Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491974
• Subject: XM_006510877.3
• Aligned Length: 1561
• Identities: 1280
• Gaps: 158

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAGGAGCTCATGTGGCTCTCTCATTGCTTCCCTTCCCCGTCTGTAGAATGGGAGCGCGAACAGTTGCCTCC  74

Query    1  --------------------------------------ATGATGT-----ATTTTG------------------  13
                                                  |.||.||     |.||||                  
Sbjct   75  TTCAGGGATGCTGTGCACACGGAAGTCAAAACAAGCTAACGAGGTCCAAAACTTTGAAAACCGCACAGAGCTCT  148

Query   14  ------------TGATCG-CAGCGAT----GAAA-----GCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGG  65
                        || ||| |||.|.|    ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGAACTCTGGGCTG-TCGTCAGTGCTGCCGGAAAATGGCGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGG  221

Query   66  AGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGC  139
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  AGACAAATCGTCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACGTGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGC  295

Query  140  AAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAA  213
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  296  AGAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGGACCAGCAGAAACCGCTGCCAG  369

Query  214  CACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAA  287
            ||.|||||..|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||
Sbjct  370  CATTGTCGGCTGCAGAAATGCCTGGCCGTGGGGATGTCTCGAGATGCTGTCAAGTTTGGTCGGATGTCCAAGAA  443

Query  288  GCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGC  361
            ||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  444  GCAGAGAGACAGCTTGTACGCCGAGGTGCAGAAGCACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGAGACCACCAGCAGCAGC  517

Query  362  CTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTC  435
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct  518  CTGGGGAGGCGGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCAGCCAATGGGCTGACGGAACTGCATGATGACCTC  591

Query  436  AGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACAT  509
            ||.|.|||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  AGCACCTATATGGATGGGCACACCCCCGAGGGCAGCAAGGCCGACTCAGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACAT  665

Query  510  ACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTACACACCAG  583
            .|||||.||||||||||||||.||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  666  CCAGCCCTCCCCAGACCAGTCGGGATTGGACATCAATGGGATCAAACCCGAACCCATATGTGACTACACACCAG  739

Query  584  CATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAA  657
            ||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct  740  CATCTGGCTTCTTCCCCTACTGTTCCTTCACCAACGGAGAGACTTCCCCAACCGTGTCCATGGCAGAACTAGAA  813

Query  658  CACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAAC  731
            ||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CACCTTGCCCAGAACATATCCAAATCCCACCTGGAAACCTGCCAGTACTTGCGGGAAGAGCTCCAGCAGATAAC  887

Query  732  GTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTG  805
            ||||||||||||..|.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||..||||||
Sbjct  888  GTGGCAGACCTTCCTGCAGGAGGAGATTGAAAACTACCAGAACAAGCAGAGAGAGGTGATGTGGCAGCTGTGTG  961

Query  806  CCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAACTGTGT  879
            |||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  962  CCATCAAGATTACAGAAGCTATCCAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAGCTGTGT  1035

Query  880  CAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGA  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1036  CAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGCTCGCTAGAGGTGGTGTTTATTAGGATGTGCCGTGCCTTTGA  1109

Query  954  CTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAG  1027
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||||
Sbjct 1110  CTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGACGGGAAGTATGCGAGCCCCGATGTCTTCAAGTCCCTAGGTTGTGAAG  1183

Query 1028  ACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTA  1101
            ||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 1184  ACTTCATCAGCTTTGTGTTTGAATTTGGGAAGAGTTTGTGTTCTATGCACCTGACCGAAGACGAAATCGCGTTA  1257

Query 1102  TTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACA  1175
            |||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1258  TTTTCTGCATTCGTACTGATGTCAGCGGATCGCTCGTGGCTTCAGGAAAAGGTAAAAATAGAAAAGCTGCAACA  1331

Query 1176  GAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAAGTTAATAT  1249
            ||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.||||||
Sbjct 1332  GAAAATTCAGCTGGCCCTTCAGCACGTCCTACAGAAGAACCACCGAGAAGATGGAATTCTAACCAAGCTAATAT  1405

Query 1250  GCAAGGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCA  1323
            |||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  GCAAGGTGTCTACGTTAAGAGCCCTATGTGGACGACATACGGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCA  1479

Query 1324  GACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCAATGCAAAT  1397
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1480  GACATTGTGCGACTCCATTTTCCTCCATTATACAAGGAATTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCCATGCAAAT  1553

Query 1398  TGATGGG  1404
            .||||||
Sbjct 1554  CGATGGG  1560