Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491918
• Subject: XM_017002082.2
• Aligned Length: 1799
• Identities: 1403
• Gaps: 385

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGATCTCCTGCCCCCCAAGCCCAAGTACAATCCACTCCGGAATGAGTCTCTGTCATCGCTGGAGGAAGGGGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTCTGGGTCCACCCCCCCGGAGGAGCTGCCTTCCCCATCAGCTTCATCCCTGGGGCCCATCCTGCCTCCTCTGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CTGGGGACGATAGTCCCACTACCCTGTGCTCCTTCTTCCCCCGGATGAGCAACCTGAGGCTGGCCAACCCGGCT  222

Query    1  ----------------------------------------ATGATTTTATTTTGACTGATAGTGACCTGTTCGT  34
                                                    .|||            ||||.|.||...|.||||
Sbjct  223  GGGGGGCGCCCAGGGTCTAAGGGGGAGCCAGGAAGGGCAGCTGA------------TGATGGGGAGGGGATCGT  284

Query   35  TGCAACAAATTGATGAGCAATGCTTTTTTATAATGCCA-ACTTTGTACAAAAAAGCAGGCAC------------  95
                        |.|.|||  ||        .|||||| |||             |||||.|            
Sbjct  285  ------------AGGGGCA--GC--------CATGCCAGACT-------------CAGGCCCCCTACCCCTCCT  323

Query   96  ------CATGAACAAGCTGAGTGGAGGCGGCGGGCGCAGGACTCGGGTGGAAGGGGGCCAGCTTGGGGGCGAGG  163
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  324  CCAGGACATGAACAAGCTGAGTGGAGGCGGCGGGCGCAGGACTCGGGTGGAAGGGGGCCAGCTTGGGGGCGAGG  397

Query  164  AGTGGACCCGCCACGGGAGCTTTGTCAATAAGCCCACGCGGGGCTGGCTGCATCCCAACGACAAAGTCATGGGA  237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  398  AGTGGACCCGCCACGGGAGCTTTGTCAATAAGCCCACGCGGGGCTGGCTGCATCCCAACGACAAAGTCATGGGA  471

Query  238  CCCGGGGTTTCCTACTTGGTTCGGTACATGGGTTGTGTGGAGGTCCTCCAGTCAATGCGTGCCCTGGACTTCAA  311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  472  CCCGGGGTTTCCTACTTGGTTCGGTACATGGGTTGTGTGGAGGTCCTCCAGTCAATGCGTGCCCTGGACTTCAA  545

Query  312  CACCCGGACTCAGGTCACCAGGGAGGCCATCAGTCTGGTGTGTGAGGCTGTGCCGGGTGCTAAGGGGGCGACAA  385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  546  CACCCGGACTCAGGTCACCAGGGAGGCCATCAGTCTGGTGTGTGAGGCTGTGCCGGGTGCTAAGGGGGCGACAA  619

Query  386  GGAGGAGAAAGCCCTGTAGCCGCCCGCTCAGCTCTATCCTGGGGAGGAGTAACCTGAAATTTGCTGGAATGCCA  459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  620  GGAGGAGAAAGCCCTGTAGCCGCCCGCTCAGCTCTATCCTGGGGAGGAGTAACCTGAAATTTGCTGGAATGCCA  693

Query  460  ATCACTCTCACCGTCTCCACCAGCAGCCTCAACCTCATGGCCGCAGACTGCAAACAGATCATCGCCAACCACCA  533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  694  ATCACTCTCACCGTCTCCACCAGCAGCCTCAACCTCATGGCCGCAGACTGCAAACA------------------  749

Query  534  CATGCAATCTATCTCATTTGCATCCGGCGGGGATCCGGACACAGCCGAGTATGTCGCCTATGTTGCCAAAGACC  607
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  750  ------------------------------------GGACACAGCCGAGTATGTCGCCTATGTTGCCAAAGACC  787

Query  608  CTGTGAATCAGAGAGCCTGCCACATTCTGGAGTGTCCCGAAGGGCTTGCCCAGGATGTCATCAGCACCATTGGC  681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  CTGTGAATCAGAGAGCCTGCCACATTCTGGAGTGTCCCGAAGGGCTTGCCCAGGATGTCATCAGCACCATTGGC  861

Query  682  CAGGCCTTCGAGTTGCGCTTCAAACAATACCTCAGGAACCCACCCAAACTGGTCACCCCTCATGACAGGATGGC  755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  CAGGCCTTCGAGTTGCGCTTCAAACAATACCTCAGGAACCCACCCAAACTGGTCACCCCTCATGACAGGATGGC  935

Query  756  TGGCTTTGATGGCTCAGCATGGGATGAGGAGGAGGAAGAGCCACCTGACCATCAGTACTATAATGACTTCCCGG  829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  TGGCTTTGATGGCTCAGCATGGGATGAGGAGGAGGAAGAGCCACCTGACCATCAGTACTATAATGACTTCCCGG  1009

Query  830  GGAAGGAACCCCCCTTGGGGGGGGTGGTAGACATGAGGCTTCGGGAAGGAGCCGCTCCAGGGGCTGCTCGACCC  903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  GGAAGGAACCCCCCTTGGGGGGGGTGGTAGACATGAGGCTTCGGGAAGGAGCCGCTCCAGGGGCTGCTCGACCC  1083

Query  904  ACTGCACCCAATGCCCAGACCCCCAGCCACTTGGGAGCTACATTGCCTGTAGGACAGCCTGTTGGGGGAGATCC  977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  ACTGCACCCAATGCCCAGACCCCCAGCCACTTGGGAGCTACATTGCCTGTAGGACAGCCTGTTGGGGGAGATCC  1157

Query  978  AGAAGTCCGCAAACAGATGCCACCTCCACCACCCTGTCCAGCAGGCAGAGAGCTTTTTGATGATCCCTCCTATG  1051
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  AGAAGTCCGCAAACAGATGCCACCTCCACCACCCTGTC---CAGGCAGAGAGCTTTTTGATGATCCCTCCTATG  1228

Query 1052  TCAACGTCCAGAACCTAGACAAGGCCCGGCAAGCAGTGGGTGGTGCTGGGCCCCCCAATCCTGCTATCAATGGC  1125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229  TCAACGTCCAGAACCTAGACAAGGCCCGGCAAGCAGTGGGTGGTGCTGGGCCCCCCAATCCTGCTATCAATGGC  1302

Query 1126  AGTGCACCCCGGGACCTGTTTGACATGAAGCCCTTCGAAGATGCTCTTCGCGTGCCTCCACCTCCCCAGTCGGT  1199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303  AGTGCACCCCGGGACCTGTTTGACATGAAGCCCTTCGAAGATGCTCTTCGCGTGCCTCCACCTCCCCAGTCGGT  1376

Query 1200  GTCCATGGCTGAGCAGCTCCGAGGGGAGCCCTGGTTCCATGGGAAGCTGAGCCGGCGGGAGGCTGAGGCACTGC  1273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377  GTCCATGGCTGAGCAGCTCCGAGGGGAGCCCTGGTTCCATGGGAAGCTGAGCCGGCGGGAGGCTGAGGCACTGC  1450

Query 1274  TGCAGCTCAATGGGGACTTCCTGGTACGGGAGAGCACGACCACACCTGGCCAGTATGTGCTCACTGGCTTGCAG  1347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451  TGCAGCTCAATGGGGACTTCCTGGTACGGGAGAGCACGACCACACCTGGCCAGTATGTGCTCACTGGCTTGCAG  1524

Query 1348  AGTGGGCAGCCTAAGCATTTGCTACTGGTGGACCCTGAGGGTGTGGTTCGGACTAAGGATCACCGCTTTGAAAG  1421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525  AGTGGGCAGCCTAAGCATTTGCTACTGGTGGACCCTGAGGGTGTGGTTCGGACTAAGGATCACCGCTTTGAAAG  1598

Query 1422  TGTCAGTCACCTTATCAGCTACCACATGGACAATCACTTGCCCATCATCTCTGCGGGCAGCGAACTGTGTCTAC  1495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599  TGTCAGTCACCTTATCAGCTACCACATGGACAATCACTTGCCCATCATCTCTGCGGGCAGCGAACTGTGTCTAC  1672

Query 1496  AGCAACCTGTGGAGCGGAAACTG  1518
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673  AGCAACCTGTGGAGCGGAAACTG  1695