Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000492131
- Subject:
- XM_011240292.2
- Aligned Length:
- 1608
- Identities:
- 1194
- Gaps:
- 294
Alignment
Query 1 ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATTCATGCCCTTTGGGTTACGGTGTCCTCAGTGATGCAGCCCTACCCTTT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 1 ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATCCATGCCCTGTGGGTGACAGTGTCCTCTGTGATGCAGCCCTACCTTTT 74
Query 75 GGTTTGGGGACATTATGATTTGTGTAAGACTCAGATTTACACGGAAGAAGGGAAAGTTTGGGATTACATGGCCT 148
.||.|||||||||||||||.|.|||||||..|.|||||||||.||||||||.||||||||||||||||..||||
Sbjct 75 CGTGTGGGGACATTATGATGTATGTAAGAGCCTGATTTACACAGAAGAAGGCAAAGTTTGGGATTACACAGCCT 148
Query 149 GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACAAAATATCTGAAAGTGAAACTCGATCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC 222
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACCAAGTATCTGAAAGTGAAACTGGACCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC 222
Query 223 CCTCCTGAGACGTTCTGTGCAATGGGCAATCCCTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAGCT 296
|||||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 CCTCCAGAGTCCTTCTGTGCAATGGGCAACCCTTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAACT 296
Query 297 GGCACACCCCCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCCACTTGGA 370
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297 GGCACACCCTCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCTACTTGGA 370
Query 371 AGGAGTATCCCAAGCCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAGCTAACAGACAACATA 444
|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 371 AGGAGTACCCCAAACCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAACTCACAGACAACATA 444
Query 445 GTTATTACCTTTGAATCTGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTGGAGAAGTCTCTCGATTATGGACGAACATGGCA 518
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 445 GTTATTACCTTTGAATCGGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTAGAGAAATCTCTCGACTACGGACGAACATGGCA 518
Query 519 GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCTTAGATGCTTTTCACATGGATCCTAAATCCGTGAAGGATTTATCAC 592
||||||||||||||||||||||||||||.|..||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCCTCCATGCATTCCACATGGACCCGAAATCCGTGAAGGATTTATCTC 592
Query 593 AGCATACGGTCTTAGAAATCATTTGCACAGAAGAGTACTCAACAGGGTATACAACAAATAGCAAAATAATCCAC 666
||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..|.||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCACACGGTCTTGGAAATCATTTGCACGGAAGAGTACTCCACTGGGTACTCCACGAATAGCAAAATAATCCAC 666
Query 667 TTTGAAATCAAAGACAGGTTCGCGTTTTTTGCTGGACCTCGCCTACGCAATATGGCTTCCCTCTACGGACAGCT 740
||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 TTCGAGATCAAAGACAGGTTTGCGTTTTTCGCTGGACCTCGGCTACGAAATATGGCTTCCCTCTATGGACAGCT 740
Query 741 GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTTACAGTCACAGACCTGAGGATAAGGCTGTTAAGACCAGCCGTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 741 GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTCACTGTCACAGACCTGAGGATCAGGCTGTTGAGACCCGCCGTTG 814
Query 815 GGGAAATATTTGTAGATGAGCTACACTTGGCACGCTACTTTTACGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG 888
|||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGAAATATTTGTAGATGAACTACATTTGGCACGTTACTTTTATGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG 888
Query 889 TGCAAGTGTAATCTCCATGCCACTGTATGTGTGTATGACAACAGCAAATTGACATGCGAATGTGAGCACAACAC 962
||||||||.||.||.|||||||||...|||.|||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCAAGTGCAACCTGCATGCCACTTCGTGTTTGTATGACAACAGCAAACTGACATGTGAATGTGAGCACAACAC 962
Query 963 TACAGGTCCAGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAATTATCAGGGCCGACCTTGGAGTCCAGGCTCCTATCTCCCCA 1036
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 963 TACAGGTCCCGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAACTACCAGGGCCGACCTTGGAGCCCCGGCTCATACCTCCCCA 1036
Query 1037 TCCCCAAAGGCACTGCAAATACCTGTATCCCCAGTATTTCCAGTATTGGTA----------------------- 1087
|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1037 TCCCCAAAGGCACCGCAAACACCTGTATCCCCAGCATTTCCAGTATCGGTACTCCTCCAAAGTTTAATAGGATA 1110
Query 1088 -------------------------------------------------------------------------- 1087
Sbjct 1111 TGGCCGAATATTTCTTCCCTTGAGGTTTCTAACCCAAAACAAGTTGCTCCCAAATTAGCTTTGTCAACAGTTTC 1184
Query 1088 -------------------------------------------------------------------------- 1087
Sbjct 1185 TTCTGTTCAAGTTGCAAACCACAAGCGAGACTGTGAATGCTTCGGCCACTCCAATCGGTGCAGTTATATCGATC 1258
Query 1088 -------------------------------------------------------------------------- 1087
Sbjct 1259 TGCTAAACACAGTCATTTGCGTGAGCTGTAAACACAACACTAGAGGGCAGCACTGTGAGTTATGCAGGCTGGGC 1332
Query 1088 -------------------------------------------------CGAATGTCTGCGACAACGAGCTCCT 1112
|.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333 TACTTCAGAAATGCTTCTGCACAGCTGGACGATGAGAATGTGTGCATAGCTAATGTCTGCGACAATGAGCTCCT 1406
Query 1113 GCACTGCCAGAACGGAGGGACGTGCCACAACAACGTGCGCTGCCTGTGCCCGGCCGCATACACGGGCATCCTCT 1186
||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||..||||||.|.|||.|||||.||||||||||
Sbjct 1407 GCACTGCCAGAATGGAGGGACCTGCCAGAACAATGTGCGCTGCGCGTGCCCAGACGCCTACACCGGCATCCTCT 1480
Query 1187 GCGAGAAGCTGCGGTGCGAGGAGGCTGGCAGCTGCGGCTCCGACTCTGGCCAGGGCGCGCCCCCGCACGGCTCC 1260
|.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||..||||||
Sbjct 1481 GTGAGAAGCTACGGTGCGAAGAGGCGGGCAGCTGTGGCTCCGAATCCGGCCAGGGAGCACCCCCGCGGGGCTCC 1554
Query 1261 CCAGCGCTGCTGCTGCTGACCACGCTGCTGGGAACCGCCAGCCCCCTGGTGTTC 1314
|||||.||||||||||||||||.|||||||||.||.|||.|.||||||||||||
Sbjct 1555 CCAGCACTGCTGCTGCTGACCATGCTGCTGGGGACTGCCGGTCCCCTGGTGTTC 1608