Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491845
• Subject: NM_008068.3
• Aligned Length: 1359
• Identities: 1149
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  ATGGCGTCGTCTCTGCCCTGGCTGTGCATTATTCTGTGGCTAGAAAATGCCCTAGGGAAACTCGAAGTTGAAGG  74
            ||||..|.|..|||.||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||.||...||||.||||.||||||
Sbjct    1  ATGGTCTTGCTTCTCCCCTGGCTCTTCATTATTCTATGGCTAGAAAATGCCCAAGCTCAACTTGAAGATGAAGG  74

Query   75  CAACTTCTACTCAGAAAACGTCAGTCGGATCCTGGACAACTTGCTTGAAGGCTATGACAATCGGCTGCGGCCGG  148
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct   75  CAACTTCTACTCTGAAAATGTCAGTCGGATTCTTGACAACTTGCTGGAAGGCTATGACAACCGTCTACGGCCAG  148

Query  149  GATTTGGAGGTGCTGTCACTGAAGTCAAAACAGACATTTATGTGACCAGTTTTGGGCCCGTGTCAGATGTGGAG  222
            |||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  149  GATTTGGGGGTGCTGTAACAGAAGTCAAAACAGACATCTATGTGACCAGCTTTGGACCTGTGTCAGATGTGGAG  222

Query  223  ATGGAGTATACGATGGATGTTTTTTTCCGCCAGACCTGGACTGATGAGAGGTTGAAGTTTGGGGGGCCAACTGA  296
            ||                              |||.||||||||||||||..||||.|||...||.||..||||
Sbjct  223  AT------------------------------GACTTGGACTGATGAGAGACTGAAATTTAAAGGCCCTGCTGA  266

Query  297  GATTCTGAGTCTGAATAATTTGATGGTCAGTAAAATCTGGACGCCTGACACCTTTTTCAGAAATGGTAAAAAGT  370
            |||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct  267  GATTCTGAGCTTAAATAACTTGATGGTCAGTAAGATCTGGACTCCTGACACTTTTTTCCGGAATGGGAAAAAGT  340

Query  371  CCATTGCTCACAACATGACAACTCCTAATAAACTCTTCAGAATAATGCAGAATGGAACCATTTTATACACCATG  444
            |.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||.||.||||||||||||||||.||..|.||.||||||
Sbjct  341  CAATTGCTCACAACATGACCACCCCCAACAAGCTCTTCCGATTAATGCAGAATGGAACAATCCTCTATACCATG  414

Query  445  AGGCTTACCATCAATGCTGACTGTCCCATGAGGCTGGTTAACTTTCCTATGGATGGGCATGCTTGTCCACTCAA  518
            |||||.||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  415  AGGCTCACCATCAACGCTGATTGCCCCATGAGATTGGTTAACTTCCCTATGGATGGACACGCTTGTCCACTCAA  488

Query  519  GTTTGGGAGCTATGCTTATCCCAAAAGTGAAATCATATATACGTGGAAAAAAGGACCACTTTACTCAGTAGAAG  592
            |||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  GTTTGGGAGCTATGCTTATCCTAAAACTGAAATCATATATACATGGAAAAAAGGACCACTTTACTCAGTAGAAG  562

Query  593  TCCCAGAAGAATCTTCAAGCCTTCTCCAGTATGATCTGATTGGACAAACAGTATCTAGTGAGACAATTAAATCT  666
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  563  TCCCAGAAGAATCTTCTAGCCTCCTCCAGTATGATTTGATTGGGCAAACAGTTTCTAGTGAGACAATTAAATCT  636

Query  667  AACACAGGTGAATACGTTATAATGACAGTTTACTTCCACTTGCAAAGGAAGATGGGCTACTTCATGATACAGAT  740
            |||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  637  AACACTGGTGAATATGTAATCATGACAGTCTATTTCCACTTACAAAGGAAGATGGGCTATTTCATGATCCAGAT  710

Query  741  ATACACTCCTTGCATTATGACAGTCATTCTTTCCCAGGTGTCTTTCTGGATTAATAAGGAGTCCGTCCCAGCAA  814
            |||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  711  ATACACTCCGTGCATCATGACAGTCATTCTTTCTCAAGTGTCTTTCTGGATTAATAAGGAGTCAGTCCCAGCAA  784

Query  815  GAACTGTTTTTGGGATCACCACTGTTTTAACTATGACCACTTTGAGCATCAGTGCCCGGCACTCTTTGCCAAAA  888
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||.|||
Sbjct  785  GAACTGTCTTTGGAATCACCACTGTTTTAACCATGACCACCTTAAGCATCAGTGCTCGGCACTCTCTACCCAAA  858

Query  889  GTGTCATATGCCACTGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTTTGCTTTGCATTCGTCTTCTCTGCTCTTATCGAGTT  962
            |||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.||
Sbjct  859  GTGTCCTATGCAACCGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTATGCTTTGCTTTTGTCTTTTCTGCTCTCATTGAATT  932

Query  963  CGCAGCTGTCAACTACTTTACCAATCTTCAGACACAGAAGGCCAAAAGGAAGGCACAGTTTGCAGCCCCACCCA  1036
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||..|||||.|||||||...|||||||.|.|||.
Sbjct  933  CGCAGCTGTCAACTACTTCACCAATCTCCAGTCACAGAAGGCTGAAAGGCAGGCACAAACTGCAGCCACGCCCC  1006

Query 1037  CAGTGACAATATCAAAAGCTACTGAACCTTTGGAAGCTGAGATTGTTTTGCATCCTGACTCCAAATATCATCTG  1110
            |.|||.|||..||||||||..|||||.|..||.||||.|||||||||.|||||.||||||||||.||.||||||
Sbjct 1007  CTGTGGCAAAGTCAAAAGCGTCTGAATCCCTGCAAGCAGAGATTGTTGTGCATTCTGACTCCAAGTACCATCTG  1080

Query 1111  AAGAAAAGGATCACTTCTCTGTCTTTGCCAATAGTTTCATCTTCCGAGGCCAATAAAGTGCTCACGAGAGCGCC  1184
            |||||.||.||||..||||||.|||||||.||.|||.|||||||.|||||||..||||..||||..|||.||||
Sbjct 1081  AAGAAGAGAATCAGCTCTCTGACTTTGCCCATCGTTCCATCTTCTGAGGCCAGCAAAGCCCTCAGTAGAACGCC  1154

Query 1185  CATCTTACAATCAACACCTGTCACACCCCCACCACTCTCGCCAGCCTTTGGAGGCACCAGTAAAATAGACCAGT  1258
            |||||||.||||.||.||||||.|.||||||...||||..||||||..|||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1155  CATCTTAAAATCGACGCCTGTCTCTCCCCCATTGCTCTTACCAGCCACTGGGGGCACCAGCAAAATAGATCAGT  1228

Query 1259  ATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTTGCATTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGGTAGTTTATCTTTCCAAAGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 1229  ATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTAGCTTTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGATAGTTTACCTTTCCAAAGAT  1302

Query 1333  ACAATGGAAGTGAGTAGCAGTGTTGAA  1359
            ||||||||||||||.||.|.||||||.
Sbjct 1303  ACAATGGAAGTGAGCAGTACTGTTGAG  1329