Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491974
- Subject:
- XM_011521875.2
- Aligned Length:
- 1512
- Identities:
- 1397
- Gaps:
- 108
Alignment
Query 1 ----------------------------------------------------------------------ATGA 4
|||.
Sbjct 1 ATGGCTGATGTGCTGCTTGAGGGTGCTGTGTCAAGCAGCAAATGGGAAACTGAAGCAATCCGTACTACCCATGC 74
Query 5 TGT-ATTTTG---------------TG----------ATCGCAG---CGATGAA---------AGCTCAAATTG 40
||| .||.|| || |||.||| |||.||| |.|||||||||
Sbjct 75 TGTCCTTCTGAAGAAGCCACCAGGCTGGAAGTCAGGTATCTCAGTAACGAAGAAGACACATACATCTCAAATTG 148
Query 41 AAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGC 114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGC 222
Query 115 AAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGA 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGA 296
Query 189 TCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTG 262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTG 370
Query 263 TAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAG 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAG 444
Query 337 CAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGG 410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGG 518
Query 411 GCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCG 484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCG 592
Query 485 CCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCA 558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCA 666
Query 559 GAACCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCC 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAACCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCC 740
Query 633 AACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACT 706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACT 814
Query 707 TGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAG 888
Query 781 CGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACG 854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACG 962
Query 855 CATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGT 928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGT 1036
Query 929 TTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGAC 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGAC 1110
Query 1003 GTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCA 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCA 1184
Query 1077 CCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAA 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAA 1258
Query 1151 AGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAA 1224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAA 1332
Query 1225 GATGGAATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCT 1298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATGGAATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGTCTACCTTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCT 1406
Query 1299 AATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTT 1372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTT 1480
Query 1373 CAGAATTTGAGCCAGCAATGCAAATTGATGGG 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGAATTTGAGCCAGCAATGCAAATTGATGGG 1512