Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491845
• Subject: NM_001099641.2
• Aligned Length: 1359
• Identities: 1177
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGTCGTCTCTGCCCTGGCTGTGCATTATTCTGTGGCTAGAAAATGCCCTAGGGAAACTCGAAGTTGAAGG  74
            ||||..|.|..|||.||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||.||...||||.||||.||||||
Sbjct    1  ATGGTCTTGCTTCTCCCCTGGCTCTTCATTATTCTATGGCTAGAAAATGCCCAAGCTCAACTTGAAGATGAAGG  74

Query   75  CAACTTCTACTCAGAAAACGTCAGTCGGATCCTGGACAACTTGCTTGAAGGCTATGACAATCGGCTGCGGCCGG  148
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct   75  CAACTTCTACTCTGAAAATGTCAGTCGGATTCTTGACAACTTGCTGGAAGGCTATGACAACCGTCTACGGCCAG  148

Query  149  GATTTGGAGGTGCTGTCACTGAAGTCAAAACAGACATTTATGTGACCAGTTTTGGGCCCGTGTCAGATGTGGAG  222
            |||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  149  GATTTGGGGGTGCTGTAACAGAAGTCAAAACAGACATCTATGTGACCAGCTTTGGACCTGTGTCAGATGTGGAG  222

Query  223  ATGGAGTATACGATGGATGTTTTTTTCCGCCAGACCTGGACTGATGAGAGGTTGAAGTTTGGGGGGCCAACTGA  296
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..||||.|||...||.||..||||
Sbjct  223  ATGGAGTATACAATGGATGTTTTCTTCCGCCAGACTTGGACTGATGAGAGACTGAAATTTAAAGGCCCTGCTGA  296

Query  297  GATTCTGAGTCTGAATAATTTGATGGTCAGTAAAATCTGGACGCCTGACACCTTTTTCAGAAATGGTAAAAAGT  370
            |||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct  297  GATTCTGAGCTTAAATAACTTGATGGTCAGTAAGATCTGGACTCCTGACACTTTTTTCCGGAATGGGAAAAAGT  370

Query  371  CCATTGCTCACAACATGACAACTCCTAATAAACTCTTCAGAATAATGCAGAATGGAACCATTTTATACACCATG  444
            |.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||.||.||||||||||||||||.||..|.||.||||||
Sbjct  371  CAATTGCTCACAACATGACCACCCCCAACAAGCTCTTCCGATTAATGCAGAATGGAACAATCCTCTATACCATG  444

Query  445  AGGCTTACCATCAATGCTGACTGTCCCATGAGGCTGGTTAACTTTCCTATGGATGGGCATGCTTGTCCACTCAA  518
            |||||.||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  AGGCTCACCATCAACGCTGATTGCCCCATGAGATTGGTTAACTTCCCTATGGATGGACACGCTTGTCCACTCAA  518

Query  519  GTTTGGGAGCTATGCTTATCCCAAAAGTGAAATCATATATACGTGGAAAAAAGGACCACTTTACTCAGTAGAAG  592
            |||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTTGGGAGCTATGCTTATCCTAAAACTGAAATCATATATACATGGAAAAAAGGACCACTTTACTCAGTAGAAG  592

Query  593  TCCCAGAAGAATCTTCAAGCCTTCTCCAGTATGATCTGATTGGACAAACAGTATCTAGTGAGACAATTAAATCT  666
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCCAGAAGAATCTTCTAGCCTCCTCCAGTATGATTTGATTGGGCAAACAGTTTCTAGTGAGACAATTAAATCT  666

Query  667  AACACAGGTGAATACGTTATAATGACAGTTTACTTCCACTTGCAAAGGAAGATGGGCTACTTCATGATACAGAT  740
            |||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  AACACTGGTGAATATGTAATCATGACAGTCTATTTCCACTTACAAAGGAAGATGGGCTATTTCATGATCCAGAT  740

Query  741  ATACACTCCTTGCATTATGACAGTCATTCTTTCCCAGGTGTCTTTCTGGATTAATAAGGAGTCCGTCCCAGCAA  814
            |||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  ATACACTCCGTGCATCATGACAGTCATTCTTTCTCAAGTGTCTTTCTGGATTAATAAGGAGTCAGTCCCAGCAA  814

Query  815  GAACTGTTTTTGGGATCACCACTGTTTTAACTATGACCACTTTGAGCATCAGTGCCCGGCACTCTTTGCCAAAA  888
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||.|||
Sbjct  815  GAACTGTCTTTGGAATCACCACTGTTTTAACCATGACCACCTTAAGCATCAGTGCTCGGCACTCTCTACCCAAA  888

Query  889  GTGTCATATGCCACTGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTTTGCTTTGCATTCGTCTTCTCTGCTCTTATCGAGTT  962
            |||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.||
Sbjct  889  GTGTCCTATGCAACCGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTATGCTTTGCTTTTGTCTTTTCTGCTCTCATTGAATT  962

Query  963  CGCAGCTGTCAACTACTTTACCAATCTTCAGACACAGAAGGCCAAAAGGAAGGCACAGTTTGCAGCCCCACCCA  1036
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||..|||||.|||||||...|||||||.|.|||.
Sbjct  963  CGCAGCTGTCAACTACTTCACCAATCTCCAGTCACAGAAGGCTGAAAGGCAGGCACAAACTGCAGCCACGCCCC  1036

Query 1037  CAGTGACAATATCAAAAGCTACTGAACCTTTGGAAGCTGAGATTGTTTTGCATCCTGACTCCAAATATCATCTG  1110
            |.|||.|||..||||||||..|||||.|..||.||||.|||||||||.|||||.||||||||||.||.||||||
Sbjct 1037  CTGTGGCAAAGTCAAAAGCGTCTGAATCCCTGCAAGCAGAGATTGTTGTGCATTCTGACTCCAAGTACCATCTG  1110

Query 1111  AAGAAAAGGATCACTTCTCTGTCTTTGCCAATAGTTTCATCTTCCGAGGCCAATAAAGTGCTCACGAGAGCGCC  1184
            |||||.||.||||..||||||.|||||||.||.|||.|||||||.|||||||..||||..||||..|||.||||
Sbjct 1111  AAGAAGAGAATCAGCTCTCTGACTTTGCCCATCGTTCCATCTTCTGAGGCCAGCAAAGCCCTCAGTAGAACGCC  1184

Query 1185  CATCTTACAATCAACACCTGTCACACCCCCACCACTCTCGCCAGCCTTTGGAGGCACCAGTAAAATAGACCAGT  1258
            |||||||.||||.||.||||||.|.||||||...||||..||||||..|||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1185  CATCTTAAAATCGACGCCTGTCTCTCCCCCATTGCTCTTACCAGCCACTGGGGGCACCAGCAAAATAGATCAGT  1258

Query 1259  ATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTTGCATTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGGTAGTTTATCTTTCCAAAGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 1259  ATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTAGCTTTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGATAGTTTACCTTTCCAAAGAT  1332

Query 1333  ACAATGGAAGTGAGTAGCAGTGTTGAA  1359
            ||||||||||||||.||.|.||||||.
Sbjct 1333  ACAATGGAAGTGAGCAGTACTGTTGAG  1359