCCTTGGTGTCTGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 CATGGCTCCCTTCAGAGGAATCCACTCTCTGGAGCAGTTTGTCTCCTCCAGGCCTGGAGGCCTTGGTGTCTGAA 1248
Query 1333 CTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGGGGTGCCCTGCTGACAGGAACTAGCAGTGTCCTTCTACG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 CTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGGGGTGCCCTGCTGACAGGAACTAGCAGTGTCCTTCTACG 1322
Query 1407 GGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGCTGCTGCCTGTAGTCACCTTGGGCTCCACTTACTGAAGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 GGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGCTGCTGCCTGTAGTCACCTTGGGCTCCACTTACTGAAGG 1396
Query 1481 TGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGGCTGTGGAGACAAAACTGCAGGCCATCTTCTCCCGGGCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 TGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGGCTGTGGAGACAAAACTGCAGGCCATCTTCTCCCGGGCC 1470
Query 1555 CGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCTGTGGACCTTCTGGGCCGGGACCGTGATGGGCTGGGTGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471 CGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCTGTGGACCTTCTGGGCCGGGACCGTGATGGGCTGGGTGA 1544
Query 1629 GGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCTCCTCAATGAGGACCCCCTCAACAGCTGCCCTCCCCTCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545 GGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCTCCTCAATGAGGACCCCCTCAACAGCTGCCCTCCCCTCA 1618
Query 1703 TGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGCCTGCTGATGTGCAGACAGCATTTCCTCATGAGCTCGAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 TGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGCCTGCTGATGTGCAGACAGCATTTCCTCATGAGCTCGAG 1692
Query 1777 GTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATCCTGCGGGCCCTCACTGCCCACCTTCCCCTGGGCCAGGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693 GTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATCCTGCGGGCCCTCACTGCCCACCTTCCCCTGGGCCAGGA 1766
Query 1851 GGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGGCTTTGTGGTAGGGGATCTCTATGCCCTTCTGACCCACA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1767 GGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGGCTTTGTGGTAGGGGATCTCTATGCCCTTCTGACCCACA 1840
Query 1925 GCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGAACTCAGGTTTGGCAGGTGGCTTGACTGAGGAGGATGAGGGGGAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841 GCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGAACTCAGGTTTGGCAGGTGGCTTGACTGAGGAGGATGAGGGGGAG 1914
Query 1999 CTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGACTTTGGGCAGGCACTGGAGCAACTGCAGACAGCTCACTC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 CTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGACTTTGGGCAGGCACTGGAGCAACTGCAGACAGCTCACTC 1988
Query 2073 CCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTCCTGGCATGATGTGGGTGGGCTGCAGGAGGTGAAGAAGG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 CCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTCCTGGCATGATGTGGGTGGGCTGCAGGAGGTGAAGAAGG 2062
Query 2147 AGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACCCTGAGCTACTGAGCCTGGGCCTGAGACGCTCAGGCCTT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063 AGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACCCTGAGCTACTGAGCCTGGGCCTGAGACGCTCAGGCCTT 2136
Query 2221 CTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTTCTGGCCAAGGCAGTAGCCACTGAGTGCAGCCTTACCTT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 CTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTTCTGGCCAAGGCAGTAGCCACTGAGTGCAGCCTTACCTT 2210
Query 2295 CCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTATGTGGGCCAAAGTGAGGAGAATGTGCGGGAAGTATTTG 2368
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2211 CCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTATGTGGGCCAAAGTGAGGAGAATGTGCGGGAAGTGTTTG 2284
Query 2369 CCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCTTTGATGAACTGGACTCTTTGGCCCCAAGCCGGGGGCGA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 CCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCTTTGATGAACTGGACTCTTTGGCCCCAAGCCGGGGGCGA 2358
Query 2443 AGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTGTCTCAGCTCCTTGCCGAGCTAGATGGGCTGCACAGCAC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359 AGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTGTCTCAGCTCCTTGCCGAGCTAGATGGGCTGCACAGCAC 2432
Query 2517 TCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACCAGATCTCCTGGACCCTGCCCTTCTGCGGCCTGGCAGAT 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2433 TCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACCAGATCTCCTGGACCCTGCCCTTCTGCGGCCTGGCAGAT 2506
Query 2591 TTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACCGGGCCTCCCAGCTACGCGTTCTAAGTGCCATCACACGC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507 TTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACCGGGCCTCCCAGCTACGCGTTCTAAGTGCCATCACACGC 2580
Query 2665 AAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAACGTGCTAGATTGCTGCCCTCCCCAGCTGACGGGCGCGGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 AAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAACGTGCTAGATTGCTGCCCTCCCCAGCTGACGGGCGCGGA 2654
Query 2739 CCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGCCCTCAAACGCAGGGTTCATGACCTGGAGGAAGGGCTGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2655 CCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGCCCTCAAACGCAGGGTTCATGACCTGGAGGAAGGGCTGG 2728
Query 2813 AGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGGACTTGCTGCAGGCTGCCGCCCGGCTGCAACCCTCAGTC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2729 AGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGGACTTGCTGCAGGCTGCCGCCCGGCTGCAACCCTCAGTC 2802
Query 2887 AGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAGCGCAAGTTTGCTGCCTGC 2940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2803 AGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAGCGCAAGTTTGCTGCCTGC 2856