Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491974
• Subject: NM_001289916.1
• Aligned Length: 1404
• Identities: 1283
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGATGTATTTTGTGATCGCAGCGATGAAAGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATC  74
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---ATGTATTTTGTGATCGCAGCGATGAAAGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATC  71

Query   75  ATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATG  148
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   72  GTCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACGTGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAGAGCAATG  145

Query  149  CCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGA  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  146  CCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGGACCAGCAGAAACCGCTGCCAGCATTGTCGG  219

Query  223  TTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGA  296
            .|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  220  CTGCAGAAATGCCTGGCCGTGGGGATGTCTCGAGATGCTGTCAAGTTTGGTCGGATGTCCAAGAAGCAGAGAGA  293

Query  297  CAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGG  370
            |||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  294  CAGCTTGTACGCCGAGGTGCAGAAGCACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGAGACCACCAGCAGCAGCCTGGGGAGG  367

Query  371  CTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTAC  444
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|.|||.
Sbjct  368  CGGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCAGCCAATGGGCTGACGGAACTGCATGATGACCTCAGCACCTAT  441

Query  445  ATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTC  518
            ||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  442  ATGGATGGGCACACCCCCGAGGGCAGCAAGGCCGACTCAGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATCCAGCCCTC  515

Query  519  CCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCT  592
            ||||||||||||.||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  516  CCCAGACCAGTCGGGATTGGACATCAATGGGATCAAACCCGAACCCATATGTGACTACACACCAGCATCTGGCT  589

Query  593  TCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCA  666
            ||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.
Sbjct  590  TCTTCCCCTACTGTTCCTTCACCAACGGAGAGACTTCCCCAACCGTGTCCATGGCAGAACTAGAACACCTTGCC  663

Query  667  CAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGAC  740
            |||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  CAGAACATATCCAAATCCCACCTGGAAACCTGCCAGTACTTGCGGGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGAC  737

Query  741  CTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAA  814
            |||..|.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||..|||||||||||||.|
Sbjct  738  CTTCCTGCAGGAGGAGATTGAAAACTACCAGAACAAGCAGAGAGAGGTGATGTGGCAGCTGTGTGCCATCAAGA  811

Query  815  TTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGAT  888
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  812  TTACAGAAGCTATCCAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAGCTGTGTCAAAATGAT  885

Query  889  CAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAA  962
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  CAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGCTCGCTAGAGGTGGTGTTTATTAGGATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAA  959

Query  963  CAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTA  1036
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|
Sbjct  960  CAACACCGTGTACTTTGACGGGAAGTATGCGAGCCCCGATGTCTTCAAGTCCCTAGGTTGTGAAGACTTCATCA  1033

Query 1037  GCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCA  1110
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1034  GCTTTGTGTTTGAATTTGGGAAGAGTTTGTGTTCTATGCACCTGACCGAAGACGAAATCGCGTTATTTTCTGCA  1107

Query 1111  TTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCA  1184
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1108  TTCGTACTGATGTCAGCGGATCGCTCGTGGCTTCAGGAAAAGGTAAAAATAGAAAAGCTGCAACAGAAAATTCA  1181

Query 1185  GCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGT  1258
            |||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1182  GCTGGCCCTTCAGCACGTCCTACAGAAGAACCACCGAGAAGATGGAATTCTAACCAAGCTAATATGCAAGGTGT  1255

Query 1259  CTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTG  1332
            ||||.|||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  CTACGTTAAGAGCCCTATGTGGACGACATACGGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTG  1329

Query 1333  CGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCAATGCAAATTGATGGG  1404
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1330  CGACTCCATTTTCCTCCATTATACAAGGAATTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCCATGCAAATCGATGGG  1401