Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492131
• Subject: XM_011240293.2
• Aligned Length: 1575
• Identities: 1194
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATTCATGCCCTTTGGGTTACGGTGTCCTCAGTGATGCAGCCCTACCCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct    1  ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATCCATGCCCTGTGGGTGACAGTGTCCTCTGTGATGCAGCCCTACCTTTT  74

Query   75  GGTTTGGGGACATTATGATTTGTGTAAGACTCAGATTTACACGGAAGAAGGGAAAGTTTGGGATTACATGGCCT  148
            .||.|||||||||||||||.|.|||||||..|.|||||||||.||||||||.||||||||||||||||..||||
Sbjct   75  CGTGTGGGGACATTATGATGTATGTAAGAGCCTGATTTACACAGAAGAAGGCAAAGTTTGGGATTACACAGCCT  148

Query  149  GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACAAAATATCTGAAAGTGAAACTCGATCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC  222
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACCAAGTATCTGAAAGTGAAACTGGACCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC  222

Query  223  CCTCCTGAGACGTTCTGTGCAATGGGCAATCCCTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAGCT  296
            |||||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CCTCCAGAGTCCTTCTGTGCAATGGGCAACCCTTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAACT  296

Query  297  GGCACACCCCCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCCACTTGGA  370
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  GGCACACCCTCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCTACTTGGA  370

Query  371  AGGAGTATCCCAAGCCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAGCTAACAGACAACATA  444
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGTACCCCAAACCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAACTCACAGACAACATA  444

Query  445  GTTATTACCTTTGAATCTGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTGGAGAAGTCTCTCGATTATGGACGAACATGGCA  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  GTTATTACCTTTGAATCGGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTAGAGAAATCTCTCGACTACGGACGAACATGGCA  518

Query  519  GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCTTAGATGCTTTTCACATGGATCCTAAATCCGTGAAGGATTTATCAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||.|..||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCCTCCATGCATTCCACATGGACCCGAAATCCGTGAAGGATTTATCTC  592

Query  593  AGCATACGGTCTTAGAAATCATTTGCACAGAAGAGTACTCAACAGGGTATACAACAAATAGCAAAATAATCCAC  666
            ||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..|.||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCACACGGTCTTGGAAATCATTTGCACGGAAGAGTACTCCACTGGGTACTCCACGAATAGCAAAATAATCCAC  666

Query  667  TTTGAAATCAAAGACAGGTTCGCGTTTTTTGCTGGACCTCGCCTACGCAATATGGCTTCCCTCTACGGACAGCT  740
            ||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  TTCGAGATCAAAGACAGGTTTGCGTTTTTCGCTGGACCTCGGCTACGAAATATGGCTTCCCTCTATGGACAGCT  740

Query  741  GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTTACAGTCACAGACCTGAGGATAAGGCTGTTAAGACCAGCCGTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  741  GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTCACTGTCACAGACCTGAGGATCAGGCTGTTGAGACCCGCCGTTG  814

Query  815  GGGAAATATTTGTAGATGAGCTACACTTGGCACGCTACTTTTACGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG  888
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGAAATATTTGTAGATGAACTACATTTGGCACGTTACTTTTATGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG  888

Query  889  TGCAAGTGTAATCTCCATGCCACTGTATGTGTGTATGACAACAGCAAATTGACATGCGAATGTGAGCACAACAC  962
            ||||||||.||.||.|||||||||...|||.|||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCAAGTGCAACCTGCATGCCACTTCGTGTTTGTATGACAACAGCAAACTGACATGTGAATGTGAGCACAACAC  962

Query  963  TACAGGTCCAGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAATTATCAGGGCCGACCTTGGAGTCCAGGCTCCTATCTCCCCA  1036
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct  963  TACAGGTCCCGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAACTACCAGGGCCGACCTTGGAGCCCCGGCTCATACCTCCCCA  1036

Query 1037  TCCCCAAAGGCACTGCAAATACCTGTATCCCCAGTATTTCCAGTATTGGTA-----------------------  1087
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||                       
Sbjct 1037  TCCCCAAAGGCACCGCAAACACCTGTATCCCCAGCATTTCCAGTATCGGTACTCCTCCAAAGTTTAATAGGATA  1110

Query 1088  --------------------------------------------------------------------------  1087
                                                                                      
Sbjct 1111  TGGCCGAATATTTCTTCCCTTGAGGTTTCTAACCCAAAACAAGTTGCTCCCAAATTAGCTTTGTCAACAGTTTC  1184

Query 1088  --------------------------------------------------------------------------  1087
                                                                                      
Sbjct 1185  TTCTGTTCAAGTTGCAAACCACAAGCGAGAGTGTTATTGTAACCCTTTGGGCTCAATCCATGATCGTTGTAATG  1258

Query 1088  --------------------------------------------------------------------------  1087
                                                                                      
Sbjct 1259  GCTCAGGATTTTGTGAGTGTAAGACTGGAACAACAGGGCCTAAATGTGATGAGTGTCTGCCAGGAAATTCCTGG  1332

Query 1088  ----------------CGAATGTCTGCGACAACGAGCTCCTGCACTGCCAGAACGGAGGGACGTGCCACAACAA  1145
                            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1333  TACTACGGCTGTCAACCTAATGTCTGCGACAATGAGCTCCTGCACTGCCAGAATGGAGGGACCTGCCAGAACAA  1406

Query 1146  CGTGCGCTGCCTGTGCCCGGCCGCATACACGGGCATCCTCTGCGAGAAGCTGCGGTGCGAGGAGGCTGGCAGCT  1219
            .|||||||||..||||||.|.|||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1407  TGTGCGCTGCGCGTGCCCAGACGCCTACACCGGCATCCTCTGTGAGAAGCTACGGTGCGAAGAGGCGGGCAGCT  1480

Query 1220  GCGGCTCCGACTCTGGCCAGGGCGCGCCCCCGCACGGCTCCCCAGCGCTGCTGCTGCTGACCACGCTGCTGGGA  1293
            |.||||||||.||.||||||||.||.|||||||..|||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 1481  GTGGCTCCGAATCCGGCCAGGGAGCACCCCCGCGGGGCTCCCCAGCACTGCTGCTGCTGACCATGCTGCTGGGG  1554

Query 1294  ACCGCCAGCCCCCTGGTGTTC  1314
            ||.|||.|.||||||||||||
Sbjct 1555  ACTGCCGGTCCCCTGGTGTTC  1575