Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491781
- Subject:
- XM_017003582.1
- Aligned Length:
- 3348
- Identities:
- 1858
- Gaps:
- 1489
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATGCTACGGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACTGCTTTGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCAACCACCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACATAACTTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAAAATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCAGCTCAGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAA 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 TTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCTAGTCACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGC 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGACAGTCAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATAC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 AGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCTAACCTGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTAT 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 AGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCACCTCTCTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAG 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 CGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTATCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCA 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 GCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAAGCTGAAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGC 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 AACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCCAGACCAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAG 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 AGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTGAATTTCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTG 1036
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1037 TGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTCCTCACATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGT 1110
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1111 ACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGAAAAATGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAG 1184
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1185 TTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACCCATGCCATCCAAACTGCACCCAAGGGTGCATAG 1258
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1259 GCTCAAGTATTGAAGACTGCATCGGCCTGATGGATAGGTGTAACGGTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTAC 1332
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1333 CCATGGACGGGCCATTCCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCCCTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCT 1406
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1407 CTTCATTCTGGTCATTGTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAGAAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCT 1480
Query 1 ---------TCTTGGAAACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCAGTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTT 65
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGAGAAGATTCTTGGAAACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCAGTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTT 1554
Query 66 CGTATTTTGAAAGAAACTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGCTCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGG 139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGTATTTTGAAAGAAACTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGCTCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGG 1628
Query 140 TATTTGGGTACCTGAAGGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTATTAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCA 213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TATTTGGGTACCTGAAGGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTATTAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCA 1702
Query 214 AGGCAAATGTGGAGTTCATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTATGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTG 287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGGCAAATGTGGAGTTCATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTATGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTG 1776
Query 288 GGTGTGTGTCTGAGCCCAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATGCCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCA 361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGTGTGTGTCTGAGCCCAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATGCCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCA 1850
Query 362 CGAGCACAAGGATAACATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTGTGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACC 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CGAGCACAAGGATAACATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTGTGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACC 1924
Query 436 TGGAAGAAAGACGACTCGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATGTCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAA 509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGGAAGAAAGACGACTCGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATGTCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAA 1998
Query 510 ATCACAGATTTTGGGCTAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAAGAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCC 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATCACAGATTTTGGGCTAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAAGAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCC 2072
Query 584 AATTAAATGGATGGCTCTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCACCCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAG 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AATTAAATGGATGGCTCTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCACCCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAG 2146
Query 658 TTACTATATGGGAACTGATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATGGAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTA 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TTACTATATGGGAACTGATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATGGAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTA 2220
Query 732 TTAGAGAAAGGAGAACGTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATTGACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTG 805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTAGAGAAAGGAGAACGTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATTGACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTG 2294
Query 806 GATGATTGATGCTGACAGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGCTGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTC 879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GATGATTGATGCTGACAGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGCTGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTC 2368
Query 880 AAAGATACCTAGTTATTCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCAGTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAAT 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AAAGATACCTAGTTATTCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCAGTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAAT 2442
Query 954 CTCTTGGATGAAGAGGATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAGTACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCC 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CTCTTGGATGAAGAGGATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAGTACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCC 2516
Query 1028 ACCTCCCATCTATACTTCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGGAGTGAAATTGGACACAGCCCTCCTCCTGCCT 1101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 ACCTCCCATCTATACTTCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGGAGTGAAATTGGACACAGCCCTCCTCCTGCCT 2590
Query 1102 ACACCCCCATGTCAGGAAACCAGTTTGTGTACCGAGATGGAGGTTTTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCC 1175
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 ACACCCCCATGTCAGGAAACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTTTTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCC 2664
Query 1176 TACAGAGCCCCAACTAGCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAGGGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTC 1249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TACAGAGCCCCAACTAGCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAGGGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTC 2738
Query 1250 CTGCTGTAATGGCACCCTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCAAGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTG 1323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CTGCTGTAATGGCACCCTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCAAGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTG 2812
Query 1324 CTGACCCCACCGTGTTTGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGCTGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATG 1397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CTGACCCCACCGTGTTTGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGCTGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATG 2886
Query 1398 CGAGACAAACCCAAACAAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAACCCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGA 1471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CGAGACAAACCCAAACAAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAACCCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGA 2960
Query 1472 CCTTCAAGCATTGGATAATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGGTCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGA 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CCTTCAAGCATTGGATAATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGGTCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGA 3034
Query 1546 ATGAGCCACTGTACCTCAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAGCTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCA 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 ATGAGCCACTGTACCTCAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAGCTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCA 3108
Query 1620 ATGCCAGAGAAGGCCAAGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGGAACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCT 1693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 ATGCCAGAGAAGGCCAAGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGGAACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCT 3182
Query 1694 TCAGCACCCAGACTACCTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTATAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTG 1767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 TCAGCACCCAGACTACCTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTATAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTG 3256
Query 1768 TGGCAGAGAATCCTGAATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAGGCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGA 1841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TGGCAGAGAATCCTGAATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAGGCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGA 3330
Query 1842 CACCGGAATACTGTGGTG 1859
||||||||||||||||||
Sbjct 3331 CACCGGAATACTGTGGTG 3348
