Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491974
• Subject: NM_002943.3
• Aligned Length: 1644
• Identities: 1396
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAATGAGGGGGCCCCAGGAGACAGTGACTTAGAGACTGAGGCAAGAGTGCCGTGGTCAATCATGGGTCATTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCTTCGAACTGGACAGGCCAGAATGTCTGCCACACCCACACCTGCAGGTGAAGGAGCCAGAAGCTCTTCAACCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GTAGCTCCCTGAGCAGGCTGTTCTGGTCTCAACTTGAGCACATAAACTGGGATGGAGCCACAGCCAAGAACTTT  222

Query    1  ----AT------GA-----TGTATTTTGTGATC---GCAGCGATGAAAGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAA  56
                ||      ||     |.|.||||.||.||   |||..||..|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTAATTTAAGGGAGTTCTTCTCTTTTCTGCTCCCTGCATTGAGAAAAGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAA  296

Query   57  GATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGA  130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGA  370

Query  131  GAAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAGAAAC  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAGAAAC  444

Query  205  CGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAAT  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAAT  518

Query  279  GTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACC  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACC  592

Query  353  AGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCAC  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCAC  666

Query  427  GACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTA  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTA  740

Query  501  CCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACT  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACT  814

Query  575  ACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCA  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCA  888

Query  649  GAATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCA  962

Query  723  GCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGC  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGC  1036

Query  797  AATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATG  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATG  1110

Query  871  GAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCG  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCG  1184

Query  945  TGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAG  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAG  1258

Query 1019  GTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAA  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAA  1332

Query 1093  ATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAA  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAA  1406

Query 1167  ACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAA  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAA  1480

Query 1241  AGTTAATATGCAAGGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCA  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGTTAATATGCAAGGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCA  1554

Query 1315  ATATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGC  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGC  1628

Query 1389  AATGCAAATTGATGGG  1404
            ||||||||||||||||
Sbjct 1629  AATGCAAATTGATGGG  1644