Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491845
• Subject: XM_006532198.3
• Aligned Length: 1359
• Identities: 960
• Gaps: 249

Alignment

Query    1  ATGGCGTCGTCTCTGCCCTGGCTGTGCATTATTCTGTGGCTAGAAAATGCCCTAGGGAAACTCGAAGTTGAAGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAACTTCTACTCAGAAAACGTCAGTCGGATCCTGGACAACTTGCTTGAAGGCTATGACAATCGGCTGCGGCCGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GATTTGGAGGTGCTGTCACTGAAGTCAAAACAGACATTTATGTGACCAGTTTTGGGCCCGTGTCAGATGTGGAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATGGAGTATACGATGGATGTTTTTTTCCGCCAGACCTGGACTGATGAGAGGTTGAAGTTTGGGGGGCCAACTGA  296
                            |||           .||||.||||||||||||||..||||.|||...||.||..||||
Sbjct    1  ----------------ATG-----------AAGACTTGGACTGATGAGAGACTGAAATTTAAAGGCCCTGCTGA  47

Query  297  GATTCTGAGTCTGAATAATTTGATGGTCAGTAAAATCTGGACGCCTGACACCTTTTTCAGAAATGGTAAAAAGT  370
            |||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct   48  GATTCTGAGCTTAAATAACTTGATGGTCAGTAAGATCTGGACTCCTGACACTTTTTTCCGGAATGGGAAAAAGT  121

Query  371  CCATTGCTCACAACATGACAACTCCTAATAAACTCTTCAGAATAATGCAGAATGGAACCATTTTATACACCATG  444
            |.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||.||.||||||||||||||||.||..|.||.||||||
Sbjct  122  CAATTGCTCACAACATGACCACCCCCAACAAGCTCTTCCGATTAATGCAGAATGGAACAATCCTCTATACCATG  195

Query  445  AGGCTTACCATCAATGCTGACTGTCCCATGAGGCTGGTTAACTTTCCTATGGATGGGCATGCTTGTCCACTCAA  518
            |||||.||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  196  AGGCTCACCATCAACGCTGATTGCCCCATGAGATTGGTTAACTTCCCTATGGATGGACACGCTTGTCCACTCAA  269

Query  519  GTTTGGGAGCTATGCTTATCCCAAAAGTGAAATCATATATACGTGGAAAAAAGGACCACTTTACTCAGTAGAAG  592
            |||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  GTTTGGGAGCTATGCTTATCCTAAAACTGAAATCATATATACATGGAAAAAAGGACCACTTTACTCAGTAGAAG  343

Query  593  TCCCAGAAGAATCTTCAAGCCTTCTCCAGTATGATCTGATTGGACAAACAGTATCTAGTGAGACAATTAAATCT  666
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  344  TCCCAGAAGAATCTTCTAGCCTCCTCCAGTATGATTTGATTGGGCAAACAGTTTCTAGTGAGACAATTAAATCT  417

Query  667  AACACAGGTGAATACGTTATAATGACAGTTTACTTCCACTTGCAAAGGAAGATGGGCTACTTCATGATACAGAT  740
            |||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  418  AACACTGGTGAATATGTAATCATGACAGTCTATTTCCACTTACAAAGGAAGATGGGCTATTTCATGATCCAGAT  491

Query  741  ATACACTCCTTGCATTATGACAGTCATTCTTTCCCAGGTGTCTTTCTGGATTAATAAGGAGTCCGTCCCAGCAA  814
            |||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  492  ATACACTCCGTGCATCATGACAGTCATTCTTTCTCAAGTGTCTTTCTGGATTAATAAGGAGTCAGTCCCAGCAA  565

Query  815  GAACTGTTTTTGGGATCACCACTGTTTTAACTATGACCACTTTGAGCATCAGTGCCCGGCACTCTTTGCCAAAA  888
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||.|||
Sbjct  566  GAACTGTCTTTGGAATCACCACTGTTTTAACCATGACCACCTTAAGCATCAGTGCTCGGCACTCTCTACCCAAA  639

Query  889  GTGTCATATGCCACTGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTTTGCTTTGCATTCGTCTTCTCTGCTCTTATCGAGTT  962
            |||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.||
Sbjct  640  GTGTCCTATGCAACCGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTATGCTTTGCTTTTGTCTTTTCTGCTCTCATTGAATT  713

Query  963  CGCAGCTGTCAACTACTTTACCAATCTTCAGACACAGAAGGCCAAAAGGAAGGCACAGTTTGCAGCCCCACCCA  1036
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||..|||||.|||||||...|||||||.|.|||.
Sbjct  714  CGCAGCTGTCAACTACTTCACCAATCTCCAGTCACAGAAGGCTGAAAGGCAGGCACAAACTGCAGCCACGCCCC  787

Query 1037  CAGTGACAATATCAAAAGCTACTGAACCTTTGGAAGCTGAGATTGTTTTGCATCCTGACTCCAAATATCATCTG  1110
            |.|||.|||..||||||||..|||||.|..||.||||.|||||||||.|||||.||||||||||.||.||||||
Sbjct  788  CTGTGGCAAAGTCAAAAGCGTCTGAATCCCTGCAAGCAGAGATTGTTGTGCATTCTGACTCCAAGTACCATCTG  861

Query 1111  AAGAAAAGGATCACTTCTCTGTCTTTGCCAATAGTTTCATCTTCCGAGGCCAATAAAGTGCTCACGAGAGCGCC  1184
            |||||.||.||||..||||||.|||||||.||.|||.|||||||.|||||||..||||..||||..|||.||||
Sbjct  862  AAGAAGAGAATCAGCTCTCTGACTTTGCCCATCGTTCCATCTTCTGAGGCCAGCAAAGCCCTCAGTAGAACGCC  935

Query 1185  CATCTTACAATCAACACCTGTCACACCCCCACCACTCTCGCCAGCCTTTGGAGGCACCAGTAAAATAGACCAGT  1258
            |||||||.||||.||.||||||.|.||||||...||||..||||||..|||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct  936  CATCTTAAAATCGACGCCTGTCTCTCCCCCATTGCTCTTACCAGCCACTGGGGGCACCAGCAAAATAGATCAGT  1009

Query 1259  ATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTTGCATTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGGTAGTTTATCTTTCCAAAGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 1010  ATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTAGCTTTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGATAGTTTACCTTTCCAAAGAT  1083

Query 1333  ACAATGGAAGTGAGTAGCAGTGTTGAA  1359
            ||||||||||||||.||.|.||||||.
Sbjct 1084  ACAATGGAAGTGAGCAGTACTGTTGAG  1110