Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491961
• Subject: NM_001083537.2
• Aligned Length: 1158
• Identities: 842
• Gaps: 270

Alignment

Query    1  ATGGCGCCCGAGGAGAACGCGGGGACCGAACTCTTGCTGCAGAGTTTCGAGCGCCGCTTCCTGGCGGCACGCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||..|||||
Sbjct    1  ATGGCGCCCGAGGAGAACGCGGGGACCGAACTCTTGCTGCAGGGTTTTGAGCGCCGCTTCCTGGCGGTGCGCAC  74

Query   75  ACTGCGCTCCTTCCCCTGGCAGGTGGGCGGCGGGGCGAGCGGAGAGGCCCGCGGGGCTCGCGGGAGTCCAGGGG  148
            ||||||||||||||||||                                                        
Sbjct   75  ACTGCGCTCCTTCCCCTG--------------------------------------------------------  92

Query  149  CAGACGGGACGGGTCTCCGTGCTGAAGCCCCTGGCGCTCCCGCCACTAATCGTTCTGGTCACTGGGACACAGCT  222
                                                                                      
Sbjct   93  --------------------------------------------------------------------------  92

Query  223  GCCCTCGCCCATTCTAAAAAGTCAGCGCCGTCAGGACCGCAGAGCTTAGAAGCAAAGTTAAGAGACTCATCAGA  296
                                                  ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   93  --------------------------------------GCAGAGCTTAGAGGCAAAGTTAAGAGACTCATCAGA  128

Query  297  TTCTGAGCTGCTGCGGGATATTTTGCACAAGACTGTGAAGCATCCTGTGTGTGTGAAGCACCCGCCGTCCGTCA  370
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  129  TTCTGAGCTGCTGCGGGATATTTTGCAGAAGACTGTGAGGCATCCTGTGTGTGTGAAGCACCCGCCGTCAGTCA  202

Query  371  AATATGCCCGGTGCTTTCTCTCAGAACTCATCAAAAAGCACGAGGCTGTCCACACAGAGCCTTTGGACGAGCTG  444
            |.||||||.||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct  203  AGTATGCCTGGTGCTTTCTCTCAGAACTCATCAAAAA-------------------------------------  239

Query  445  TATGAAGCGCTGGCGGAGACCCTGATGGCCAAGGAGTCCACCCAGGGCCACCGGAGCTATTTGCTGCCCTCGGG  518
                                                                             |.||||.||
Sbjct  240  -----------------------------------------------------------------GTCCTCAGG  248

Query  519  AGGCTCGGTCACACTCTCCGAGAGCACGGCCATCATCTCCTACGGTACCACAGGCCTGGTCACATGGGACGCCG  592
            ||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  249  AGGCTCAGTCACACTCTCCAAGAGCACAGCCATCATCTCCCACGGTACCACAGGCCTGGTCACATGGGATGCCG  322

Query  593  CCCTCTACCTTGCAGAATGGGCCATCGAGAACCCGGCAGTCTTCACTAACAGGACTGTCCTAGAGCTTGGCAGT  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  323  CCCTCTACCTTGCAGAATGGGCCATCGAGAACCCGGCAGCCTTCATTAACAGGACTGTCCTAGAGCTTGGCAGT  396

Query  667  GGTGTTGGCCTCACAGGCCTGGCCATCTGCAAGATGTGCCGCCCCCGGGCATACATCTTCAGCGACTGTCACAG  740
            ||||..||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct  397  GGTGCCGGCCTCACAGGCCTTGCCATCTGCAAGATGTGCCGCCCCCGGGCATACATCTTCAGCGACCCTCACAG  470

Query  741  CCGGGTCCTTGAGCAGCTCCGAGGGAATGTCCTTCTCAATGGCCTCTCATTAGAGGCAGACATCACTGCCAAGT  814
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct  471  CCGGGTCCTCGAGCAGCTCCGAGGGAATGTCCTTCTCAATGGCCTCTCATTAGAGGCAGACATCACTGGCAACT  544

Query  815  TAGACAGCCCCAGGGTGACAGTGGCCCAGCTGGACTGGGACGTCGCGACGGTCCATCAGCTCTCTGCCTTCCAG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  545  TAGACAGCCCCAGGGTGACAGTGGCCCAGCTGGACTGGGACGTAGCAATGGTCCATCAGCTCTCTGCCTTCCAG  618

Query  889  CCAGATGTTGTCATTGCAGCAGATGTGCTGTATTGCCCAGAAGCCATCATGTCGCTGGTCGGCGTCCTGCGGAG  962
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct  619  CCAGATGTTGTCATTGCAGCAGACGTGCTGTATTGCCCAGAAGCCATCGTGTCGCTGGTCGGGGTCCTGCAGAG  692

Query  963  GCTGGCTGCCTGCCGGGAGGACCAGCGGGCTCCTGAGGTCTACGTGGCCTTTACCGTCCGCAACCCAGAGACGT  1036
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  GCTGGCTGCCTGCCGGGAGCACAAGCGGGCTCCTGAGGTCTACGTGGCCTTTACCGTCCGCAACCCAGAGACGT  766

Query 1037  GCCAGCTGTTCACCACCGAGCTAGGCCGGGCCGGGATCAGATGGGAAGTGGAACCTCGTCATGAGCAGAAACTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||.|||.||||||.|||||||||
Sbjct  767  GCCAGCTGTTCACCACCGAGCTAGGCCGGGATGGGATCAGATGGGAAGCGGAAGCTCATCATGACCAGAAACTG  840

Query 1111  TTTCCCTACGAAGAGCACTTGGAGATGGCAATGCTGAATCTCACCCTG  1158
            ||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  841  TTTCCCTATGGAGAGCACTTGGAGATGGCAATGCTGAACCTCACACTG  888