Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491750
- Subject:
- XR_001743466.2
- Aligned Length:
- 4344
- Identities:
- 2827
- Gaps:
- 1516
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 CGGCTACAGTTACTCGGGAGGCTGAGGTGGGAGATCACTTGAGCCTGGGACGGTAGAAGCTGCAATGAATGGGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ATCGTGCCACTGTACTCCAACCTGGGTGACAGAGTAGGACCCTGTTGCCATAAAAAAGGAAATGTGGCCTACCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CTAGCTGAGTGTCTTGTACAGAACAGTGGAGGTGAAGAGAAGGATGGAATCTAAATAACAGCACACGCAGGAAG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TCGACTGTTGGTGTTATGCTGACAGAAGCCTTGAACTCCTTTCCTTCTGCCTGCTCTGCTGCCTGCCCCGCTCT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AGGATAGAAAGTGAATGGGTTTCCGATCTGCAAGGATTTGGGGGGGGGGGGTGAAAGAAAAGCTGTTTTGTCTT 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CAACTTAAGTTTGGTGGGAGTAAAACAAACAGAACAATGAACAGGGCAAGAAGTCCTGGAACATGGGTTTTGTG 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CCAGATGTGCTGGAACATGTGTGGTGGCACCAAGCACTCCAGGGCTGTATGAATCACATCTAGTAATTCACTCA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GCAGCCACTATATACCTATAAGCAAGTGTGAGACAGTTTTCTAATCCTGCTACTCCCTCCTGCAACCTTTCCTG 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 CAACCCTCAAACCTCAGTGCTCACAGTTCCACAGGGGAAGCTGCAGGAGCTCCGCAGAGGAGCGGACTCCTTCC 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 GAAACATTTCACCTAGAGCTCCCAGTACTGGGCCCAGTCATCCCGAGCATGCTGACTGTTCATTTATCAGTCAA 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 TAAACTGTTACGTTCATGCCACGGGGAAAAATAGTTAAGAGAACATTACTTCCGTAGAAGGCAAAGATAAATCC 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 CTTAAGCACAAGTTCAAATGGCGCATGGGTAAACGCTACGCAACCGCAGCGATGAAGGTTACTGCCTATCGAGG 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 CACGACGCAGATCAATCCGAGGCGCAGCTAACCCCCTCAGAGCAAGTTCGCGGCACCCGACCCCCCTCCCCTTT 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 TCCTCTGGCCTCCCCTGACGGAAGCGGAAGCGGCCCTCGCGCACACTAGTCGTCTGGCTCTCTGGCTCCGGAAG 1036
Query 1 --------------------------------------ATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTT 36
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGCGCTCCTTCACCCTCCTCGTTGGTGTCCTGTCACCATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTT 1110
Query 37 CCGACCGAGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACCCGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGT 110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCGACCGAGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACCCGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGT 1184
Query 111 GCTGGCCCTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGCCGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGGAGGGGCCGGACG 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCTGGCCCTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGCCGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGGAGGGGCCGGACG 1258
Query 185 CGGGCACCGAAGAGCAGGGTCCCGGGCCGCCGCAGCTACTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTG 258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CGGGCACCGAAGAGCAGGGTCCCGGGCCGCCGCAGCTACTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTG 1332
Query 259 GGCTCCGGGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGGTGCGGCGGCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTC 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGCTCCGGGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGGTGCGGCGGCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTC 1406
Query 333 GCTGGGGCCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGGCCGCTGCTGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGAC 406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCTGGGGCCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGGCCGCTGCTGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGAC 1480
Query 407 CGCGGGTGCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCAAGGGCTGCTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTC 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CGCGGGTGCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCAAGGGCTGCTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTC 1554
Query 481 CGCGGGCGGGCCAGACTGTGTCCAGAGTCTGGGGACAGCAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTT 554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGCGGGCGGGCCAGACTGTGTCCAGAGTCTGGGGACAGCAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTT 1628
Query 555 TGCGGTTTCTGGCACAGTGCGGCGACTCCAGGGAGTTCTGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGA 628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGCGGTTTCTGGCACAGTGCGGCGACTCCAGGGAGTTCTGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGA 1702
Query 629 GCTGTCTCCGTGGCCTTGGCCTCTTCCAGGGCGAATGGGTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACT 702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCTGTCTCCGTGGCCTTGGCCTCTTCCAGGGCGAATGGGTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACT 1776
Query 703 TCACAGCCGCACTTGGCTAGGGTGCAGGTCCTAGAACCTCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTC 776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCACAGCCGCACTTGGCTAGGGTGCAGGTCCTAGAACCTCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTC 1850
Query 777 TGGACCGCTGGGAGAGCCCCTCGCTGACGGACTGGCGCTTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGGACCGCTGGGAGAGCCCCTCGCTGACGGACTGGCGCTTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTG 1924
Query 851 ACCCCCTGGAAATGGGAGAGCTCAGAATTCAGAGGTACTTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGC 924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACCCCCTGGAAATGGGAGAGCTCAGAATTCAGAGGTACTTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGC 1998
Query 925 TGCTCATTGCTGCCTGGGCCTCCATTTGCCAGAGAGTTACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCAC 998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGCTCATTGCTGCCTGGGCCTCCATTTGCCAGAGAGTTACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCAC 2072
Query 999 TAATGGAAATTATGACGGTGTTCTTTACCGGCACTTTCAGATACCCAGGGTAGTCCAGGAAGGGGATGTTCTAT 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TAATGGAAATTATGACGGTGTTCTTTACCGGCACTTTCAGATACCCAGGGTAGTCCAGGAAGGGGATGTTCTAT 2146
Query 1073 GTGTGCCAACAATTGGGCAAGTAGAGATCCTGGAAGGAAGTCCAGAGAAACTGCCCAGGTGGCGGGAAATGTTT 1146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GTGTGCCAACAATTGGGCAAGTAGAGATCCTGGAAGGAAGTCCAGAGAAACTGCCCAGGTGGCGGGAAATGTTT 2220
Query 1147 TTTAAAGTGAAGAAAACAGTTGGGGAAGCTCCAGATGGACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATAC 1220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTTAAAGTGAAGAAAACAGTTGGGGAAGCTCCAGATGGACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATAC 2294
Query 1221 CTCCTTGTACATGGTGGGTTCTACCCTGAGCCCTGTTCCATGGCTCCCTTCAGAGGAATCCACTCTCTGGAGCA 1294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CTCCTTGTACATGGTGGGTTCTACCCTGAGCCCTGTTCCATGGCTCCCTTCAGAGGAATCCACTCTCTGGAGCA 2368
Query 1295 GTTTGTCTCCTCCAGGCCTGGAGGCCTTGGTGTCTGAACTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGG 1368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GTTTGTCTCCTCCAGGCCTGGAGGCCTTGGTGTCTGAACTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAG-- 2440
Query 1369 GGTGCCCTGCTGACAGGAACTAGCAGTGTCCTTCTACGGGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGC 1442
Sbjct 2441 -------------------------------------------------------------------------- 2440
Query 1443 TGCTGCCTGTAGTCACCTTGGGCTCCACTTACTGAAGGTGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGG 1516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441 ------------------------------------GGTGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGG 2478
Query 1517 CTGTGGAGACAAAACTGCAGGCCATCTTCTCCCGGGCCCGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCT 1590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2479 CTGTGGAGACAAAACTGCAGGCCATCTTCTCCCGGGCCCGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCT 2552
Query 1591 GTGGACCTTCTGGGCCGGGACCGTGATGGGCTGGGTGAGGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCT 1664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2553 GTGGACCTTCTGGGCCGGGACCGTGATGGGCTGGGTGAGGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCT 2626
Query 1665 CCTCAATGAGGACCCCCTCAACAGCTGCCCTCCCCTCATGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGC 1738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2627 CCTCAATGAGGACCCCCTCAACAGCTGCCCTCCCCTCATGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGC 2700
Query 1739 CTGCTGATGTGCAGACAGCATTTCCTCATGAGCTCGAGGTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATC 1812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 CTGCTGATGTGCAGACAGCATTTCCTCATGAGCTCGAGGTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATC 2774
Query 1813 CTGCGGGCCCTCACTGCCCACCTTCCCCTGGGCCAGGAGGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGG 1886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2775 CTGCGGGCCCTCACTGCCCACCTTCCCCTGGGCCAGGAGGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGG 2848
Query 1887 CTTTGTGGTAGGGGATCTCTATGCCCTTCTGACCCACAGCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGAACTCAG 1960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2849 CTTTGTGGTAGGGGATCTCTATGCCCTTCTGACCCACAGCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGAACTCAG 2922
Query 1961 GTTTGGCAGGTGGCTTGACTGAGGAGGATGAGGGGGAGCTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGAC 2034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2923 GTTTGGCAGGTGGCTTGACTGAGGAGGATGAGGGGGAGCTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGAC 2996
Query 2035 TTTGGGCAGGCACTGGAGCAACTGCAGACAGCTCACTCCCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTC 2108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2997 TTTGGGCAGGCACTGGAGCAACTGCAGACAGCTCACTCCCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTC 3070
Query 2109 CTGGCATGATGTGGGTGGGCTGCAGGAGGTGAAGAAGGAGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACC 2182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3071 CTGGCATGATGTGGGTGGGCTGCAGGAGGTGAAGAAGGAGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACC 3144
Query 2183 CTGAGCTACTGAGCCTGGGCCTGAGACGCTCAGGCCTTCTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTT 2256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3145 CTGAGCTACTGAGCCTGGGCCTGAGACGCTCAGGCCTTCTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTT 3218
Query 2257 CTGGCCAAGGCAGTAGCCACTGAGTGCAGCCTTACCTTCCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTA 2330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3219 CTGGCCAAGGCAGTAGCCACTGAGTGCAGCCTTACCTTCCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTA 3292
Query 2331 TGTGGGCCAAAGTGAGGAGAATGTGCGGGAAGTATTTGCCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCT 2404
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3293 TGTGGGCCAAAGTGAGGAGAATGTGCGGGAAGTGTTTGCCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCT 3366
Query 2405 TTGATGAACTGGACTCTTTGGCCCCAAGCCGGGGGCGAAGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTG 2478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3367 TTGATGAACTGGACTCTTTGGCCCCAAGCCGGGGGCGAAGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTG 3440
Query 2479 TCTCAGCTCCTTGCCGAGCTAGATGGGCTGCACAGCACTCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACC 2552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3441 TCTCAGCTCCTTGCCGAGCTAGATGGGCTGCACAGCACTCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACC 3514
Query 2553 AGATCTCCTGGACCCTGCCCTTCTGCGGCCTGGCAGATTTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACC 2626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3515 AGATCTCCTGGACCCTGCCCTTCTGCGGCCTGGCAGATTTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACC 3588
Query 2627 GGGCCTCCCAGCTACGCGTTCTAAGTGCCATCACACGCAAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAAC 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3589 GGGCCTCCCAGCTACGCGTTCTAAGTGCCATCACACGCAAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAAC 3662
Query 2701 GTGCTAGATTGCTGCCCTCCCCAGCTGACGGGCGCGGACCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGC 2774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3663 GTGCTAGATTGCTGCCCTCCCCAGCTGACGGGCGCGGACCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGC 3736
Query 2775 CCTCAAACGCAGGGTTCATGACCTGGAGGAAGGGCTGGAGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGG 2848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3737 CCTCAAACGCAGGGTTCATGACCTGGAGGAAGGGCTGGAGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGG 3810
Query 2849 ACTTGCTGCAGGCTGCCGCCCGGCTGCAACCCTCAGTCAGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAG 2922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3811 ACTTGCTGCAGGCTGCCGCCCGGCTGCAACCCTCAGTCAGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAG 3884
Query 2923 CGCAAGTTTGCTGCCTGC-------------------------------------------------------- 2940
||||||||||||||||||
Sbjct 3885 CGCAAGTTTGCTGCCTGCTAGGAGCCCCCCAGGGTCTGGGACCCCGCTCAGCATGGCTGCAGGTACCTTGATAG 3958
Query 2941 -------------------------------------------------------------------------- 2940
Sbjct 3959 CCCACAGAGAGATCTGGGAAGGAAGGGCTCCTCCTCAGGCTGCTGCCAACCCACCTGGAGGCCACCTCCCTCCA 4032
Query 2941 -------------------------------------------------------------------------- 2940
Sbjct 4033 GGAGATCCCAGGGTGCAAAGTGGCATTGAGACAGCAGCAACAGCTCAAGAGATATCTCCTGCCTACTTGCCCCT 4106
Query 2941 -------------------------------------------------------------------------- 2940
Sbjct 4107 CCTTCCAGGCCGGCTCTAAGAGAAAGGCCCATCTACTCAGGAAGAGGGCCAGGGCCTTGGGTTCTGGGGATTGG 4180
Query 2941 ---------------------------------------------------- 2940
Sbjct 4181 GCCCTGAGAGGGCTAGTTCTGTGGCTGAAAATAAAGCATGTCCCGCCCCCTA 4232
