Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492074
• Subject: NM_008177.3
• Aligned Length: 1161
• Identities: 1017
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGCTCTAAATGACTGTTTCCTTCTGAACTTGGAGGTGGACCATTTCATGCACTGCA---ACATCTCCAGTCA  71
            |||||||.||||.|.||||.||..|||||||||||.|||||||.||||.||..|||||   |||.||.||.|||
Sbjct    1  ATGGCTCCAAATAATTGTTCCCACCTGAACTTGGACGTGGACCCTTTCCTGTCCTGCAACGACACCTTCAATCA  74

Query   72  CAGTGCGGA-TCTCCCCGTGAACGATG----ACTGGTCCCACCCGGGGATCCTCTATGTCATCCCTGCAGTTTA  140
            .||| |.|| ||.||||    |.||||    ||||||..||||||||..||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAGT-CTGAGTCCCCCC----AAGATGGACAACTGGTTTCACCCGGGCTTCATCTATGTCATCCCTGCAGTTTA  143

Query  141  TGGGGTTATCATTCTGATAGGCCTCATTGGCAACATCACTTTGATCAAGATCTTCTGTACAGTCAAGTCCATGC  214
            ||||.|||||||..|||||||.||.||||||||||||||..|.||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  144  TGGGCTTATCATCGTGATAGGTCTTATTGGCAACATCACGCTCATCAAGATCTTCTGCACGGTCAAGTCCATGC  217

Query  215  GAAACGTTCCAAACCTGTTCATTTCCAGTCTGGCTTTGGGAGACCTGCTCCTCCTAATAACGTGTGCTCCAGTG  288
            |||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||..|.||.||.||.||.|||
Sbjct  218  GAAACGTGCCAAACCTGTTCATCTCTAGCCTGGCTTTGGGAGACCTGCTGCTGCTGGTGACATGCGCCCCTGTG  291

Query  289  GATGCCAGCAGGTACCTGGCTGACAGATGGCTATTTGGCAGGATTGGCTGCAAACTGATCCCCTTTATACAGCT  362
            ||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  292  GATGCCAGCAAGTACCTGGCTGACAGGTGGCTATTTGGCAGAATTGGCTGCAAACTGATCCCCTTTATACAACT  365

Query  363  TACCTCTGTTGGGGTGTCTGTCTTCACACTCACGGCGCTCTCGGCAGACAGATACAAAGCCATTGTCCGGCCAA  436
            |||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  366  TACTTCAGTGGGGGTGTCTGTCTTCACACTTACGGCACTGTCAGCTGACAGGTACAAAGCCATTGTACGGCCAA  439

Query  437  TGGATATCCAGGCCTCCCATGCCCTGATGAAGATCTGCCTCAAAGCCGCCTTTATCTGGATCATCTCCATGCTG  510
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||..||||.|||.||
Sbjct  440  TGGATATCCAGGCATCCCATGCCCTGATGAAGATCTGTCTCAAAGCTGCTTTGATCTGGATTGTCTCTATGTTG  513

Query  511  CTGGCCATTCCAGAGGCCGTGTTTTCTGACCTCCATCCCTTCCATGAGGAAAG-CACCAACCAGACCTTCATTA  583
            .|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||| .||||| .||||||||.||||||||||
Sbjct  514  TTGGCCATCCCAGAGGCTGTGTTTTCTGACCTCCACCCCTTCCATG-TGAAAGATACCAACCAAACCTTCATTA  586

Query  584  GCTGTGCCCCATACCCACACTCTAATGAGCTTCACCCCAAAATCCATTCTATGGCTTCCTTTCTGGTCTTCTAC  657
            |.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  587  GTTGTGCCCCCTACCCACACTCCAATGAGCTACACCCTAAAATCCATTCCATGGCTTCCTTTCTGGTTTTCTAC  660

Query  658  GTCATCCCACTGTCGATCATCTCTGTTTACTACTACTTCATTGCTAAAAATCTGATCCAGAGTGCTTACAATCT  731
            ||.|||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||...|||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  661  GTTATCCCACTGGCGATCATCTCTGTCTACTACTACTTCATTGCCCGAAATCTGATTCAGAGTGCCTACAATCT  734

Query  732  TCCCGTGGAAGGGAATATACATGTCAAGAAGCAGATTGAATCCCGGAAGCGACTTGCCAAGACAGTGCTGGTGT  805
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  735  TCCCGTGGAAGGCAATATACATGTCAAGAAGCAGATCGAATCCCGGAAGCGGCTTGCCAAGACAGTACTGGTGT  808

Query  806  TTGTGGGCCTGTTCGCCTTCTGCTGGCTCCCCAATCATGTCATCTACCTGTACCGCTCCTACCACTACTCTGAG  879
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  809  TTGTGGGCCTCTTTGCCTTCTGCTGGCTCCCCAACCATGTCATCTACCTGTACCGTTCCTACCACTACTCTGAA  882

Query  880  GTGGACACCTCCATGCTCCACTTTGTCACCAGCATCTGTGCCCGCCTCCTGGCCTTCACCAACTCCTGCGTGAA  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  883  GTGGACACCTCCATGCTCCACTTTGTCACCAGCATCTGTGCCCGCCTCCTGGCCTTCACCAACTCCTGTGTGAA  956

Query  954  CCCCTTTGCCCTCTACCTGCTGAGCAAGAGTTTCAGGAAACAGTTCAACACTCAGCTGCTCTGTTGCCAGCCTG  1027
            |||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  957  CCCCTTTGCTCTTTATCTGCTGAGCAAGAGCTTCAGGAAGCAGTTCAACACTCAACTTCTCTGCTGCCAGCCTG  1030

Query 1028  GCCTGATCATCCGGTCTCACAGCACTGGAAGGAGTACAACCTGCATGACCTCCCTCAAGAGTACCAACCCCTCC  1101
            |||||||.|.|.||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||.|||||||| 
Sbjct 1031  GCCTGATGAACAGGTCCCACAGCACAGGCAGAAGTACCACCTGCATGACCTCCTTCAAGAGCACTAACCCCTC-  1103

Query 1102  GTGGCCACCTTTAGCCTCATCAATGGAAACATCTGTCACGAGCGGTATGTC  1152
              |||.|||||||||||||||||..||||.||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1104  --GGCTACCTTTAGCCTCATCAACAGAAATATCTGTCATGAGGGGTATGTC  1152