Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492060
• Subject: XM_017012224.2
• Aligned Length: 1042
• Identities: 887
• Gaps: 103

Alignment

Query    1  ------------ATGG----CCACGTTTGTGGAGCTCA-----------GTACCAAAG---------CCAAGAT  38
                        ||||    |||.||     ||.||||           ..|||||.|         ||||   
Sbjct    1  ATGGTCTTACAAATGGAACCCCAAGT-----GAACTCAACTAACAACTTCCACCAAGGACCCCTGGACCAA---  66

Query   39  GCCCATTG------TG---GGCCT------------------GGGCACT-----TGGAAG--------------  66
             |||.|||      ||   |||||                  ||.||||     ||.|.|              
Sbjct   67  -CCCGTTGGCCCTTTGACTGGCCTAAAGAGTTCCCTTCTGAAGGACACTACAAGTGCAGGGCCCCTTCTTCGCC  139

Query   67  -----------TCTCCTCTTGGCAAAGTGAAAGAAGCAGTGAAGGTGGCCATTGATGCAGGATATCGGCACATT  129
                       ||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct  140  CCTATCCAGCATCTCTTCTCGGCAAAGTGAAAGAAGCGGTGAAGGTGGCCATTGATGCAGAATATCGCCACATT  213

Query  130  GACTGTGCCTATGTCTATCAGAATGAACATGAAGTGGGGGAAGCCATCCAAGAGAAGATCCAAGAGAAGGCTGT  203
            ||||||||||||.|||||.|||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  GACTGTGCCTATTTCTATGAGAATCAACATGAGGTGGGAGAAGCCATCCAAGAGAAGATCCAAGAGAAGGCTGT  287

Query  204  GAAGCGGGAGGACCTGTTCATCGTCAGCAAGTTGTGGCCCACTTTCTTTGAGAGACCCCTTGTGAGGAAAGCCT  277
            ||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  GATGCGGGAGGACCTGTTCATCGTCAGCAAGGTGTGGCCCACTTTCTTTGAGAGACCCCTTGTGAGGAAAGCCT  361

Query  278  TTGAGAAGACCCTCAAGGACCTGAAGCTGAGCTATCTGGACGTCTATCTTATTCACTGGCCACAGGGATTCAAG  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  TTGAGAAGACCCTCAAGGACCTGAAGCTGAGCTATCTGGACGTCTATCTTATTCACTGGCCACAGGGATTCAAG  435

Query  352  TCTGGGGATGACCTTTTCCCCAAAGATGATAAAGGTAATGCCATCGGTGGAAAAGCAACGTTCTTGGATGCCTG  425
            .|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||...|||.|||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  436  ACTGGGGATGACTTTTTCCCCAAAGATGATAAAGGTAATATGATCAGTGGAAAAGGAACGTTCTTGGATGCCTG  509

Query  426  GGAGGCCATGGAGGAGCTGGTGGATGAGGGGCTGGTGAAAGCCCTTGGGGTCTCCAATTTCAGCCACTTCCAGA  499
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  510  GGAGGCCATGGAGGAGCTGGTGGACGAGGGGCTGGTGAAAGCCCTTGGGGTCTCAAATTTCAACCACTTCCAGA  583

Query  500  TCGAGAAGCTCTTGAACAAACCTGGACTGAAATATAAACCAGTGACTAACCAGGTTGAGTGTCACCCATACCTC  573
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  TCGAGAGGCTCTTGAACAAACCTGGACTGAAATATAAACCAGTGACTAACCAGGTTGAGTGTCACCCATACCTC  657

Query  574  ACACAGGAGAAACTGATCCAGTACTGCCACTCCAAGGGCATCACCGTTACGGCCTACAGCCCCCTGGGCTCTCC  647
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  ACGCAGGAGAAACTGATCCAGTACTGCCACTCCAAGGGCATCACCGTTACGGCCTACAGCCCCCTGGGCTCTCC  731

Query  648  GGATAGACCTTGGGCCAAGCCAGAAGACCCTTCCCTGCTGGAGGATCCCAAGATTAAGGAGATTGCTGCAAAGC  721
            ||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  GGATAGACCTTGGGCCAAACCTGAGGACCCTTCCCTGCTGGAGGATCCCAAGATTAAGGAGATTGCTGCAAAGC  805

Query  722  ACAAAAAAACCGCAGCCCAGGTTCTGATCCGTTTCCATATCCAGAGGAATGTGATTGTCATCCCCAAGTCTGTG  795
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||||||||||.||
Sbjct  806  ACAAAAAAACCACAGCCCAGGTTCTGATCCGTTTCCATATCCAGAGGAATGTGACAGTGATCCCCAAGTCTATG  879

Query  796  ACACCAGCACGCATTGTTGAGAACATTCAGGTCTTTGACTTTAAATTGAGTGATGAGGAGATGGCAACCATACT  869
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  ACACCAGCACACATTGTTGAGAACATTCAGGTCTTTGACTTTAAATTGAGTGATGAGGAGATGGCAACCATACT  953

Query  870  CAGCTTCAACAGAAACTGGAGGGCCTGTAACGTGTTGCAATCCTCTCATTTGGAAGACTATCCCTTCGATGCAG  943
            ||||||||||||||||||||||||||.|.||.|...|.|||.||||||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct  954  CAGCTTCAACAGAAACTGGAGGGCCTTTGACTTCAAGGAATTCTCTCATTTGGAGGACTTTCCCTTCGATGCAG  1027

Query  944  AATATG  949
            ||||| 
Sbjct 1028  AATAT-  1032