Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491967
- Subject:
- XM_017018399.1
- Aligned Length:
- 1989
- Identities:
- 1448
- Gaps:
- 540
Alignment
Query 1 ATGGCGGGGATGAAGACAGCCTCCGGGGACTACATCGACTCGTCATGGGAGCTGCGGGTGTTTGTGGGAGAGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGACCCAGAGGCCGAGTCGGTCACCCTGCGGGTCACTGGGGAGTCGCACATCGGCGGGGTGCTCCTGAAGATTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGAGCAGATCAATCGCAAGCAGGACTGGTCAGACCATGCTATTTGGTGGGAACAGAAGAGGCAGTGGCTGCTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CAGACCCACTGGACACTGGACAAGTACGGGATCCTGGCCGACGCACGCCTCTTCTTTGGGCCCCAGCACCGGCC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CGTCATCCTTCGGTTGCCCAACCGCCGCGCACTGCGCCTCCGTGCCAGCTTCTCCCAGCCCCTCTTCCAGGCTG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TGGCTGCCATCTGCCGCCTCCTCAGCATCCGGCACCCCGAGGAGCTGTCCCTGCTCCGGGCTCCTGAGAAGAAG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GAGAAGAAGAAGAAAGAGAAGGAGCCAGAGGAAGAGCTCTATGACTTGAGCAAGGTTGTCTTGGCTGGGGGCGT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 GGCACCTGCACTGTTCCGGGGGATGCCAGCTCACTTCTCGGACAGCGCCCAGACTGAGGCCTGCTACCACATGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------ATGCCAGCTCACTTCTCGGACAGCGCCCAGACTGAGGCCTGCTACCACATGC 52
Query 593 TGAGCCGGCCCCAGCCGCCACCCGACCCCCTCCTGCTCCAGCGTCTGCCACGGCCCAGCTCCCTGTCAGACAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 TGAGCCGGCCCCAGCCGCCACCCGACCCCCTCCTGCTCCAGCGTCTGCCACGGCCCAGCTCCCTGTCAGACAAG 126
Query 667 ACCCAGCTCCACAGCAGGTGGCTGGACTCGTCGCGGTGTCTCATGCAGCAGGGCATCAAGGCTGGGGACGCACT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 127 ACCCAGCTCCACAGCAGGTGGCTGGACTCGTCGCGGTGTCTCATGCAGCAGGGCATCAAGGCCGGGGACGCACT 200
Query 741 CTGGCTGCGCTTCAAGTACTACAGCTTCTTCGATTTGGATCCCAAGACAGACCCCGTGCGGCTGACACAGCTGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 CTGGCTGCGCTTCAAGTACTACAGCTTCTTCGATTTGGATCCCAAGACAGACCCCGTGCGGCTGACACAGCTGT 274
Query 815 ATGAGCAGGCCCGGTGGGACCTGCTGCTGGAGGAGATTGACTGCACCGAGGAGGAGATGATGGTGTTTGCCGCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 ATGAGCAGGCCCGGTGGGACCTGCTGCTGGAGGAGATTGACTGCACCGAGGAGGAGATGATGGTGTTTGCCGCC 348
Query 889 CTGCAGTACCACATCAACAAGCTGTCCCAGAGCGGGGAGGTGGGGGAGCCGGCTGGCACAGACCCAGGGCTGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 CTGCAGTACCACATCAACAAGCTGTCCCAGAGCGGGGAGGTGGGGGAGCCGGCTGGCACAGACCCAGGGCTGGA 422
Query 963 CGACCTGGATGTGGCCCTGAGCAACCTGGAGGTGAAGCTGGAGGGGTCGGCGCCCACAGATGTGCTGGACAGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 CGACCTGGATGTGGCCCTGAGCAACCTGGAGGTGAAGCTGGAGGGGTCGGCGCCCACAGATGTGCTGGACAGCC 496
Query 1037 TCACCACCATCCCAGAGCTCAAGGACCATCTCCGAATCTTTCGGCCCCGGAAGCTGACCCTGAAGGGCTACCGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 TCACCACCATCCCAGAGCTCAAGGACCATCTCCGAATCTTTCGGCCCCGGAAGCTGACCCTGAAGGGCTACCGC 570
Query 1111 CAACACTGGGTGGTGTTCAAGGAGACCACACTGTCCTACTACAAGAGCCAGGACGAGGCCCCTGGGGACCCCAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 CAACACTGGGTGGTGTTCAAGGAGACCACACTGTCCTACTACAAGAGCCAGGACGAGGCCCCTGGGGACCCCAT 644
Query 1185 TCAGCAGCTCAACCTCAAGGGCTGTGAGGTGGTTCCCGATGTTAACGTCTCCGGCCAGAAGTTCTGCATTAAAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 TCAGCAGCTCAACCTCAAGGGCTGTGAGGTGGTTCCCGATGTTAACGTCTCCGGCCAGAAGTTCTGCATTAAAC 718
Query 1259 TCCTAGTGCCCTCCCCTGAGGGCATGAGTGAGATCTACCTGCGGTGCCAGGATGAGCAGCAGTATGCCCGCTGG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 TCCTAGTGCCCTCCCCTGAGGGCATGAGTGAGATCTACCTGCGGTGCCAGGATGAGCAGCAGTATGCCCGCTGG 792
Query 1333 ATGGCTGGCTGCCGCCTGGCCTCCAAAGGCCGCACCATGGCCGACAGCAGCTACACCAGCGAGGTGCAGGCCAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 ATGGCTGGCTGCCGCCTGGCCTCCAAAGGCCGCACCATGGCCGACAGCAGCTACACCAGCGAGGTGCAGGCCAT 866
Query 1407 CCTGGCCTTCCTCAGCCTGCAGCGCACGGGCAGTGGGGGCCCGGGCAACCACCCCCACGGCCCTGATGCCTCTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 CCTGGCCTTCCTCAGCCTGCAGCGCACGGGCAGTGGGGGCCCGGGCAACCACCCCCACGGCCCTGATGCCTCTG 940
Query 1481 CCGAGGGCCTCAACCCCTACGGCCTCGTTGCCCCCCGTTTCCAGCGAAAGTTCAAGGCCAAGCAGCTCACCCCA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 CCGAGGGCCTCAACCCCTACGGCCTCGTTGCCCCCCGTTTCCAGCGAAAGTTCAAGGCCAAGCAGCTCACCCCA 1014
Query 1555 CGGATCCTGGAAGCCCACCAGAATGTGGCCCAGTTGTCGCTGGCAGAGGCCCAGCTGCGCTTCATCCAGGCCTG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 CGGATCCTGGAAGCCCACCAGAATGTGGCCCAGTTGTCGCTGGCAGAGGCCCAGCTGCGCTTCATCCAGGCCTG 1088
Query 1629 GCAGTCCCTGCCCGACTTCGGCATCTCCTATGTCATGGTCAGGTTCAAGGGCAGCAGGAAAGACGAGATCCTGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 GCAGTCCCTGCCCGACTTCGGCATCTCCTATGTCATGGTCAGGTTCAAGGGCAGCAGGAAAGACGAGATCCTGG 1162
Query 1703 GCATCGCCAACAACCGACTGATCCGCATCGACTTGGCCGTGGGCGACGTGGTCAAGACCTGGCGTTTCAGCAAC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 GCATCGCCAACAACCGACTGATCCGCATCGACTTGGCCGTGGGCGACGTGGTCAAGACCTGGCGTTTCAGCAAC 1236
Query 1777 ATGCGCCAGTGGAATGTCAACTGGGACATCCGGCAGGTGGCCATCGAGTTTGATGAACACATCAATGTGGCCTT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 ATGCGCCAGTGGAATGTCAACTGGGACATCCGGCAGGTGGCCATCGAGTTTGATGAACACATCAATGTGGCCTT 1310
Query 1851 CAGCTGCGTGTCTGCCAGCTGCCGAATTGTACACGAGTATATCGGGGGCTACATTTTCCTGTCGACGCGGGAGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 CAGCTGCGTGTCTGCCAGCTGCCGAATTGTACACGAGTATATCGGGGGCTACATTTTCCTGTCGACGCGGGAGC 1384
Query 1925 GGGCCCGTGGGGAGGAGCTGGATGAAGACCTCTTCCTGCAGCTCACCGGGGGCCATGAGGCCTTC 1989
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 GGGCCCGTGGGGAGGAGCTGGATGAAGACCTCTTCCTGCAGCTCACCGGGGGCCATGAGGCCTTC 1449