Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491812
• Subject: XM_024446877.1
• Aligned Length: 1290
• Identities: 1024
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  AT-GGATCTC-----ATTCC---AAACTTTGC-----------CATGGA----------AACATGGGT-TCTTG  43
            || ||||.||     |.|.|   ||..|||||           .|||||          |||||.|.| |||  
Sbjct    1  ATGGGATTTCTGAAAAGTGCCTTAAGTTTTGCTGAAGATGAAGAATGGAAGAGAATACGAACATTGCTATCT--  72

Query   44  TGGCTACCAGCCTGGTACTCC--TCTATATTT-------ATGGGACCCA----TTC---------ACATAAACT  95
                  |||||   .|.|.||  |.||.|.||       ||||..||||    |||         |.|||   |
Sbjct   73  ------CCAGC---TTTCACCAGTGTAAAATTCAAGGAAATGGTCCCCATCATTTCCCAATGTGGAGATA---T  134

Query   96  TTT--TAAGAAGCTGGGAATTCCTGGGCCAACCCCTCTGCCTTTTCTGG-------GAACTATTTTGTTCTACC  160
            .||  |.|||||         ||||.|.||                 ||       ||||              
Sbjct  135  GTTGGTGAGAAG---------CCTGAGGCA-----------------GGAAGCAGAGAAC--------------  168

Query  161  TTAGGAGGTC--TC----TGAATAAGATTCCCAGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCC-----TGTAATC-CCAGCA  222
              ||.|.|||  ||    |||  ||||||         .|.|.|.|||..||.||     ||||||| |..|||
Sbjct  169  --AGCAAGTCCATCAACTTGA--AAGATT---------TCTTTGGGGCCTACACCATGGATGTAATCACTGGCA  229

Query  223  C----TTTGGGAGGCTGAAGCAGGAGGAT----------CACCTAAGGTC--------------AGGAGTTCGA  268
            |    ||| ||||  ||||...|||...|          |||  |||.||              |.||     |
Sbjct  230  CATTATTT-GGAG--TGAACTTGGATTCTCTCAACAATCCAC--AAGATCCCTTTCTGAAAAATATGA-----A  293

Query  269  GACCAGCTTTGCCAACATGGG--TCTTTGGA---ATTTTGACAGAGAAT-GTAATGAAAAATACGGAGAAATGT  336
            ||  ||||||  .||.||.||  |.||||||   .||||.||      | .||||     ||            
Sbjct  294  GA--AGCTTT--TAAAATTGGATTTTTTGGATCCCTTTTTAC------TCTTAAT-----AT------------  340

Query  337  GGGGCACTCTTTCCATTTCTTACCCCAGTTTTTGAAGCCCTAAATATCGGTTTGTTTCCAAAAGATGTTACCCA  410
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  341  ----CACTCTTTCCATTTCTTACCCCAGTTTTTGAAGCCCTAAATATCGGTTTGTTTCCAAAAGATGTTACCCA  410

Query  411  TTTTTTAAAAAATTCCATTGAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCAAAGATAAACAAAAGCATCGAGTAGATTTCT  484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  TTTTTTAAAAAATTCCATTGAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCAAAGATAAACAAAAGCATCGAGTAGATTTCT  484

Query  485  TTCAACAGATGATCGACTCCCAGAATTCCAAAGAAACAAAGTCCCATAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTTGTG  558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  TTCAACAGATGATCGACTCCCAGAATTCCAAAGAAACAAAGTCCCATAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTTGTG  558

Query  559  GCCCAGTCAATTATCATCATTTTTGCTGCCTATGACACAACTAGCACCACTCTCCCCTTCATTATGTATGAACT  632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  GCCCAGTCAATTATCATCATTTTTGCTGCCTATGACACAACTAGCACCACTCTCCCCTTCATTATGTATGAACT  632

Query  633  GGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAGATTGACGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCTGTCA  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  GGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAGATTGACGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCTGTCA  706

Query  707  CCTACGATGCCCTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAGTTGTT  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  CCTACGATGCCCTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAGTTGTT  780

Query  781  AGTAGAGTTACGAGAGTCTGCAAGAAAGATATTGAAATCAATGGAGTGTTCATTCCCAAAGGGTTAGCAGTGAT  854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  AGTAGAGTTACGAGAGTCTGCAAGAAAGATATTGAAATCAATGGAGTGTTCATTCCCAAAGGGTTAGCAGTGAT  854

Query  855  GGTTCCAATCTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCTGCCCTGAA---AGGT  925
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
Sbjct  855  GGTTCCAATCTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCTGCCCTGAAAGTAGGT  928

Query  926  TCAGTAAGAAGAACAAGGACAGCATAGATCTTTACAGATACATACCTTTTGGAGCTGGACCCCGAAACTGCATT  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  TCAGTAAGAAGAACAAGGACAGCATAGATCTTTACAGATACATACCTTTTGGAGCTGGACCCCGAAACTGCATT  1002

Query 1000  GGCATGAGGTTTGCTCTCACAAACATAAAACTTGCTGTCATTAGAGCACTGCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTG  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  GGCATGAGGTTTGCTCTCACAAACATAAAACTTGCTGTCATTAGAGCACTGCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTG  1076

Query 1074  TAAAGAGACTCAGATCCCACTGAAATTAGACAATCTACCAATTCTTCAACCAGAAAAACCTATTGTTCTAAAAG  1147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  TAAAGAGACTCAGATCCCACTGAAATTAGACAATCTACCAATTCTTCAACCAGAAAAACCTATTGTTCTAAAAG  1150

Query 1148  TGCACTTAAGAGATGGGATTACAAGTGGACCC  1179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151  TGCACTTAAGAGATGGGATTACAAGTGGACCC  1182