Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000492109
- Subject:
- XM_011545317.2
- Aligned Length:
- 3681
- Identities:
- 3599
- Gaps:
- 75
Alignment
Query 1 ATGATGTGCGAGGTGATGCCGACCATCAGCGAAGCAGAAGGCCCCCCTGGAGGAGGTGGAGGCCATGGTTCCGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGTGCGAGGTGATGCCGACCATCAGCGAAGCAGAAGGCCCCCCTGGAGGAGGTGGAGGCCATGGTTCCGG 74
Query 75 CTCCCCTTCACAGCCAGATGCAGATTCACATTTTGAACAGTTGATGGTCTCCATGCTAGAAGAAAGGGACCGCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCCCCTTCACAGCCAGATGCAGATTCACATTTTGAACAGTTGATGGTCTCCATGCTAGAAGAAAGGGACCGCC 148
Query 149 TTCTTGATACACTGAGAGAGACTCAAGAAACGCTGGCCTTAACCCAGGGGAAGTTACACGAGGTTGGTCATGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTCTTGATACACTGAGAGAGACTCAAGAAACGCTGGCCTTAACCCAGGGGAAGTTACACGAGGTTGGTCATGAA 222
Query 223 AGAGATTCCTTGCAGAGACAGCTCAACACAGCACTTCCACAGGAGTTCGCAGCACTTACTAAAGAACTCAATGT 296
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGAGATTCCTTGCAGAGACAGCTCAACACGGCACTTCCACAGGAGTTCGCAGCACTTACTAAAGAACTCAATGT 296
Query 297 ATGCAGGGAACAGCTCCTTGAAAGGGAAGAAGAAATTGCTGAACTGAAAGCAGAAAGGAATAACACCAGGCTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATGCAGGGAACAGCTCCTTGAAAGGGAAGAAGAAATTGCTGAACTGAAAGCAGAAAGGAATAACACCAGGCTGC 370
Query 371 TGTTAGAGCATTTGGAATGCCTTGTCTCCAGGCATGAGCGGTCTCTTAGGATGACCGTGGTGAAGAGACAAGCG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGTTAGAGCATTTGGAATGCCTTGTCTCCAGGCATGAGCGGTCTCTTAGGATGACCGTGGTGAAGAGACAAGCG 444
Query 445 CAGTCTCCAGCAGGCGTGTCCAGCGAAGTGGAAGTGCTGAAAGCACTGAAGTCCTTATTTGAACACCACAAAGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAGTCTCCAGCAGGCGTGTCCAGCGAAGTGGAAGTGCTGAAAGCACTGAAGTCCTTATTTGAACACCACAAAGC 518
Query 519 TCTGGATGAAAAGGTGAGAGAGCGATTACGAGTAGCACTTGAAAGATGTAGTTTGTTAGAAGAGGAATTAGGTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCTGGATGAAAAGGTGAGAGAGCGATTACGAGTAGCACTTGAAAGATGTAGTTTGTTAGAAGAGGAATTAGGTG 592
Query 593 CCACACACAAAGAGCTAATGATTCTTAAAGAACAGAATAATCAGAAAAAAACTCTAACAGATGGAGTGCTGGAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCACACACAAAGAGCTAATGATTCTTAAAGAACAGAATAATCAGAAAAAAACTCTAACAGATGGAGTGCTGGAC 666
Query 667 ATAAACCATGAACAAGAAAATACACCAAGCACGAGTGGAAAGAGATCTTCTGATGGTTCTTTAAGCCACGAGGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATAAACCATGAACAAGAAAATACACCAAGCACGAGTGGAAAGAGATCTTCTGATGGTTCTTTAAGCCACGAGGA 740
Query 741 AGACCTTGCTAAAGTAATTGAGCTCCAAGAAATCATAAGTAAGCAGTCAAGGGAACAGAGCCAAATGAAAGAAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGACCTTGCTAAAGTAATTGAGCTCCAAGAAATCATAAGTAAGCAGTCAAGGGAACAGAGCCAAATGAAAGAAC 814
Query 815 GCCTGGCTTCCCTTTCCAGTCATGTGACAGAACTGGAAGAGGATCTGGACACGGCTAGAAAAGATCTCATCAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCTGGCTTCCCTTTCCAGTCATGTGACAGAACTGGAAGAGGATCTGGACACGGCTAGAAAAGATCTCATCAAA 888
Query 889 TCTGAAGAAATGAACACAAAATTGCAACGAGATGTCCGTGAAGCCATGGCCCAAAAGGAAGATATGGAAGAGAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCTGAAGAAATGAACACAAAATTGCAACGAGATGTCCGTGAAGCCATGGCCCAAAAGGAAGATATGGAAGAGAG 962
Query 963 AATCACTACTCTTGAAAAACGCTACCTCGCTGCACAGCGTGAAGCCACATCTGTGCATGACCTCAATGATAAAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AATCACTACTCTTGAAAAACGCTACCTCGCTGCACAGCGTGAAGCCACATCTGTGCATGACCTCAATGATAAAC 1036
Query 1037 TTGAAAATGAAATTGCAAATAAAGATTCTATGCATCGACAGACTGAAGATAAAAACCGCCAGTTACAGGAGCGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGAAAATGAAATTGCAAATAAAGATTCTATGCATCGACAGACTGAAGATAAAAACCGCCAGTTACAGGAGCGC 1110
Query 1111 TTGGAATTGGCAGAGCAAAAGCTGCAACAGACACTGAGGAAGGCAGAGACGCTCCCGGAGGTGGAGGCGGAGCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTGGAATTGGCAGAGCAAAAGCTGCAACAGACACTGAGGAAGGCAGAGACGCTCCCGGAGGTGGAGGCGGAGCT 1184
Query 1185 GGCCCAGAGGGTGGCAGCGCTTTCC------------------------------------------------- 1209
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCCCAGAGGGTGGCAGCGCTTTCCAAGTCTGACCTTTTGTCTTCTGGGAGCTCTGCTGCTAAGGAAGCTAAAC 1258
Query 1210 --------------------------AAGGCTGAAGAGAGACACGGCAACATTGAAGAAAGGTTACGACAGATG 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGTTGGAACTTACTTCCAAGCTTAGGAAGGCTGAAGAGAGACACGGCAACATTGAAGAAAGGTTACGACAGATG 1332
Query 1258 GAAGCACAGTTGGAGGAGAAGAATCAAGAACTGCAGCGGGCAAGGCAAAGAGAAAAAATGAACGAAGAACATAA 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAGCACAGTTGGAGGAGAAGAATCAAGAACTGCAGCGGGCAAGGCAAAGAGAAAAAATGAACGAAGAACATAA 1406
Query 1332 TAAACGTTTATCAGACACTGTTGACAAGCTGCTTTCAGAATCTAATGAGAGGCTTCAACTTCATCTTAAAGAGA 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TAAACGTTTATCAGACACTGTTGACAAGCTGCTTTCAGAATCTAATGAGAGGCTTCAACTTCATCTTAAAGAGA 1480
Query 1406 GAATGGCTGCTTTGGAAGATAAGAACTCTCTTTTAAGAGAAGTTGAAAGTGCAAAAAAGCAGTTAGAAGGAACA 1479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1481 GAATGGCTGCTTTGGAAGATAAGAACTCTCTTTTAAGAGAAGTTGAAAGTGCAAAAAAGCAGTTAGAAGAAACA 1554
Query 1480 CAACACGATAAGGATCAGCTTGTCCTAAACATTGAAGCACTGAGGGCTGAACTAGACCACATGAGACTAAGAGG 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAACACGATAAGGATCAGCTTGTCCTAAACATTGAAGCACTGAGGGCTGAACTAGACCACATGAGACTAAGAGG 1628
Query 1554 TGCTTCACTTCATCATGGCCGACCCCACTTGGGCAGTGTCCCAGATTTCAGGTTCCCCATGGCAGATGGCCACA 1627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1629 TGCTTCACTTCATCATGGCCGACCCCACTTGGGCAGTGTCCCAGATTTCAGGTTCCCCATGGCAGACGGCCACA 1702
Query 1628 CAGACTCCTACAGCACCAGTGCAGTGCTGCGGCGCACACAGAAAGGCCGGCTGGCAGCCCTGCGAGATGAGCCT 1701
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAGACTCCTACAGCACCAGTGCAGTGCTGCGGCGCCCACAGAAAGGCCGGCTGGCAGCCCTGCGAGATGAGCCT 1776
Query 1702 TCCAAGGTACAAACTCTTAATGAGCAGGATTGGGAACGTGCCCAGCAAGCTAGTGTCTTGGCAAATGTAGCACA 1775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCCAAGGTACAAACTCTTAATGAGCAGGATTGGGAACGTGCCCAGCAAGCTAGTGTCTTGGCAAATGTAGCACA 1850
Query 1776 AGCATTCGAGAGTGATGCTGACGTGTCTGATGGTGAAGATGACAGGGACACTCTCCTCAGCTCAGTTGACCTGC 1849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGCATTCGAGAGTGATGCTGACGTGTCTGATGGTGAAGATGACAGGGACACTCTCCTCAGCTCAGTTGACCTGC 1924
Query 1850 TATCGCCCAGCGGGCAGGCCGACGCGCACACACTAGCCATGATGCTTCAGGAGCAGCTGGACGCCATCAACAAA 1923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TATCGCCCAGCGGGCAGGCCGACGCGCACACACTAGCCATGATGCTTCAGGAGCAGCTGGACGCCATCAACAAA 1998
Query 1924 GAGATCAGGTTGATTCAGGAAGAAAAAGAAAATACAGAGCAGCGGGCAGAGGAGATTGAAAGTCGAGTTGGCAG 1997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAGATCAGGTTGATTCAGGAAGAAAAAGAAAATACAGAGCAGCGGGCAGAGGAGATTGAAAGTCGAGTTGGCAG 2072
Query 1998 TGGAAGTCTAGACAATCTTGGTCGTTTTAGATCAATGAGCTCCATTCCCCCCTACCCTGCTTCCTCGCTTGCTA 2071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGGAAGTCTAGACAATCTTGGTCGTTTTAGATCAATGAGCTCCATTCCCCCCTACCCTGCTTCCTCGCTTGCTA 2146
Query 2072 GCTCCTCCCCTCCGGGCAGTGGGCGCTCCACCCCACGAAGGATCCCTCACAGCCCAGCTCGGGAAGTGGACAGA 2145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GCTCCTCCCCTCCGGGCAGTGGGCGCTCCACCCCACGAAGGATCCCTCACAGCCCAGCTCGGGAAGTGGACAGA 2220
Query 2146 CTGGGCGTCATGACCCTTTTGCCACCTTCCAGAGAAGAGGTACGAGATGACAAGACAACCATAAAGTGTGAAAC 2219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTGGGCGTCATGACCCTTTTGCCACCTTCCAGAGAAGAGGTACGAGATGACAAGACAACCATAAAGTGTGAAAC 2294
Query 2220 CTCCCCGCCTTCCTCCCCGAGAGCCCTTCGGTTAGACCGGCTGCACAAAGGGGCGCTGCACACCGTTAGCCACG 2293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2295 CTCCCCGCCTTCCTCCCCGAGAGCCCTTCGGTTAGACCGGCTGCACAAAGGGGCGCTGCACACCGTCAGCCACG 2368
Query 2294 AGGACATCAGGGACATAAGGAACTCCACAGGCTCCCAGGATGGTCCCGTGAGCAACCCCAGCAGTAGCAACAGT 2367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AGGACATCAGGGACATAAGGAACTCCACAGGCTCCCAGGATGGTCCCGTGAGCAACCCCAGCAGTAGCAACAGT 2442
Query 2368 AGCCAGGACTCGCTCCACAAAGCCCCAAAGAAGAAAGGCATTAAGTCCTCCATTGGCCGCTTGTTTGGCAAGAA 2441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AGCCAGGACTCGCTCCACAAAGCCCCAAAGAAGAAAGGCATTAAGTCCTCCATTGGCCGCTTGTTTGGCAAGAA 2516
Query 2442 AGAAAAGGGCCGACCTGGACAAACTGGCAAAGAAGCATTAGGACAAGCTGGTGTTTCCGAGACGGATAACTCAT 2515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 AGAAAAGGGCCGACCTGGACAAACTGGCAAAGAAGCATTAGGACAAGCTGGTGTTTCCGAGACGGATAACTCAT 2590
Query 2516 CTCAGGATGCCTTGGGACTTAGCAAATTGGGGGGACAGGCTGAAAAAAATCGTAAACTTCAAAAAAAGCATGAA 2589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CTCAGGATGCCTTGGGACTTAGCAAATTGGGGGGACAGGCTGAAAAAAATCGTAAACTTCAAAAAAAGCATGAA 2664
Query 2590 TTGCTGGGGGAAGCCCGGAGACAAGGTTTACCTTTTGCCCAATGGGACGGGCCAACGGTTGTGGTCTGGCTAGA 2663
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TTGCTGGAGGAAGCCCGGAGACAAGGTTTACCTTTTGCCCAATGGGACGGGCCAACGGTTGTGGTCTGGCTAGA 2738
Query 2664 GCTCTGGGTTGGGATGCCAGCCTGGTATGTGGCTGCCTGCCGAGCAAACGTGAAAAGCGGGGCCATCATGTCGG 2737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GCTCTGGGTTGGGATGCCAGCCTGGTATGTGGCTGCCTGCCGAGCAAACGTGAAAAGCGGGGCCATCATGTCGG 2812
Query 2738 CCCTGTCCGACACAGAGATCCAGCGTGAGATTGGCATCAGCAACCCCCTGCACAGGCTGAAGCTGAGGCTGGCC 2811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CCCTGTCCGACACAGAGATCCAGCGTGAGATTGGCATCAGCAACCCCCTGCACAGGCTGAAGCTGAGGCTGGCC 2886
Query 2812 ATCCAGGAGATCATGTCGCTGACCAGCCCGTCTGCCCCGCCCACATCTAGAACGACACTCGCCTATGGGGACAT 2885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 ATCCAGGAGATCATGTCGCTGACCAGCCCGTCTGCCCCGCCCACATCTAGAACGACACTCGCCTATGGGGACAT 2960
Query 2886 GAACCACGAGTGGATCGGCAACGAGTGGCTCCCCAGCCTGGGCCTCCCCCAGTACCGCAGCTACTTCATGGAGT 2959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GAACCACGAGTGGATCGGCAACGAGTGGCTCCCCAGCCTGGGCCTCCCCCAGTACCGCAGCTACTTCATGGAGT 3034
Query 2960 GCCTTGTAGACGCCAGGATGCTGGACCACTTGACCAAGAAAGACCTTCGAGGGCAGCTGAAAATGGTCGACAGT 3033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 GCCTTGTAGACGCCAGGATGCTGGACCACTTGACCAAGAAAGACCTTCGAGGGCAGCTGAAAATGGTCGACAGT 3108
Query 3034 TTTCACAGAAACAGTTTCCAGTGTGGAATTATGTGCCTGAGAAGGTTAAATTATGACCGGAAAGAACTGGAAAG 3107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 TTTCACAGAAACAGTTTCCAGTGTGGAATTATGTGCCTGAGAAGGTTAAATTATGACCGGAAAGAACTGGAAAG 3182
Query 3108 AAAAAGAGAAGAAAGTCAGAGTGAAATAAAAGACGTGCTTGTTTGGAGCAATGATCGAGTGATTCGCTGGATCC 3181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AAAAAGAGAAGAAAGTCAGAGTGAAATAAAAGACGTGCTTGTTTGGAGCAATGATCGAGTGATTCGCTGGATCC 3256
Query 3182 TGTCAATTGGCCTTAAAGAATATGCAAACAATCTTATAGAGAGTGGTGTTCACGGAGCACTTCTGGCCTTAGAT 3255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TGTCAATTGGCCTTAAAGAATATGCAAACAATCTTATAGAGAGTGGTGTTCACGGAGCACTTCTGGCCTTAGAT 3330
Query 3256 GAAACCTTCGACTTCAGTGCACTGGCACTGCTGTTACAGATCCCAACGCAGAACACACAGGCTCGTGCTGTCTT 3329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GAAACCTTCGACTTCAGTGCACTGGCACTGCTGTTACAGATCCCGACGCAGAACACACAGGCTCGTGCTGTCTT 3404
Query 3330 GGAAAGAGAATTTAACAACCTTTTGGTCATGGGGACTGATAGAAGGTTTGATGAAGATGATGATAAAAGCTTTA 3403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 GGAAAGAGAATTTAACAACCTTTTGGTCATGGGGACTGATAGAAGGTTTGATGAAGATGATGATAAAAGCTTTA 3478
Query 3404 GGAGAGCACCTTCATGGAGAAAAAAGTTTAGACCAAAGGACATTCGTGGCTTAGCTGCTGGGTCAGCAGAGACT 3477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 GGAGAGCACCTTCATGGAGAAAAAAGTTTAGACCAAAGGACATTCGTGGCTTAGCTGCTGGGTCAGCAGAGACT 3552
Query 3478 CTCCCTGCAAACTTCCGGGTGACTTCTTCTATGTCTTCCCCCTCTATGCAGCCAAAGAAGATGCAGATGGACGG 3551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 CTCCCTGCAAACTTCCGGGTGACTTCTTCTATGTCTTCCCCCTCTATGCAGCCAAAGAAGATGCAGATGGACGG 3626
Query 3552 CAATGTATCAGGAACACAGAGGTTGGATTCTGCTACAGTCAGGACTTACTCCTGC 3606
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 CAATGTATCAGGAACACAGAGGTTGGATTCTGCTACAGTCAGGACTTACTCCTGC 3681