Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000492109
- Subject:
- XM_017322222.1
- Aligned Length:
- 3701
- Identities:
- 3098
- Gaps:
- 103
Alignment
Query 1 ATGATGTGCGAGGTGATGCCGACCATCAGCGAAGCAGAAGGCCCCCCTGGAGGAGGTGGAGGCCATGGTTCCGG 74
||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||
Sbjct 1 ATGATGTGCGAGGTGATGCCGACCATTAGTGAAGCAGAAGGCCCTCCAGGAGGAGGTGGGAGCCATGGGTCAGG 74
Query 75 CTCCCCTTCACAGCCAGATGCAGATTCACATTTTGAACAGTTGATGGTCTCCATGCTAGAAGAAAGGGACCGCC 148
|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||.||||||.|.||||||.|||||||||
Sbjct 75 CTCCCCTTCACAGCCAGATGCTGATTCGCATTTTGAGCAGCTCATGGTTTCCATGTTGGAAGAACGGGACCGCC 148
Query 149 TTCTTGATACACTGAGAGAGACTCAAGAAACGCTGGCCTTAACCCAGGGGAAGTTACACGAGGTTGGTCATGAA 222
||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 149 TTCTGGACACACTAAGAGAGACACAAGAAACACTGGCATTAACCCAGGGGAAGTTGCATGAAGTTGGTCATGAA 222
Query 223 AGAGATTCCTTGCAGAGACAGCTCAACACAGCACTTCCACAGGAGTTCGCAGCACTTACTAAAGAACTCAATGT 296
||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct 223 AGAGATTCTTTGCAGAGGCAGCTCAATACTGCACTTCCACAGGAGTTTGCTGCGCTCACGAAGGAACTCAATGT 296
Query 297 ATGCAGGGAACAGCTCCTTGAAAGGGAAGAAGAAATTGCTGAACTGAAAGCAGAAAGGAATAACACCAGGCTGC 370
.||||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 297 GTGCAGGGAGCAGCTTCTAGAGAGAGAGGAAGAAATCGCCGAGCTGAAGGCAGAGAGGAACAACACTAGGCTGC 370
Query 371 TGTTAGAGCATTTGGAATGCCTTGTCTCCAGGCATGAGCGGTCTCTTAGGATGACCGTGGTGAAGAGACAAGCG 444
||||.|||||..|.||.|||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||.|||||.|||||.||.||.
Sbjct 371 TGTTGGAGCACCTAGAGTGCCTTGTCTCCAGGCATGAGCGCTCTCTCCGGATGACAGTGGTAAAGAGGCAGGCA 444
Query 445 CAGTCTCCAGCAGGCGTGTCCAGCGAAGTGGAAGTGCTGAAAGCACTGAAGTCCTTATTTGAACACCACAAAGC 518
|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||
Sbjct 445 CAGTCACCTGCAGGCGTGTCCAGTGAGGTGGAAGTGCTGAAAGCCCTGAAGTCACTGTTTGAACACCACAAAGC 518
Query 519 TCTGGATGAAAAGGTGAGAGAGCGATTACGAGTAGCACTTGAAAGATGTAGTTTGTTAGAAGAGGAATTAGGTG 592
..|||||||.|||||..||||||||.|||||||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||..|.||||
Sbjct 519 CTTGGATGAGAAGGTACGAGAGCGACTACGAGTGGCTCTGGAGAGGTGCAGCTTGTTAGAAGAGGAGCTGGGTG 592
Query 593 CCACACACAAAGAGCTAATGATTCTTAAAGAACAGAATAATCAGAAAAAAACTCTAACAGATGGAGTGCTGGAC 666
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.||||.|||
Sbjct 593 CCACCCACAAAGAGCTAATGATTCTTAAAGAACAGAATAATCAGAAGAAAACACTAACAGATGGACTGCTTGAC 666
Query 667 ATAAACCATGAACAAGAAAATACACCAAGCACGAGTGGAAAGAGATCTTCTGATGGTTCTTTAAGCCACGAGGA 740
..||||||||||||.||||.|.||||||||||.|..||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.|||
Sbjct 667 GGAAACCATGAACAGGAAAGTGCACCAAGCACCAACGGCAAGAGATCTTCTGATGGCTCCTTGAGTCATGAG-- 738
Query 741 AGACCTTGCTAAAGTAATTGAGCTCCAAGAAATCATAAGTAAGCAGTCAAGGGAACAGAGCCAAATGAAAGAAC 814
||.|||||.|||||..|.|||||.||.|||.|||||...|.||||.|.||.||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 739 -GATCTTGCCAAAGTGCTGGAGCTGCAGGAAGTCATAGACAGGCAGGCGAGAGAGCAGAGCCAGATGAAGGAGC 811
Query 815 GCCTGGCTTCCCTTTCCAGTCATGTGACAGAACTGGAAGAGGATCTGGACACGGCTAGAAAAGATCTCATCAAA 888
|||||||.|||||.||||||||||...|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 812 GCCTGGCCTCCCTGTCCAGTCATGCAGCAGAACTAGAAGAGGATCTGGACACAGCTAGAAAAGACCTCATCAAG 885
Query 889 TCTGAAGAAATGAACACAAAATTGCAACGAGATGTCCGTGAAGCCATGGCCCAAAAGGAAGATATGGAAGAGAG 962
||||||||.|||||.||.|||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 886 TCTGAAGAGATGAATACGAAACTGCAGCGAGAAGTCCGTGAAGCAATGGCCCAGAAGGAGGATATGGAAGAGAG 959
Query 963 AATCACTACTCTTGAAAAACGCTACCTCGCTGCACAGCGTGAAGCCACATCTGTGCATGACCTCAATGATAAAC 1036
||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 960 AATCACCACCCTTGAGAAACGCTACCTCGCCGCACAGCGTGAAGCCACGTCTGTGCATGACCTCAATGACAAAC 1033
Query 1037 TTGAAAATGAAATTGCAAATAAAGATTCTATGCATCGACAGACTGAAGATAAAAACCGCCAGTTACAGGAGCGC 1110
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1034 TTGAAAATGAAATTGCAAATAAAGACTCCATGCACCGACAGACAGAAGACAAGAACCGCCAGTTGCAAGAGCGT 1107
Query 1111 TTGGAATTGGCAGAGCAAAAGCTGCAACAGACACTGAGGAAGGCAGAGACGCTCCCGGAGGTGGAGGCGGAGCT 1184
.||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1108 CTGGAGTTGGCCGAGCAGAAGCTGCAGCAGACCCTGCGCAAAGCTGAGACGCTGCCAGAGGTGGAGGCTGAGCT 1181
Query 1185 GGCCCAGAGGGTGGCAGCGCTTTCCAAGGCTGAAGAGAGACACGGCAACATTGAAGAAAGGTTACGACAGATGG 1258
|||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||.|.||.|||||||
Sbjct 1182 GGCCCAGAGGGTGGCTGCACTCTCCAAGGCTGAGGAGAGACATGGCAATATTGAAGAGAGGCTGCGGCAGATGG 1255
Query 1259 AAGCACAGTTGGAGGAGAAGAATCAAGAACTGCAGCGGGCAAGGCAAAGAGAAAAAATGAACGAAGAACATAAT 1332
|.||||||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1256 AGGCACAGCTGGAGGAGAAAAATCAGGAGCTGCAGCGGGCAAGGCAGAGAGAAAAGATGAACGAGGAACATAAT 1329
Query 1333 AAACGTTTATCAGACACTGTTGACAAGCTGCTTTCAGAATCTAATGAGAGGCTTCAACTTCATCTTAAAGAGAG 1406
||.||..|.||.||||||||.||.|||.||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1330 AAGCGCCTGTCTGACACTGTGGATAAGTTGCTCTCAGAATCCAATGAGAGGCTGCAGCTGCATCTGAAGGAGAG 1403
Query 1407 AATGGCTGCTTTGGAAGATAAGAACTCTCTTTTAAGAGAAGTTGAAAGTGCAAAAAAGCAGTTAGAAGGAACAC 1480
||||||.||..||||.||.|||||.|||||..||||.||||||||||.||||||.|||||..||||||..||.|
Sbjct 1404 AATGGCGGCGCTGGAGGACAAGAATTCTCTACTAAGGGAAGTTGAAAATGCAAAGAAGCAACTAGAAGAGACCC 1477
Query 1481 AACACGATAAGGATCAGCTTGTCCTAAACATTGAAGCACTGAGGGCTGAACTAGACCACATGAGACTAAGAGGT 1554
|.||.||||||||.||.||||||.|.|..||||||||.||||.||||||.||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1478 AGCATGATAAGGACCAACTTGTCGTGACTATTGAAGCCCTGAAGGCTGAGCTGGAGCAGATGAGACTGAGAGGT 1551
Query 1555 GCTTCACTTCATCATGGCCGACCCCACTTGGGCAGTGTCCCAGATTTCAGGTTCCCCATGGCAGATGGCCACAC 1628
.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||.|..|||||||.|| ||
Sbjct 1552 CCTTCACTCCATCATGGCCGACCCCATTTGGGCAGCGTCCCGGACTTCAGGTTCTCTGTGGCAGACGG----AC 1621
Query 1629 A----GACTCCTACAGCACCAGTGCAGTGCTGCGGCGCACACAGAAAGGCCGGCTGGCAGCCCTGCGAGATGAG 1698
| ||..|.||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1622 ATGTGGATGCTTACAGCACCAGTGCAGTGTTGCGGCGCCCCCAGAAGGGCCGACTGGCAGCGCTGCGGGATGAG 1695
Query 1699 CCTTCCAAGGTACAAACTCTTAATGAGCAGGATTGGGAACGTGCCCAGCAAGCTAGTGTCTTGGCAAATGTAGC 1772
||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1696 CCCTCCAAGGTGCAGACCCTCAATGAGCAGGACTGGGAACGGGCCCAACAAGCCAGCGTCTTGGCAAATGTGGC 1769
Query 1773 ACAAGCATTCGAGAGTGATGCTGACGTGTCTGATGGTGAAGATGACAGGGACACTCTCCTCAGCTCAGTTGACC 1846
|||.|||||.||||||||||..||.|||||||||||||||||||||.|.||.||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1770 ACAGGCATTTGAGAGTGATGTCGATGTGTCTGATGGTGAAGATGACCGAGATACACTGCTCAGCTCAGTTGATC 1843
Query 1847 TGCTATCGCCCAGCGGGCAGGCCGACGCGCACACACTAGCCATGATGCTTCAGGAGCAGCTGGACGCCATCAAC 1920
||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 1844 TGCTGTCACCCAGTGGACAGGCTGATGCCCAGACACTGGCCATGATGCTTCAGGAACAGCTGGATGCTATCAAC 1917
Query 1921 AAAGAGATCAGGTTGATTCAGGAAGAAAAAGAAAATACAGAGCAGCGGGCAGAGGAGATTGAAAGTCGAGTTGG 1994
||||||||||||.||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||..||||.||
Sbjct 1918 AAAGAGATCAGGCTGATACAAGAAGAGAAGGAGAATACAGAACAGCGGGCAGAGGAGATCGAGAGCAGAGTGGG 1991
Query 1995 CAGTGGAAGTCTAGACAATCTTGGTCGTTTTAGATCAATGAGCTCCATTCCCCCCTACCCTGCTTCCTCGCTTG 2068
|||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1992 CAGTGGAAGCTTGGACAATCTTGGTCGTTTTAGATCAATGAGCTCCATTCCCCCCTACCCTGCTTCCTCGCTTG 2065
Query 2069 CTAGCTCCTCCCCTCCGGGCAGTGGGCGCTCCACCCCACGAAGGATCCCTCACAGCCCAGCTCGGGAAGTGGAC 2142
||.|||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||.|||||.||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 2066 CTGGCTCCTCTCCTCCAGGCAGTGGTCGGTCCACACCAAGAAGGGTCCCTCACAGTCCTGCCCGGGAGGTGGAC 2139
Query 2143 AGACTGGGCGTCATGACCCTTTTGCCACCTTCCAGAGAAGAGGTACGAGATGACAAGACAACCATAAAGTGTGA 2216
||.|||||.||||||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 2140 AGGCTGGGTGTCATGACTCTGTTGCCAGCTTCCAGAGAAGAGGTACGAGACGACAAGACGACGATAAAATGTGA 2213
Query 2217 AACCTCCCCGCCTTCCTCCCCGAGAGCCCTTCGGTTAGACCGGCTGCACAAAGGGGCGCTGCACACCGTTAGCC 2290
||||||.||.||.|||||||||||..||||.||.||||||.||.|||||||.||.||.|.||||||.||.||||
Sbjct 2214 AACCTCTCCCCCCTCCTCCCCGAGGCCCCTGCGCTTAGACAGGATGCACAAGGGCGCACCGCACACGGTCAGCC 2287
Query 2291 ACGAGGACATCAGGGACATAAGGAACTCCACAGGCTCCCAGGATGGTCCCGTGAGCAACCCCAGCAGTAGCAAC 2364
|.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.
Sbjct 2288 ATGAGGACATCAGGGACCTGAGGAACTCCACAGGCTCCCAGGATGGTCCCGTGAGCAACCCTAGCAGCAGTAAT 2361
Query 2365 AGTAGCCAGGACTCGCTCCACAAAGCCCCAAAGAAGAAAGGCATTAAGTCCTCCATTGGCCGCTTGTTTGGCAA 2438
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2362 AGTAGCCAGGACTCCCTCCACAAAGCCCCAAAGAAGAAGGGTATCAAATCCTCCATTGGCCGCTTGTTTGGGAA 2435
Query 2439 GAAAGAAAAGGGCCGACCTGGACAAACT-GGCAAAGAAGCATTAGGACAAGCTGGTGTTTCCGAGACGGATAAC 2511
|||.|||||||||||.|||||.| .||| |||||.||..||..|||.||||.|||||||||.|||||.||.||.
Sbjct 2436 GAAGGAAAAGGGCCGGCCTGGTC-CACTGGGCAAGGAGTCACCAGGGCAAGTTGGTGTTTCAGAGACAGAAAAT 2508
Query 2512 TCATCTCAGGATGCCTTGGGACTTAGCAAATTGGGGGGACAGGCTGAAAAAAATCGTAAACTTCAAAAAAAGCA 2585
||||||||.||||||.|||||||.||||||.||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 2509 TCATCTCAAGATGCCCTGGGACTCAGCAAACTGGGAGGACAAGCTGAGAAAAACCGTAAACTTCAGAAAAAGCA 2582
Query 2586 TGAATTGCTGGGGGAAGCCCGGAGACAAGGTTTACCTTTTGCCCAATGGGACGGGCCAACGGTTGTGGTCTGGC 2659
.||..||||||.|||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.||.|||.
Sbjct 2583 CGAGCTGCTGGAGGAGGCCCGCAGGCAAGGCTTGCCTTTTGCACAGTGGGATGGGCCCACAGTGGTAGTGTGGT 2656
Query 2660 TAGAGCTCTGGGTTGGGATGCCAGCCTGGTATGTGGCTGCCTGCCGAGCAAACGTGAAAAGCGGGGCCATCATG 2733
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 2657 TAGAGCTCTGGGTTGGGATGCCTGCCTGGTATGTGGCTGCTTGCCGAGCAAATGTCAAGAGTGGTGCCATCATG 2730
Query 2734 TCGGCCCTGTCCGACACAGAGATCCAGCGTGAGATTGGCATCAGCAACCCCCTGCACAGGCTGAAGCTGAGGCT 2807
||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 2731 TCAGCCCTGTCAGACACTGAGATCCAGCGGGAGATTGGCATCAGCAACCCCCTGCATAGGCTGAAGCTGCGGCT 2804
Query 2808 GGCCATCCAGGAGATCATGTCGCTGACCAGCCCGTCTGCCCCGCCCACATCTAGAACGAC-------------- 2867
|||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 2805 GGCCATCCAAGAGATAATGTCACTGACTAGCCCTTCTGCTCCACCCACATCCAGGACGACCACAGGAAATGTCT 2878
Query 2868 -------------------------------------------------------------------------- 2867
Sbjct 2879 GGTTGACACATGAAGAGATGGAAACGCTTACAGCCACGCCACAAACGGAAGACGAGGAGGGAAGCTGGGCTCAG 2952
Query 2868 ACTC--GCCTATGGGGACATGAACCACGAGTGGATCGGCAACGAGTGGCTCCCCAGCCTGGGCCTCCCCCAGTA 2939
|||| ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 2953 ACTCTAGCATATGGGGACATGAACCACGAGTGGATCGGCAATGAGTGGCTGCCCAGCCTGGGCCTGCCGCAGTA 3026
Query 2940 CCGCAGCTACTTCATGGAGTGCCTTGTAGACGCCAGGATGCTGGACCACTTGACCAAGAAAGACCTTCGAGGGC 3013
||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 3027 CCGCAGCTACTTTATGGAGTGCCTTGTAGATGCCCGGATGCTGGACCACTTGACCAAGAAAGACTTGCGAGGGC 3100
Query 3014 AGCTGAAAATGGTCGACAGTTTTCACAGAAACAGTTTCCAGTGTGGAATTATGTGCCTGAGAAGGTTAAATTAT 3087
|||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 3101 AGCTGAAGATGGTCGACAGCTTCCACAGAAACAGTTTCCAGTGTGGAATTATGTGCCTGAGAAGGCTAAATTAT 3174
Query 3088 GACCGGAAAGAACTGGAAAGAAAAAGAGAAGAAAGTCAGAGTGAAATAAAAGACGTGCTTGTTTGGAGCAATGA 3161
|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|.||.|||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 3175 GACCGAAAAGAACTGGAAAGAAAAAGAGAAGAGAGTCAGAATGAGACAAGAGATGTGCTTGTGTGGAGCAATGA 3248
Query 3162 TCGAGTGATTCGCTGGATCCTGTCAATTGGCCTTAAAGAATATGCAAACAATCTTATAGAGAGTGGTGTTCACG 3235
.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 3249 CCGGGTGATTCGCTGGATCCTGTCGATTGGCCTTAAAGAGTATGCCAACAACCTAATAGAGAGCGGTGTTCACG 3322
Query 3236 GAGCACTTCTGGCCTTAGATGAAACCTTCGACTTCAGTGCACTGGCACTGCTGTTACAGATCCCAACGCAGAAC 3309
|.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||..||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 3323 GTGCACTTCTGGCTTTGGACGAGACTTTCGATTTCAGTGCCCTGGCACTCTTGTTACAGATTCCAACACAGAAT 3396
Query 3310 ACACAGGCTCGTGCTGTCTTGGAAAGAGAATTTAACAACCTTTTGGTCATGGGGACTGATAGAAGGTTTGATGA 3383
||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 3397 ACGCAGGCTCGAGCTGTCTTGGAAAGAGAATTCAACAACCTTTTGATCACGGGGACTGATCGGAGGTTTGATGA 3470
Query 3384 AGATGATGATAAAAGCTTTAGGAGAGCACCTTCATGGAGAAAAAAGTTTAGACCAAAGGACATTCGTGGCTTAG 3457
.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3471 GGATGATGACAAAAGCTTCAGGAGGGCGCCTTCCTGGAGGAAGAAGTTCAGACCAAAGGACATTCGTGGCTTGG 3544
Query 3458 CTGCTGGGTCAGCAGAGACTCTCCCTGCAAACTTCCGGGTGACTTCTTCTATGTCTTCCCCCTCTATGCAGCCA 3531
|..||||.||.||||||||..|.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 3545 CCTCTGGCTCTGCAGAGACGTTGCCTGCCAACTTCCGGGTCACCTCCTCAATGTCATCTCCCTCTATGCAGCCA 3618
Query 3532 AAGAAGATGCAGATGGACGGCAATGTATCAGGAACACAGAGGTTGGATTCTGCTACAGTCAGGACTTACTCCTG 3605
||||||.|.|||||||||||.|.|||.||.|||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 3619 AAGAAGGTTCAGATGGACGGTAGTGTGTCCGGAGCACAGAGGTTGGACTCTGCCACAGTCAGGACTTACTCCTG 3692
Query 3606 C 3606
|
Sbjct 3693 C 3693