Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491812
• Subject: NM_057095.3
• Aligned Length: 1514
• Identities: 1140
• Gaps: 340

Alignment

Query    1  ATGGATCTCATTCCAAACTTTGCCATGGAAACATGGGTTCTTGTGGCTACCAGCCTGGTACTCCTCTATATTTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATCTCATTCCAAACTTTGCCATGGAAACATGGGTTCTTGTGGCTACCAGCCTGGTACTCCTCTATATTTA  74

Query   75  TGGGACCCATTCACATAAACTTTTTAAGAAGCTGGGAATTCCTGGGCCAACCCCTCTGCCTTTTCTGGGAACTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGGACCCATTCACATAAACTTTTTAAGAAGCTGGGAATTCCTGGGCCAACCCCTCTGCCTTTTCTGGGAACTA  148

Query  149  TTTTGTTCTACCTTAGGAGGTCTCTG--------------------------AATA---AGA------------  181
            ||||||||||||||||| |||||.||                          ||||   |||            
Sbjct  149  TTTTGTTCTACCTTAGG-GGTCTTTGGAATTTTGACAGAGAATGTAATGAAAAATACGGAGAAATGTGGGGGCT  221

Query  182  --------------TTCCCA-GCTGGGCGTGGTGGCTCACG---------------------------------  207
                          ..|||| |||||.|.|..|||.||.||                                 
Sbjct  222  GTATGAGGGGCAACAGCCCATGCTGGTCATCATGGATCCCGACATGATCAAAACAGTGTTAGTGAAAGAATGTT  295

Query  208  --CCTGTAATCCCA--------GCACTT---------TGGGA-----------------------GGCTGAAGC  239
              .||||..||.||        || |||         |||||                       .||||||| 
Sbjct  296  ACTCTGTCTTCACAAACCAGATGC-CTTTAGGTCCAATGGGATTTCTGAAAAGTGCCTTAAGTTTTGCTGAAG-  367

Query  240  AGGAGGA-----------------------------------TCACC----TAA-------------GGT----  257
            |.||.||                                   |||||    |||             |||    
Sbjct  368  ATGAAGAATGGAAGAGAATACGAACATTGCTATCTCCAGCTTTCACCAGTGTAAAATTCAAGGAAATGGTCCCC  441

Query  258  ------------------------------------------CAGGAGTTCGAGACCAG---------------  274
                                                      |||||....||||.|||               
Sbjct  442  ATCATTTCCCAATGTGGAGATATGTTGGTGAGAAGCCTGAGGCAGGAAGCAGAGAACAGCAAGTCCATCAACTT  515

Query  275  ---------CTTTG------CCAACATGG-----------------GTCTTTGGA----------ATTTTGACA  306
                     |||||      .||.|||||                 .|.||||||          |||.|..||
Sbjct  516  GAAAGATTTCTTTGGGGCCTACACCATGGATGTAATCACTGGCACATTATTTGGAGTGAACTTGGATTCTCTCA  589

Query  307  GAGAAT------------GTAATGAAAAATACGGAG---------AAATGTGG-------GG------------  340
             |.|||            .|..|||||||||.|.||         |||| |||       ||            
Sbjct  590  -ACAATCCACAAGATCCCTTTCTGAAAAATATGAAGAAGCTTTTAAAAT-TGGATTTTTTGGATCCCTTTTTAC  661

Query  341  ---------CACTCTTTCCATTTCTTACCCCAGTTTTTGAAGCCCTAAATATCGGTTTGTTTCCAAAAGATGTT  405
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  TCTTAATATCACTCTTTCCATTTCTTACCCCAGTTTTTGAAGCCCTAAATATCGGTTTGTTTCCAAAAGATGTT  735

Query  406  ACCCATTTTTTAAAAAATTCCATTGAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCAAAGATAAACAAAAGCATCGAGTAGA  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  ACCCATTTTTTAAAAAATTCCATTGAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCAAAGATAAACAAAAGCATCGAGTAGA  809

Query  480  TTTCTTTCAACAGATGATCGACTCCCAGAATTCCAAAGAAACAAAGTCCCATAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGC  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  TTTCTTTCAACAGATGATCGACTCCCAGAATTCCAAAGAAACAAAGTCCCATAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGC  883

Query  554  TTGTGGCCCAGTCAATTATCATCATTTTTGCTGCCTATGACACAACTAGCACCACTCTCCCCTTCATTATGTAT  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  TTGTGGCCCAGTCAATTATCATCATTTTTGCTGCCTATGACACAACTAGCACCACTCTCCCCTTCATTATGTAT  957

Query  628  GAACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAGATTGACGCAGTTTTACCCAATAAGGCACC  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  GAACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAGATTGACGCAGTTTTACCCAATAAGGCACC  1031

Query  702  TGTCACCTACGATGCCCTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAG  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  TGTCACCTACGATGCCCTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAG  1105

Query  776  TTGTTAGTAGAGTTACGAGAGTCTGCAAGAAAGATATTGAAATCAATGGAGTGTTCATTCCCAAAGGGTTAGCA  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  TTGTTAGTAGAGTTACGAGAGTCTGCAAGAAAGATATTGAAATCAATGGAGTGTTCATTCCCAAAGGGTTAGCA  1179

Query  850  GTGATGGTTCCAATCTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCTGCCCTGAAAG  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  GTGATGGTTCCAATCTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCTGCCCTGAAAG  1253

Query  924  GTTCAGTAAGAAGAACAAGGACAGCATAGATCTTTACAGATACATACCTTTTGGAGCTGGACCCCGAAACTGCA  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  GTTCAGTAAGAAGAACAAGGACAGCATAGATCTTTACAGATACATACCTTTTGGAGCTGGACCCCGAAACTGCA  1327

Query  998  TTGGCATGAGGTTTGCTCTCACAAACATAAAACTTGCTGTCATTAGAGCACTGCAGAACTTCTCCTTCAAACCT  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  TTGGCATGAGGTTTGCTCTCACAAACATAAAACTTGCTGTCATTAGAGCACTGCAGAACTTCTCCTTCAAACCT  1401

Query 1072  TGTAAAGAGACTCAGATCCCACTGAAATTAGACAATCTACCAATTCTTCAACCAGAAAAACCTATTGTTCTAAA  1145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402  TGTAAAGAGACTCAGATCCCACTGAAATTAGACAATCTACCAATTCTTCAACCAGAAAAACCTATTGTTCTAAA  1475

Query 1146  AGTGCACTTAAGAGATGGGATTACAAGTGGACCC  1179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  AGTGCACTTAAGAGATGGGATTACAAGTGGACCC  1509