Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491986
• Subject: XM_006518697.3
• Aligned Length: 2141
• Identities: 1711
• Gaps: 195

Alignment

Query    1  ATGGCGCCGTTCCTGCGCATCGCCTTCAACTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAGGCCGAGGACGAGGCGAACCA  74
            |||||.||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|..||||||||.||.|.|||
Sbjct    1  ATGGCACCCTTCCTGCGCATCTCCTTCAATTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAAGTTGAGGACGAAGCAAGCCA  74

Query   75  GCCCTTCTGTGCCGTGAAGATGAAGGAGGCGCTCAGCACAGAGCGTGGGAAAACACTGGTGCAGAAGAAGCCGA  148
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  GCCTTTCTGTGCTGTGAAGATGAAGGAGGCACTCAGCACAGAGCGAGGGAAGACACTGGTACAGAAGAAGCCCA  148

Query  149  CCATGTATCCTGAGTGGAAGTCGACGTTCGATGCCCACATCTATGAGGGGCGCGTCATCCAGATTGTGCTAATG  222
            ||||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  CCATGTATCCTGAGTGGAAGACAACGTTCGACGCCCACATCTATGAAGGCCGTGTTATCCAGATTGTGCTGATG  222

Query  223  CGGGCAGCAGAGGAGCCAGTGTCTGAGGTGACCGTGGGTGTGTCGGTGCTGGCCGAGCGCTGCAAGAAGAACAA  296
            ||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGGCAGCTGAAGACCCCGTGTCTGAGGTCACGGTGGGCGTGTCAGTACTGGCTGAGCGCTGCAAGAAGAACAA  296

Query  297  TGGCAAGGCTGAGTTCTGGCTGGACCTGCAGCCTCAGGCCAAGGTGTTGATGTCTGTTCAGTATTTCCTGGAGG  370
            .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGCAAGGCTGAGTTCTGGCTGGATCTGCAGCCTCAGGCCAAGGTGCTGATGTGTGTGCAGTATTTCCTGGAGG  370

Query  371  ACGTGGATTGCAAACAGTCTATGCGCAGTGAGGACGAGGCCAAGTTCCCAACGATGAACCGCCGCGGAGCCATC  444
            |.|.|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct  371  ATGGGGATTGCAAACAGTCTATGCGTAGTGAGGAGGAGGCAAAGTTTCCAACCATGAACCGTCGTGGAGCCATT  444

Query  445  AAACAGGCCAAAATCCACTACATCAAGAACCATGAGTTTATCGCCACCTTCTTTGGGCAACCCACCTTCTGTTC  518
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  445  AAACAGGCCAAGATCCACTACATCAAGAACCACGAGTTTATCGCCACCTTCTTCGGGCAGCCCACCTTCTGTTC  518

Query  519  TGTGTGCAAAGACTTTGTCTGGGGCCTCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGTAACGCTGCCATCCACA  592
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGTGCAAAGAGTTTGTCTGGGGCCTCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGCAACGCTGCCATCCACA  592

Query  593  AGAAATGCATCGACAAGATCATCGGCAGATGCACTGGCACCGCGGCCAACAGCCGGGACACTATATTCCAGAAA  666
            ||||||||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  593  AGAAATGCATTGACAAGATTATCGGCCGCTGCACTGGCACTGCCACCAATAGCCGGGACACCATCTTCCAGAAA  666

Query  667  GAACGCTTCAACATCGACATGCCGCACCGCTTCAAGGTTCACAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTG  740
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAACGCTTCAACATCGACATGCCTCACCGATTCAAGGTTTATAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTG  740

Query  741  CGGCAGCCTGCTCTGGGGACTGGTGAAGCAGGGATTAAAGTGTGAAGACTGCGGCATGAATGTGCACCATAAAT  814
            .|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  TGGCAGTTTGCTCTGGGGACTGGTGAAGCAGGGATTAAAGTGTGAAGATTGTGGCATGAATGTGCACCACAAAT  814

Query  815  GCCGGGAGAAGGTGGCCAACCTCTGCGGCATCAACCAGAAGCTTTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTCACCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  GCCGGGAGAAGGTGGCCAACCTGTGTGGTATCAACCAAAAGCTCTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTGACCCAG  888

Query  889  AGAGCCTCCCGGAGATCAGACTCAGC----CTCCTCAGAGCCTGTTGGGATATATCAGGGTTTCGAGAAGAAGA  958
            |||.|.|||||||          |||    |.|..|||||.||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.
Sbjct  889  AGATCTTCCCGGA----------AGCTGGACACAACAGAGTCTGTCGGAATATACCAGGGATTTGAGAAGAAGC  952

Query  959  CCGGAGTTGCTGGGGAG-GACAT---------------------------------------------------  980
            |.|.|||..|| ||||| |||||                                                   
Sbjct  953  CAGAAGTCTCT-GGGAGTGACATCCTAGGTGAAGCTGGGTCACATATCTCTTTAAAGCTATCATTCCCCAGCAG  1025

Query  981  -GCAA--------------------------GACAACAGTGGGACCTACGGCAAGATCTGGGAGGGCAGCAGCA  1027
             ||||                          |||||||..||||||||.|||||||||||||||||.||||.|.
Sbjct 1026  GGCAAAGGAAAAGGACAGTAGTGAGACCTGCGACAACAACGGGACCTATGGCAAGATCTGGGAGGGGAGCACCC  1099

Query 1028  AGTGCAACATCAACAACTTCATCTTCCACAAGGTCCTGGGCAAAGGCAGCTTCGGGAAGGTGCTGCTTGGAGAG  1101
            .|||||.|.|..|.|||||||.||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|.||||
Sbjct 1100  GGTGCACCCTTGAGAACTTCACCTTCCAAAAAGTACTTGGCAAAGGCAGCTTTGGCAAGGTGCTGCTGGCAGAG  1173

Query 1102  CTGAAGGGCAGAGGAGAGTACTTTGCCATCAAGGCCCTCAAGAAGGATGTGGTCCTGATCGACGACGACGTGGA  1175
            ||||||||||.||...||||||||||.||||||...||.||||||||.|||||..||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1174  CTGAAGGGCAAAGACAAGTACTTTGCAATCAAGTGTCTGAAGAAGGACGTGGTGTTGATTGACGATGATGTAGA  1247

Query 1176  GTGCACCATGGTTGAGAAGCGGGTGCTGACACTTGCCGCAGAGAATCCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCACCT  1249
            |||.||||||||.|||||||||||||||.|.||.|||...||||.||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1248  GTGTACCATGGTGGAGAAGCGGGTGCTGGCGCTCGCCTGGGAGAGTCCCTTCCTCACCCACCTCATCTGTACCT  1321

Query 1250  TCCAGACCAAGGACCACCTGTTCTTTGTGATGGAGTTCCTCAACGGGGGGGACCTGATGTACCACATCCAGGAC  1323
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 1322  TCCAGACCAAGGACCACCTGTTCTTCGTGATGGAGTTTCTCAATGGGGGTGACCTGATGTTCCACATTCAGGAC  1395

Query 1324  AAAGGCCGCTTTGAACTCTACCGTGCCACGTTTTATGCCGCTGAGATAATGTGTGGACTGCAGTTTCTACACAG  1397
            |||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  AAAGGCCGCTTCGAACTCTACCGGGCTACGTTTTATGCAGCTGAGATCATCTGCGGACTGCAGTTTCTACACAG  1469

Query 1398  CAAGGGCATCATTTACAGGGACCTCAAACTGGACAATGTGCTGTTGGACCGGGATGGCCACATCAAGATTGCCG  1471
            |||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||.|.|||.||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 1470  CAAAGGCATTATTTACAGGGACCTCAAGCTGGACAATGTGATGCTAGACAGGGACGGCCACATCAAGATCGCTG  1543

Query 1472  ACTTTGGGATGTGCAAAGAGAACATATTCGGGGAGAGCCGGGCCAGCACCTTCTGCGGCACCCCTGACTATATC  1545
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1544  ACTTTGGGATGTGCAAAGAGAATATATTTGGGGAGGGCCGGGCCAGCACATTCTGCGGCACTCCTGACTACATC  1617

Query 1546  GCCCCTGAGATCCTACAGGGCCTGAAGTACACATTCTCTGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTTCTGTACGA  1619
            ||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1618  GCCCCTGAGATCCTGCAGGGCCTGAAGTACTCCTTCTCGGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTCCTGTACGA  1691

Query 1620  GATGCTCATTGGCCAGTCCCCCTTCCATGGTGATGATGAGGATGAACTCTTCGAGTCCATCCGTGTGGACACGC  1693
            .||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1692  AATGCTCATCGGCCAGTCCCCCTTCCACGGCGACGATGAGGACGAGCTCTTCGAGTCCATCCGGGTGGACACAC  1765

Query 1694  CACATTATCCCCGCTGGATCACCAAGGAGTCCAAGGACATCCTGGAGAAGCTCTTTGAAAGGGAACCAACCAAG  1767
            ||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||.||.||.|||||.||...||||
Sbjct 1766  CACACTATCCCCGTTGGATCACCAAGGAATCCAAGGACATCATGGAGAAGCTATTCGAGAGGGACCCTGACAAG  1839

Query 1768  AGGCTGGGAGTGACGGGAAACATCAAAATCCACCCCTTCTTCAAGACCATAAACTGGACTCTGCTGGAAAAGCG  1841
            |||||||||||.||.||||||||||..||.||||||||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||.|||||
Sbjct 1840  AGGCTGGGAGTAACAGGAAACATCAGGATTCACCCCTTTTTCAAGACTATCAACTGGTCCCTCCTGGAGAAGCG  1913

Query 1842  GAGGTTGGAGCCACCCTTCAGGCCCAAAGTGAAGTCACCCAGAGACTACAGTAACTTTGACCAGGAGTTCCTGA  1915
            ||.|.|||||||.|||||.|.||||||||||.|         ||.||.|                  |||||||
Sbjct 1914  GAAGGTGGAGCCGCCCTTTAAGCCCAAAGTGCA---------AGCCTGC------------------TTCCTGA  1960

Query 1916  ACGAGAAGGCGCGCCTCTCCTACAGCGAC---------AAGAACCTCA---TCGACTC---CATGGACCAGTCT  1974
                         ||.|||||     |.|         |.|.|||.||   ||.||||   |||   ||  || 
Sbjct 1961  -------------CCCCTCCT-----GGCATGCTGTGTATGTACCACAGCCTCTACTCTTGCAT---CC--TC-  2010

Query 1975  GCATTCGCTGGCTT---CTCCTT-----------TGTGAACCCCAAATTCGAGCACCTCCTGGAAGATG  2029
            |||.||.|.|.|.|   |||.||           || ||||..||.|||                    
Sbjct 2011  GCAATCTCAGCCCTGCACTCATTCAGGAGACAGCTG-GAACTGCAGATT--------------------  2058