Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491974
- Subject:
- XM_011521874.1
- Aligned Length:
- 1588
- Identities:
- 1384
- Gaps:
- 197
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCGGGTGACCGTAGCTCCCCAGACCAAACCTGTCTTTTCCACCAACGAGCTGGCGCATTTATCGCCCCCGAG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGCTCCGGCAAGCCAGCGGGAGAGTGGCGTCGGGTTGCGAGCCTCTTGCCCCACCGAGTGGGGGCAGAAAGTGG 148
Query 1 ------------------------------------ATGATGTATTTTGTGATCGCAGCGATGAAAGCTCAAAT 38
| |.||.|| |||...|.|||||||||
Sbjct 149 TCAGAGGCGCGTTCCGCGGGGCGCTGCGTGCAGAAAA-----------GCGACCG--GCGGCCACAGCTCAAAT 209
Query 39 TGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCT 112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 TGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCT 283
Query 113 GCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATT 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284 GCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATT 357
Query 187 GATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGC 260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 GATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGC 431
Query 261 TGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGC 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432 TGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGC 505
Query 335 AGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAAC 408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 506 AGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAAC 579
Query 409 GGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTC 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580 GGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTC 653
Query 483 CGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAAC 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 654 CGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAAC 727
Query 557 CAGAACCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCC 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 728 CAGAACCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCC 801
Query 631 CCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATA 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 802 CCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATA 875
Query 705 CTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGC 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 876 CTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGC 949
Query 779 AGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAA 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 AGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAA 1023
Query 853 CGCATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGT 926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024 CGCATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGT 1097
Query 927 GTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098 GTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCG 1171
Query 1001 ACGTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATG 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172 ACGTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATG 1245
Query 1075 CACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGA 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246 CACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGA 1319
Query 1149 AAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAG 1222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 AAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAG 1393
Query 1223 AAGATGGAATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAG 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 AAGATGGAATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGTCTACCTTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAG 1467
Query 1297 CTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCAC 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468 CTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCAC 1541
Query 1371 TTCAGAATTTGAGCCAGCAATGCAAATTGATGGG 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542 TTCAGAATTTGAGCCAGCAATGCAAATTGATGGG 1575