Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492117
• Subject: XM_030254519.1
• Aligned Length: 1274
• Identities: 1024
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGAGCCTCCATTTCTTATACTACTGCAGTGAACCAACATTGGATGTGAAAATTGCCTTTTGTCAGGGATTCGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TAAACAAGTGGATGTGTCATATATTGCCAAACATTACAACATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACA  148
                                                    ||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------ATGAGCAAAAGCAAGGTGGACAACCAGTTCTACA  34

Query  149  GTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCGCTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCT  222
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct   35  GTGTGGAAGTGGGGGACTCAACCTTCACCGTTCTTAAGCGCTACCAGAACCTGAAGCCAATTGGCTCTGGGGCT  108

Query  223  CAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT  296
            |||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  109  CAGGGAATAGTCTGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT  182

Query  297  TCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA  370
            .|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  183  CCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA  256

Query  371  TTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGAGGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTG  444
            ||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  257  TTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGGAGGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTG  330

Query  445  ATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAAT  518
            |||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||
Sbjct  331  ATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTGGACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGAT  404

Query  519  GTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCA  592
            |.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  405  GCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCATCCACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCA  478

Query  593  AGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCA  666
            ||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  479  AGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGGCCAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCG  552

Query  667  TATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATG  740
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||..|.||
Sbjct  553  TATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACCTGTG  626

Query  741  GTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAA-------TCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATT  807
            |||.||.||.|||||.||||||||||||||       ||||       |.||.||.||.||.|..||..|||||
Sbjct  627  GTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATGGT-------AAAAGGCACAGTGCTGTTCCCTGGCACTGATCATATT  693

Query  808  GACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGT  881
            |||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  694  GACCAGTGGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGTGTCCAGAGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGT  767

Query  882  AAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCC  955
            .||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  768  CAGAAACTACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTCACCTTCCCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCC  841

Query  956  CAGCAGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGAC  1029
            ||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  842  CAGCGGATTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGCCAGGGATTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGAC  915

Query 1030  CCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGT  1103
            |||||.||.||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  916  CCAGCGAAGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATCCGTACATCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGT  989

Query 1104  GGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAAC  1177
            ||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  990  GGAGGCGCCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGATGAAAGGGAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAAC  1063

Query 1178  TTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCA  1251
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1064  TTATCTACAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAAGAATGGCGTAGTCAAAGGCCAGCCCTCGCCTTCA  1137

Query 1252  GCACAGGTGCAGCAGG  1267
            ||||||||||||||| 
Sbjct 1138  GCACAGGTGCAGCAG-  1152