Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491774
• Subject: NM_001271877.1
• Aligned Length: 1321
• Identities: 963
• Gaps: 356

Alignment

Query    1  ATGGATATAAAAAACTCACCATCTAGCCTTAATTCTCCTTCCTCCTACAACTGCAGTCAATCCATCTTACCCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATATAAAAAACTCACCATCTAGCCTTAATTCTCCTTCCTCCTACAACTGCAGTCAATCCATCTTACCCCT  74

Query   75  GGAGCACGGCTCCATATACATACCTTCCTCCTATGTAGACAGCCACCATGAATATCCAGCCATGACATTCTATA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGCACGGCTCCATATACATACCTTCCTCCTATGTAGACAGCCACCATGAATATCCAGCCATGACATTCTATA  148

Query  149  GCCCTGCTGTGATGAATTACAGCATTCCCAGCAATGTCACTAACTTGGAAGGTGGGCCTGGTCGGCAGACCACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCCTGCTGTGATGAATTACAGCATTCCCAGCAATGTCACTAACTTGGAAGGTGGGCCTGGTCGGCAGACCACA  222

Query  223  AGCCCAAATGTGTTGTGGCCAACACCTGGGCACCTTTCTCCTTTAGTGGTCCATCGCCAGTTATCACATCTGTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCCCAAATGTGTTGTGGCCAACACCTGGGCACCTTTCTCCTTTAGTGGTCCATCGCCAGTTATCACATCTGTA  296

Query  297  TGCGGAACCTCAAAAGAGTCCCTGGTGTGAAGCAAGATCGCTAGAACACACCTTACCTGTAAACAGAGAGACAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCGGAACCTCAAAAGAGTCCCTGGTGTGAAGCAAGATCGCTAGAACACACCTTACCTGTAAACAGAGAGACAC  370

Query  371  TGAAAAGGAAGGTTAGTGGGAACCGTTGCGCCAGCCCTGTTACTGGTCCAGGTTCAAAGAGGGATGCTCACTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAAAGGAAGGTTAGTGGGAACCGTTGCGCCAGCCCTGTTACTGGTCCAGGTTCAAAGAGGGATGCTCACTTC  444

Query  445  TGCGCTGTCTGCAGCGATTACGCATCGGGATATCACTATGGAGTCTGGTCGTGTGAAGGATGTAAGGCCTTTTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCGCTGTCTGCAGCGATTACGCATCGGGATATCACTATGGAGTCTGGTCGTGTGAAGGATGTAAGGCCTTTTT  518

Query  519  TAAAAGAAGCATTCAAGGACATAATGATTATATTTGTCCAGCTACAAATCAGTGTACAATCGATAAAAACCGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAAAAGAAGCATTCAAGGACATAATGATTATATTTGTCCAGCTACAAATCAGTGTACAATCGATAAAAACCGGC  592

Query  593  GCAAGAGCTGCCAGGCCTGCCGACTTCGGAAGTGTTACGAAGTGGGAATGGTGAAGTGTGGCTCCCGGAGAGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAGAGCTGCCAGGCCTGCCGACTTCGGAAGTGTTACGAAGTGGGAATGGTGAAGTGTGGCTCCCGGAGAGAG  666

Query  667  AGATGTGGGTACCGCCTTGTGCGGAGACAGAGAAGTGCCGACGAGCAGCTGCACTGTGCCGGCAAGGCCAAGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGATGTGGGTACCGCCTTGTGCGGAGACAGAGAAGTGCCGACGAGCAGCTGCACTGTGCCGGCAAGGCCAAGAG  740

Query  741  AAGTGGCGGCCACGCGCCCCGAGTGCGGGAGCTGCTGCTGGACGCCCTGAGCCCCGAGCAGCTAGTGCTCACCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGTGGCGGCCACGCGCCCCGAGTGCGGGAGCTGCTGCTGGACGCCCTGAGCCCCGAGCAGCTAGTGCTCACCC  814

Query  815  TCCTGGAGGCTGAGCCGCCCCATGTGCTGATCAGCCGCCCCAGTGCGCCCTTCACCGAGGCCTCCATGATGATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCTGGAGGCTGAGCCGCCCCATGTGCTGATCAGCCGCCCCAGTGCGCCCTTCACCGAGGCCTCCATGATGATG  888

Query  889  TCCCTGACCAAGTTGGCCGACAAGGAGTTGGTACACATGATCAGCTGGGCCAAGAAGATTCCCGGGATG-----  957
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||     
Sbjct  889  TCCCTGACCAAGTTGGCCGACAAGGAGTTGGTACACATGATCAGCTGGGCCAAGAAGATTCCCGGTATGTACCC  962

Query  958  -----------------AGGGGAAATGCG---------------------------------------------  969
                             |||    ||||.                                             
Sbjct  963  TCTGGTCACAGCGACCCAGG----ATGCTGACAGCAGCCGGAAGCTGGCTCACTTGCTGAACGCCGTGACCGAT  1032

Query  970  --------------------------------------------------------------------------  969
                                                                                      
Sbjct 1033  GCTTTGGTTTGGGTGATTGCCAAGAGCGGCATCTCCTCCCAGCAGCAATCCATGCGCCTGGCTAACCTCCTGAT  1106

Query  970  --------------------------------------------------------------------------  969
                                                                                      
Sbjct 1107  GCTCCTGTCCCACGTCAGGCATGCGAGTAACAAGGGCATGGAACATCTGCTCAACATGAAGTGCAAAAATGTGG  1180

Query  970  --------------------------------------------------------------------------  969
                                                                                      
Sbjct 1181  TCCCAGTGTATGACCTGCTGCTGGAGATGCTGAATGCCCACGTGCTTCGCGGGTGCAAGTCCTCCATCACGGGG  1254

Query  970  ---------------------------------------------------------------  969
                                                                           
Sbjct 1255  TCCGAGTGCAGCCCGGCAGAGGACAGTAAAAGCAAAGAGGGCTCCCAGAACCCACAGTCTCAG  1317