Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492131
• Subject: NM_001372170.1
• Aligned Length: 1617
• Identities: 1314
• Gaps: 303

Alignment

Query    1  ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATTCATGCCCTTTGGGTTACGGTGTCCTCAGTGATGCAGCCCTACCCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATTCATGCCCTTTGGGTTACGGTGTCCTCAGTGATGCAGCCCTACCCTTT  74

Query   75  GGTTTGGGGACATTATGATTTGTGTAAGACTCAGATTTACACGGAAGAAGGGAAAGTTTGGGATTACATGGCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTTTGGGGACATTATGATTTGTGTAAGACTCAGATTTACACGGAAGAAGGGAAAGTTTGGGATTACATGGCCT  148

Query  149  GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACAAAATATCTGAAAGTGAAACTCGATCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACAAAATATCTGAAAGTGAAACTCGATCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC  222

Query  223  CCTCCTGAGACGTTCTGTGCAATGGGCAATCCCTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCCTGAGACGTTCTGTGCAATGGGCAATCCCTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAGCT  296

Query  297  GGCACACCCCCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCCACTTGGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCACACCCCCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCCACTTGGA  370

Query  371  AGGAGTATCCCAAGCCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAGCTAACAGACAACATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGTATCCCAAGCCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAGCTAACAGACAACATA  444

Query  445  GTTATTACCTTTGAATCTGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTGGAGAAGTCTCTCGATTATGGACGAACATGGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTATTACCTTTGAATCTGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTGGAGAAGTCTCTCGATTATGGACGAACATGGCA  518

Query  519  GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCTTAGATGCTTTTCACATGGATCCTAAATCCGTGAAGGATTTATCAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCTTAGATGCTTTTCACATGGATCCTAAATCCGTGAAGGATTTATCAC  592

Query  593  AGCATACGGTCTTAGAAATCATTTGCACAGAAGAGTACTCAACAGGGTATACAACAAATAGCAAAATAATCCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCATACGGTCTTAGAAATCATTTGCACAGAAGAGTACTCAACAGGGTATACAACAAATAGCAAAATAATCCAC  666

Query  667  TTTGAAATCAAAGACAGGTTCGCGTTTTTTGCTGGACCTCGCCTACGCAATATGGCTTCCCTCTACGGACAGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGAAATCAAAGACAGGTTCGCGTTTTTTGCTGGACCTCGCCTACGCAATATGGCTTCCCTCTACGGACAGCT  740

Query  741  GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTTACAGTCACAGACCTGAGGATAAGGCTGTTAAGACCAGCCGTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTTACAGTCACAGACCTGAGGATAAGGCTGTTAAGACCAGCCGTTG  814

Query  815  GGGAAATATTTGTAGATGAGCTACACTTGGCACGCTACTTTTACGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGAAATATTTGTAGATGAGCTACACTTGGCACGCTACTTTTACGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG  888

Query  889  TGCAAGTGTAATCTCCATGCCACTGTATGTGTGTATGACAACAGCAAATTGACATGCGAATGTGAGCACAACAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCAAGTGTAATCTCCATGCCACTGTATGTGTGTATGACAACAGCAAATTGACATGCGAATGTGAGCACAACAC  962

Query  963  TACAGGTCCAGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAATTATCAGGGCCGACCTTGGAGTCCAGGCTCCTATCTCCCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACAGGTCCAGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAATTATCAGGGCCGACCTTGGAGTCCAGGCTCCTATCTCCCCA  1036

Query 1037  TCCCCAAAGGCACTGCAAATACCTGTATCCCCAGTATTTCCAGTATTGGTA-----------------------  1087
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 1037  TCCCCAAAGGCACTGCAAATACCTGTATCCCCAGTATTTCCAGTATTGGTAATTGTGAATGCTTCGGCCACTCC  1110

Query 1088  --------------------------------------------------------------------------  1087
                                                                                      
Sbjct 1111  AATCGATGCAGTTATATCGATCTGCTAAATACAGTCATTTGCGTGAGCTGTAAACACAACACTAGAGGGCAGCA  1184

Query 1088  --------------------------------------------------------------------------  1087
                                                                                      
Sbjct 1185  CTGTGAGTTATGCAGGCTGGGCTACTTCAGAAATGCTTCTGCACAACTGGACGATGAGAATGTGTGCATAGAGT  1258

Query 1088  --------------------------------------------------------------------------  1087
                                                                                      
Sbjct 1259  GTTATTGTAACCCTTTGGGCTCAATCCATGATCGTTGTAATGGCTCAGGATTTTGTGAGTGTAAGACTGGAACA  1332

Query 1088  ----------------------------------------------------------CGAATGTCTGCGACAA  1103
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACAGGGCCTAAGTGTGATGAGTGTCTGCCGGGAAATTCCTGGCACTACGGCTGTCAACCGAATGTCTGCGACAA  1406

Query 1104  CGAGCTCCTGCACTGCCAGAACGGAGGGACGTGCCACAACAACGTGCGCTGCCTGTGCCCGGCCGCATACACGG  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGAGCTCCTGCACTGCCAGAACGGAGGGACGTGCCACAACAACGTGCGCTGCCTGTGCCCGGCCGCATACACGG  1480

Query 1178  GCATCCTCTGCGAGAAGCTGCGGTGCGAGGAGGCTGGCAGCTGCGGCTCCGACTCTGGCCAGGGCGCGCCCCCG  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCATCCTCTGCGAGAAGCTGCGGTGCGAGGAGGCTGGCAGCTGCGGCTCCGACTCTGGCCAGGGCGCGCCCCCG  1554

Query 1252  CACGGCTCCCCAGCGCTGCTGCTGCTGACCACGCTGCTGGGAACCGCCAGCCCCCTGGTGTTC  1314
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CACGGCTCCCCAGCGCTGCTGCTGCTGACCACGCTGCTGGGAACCGCCAGCCCCCTGGTGTTC  1617