Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000492131
Subject:
NM_001163349.1
Aligned Length:
1314
Identities:
1194
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATTCATGCCCTTTGGGTTACGGTGTCCTCAGTGATGCAGCCCTACCCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct    1  ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATCCATGCCCTGTGGGTGACAGTGTCCTCTGTGATGCAGCCCTACCTTTT  74

Query   75  GGTTTGGGGACATTATGATTTGTGTAAGACTCAGATTTACACGGAAGAAGGGAAAGTTTGGGATTACATGGCCT  148
            .||.|||||||||||||||.|.|||||||..|.|||||||||.||||||||.||||||||||||||||..||||
Sbjct   75  CGTGTGGGGACATTATGATGTATGTAAGAGCCTGATTTACACAGAAGAAGGCAAAGTTTGGGATTACACAGCCT  148

Query  149  GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACAAAATATCTGAAAGTGAAACTCGATCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC  222
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACCAAGTATCTGAAAGTGAAACTGGACCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC  222

Query  223  CCTCCTGAGACGTTCTGTGCAATGGGCAATCCCTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAGCT  296
            |||||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CCTCCAGAGTCCTTCTGTGCAATGGGCAACCCTTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAACT  296

Query  297  GGCACACCCCCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCCACTTGGA  370
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  GGCACACCCTCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCTACTTGGA  370

Query  371  AGGAGTATCCCAAGCCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAGCTAACAGACAACATA  444
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGTACCCCAAACCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAACTCACAGACAACATA  444

Query  445  GTTATTACCTTTGAATCTGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTGGAGAAGTCTCTCGATTATGGACGAACATGGCA  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  GTTATTACCTTTGAATCGGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTAGAGAAATCTCTCGACTACGGACGAACATGGCA  518

Query  519  GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCTTAGATGCTTTTCACATGGATCCTAAATCCGTGAAGGATTTATCAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||.|..||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCCTCCATGCATTCCACATGGACCCGAAATCCGTGAAGGATTTATCTC  592

Query  593  AGCATACGGTCTTAGAAATCATTTGCACAGAAGAGTACTCAACAGGGTATACAACAAATAGCAAAATAATCCAC  666
            ||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..|.||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCACACGGTCTTGGAAATCATTTGCACGGAAGAGTACTCCACTGGGTACTCCACGAATAGCAAAATAATCCAC  666

Query  667  TTTGAAATCAAAGACAGGTTCGCGTTTTTTGCTGGACCTCGCCTACGCAATATGGCTTCCCTCTACGGACAGCT  740
            ||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  TTCGAGATCAAAGACAGGTTTGCGTTTTTCGCTGGACCTCGGCTACGAAATATGGCTTCCCTCTATGGACAGCT  740

Query  741  GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTTACAGTCACAGACCTGAGGATAAGGCTGTTAAGACCAGCCGTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  741  GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTCACTGTCACAGACCTGAGGATCAGGCTGTTGAGACCCGCCGTTG  814

Query  815  GGGAAATATTTGTAGATGAGCTACACTTGGCACGCTACTTTTACGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG  888
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGAAATATTTGTAGATGAACTACATTTGGCACGTTACTTTTATGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG  888

Query  889  TGCAAGTGTAATCTCCATGCCACTGTATGTGTGTATGACAACAGCAAATTGACATGCGAATGTGAGCACAACAC  962
            ||||||||.||.||.|||||||||...|||.|||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCAAGTGCAACCTGCATGCCACTTCGTGTTTGTATGACAACAGCAAACTGACATGTGAATGTGAGCACAACAC  962

Query  963  TACAGGTCCAGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAATTATCAGGGCCGACCTTGGAGTCCAGGCTCCTATCTCCCCA  1036
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct  963  TACAGGTCCCGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAACTACCAGGGCCGACCTTGGAGCCCCGGCTCATACCTCCCCA  1036

Query 1037  TCCCCAAAGGCACTGCAAATACCTGTATCCCCAGTATTTCCAGTATTGGTACGAATGTCTGCGACAACGAGCTC  1110
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037  TCCCCAAAGGCACCGCAAACACCTGTATCCCCAGCATTTCCAGTATCGGTACTAATGTCTGCGACAATGAGCTC  1110

Query 1111  CTGCACTGCCAGAACGGAGGGACGTGCCACAACAACGTGCGCTGCCTGTGCCCGGCCGCATACACGGGCATCCT  1184
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||..||||||.|.|||.|||||.||||||||
Sbjct 1111  CTGCACTGCCAGAATGGAGGGACCTGCCAGAACAATGTGCGCTGCGCGTGCCCAGACGCCTACACCGGCATCCT  1184

Query 1185  CTGCGAGAAGCTGCGGTGCGAGGAGGCTGGCAGCTGCGGCTCCGACTCTGGCCAGGGCGCGCCCCCGCACGGCT  1258
            |||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||..||||
Sbjct 1185  CTGTGAGAAGCTACGGTGCGAAGAGGCGGGCAGCTGTGGCTCCGAATCCGGCCAGGGAGCACCCCCGCGGGGCT  1258

Query 1259  CCCCAGCGCTGCTGCTGCTGACCACGCTGCTGGGAACCGCCAGCCCCCTGGTGTTC  1314
            |||||||.||||||||||||||||.|||||||||.||.|||.|.||||||||||||
Sbjct 1259  CCCCAGCACTGCTGCTGCTGACCATGCTGCTGGGGACTGCCGGTCCCCTGGTGTTC  1314