Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491918
• Subject: XM_011509892.3
• Aligned Length: 1826
• Identities: 1460
• Gaps: 355

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGATCTCCTGCCCCCCAAGCCCAAGTACAATCCACTCCGGAATGAGTCTCTGTCATCGCTGGAGGAAGGGGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTCTGGGTCCACCCCCCCGGAGGAGCTGCCTTCCCCATCAGCTTCATCCCTGGGGCCCATCCTGCCTCCTCTGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CTGGGGACGATAGTCCCACTACCCTGTGCTCCTTCTTCCCCCGGATGAGCAACCTGAGGCTGGCCAACCCGGCT  222

Query    1  ----------------------------------------ATGATTTTATTTTGACTGATAGTGACCTGTTCGT  34
                                                    .|||            ||||.|.||...|.||||
Sbjct  223  GGGGGGCGCCCAGGGTCTAAGGGGGAGCCAGGAAGGGCAGCTGA------------TGATGGGGAGGGGATCGT  284

Query   35  TGCAACAAATTGATGAGCAATGCTTTTTTATAATGCCA-ACTTTGTACAAAAAAGCAGGCAC------------  95
                        |.|.|||  ||        .|||||| |||             |||||.|            
Sbjct  285  ------------AGGGGCA--GC--------CATGCCAGACT-------------CAGGCCCCCTACCCCTCCT  323

Query   96  ------CATGAACAAGCTGAGTGGAGGCGGCGGGCGCAGGACTCGGGTGGAAGGGGGCCAGCTTGGGGGCGAGG  163
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  324  CCAGGACATGAACAAGCTGAGTGGAGGCGGCGGGCGCAGGACTCGGGTGGAAGGGGGCCAGCTTGGGGGCGAGG  397

Query  164  AGTGGACCCGCCACGGGAGCTTTGTCAATAAGCCCACGCGGGGCTGGCTGCATCCCAACGACAAAGTCATGGGA  237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  398  AGTGGACCCGCCACGGGAGCTTTGTCAATAAGCCCACGCGGGGCTGGCTGCATCCCAACGACAAAGTCATGGGA  471

Query  238  CCCGGGGTTTCCTACTTGGTTCGGTACATGGGTTGTGTGGAGGTCCTCCAGTCAATGCGTGCCCTGGACTTCAA  311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  472  CCCGGGGTTTCCTACTTGGTTCGGTACATGGGTTGTGTGGAGGTCCTCCAGTCAATGCGTGCCCTGGACTTCAA  545

Query  312  CACCCGGACTCAGGTCACCAGGGAGGCCATCAGTCTGGTGTGTGAGGCTGTGCCGGGTGCTAAGGGGGCGACAA  385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  546  CACCCGGACTCAGGTCACCAGGGAGGCCATCAGTCTGGTGTGTGAGGCTGTGCCGGGTGCTAAGGGGGCGACAA  619

Query  386  GGAGGAGAAAGCCCTGTAGCCGCCCGCTCAGCTCTATCCTGGGGAGGAGTAACCTGAAATTTGCTGGAATGCCA  459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  620  GGAGGAGAAAGCCCTGTAGCCGCCCGCTCAGCTCTATCCTGGGGAGGAGTAACCTGAAATTTGCTGGAATGCCA  693

Query  460  ATCACTCTCACCGTCTCCACCAGCAGCCTCAACCTCATGGCCGCAGACTGCAAACAGATCATCGCCAACCACCA  533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  694  ATCACTCTCACCGTCTCCACCAGCAGCCTCAACCTCATGGCCGCAGACTGCAAACAGATCATCGCCAACCACCA  767

Query  534  CATGCAATCTATCTCATTTGCATCCGGCGGGGATCCGGACACAGCCGAGTATGTCGCCTATGTTGCCAAAGACC  607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  768  CATGCAATCTATCTCATTTGCATCCGGCGGGGATCCGGACACAGCCGAGTATGTCGCCTATGTTGCCAAAGACC  841

Query  608  CTGTGAATCAGAGAGCCTGCCACATTCTGGAGTGTCCCGAAGGGCTTGCCCAGGATGTCATCAGCACCATTGGC  681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  CTGTGAATCAGAGAGCCTGCCACATTCTGGAGTGTCCCGAAGGGCTTGCCCAGGATGTCATCAGCACCATTGGC  915

Query  682  CAGGCCTTCGAGTTGCGCTTCAAACAATACCTCAGGAACCCACCCAAACTGGTCACCCCTCATGA---------  746
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  916  CAGGCCTTCGAGTTGCGCTTCAAACAATACCTCAGGAACCCACCCAAACTGGTCACCCCTCATGACAGCCACAG  989

Query  747  ------------------CAGGATGGCTGGCTTTGATGGCTCAGCATGGGATGAGGAGGAGGAAGAGCCACCTG  802
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  990  CTTCACTGTCCTGTCCCTCAGGATGGCTGGCTTTGATGGCTCAGCATGGGATGAGGAGGAGGAAGAGCCACCTG  1063

Query  803  ACCATCAGTACTATAATGACTTCCCGGGGAAGGAACCCCCCTTGGGGGGGGTGGTAGACATGAGGCTTCGGGAA  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064  ACCATCAGTACTATAATGACTTCCCGGGGAAGGAACCCCCCTTGGGGGGGGTGGTAGACATGAGGCTTCGGGAA  1137

Query  877  GGAGCCGCTCCAGGGGCTGCTCGACCCACTGCACCCAATGCCCAGACCCCCAGCCACTTGGGAGCTACATTGCC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138  GGAGCCGCTCCAGGGGCTGCTCGACCCACTGCACCCAATGCCCAGACCCCCAGCCACTTGGGAGCTACATTGCC  1211

Query  951  TGTAGGACAGCCTGTTGGGGGAGATCCAGAAGTCCGCAAACAGATGCCACCTCCACCACCCTGTCCAGCAGGCA  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1212  TGTAGGACAGCCTGTTGGGGGAGATCCAGAAGTCCGCAAACAGATGCCACCTCCACCACCCTGTCCAGCAGGCA  1285

Query 1025  GAGAGCTTTTTGATGATCCCTCCTATGTCAACGTCCAGAACCTAGACAAGGCCCGGCAAGCAGTGGGTGGTGCT  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1286  GAGAGCTTTTTGATGATCCCTCCTATGTCAACGTCCAGAACCTAGACAAGGCCCGGCAAGCAGTGGGTGGTGCT  1359

Query 1099  GGGCCCCCCAATCCTGCTATCAATGGCAGTGCACCCCGGGACCTGTTTGACATGAAGCCCTTCGAAGATGCTCT  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1360  GGGCCCCCCAATCCTGCTATCAATGGCAGTGCACCCCGGGACCTGTTTGACATGAAGCCCTTCGAAGATGCTCT  1433

Query 1173  TCGCGTGCCTCCACCTCCCCAGTCGGTGTCCATGGCTGAGCAGCTCCGAGGGGAGCCCTGGTTCCATGGGAAGC  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1434  TCGCGTGCCTCCACCTCCCCAGTCGGTGTCCATGGCTGAGCAGCTCCGAGGGGAGCCCTGGTTCCATGGGAAGC  1507

Query 1247  TGAGCCGGCGGGAGGCTGAGGCACTGCTGCAGCTCAATGGGGACTTCCTGGTACGGGAGAGCACGACCACACCT  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1508  TGAGCCGGCGGGAGGCTGAGGCACTGCTGCAGCTCAATGGGGACTTCCTGGTACGGGAGAGCACGACCACACCT  1581

Query 1321  GGCCAGTATGTGCTCACTGGCTTGCAGAGTGGGCAGCCTAAGCATTTGCTACTGGTGGACCCTGAGGGTGTGGT  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1582  GGCCAGTATGTGCTCACTGGCTTGCAGAGTGGGCAGCCTAAGCATTTGCTACTGGTGGACCCTGAGGGTGTGGT  1655

Query 1395  TCGGACTAAGGATCACCGCTTTGAAAGTGTCAGTCACCTTATCAGCTACCACATGGACAATCACTTGCCCATCA  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1656  TCGGACTAAGGATCACCGCTTTGAAAGTGTCAGTCACCTTATCAGCTACCACATGGACAATCACTTGCCCATCA  1729

Query 1469  TCTCTGCGGGCAGCGAACTGTGTCTACAGCAACCTGTGGAGCGGAAACTG  1518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1730  TCTCTGCGGGCAGCGAACTGTGTCTACAGCAACCTGTGGAGCGGAAACTG  1779