Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491796
• Subject: NM_001030003.3
• Aligned Length: 1431
• Identities: 1307
• Gaps: 113

Alignment

Query    1  ATGCGACTCTCCAAAACCCTCGTCGACATGGACA---TG-----GCCGACTACAGTGCTGCACTGGACCCAGCC  66
                                       ||||.||   ||     |||  |..|.|.|||.||.||||       
Sbjct    1  ---------------------------ATGGTCAGCGTGAACGCGCC--CCTCGGGGCTCCAGTGGA-------  38

Query   67  TACACCACCCTGGAATTTGAGAATGTGCAGGTGTTGACGATGGGCAATGACACGTCCCCATCAGAAGGCACCAA  140
                                       .||.|.||           |.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   39  ---------------------------GAGTTCTT-----------ACGACACGTCCCCATCAGAAGGCACCAA  74

Query  141  CCTCAACGCGCCCAACAGCCTGGGTGTCAGCGCCCTGTGTGCCATCTGCGGGGACCGGGCCACGGGCAAACACT  214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCAACGCGCCCAACAGCCTGGGTGTCAGCGCCCTGTGTGCCATCTGCGGGGACCGGGCCACGGGCAAACACT  148

Query  215  ACGGTGCCTCGAGCTGTGACGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGGAGGAGCGTGCGGAAGAACCACATGTACTCCTGC  288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGGTGCCTCGAGCTGTGACGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGGAGGAGCGTGCGGAAGAACCACATGTACTCCTGC  222

Query  289  AGATTTAGCCGGCAGTGCGTGGTGGACAAAGACAAGAGGAACCAGTGCCGCTACTGCAGGCTCAAGAAATGCTT  362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGATTTAGCCGGCAGTGCGTGGTGGACAAAGACAAGAGGAACCAGTGCCGCTACTGCAGGCTCAAGAAATGCTT  296

Query  363  CCGGGCTGGCATGAAGAAGGAAGCCGTCCAGAATGAGCGGGACCGGATCAGCACTCGAAGGTCAAGCTATGAGG  436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGGGCTGGCATGAAGAAGGAAGCCGTCCAGAATGAGCGGGACCGGATCAGCACTCGAAGGTCAAGCTATGAGG  370

Query  437  ACAGCAGCCTGCCCTCCATCAATGCGCTCCTGCAGGCGGAGGTCCTGTCCCGACAGATCACCTCCCCCGTCTCC  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGCAGCCTGCCCTCCATCAATGCGCTCCTGCAGGCGGAGGTCCTGTCCCGACAGATCACCTCCCCCGTCTCC  444

Query  511  GGGATCAACGGCGACATTCGGGCGAAGAAGATTGCCAGCATCGCAGATGTGTGTGAGTCCATGAAGGAGCAGCT  584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGATCAACGGCGACATTCGGGCGAAGAAGATTGCCAGCATCGCAGATGTGTGTGAGTCCATGAAGGAGCAGCT  518

Query  585  GCTGGTTCTCGTTGAGTGGGCCAAGTACATCCCAGCTTTCTGCGAGCTCCCCCTGGACGACCAGGTGGCCCTGC  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGTTCTCGTTGAGTGGGCCAAGTACATCCCAGCTTTCTGCGAGCTCCCCCTGGACGACCAGGTGGCCCTGC  592

Query  659  TCAGAGCCCATGCTGGCGAGCACCTGCTGCTCGGAGCCACCAAGAGATCCATGGTGTTCAAGGACGTGCTGCTC  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAGAGCCCATGCTGGCGAGCACCTGCTGCTCGGAGCCACCAAGAGATCCATGGTGTTCAAGGACGTGCTGCTC  666

Query  733  CTAGGCAATGACTACATTGTCCCTCGGCACTGCCCGGAGCTGGCGGAGATGAGCCGGGTGTCCATACGCATCCT  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTAGGCAATGACTACATTGTCCCTCGGCACTGCCCGGAGCTGGCGGAGATGAGCCGGGTGTCCATACGCATCCT  740

Query  807  TGACGAGCTGGTGCTGCCCTTCCAGGAGCTGCAGATCGATGACAATGAGTATGCCTACCTCAAAGCCATCATCT  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACGAGCTGGTGCTGCCCTTCCAGGAGCTGCAGATCGATGACAATGAGTATGCCTACCTCAAAGCCATCATCT  814

Query  881  TCTTTGACCCAGATGCCAAGGGGCTGAGCGATCCAGGGAAGATCAAGCGGCTGCGTTCCCAGGTGCAGGTGAGC  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTTTGACCCAGATGCCAAGGGGCTGAGCGATCCAGGGAAGATCAAGCGGCTGCGTTCCCAGGTGCAGGTGAGC  888

Query  955  TTGGAGGACTACATCAACGACCGCCAGTATGACTCGCGTGGCCGCTTTGGAGAGCTGCTGCTGCTGCTGCCCAC  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGGAGGACTACATCAACGACCGCCAGTATGACTCGCGTGGCCGCTTTGGAGAGCTGCTGCTGCTGCTGCCCAC  962

Query 1029  CTTGCAGAGCATCACCTGGCAGATGATCGAGCAGATCCAGTTCATCAAGCTCTTCGGCATGGCCAAGATTGACA  1102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTGCAGAGCATCACCTGGCAGATGATCGAGCAGATCCAGTTCATCAAGCTCTTCGGCATGGCCAAGATTGACA  1036

Query 1103  ACCTGTTGCAGGAGATGCTGCTGGGAGGGTCCCCCAGCGATGCACCCCATGCCCACCACCCCCTGCACCCTCAC  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCTGTTGCAGGAGATGCTGCTGGGAGGGTCCCCCAGCGATGCACCCCATGCCCACCACCCCCTGCACCCTCAC  1110

Query 1177  CTGATGCAGGAACATATGGGAACCAACGTCATCGTTGCCAACACAATGCCCACTCACCTCAGCAACGGACAGAT  1250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGATGCAGGAACATATGGGAACCAACGTCATCGTTGCCAACACAATGCCCACTCACCTCAGCAACGGACAGAT  1184

Query 1251  GTGTGAGTGGCCCCGACCCAGGGGACAGGCAGCCACCCCTGAGACCCCACAGCCCTCACCGCCAGGTGGCTCAG  1324
            ||                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GT------------------------------CCACCCCTGAGACCCCACAGCCCTCACCGCCAGGTGGCTCAG  1228

Query 1325  GGTCTGAGCCCTATAAGCTCCTGCCGGGAGCCGTCGCCACAATCGTCAAGCCCCTCTCTGCCATCCCCCAGCCG  1398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229  GGTCTGAGCCCTATAAGCTCCTGCCGGGAGCCGTCGCCACAATCGTCAAGCCCCTCTCTGCCATCCCCCAGCCG  1302

Query 1399  ACCATCACCAAGCAGGAAGTTATCG  1423
            |||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1303  ACCATCACCAAGCAGGAAGTTATC-  1326