Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492170
• Subject: XM_011544483.2
• Aligned Length: 4014
• Identities: 3271
• Gaps: 741

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGGGGGACGCAGGATGCGGGGGGCGCCCGCGCGCCTGCTGCTGCCGCTGCTGCCGTGGCTCCTGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCGCCGGGGGACGCAGGATGCGGGGGGCGCCCGCGCGCCTGCTGCTGCCGCTGCTGCCGTGGCTCCTGCT  74

Query   75  GCTCCTGGCGCCCGAGGCTCGGGGCGCGCCCGGCTGCCCGCTATCCATCCGCAGCTGCAAGTGCTCGGGGGAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTCCTGGCGCCCGAGGCTCGGGGCGCGCCCGGCTGCCCGCTATCCATCCGCAGCTGCAAGTGCTCGGGGGAGC  148

Query  149  GGCCCAAGGGGCTGAGCGGCGGCGTCCCTGGCCCGGCTCGGCGGAGGGTGGTGTGCAGCGGCGGGGACCTCCCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCCCAAGGGGCTGAGCGGCGGCGTCCCTGGCCCGGCTCGGCGGAGGGTGGTGTGCAGCGGCGGGGACCTCCCG  222

Query  223  GAGCCTCCCGAGCCCGGCCTTCTGCCTAACGGCACCGTTACCCTGCTCTTGAGCAATAACAAGATCACGGGGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCCTCCCGAGCCCGGCCTTCTGCCTAACGGCACCGTTACCCTGCTCTTGAGCAATAACAAGATCACGGGGCT  296

Query  297  CCGCAATGGCTCCTTCCTGGGACTGTCACTGCTGGAGAAGCTGGACCTGAGGAACAACATCATCAGCACAGTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGCAATGGCTCCTTCCTGGGACTGTCACTGCTGGAGAAGCTGGACCTGAGGAACAACATCATCAGCACAGTGC  370

Query  371  AGCCGGGCGCCTTCCTGGGCCTGGGGGAGCTGAAGCGTTTAGATCTCTCCAACAACCGGATTGGCTGTCTCACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCCGGGCGCCTTCCTGGGCCTGGGGGAGCTGAAGCGTTTAGATCTCTCCAACAACCGGATTGGCTGTCTCACC  444

Query  445  TCCGAGACCTTCCAGGGCCTCCCCAGGCTTCTCCGACTAAACATATCTGGAAACATCTTCTCCAGTCTGCAACC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCGAGACCTTCCAGGGCCTCCCCAGGCTTCTCCGACTAAACATATCTGGAAACATCTTCTCCAGTCTGCAACC  518

Query  519  TGGGGTCTTTGATGAGCTGCCAGCCCTTAAGGTTGTGGACTTGGGCACCGAGTTCCTGACCTGTGACTGCCACC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGGGTCTTTGATGAGCTGCCAGCCCTTAAGGTTGTGGACTTGGGCACCGAGTTCCTGACCTGTGACTGCCACC  592

Query  593  TGCGCTGGCTGCTGCCCTGGGCCCAGAATCGCTCCCTGCAGCTGTCGGAACACACGCTCTGTGCTTACCCCAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCGCTGGCTGCTGCCCTGGGCCCAGAATCGCTCCCTGCAGCTGTCGGAACACACGCTCTGTGCTTACCCCAGT  666

Query  667  GCCCTGCATGCTCAGGCCCTGGGCAGCCTCCAGGAGGCCCAGCTCTGCTGCGAGGGGGCCCTGGAGCTGCACAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCCTGCATGCTCAGGCCCTGGGCAGCCTCCAGGAGGCCCAGCTCTGCTGCGAGGGGGCCCTGGAGCTGCACAC  740

Query  741  ACACCACCTCATCCCGTCCCTACGCCAAGTGGTGTTCCAGGGGGATCGGCTGCCCTTCCAGTGCTCTGCCAGCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACACCACCTCATCCCGTCCCTACGCCAAGTGGTGTTCCAGGGGGATCGGCTGCCCTTCCAGTGCTCTGCCAGCT  814

Query  815  ACCTGGGCAACGACACCCGCATCCGCTGGTACCACAACCGAGCCCCTGTGGAGGGTGATGAGCAGGCGGGCATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCTGGGCAACGACACCCGCATCCGCTGGTACCACAACCGAGCCCCTGTGGAGGGTGATGAGCAGGCGGGCATC  888

Query  889  CTCCTGGCCGAGAGCCTCATCCACGACTGCACCTTCATCACCAGTGAGCTGACGCTGTCTCACATCGGCGTGTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCCTGGCCGAGAGCCTCATCCACGACTGCACCTTCATCACCAGTGAGCTGACGCTGTCTCACATCGGCGTGTG  962

Query  963  GGCCTCAGGCGAGTGGGAGTGCACCGTGTCCATGGCCCAAGGCAACGCCAGCAAGAAGGTGGAGATCGTGGTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCCTCAGGCGAGTGGGAGTGCACCGTGTCCATGGCCCAAGGCAACGCCAGCAAGAAGGTGGAGATCGTGGTGC  1036

Query 1037  TGGAGACCTCTGCCTCCTACTGCCCCGCCGAGCGTGTTGCCAACAACCGCGGGGACTTCAGGTGGCCCCGAACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGAGACCTCTGCCTCCTACTGCCCCGCCGAGCGTGTTGCCAACAACCGCGGGGACTTCAGGTGGCCCCGAACT  1110

Query 1111  CTGGCTGGCATCACAGCCTACCAGTCCTGCCTGCAGTATCCCTTCACCTCAGTGCCCCTGGGCGGGGGTGCCCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGGCTGGCATCACAGCCTACCAGTCCTGCCTGCAGTATCCCTTCACCTCAGTGCCCCTGGGCGGGGGTGCCCC  1184

Query 1185  GGGCACCCGAGCCTCCCGCCGGTGTGACCGTGCCGGCCGCTGGGAGCCAGGGGACTACTCCCACTGTCTCTACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGCACCCGAGCCTCCCGCCGGTGTGACCGTGCCGGCCGCTGGGAGCCAGGGGACTACTCCCACTGTCTCTACA  1258

Query 1259  CCAACGACATCACCAGGGTGCTGTACACCTTCGTGCTGATGCCCATCAATGCCTCCAATGCGCTGACCCTGGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCAACGACATCACCAGGGTGCTGTACACCTTCGTGCTGATGCCCATCAATGCCTCCAATGCGCTGACCCTGGCT  1332

Query 1333  CACCAGCTGCGCGTGTACACAGCCGAGGCCGCTAGCTTTTCAGACATGATGGATGTAGTCTATGTGGCTCAGAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CACCAGCTGCGCGTGTACACAGCCGAGGCCGCTAGCTTTTCAGACATGATGGATGTAGTCTATGTGGCTCAGAT  1406

Query 1407  GATCCAGAAATTTTTGGGTTATGTCGACCAGATCAAAGAGCTGGTAGAGGTGATGGTGGACATGGCCAGCAACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GATCCAGAAATTTTTGGGTTATGTCGACCAGATCAAAGAGCTGGTAGAGGTGATGGTGGACATGGCCAGCAACC  1480

Query 1481  TGATGCTGGTGGACGAGCACCTGCTGTGGCTGGCCCAGCGCGAGGACAAGGCCTGCAGCCGCATCGTGGGTGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGATGCTGGTGGACGAGCACCTGCTGTGGCTGGCCCAGCGCGAGGACAAGGCCTGCAGCCGCATCGTGGGTGCC  1554

Query 1555  CTGGAGCGCATTGGGGGGGCCGCCCTCAGCCCCCATGCCCAGCACATCTCAG----------------------  1606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct 1555  CTGGAGCGCATTGGGGGGGCCGCCCTCAGCCCCCATGCCCAGCACATCTCAGTGAATGCGAGGAACGTGGCATT  1628

Query 1607  --------------------------------------------------------------------------  1606
                                                                                      
Sbjct 1629  GGAGGCCTACCTCATCAAGCCGCACAGCTACGTGGGCCTGACCTGCACAGCCTTCCAGAGGAGGGAGGGAGGGG  1702

Query 1607  --------------------------------------------------------------------------  1606
                                                                                      
Sbjct 1703  TGCCGGGCACACGGCCAGGAAGCCCTGGCCAGAACCCCCCACCTGAGCCCGAGCCCCCAGCTGACCAGCAGCTC  1776

Query 1607  --------------------------------------------------------------------------  1606
                                                                                      
Sbjct 1777  CGCTTCCGCTGCACCACCGGGAGGCCCAATGTTTCTCTGTCGTCCTTCCACATCAAGAACAGCGTGGCCCTGGC  1850

Query 1607  --------------------------------------------------------------------------  1606
                                                                                      
Sbjct 1851  CTCCATCCAGCTGCCCCCGAGTCTATTCTCATCCCTTCCGGCTGCCCTGGCTCCCCCGGTGCCCCCAGACTGCA  1924

Query 1607  --------------------------------------------------------------------------  1606
                                                                                      
Sbjct 1925  CCCTGCAACTGCTCGTCTTCCGAAATGGCCGCCTCTTCCACAGCCACAGCAACACCTCCCGCCCTGGAGCTGCT  1998

Query 1607  --------------------------------------------------------------------------  1606
                                                                                      
Sbjct 1999  GGGCCTGGCAAGAGGCGTGGCGTGGCCACCCCCGTCATCTTCGCAGGAACCAGTGGCTGTGGCGTGGGAAACCT  2072

Query 1607  --------------------------------------------------------------------------  1606
                                                                                      
Sbjct 2073  GACAGAGCCAGTGGCCGTTTCGCTGCGGCACTGGGCTGAGGGAGCCGAACCTGTGGCCGCTTGGTGGAGCCAGG  2146

Query 1607  --------------------------------------------------------------------------  1606
                                                                                      
Sbjct 2147  AGGGGCCCGGGGAGGCTGGGGGCTGGACCTCGGAGGGCTGCCAGCTCCGCTCCAGCCAGCCCAATGTCAGCGCC  2220

Query 1607  -------------------------------------TGGAGCTGAGCGCCTTTCCCAGGGAGGTGGGGGGCGC  1643
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGCACTGCCAGCACTTGGGCAATGTGGCCGTGCTCATGGAGCTGAGCGCCTTTCCCAGGGAGGTGGGGGGCGC  2294

Query 1644  CGGGGCAGGGCTGCACCCCGTGGTATACCCCTGCACGGCCTTGCTGCTGCTCTGCCTCTTCGCCACCATCATCA  1717
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CGGGGCAGGGCTGCACCCCGTGGTATACCCCTGCACGGCCTTGCTGCTGCTCTGCCTCTTCGCCACCATCATCA  2368

Query 1718  CCTACATCCTCAACCACAGCTCCATCCGTGTGTCCCGGAAAGGCTGGCACATGCTGCTGAACTTGTGCTTCCAC  1791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CCTACATCCTCAACCACAGCTCCATCCGTGTGTCCCGGAAAGGCTGGCACATGCTGCTGAACTTGTGCTTCCAC  2442

Query 1792  ATAGCCATGACCTCTGCTGTCTTTGCGGGGGGCATCACACTCACCAACTACCAGATGGTCTGCCAGGCGGTGGG  1865
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ATAGCCATGACCTCTGCTGTCTTTGCGGGGGGCATCACACTCACCAACTACCAGATGGTCTGCCAGGCGGTGGG  2516

Query 1866  CATCACCCTGCACTACTCCTCCCTATCCACGCTGCTCTGGATGGGCGTGAAGGCGCGAGTGCTCCATAAGGAGC  1939
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CATCACCCTGCACTACTCCTCCCTATCCACGCTGCTCTGGATGGGCGTGAAGGCGCGAGTGCTCCATAAGGAGC  2590

Query 1940  TCACCTGGAGGGCACCCCCTCCGCAAGAAGGGGACCCCGCTCTGCCTACTCCCAGTCCTATGCTCCGGTTCTAT  2013
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct 2591  TCACCTGGAGGGCACCCCCTCCGCAAGAAGGGGACCCCGCTCTGCCTACTCCCAGTCCTATGCTCCG-------  2657

Query 2014  TTGATCGCTGGAGGGATTCCACTCATTATCTGTGGCATCACAGCTGCAGTCAACATCCACAACTACCGGGACCA  2087
                                                                                      
Sbjct 2658  --------------------------------------------------------------------------  2657

Query 2088  CAGCCCCTACTGCTGGCTGGTGTGGCGTCCAAGCCTTGGCGCCTTCTACATCCCTGTGGCTTTGATTCTGCTCA  2161
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2658  ---------CTGCTGGCTGGTGTGGCGTCCAAGCCTTGGCGCCTTCTACATCCCTGTGGCTTTGATTCTGCTCA  2722

Query 2162  TCACCTGGATCTATTTCCTGTGCGCCGGGCTACGCTTACGGGGTCCTCTGGCACAGAACCCCAAGGCGGGCAAC  2235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2723  TCACCTGGATCTATTTCCTGTGCGCCGGGCTACGCTTACGGGGTCCTCTGGCACAGAACCCCAAGGCGGGCAAC  2796

Query 2236  AGCAGGGCCTCCCTGGAGGCAGGGGAGGAGCTGAGGGGTTCCACCAGGCTCAGGGGCAGCGGCCCCCTCCTGAG  2309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2797  AGCAGGGCCTCCCTGGAGGCAGGGGAGGAGCTGAGGGGTTCCACCAGGCTCAGGGGCAGCGGCCCCCTCCTGAG  2870

Query 2310  TGACTCAGGTTCCCTTCTTGCTACTGGGAGCGCGCGAGTGGGGACGCCCGGGCCCCCGGAGGATGGTGACAGCC  2383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2871  TGACTCAGGTTCCCTTCTTGCTACTGGGAGCGCGCGAGTGGGGACGCCCGGGCCCCCGGAGGATGGTGACAGCC  2944

Query 2384  TCTATTCTCCGGGAGTCCAGCTAGGGGCGCTGGTGACCACGCACTTCCTGTACTTGGCCATGTGGGCCTGCGGG  2457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2945  TCTATTCTCCGGGAGTCCAGCTAGGGGCGCTGGTGACCACGCACTTCCTGTACTTGGCCATGTGGGCCTGCGGG  3018

Query 2458  GCTCTGGCAGTGTCCCAGCGCTGGCTGCCCCGGGTGGTGTGCAGCTGCTTGTACGGGGTGGCAGCCTCCGCCCT  2531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3019  GCTCTGGCAGTGTCCCAGCGCTGGCTGCCCCGGGTGGTGTGCAGCTGCTTGTACGGGGTGGCAGCCTCCGCCCT  3092

Query 2532  GGGCCTCTTCGTCTTCACTCACCACTGTGCCAGGCGGAGGGACGTGAGAGCCTCGTGGCGCGCCTGCTGCCCCC  2605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3093  GGGCCTCTTCGTCTTCACTCACCACTGTGCCAGGCGGAGGGACGTGAGAGCCTCGTGGCGCGCCTGCTGCCCCC  3166

Query 2606  CTGCCTCTCCCGCGGCCCCCCATGCCCCGCCCCGGGCCCTGCCCGCCGCCGCAGAGGACGGTTCCCCGGTGTTC  2679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3167  CTGCCTCTCCCGCGGCCCCCCATGCCCCGCCCCGGGCCCTGCCCGCCGCCGCAGAGGACGGTTCCCCGGTGTTC  3240

Query 2680  GGGGAGGGGCCCCCCTCCCTCAAGTCCTCCCCAAGCGGCAGCAGCGGCCATCCGCTGGCTCTGGGCCCCTGCAA  2753
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3241  GGGGAGGGCCCCCCCTCCCTCAAGTCCTCCCCAAGCGGCAGCAGCGGCCATCCGCTGGCTCTGGGCCCCTGCAA  3314

Query 2754  GCTCACCAACCTGCAGCTGGCCCAGAGTCAGGTGTGCGAGGCGGGGGCGGCGGCCGGCGGGGAAGGAGAGCCGG  2827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3315  GCTCACCAACCTGCAGCTGGCCCAGAGTCAGGTGTGCGAGGCGGGGGCGGCGGCCGGCGGGGAAGGAGAGCCGG  3388

Query 2828  AGCCGGCGGGCACCCGGGGAAACCTCGCCCACCGCCACCCCAACAACGTGCACCACGGGCGTCGGGCGCACAAG  2901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3389  AGCCGGCGGGCACCCGGGGAAACCTCGCCCACCGCCACCCCAACAACGTGCACCACGGGCGTCGGGCGCACAAG  3462

Query 2902  AGCCGGGCCAAGGGACACCGCGCGGGGGAGGCCTGCGGCAAGAACCGGCTCAAGGCCCTGCGCGGGGGCGCGGC  2975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3463  AGCCGGGCCAAGGGACACCGCGCGGGGGAGGCCTGCGGCAAGAACCGGCTCAAGGCCCTGCGCGGGGGCGCGGC  3536

Query 2976  GGGGGCGCTGGAGCTGCTGTCCAGCGAGAGCGGTAGTCTGCACAACAGCCCCACCGACAGCTACCTGGGCAGCA  3049
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3537  GGGGGCGCTGGAGCTGCTGTCCAGCGAGAGCGGCAGTCTGCACAACAGCCCCACCGACAGCTACCTGGGCAGCA  3610

Query 3050  GCCGCAACAGCCCGGGCGCCGGCCTGCAGCTGGAAGGCGAGCCCATGCTCACGCCGTCCGAGGGCAGCGACACC  3123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3611  GCCGCAACAGCCCGGGCGCCGGCCTGCAGCTGGAAGGCGAGCCCATGCTCACGCCGTCCGAGGGCAGCGACACC  3684

Query 3124  AGCGCCGCGCCGCTTTCTGAGGCGGGCCGGGCAGGCCAGCGCCGCAGCGCCAGCCGCGACAGTCTCAAGGGCGG  3197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3685  AGCGCCGCGCCGCTTTCTGAGGCGGGCCGGGCAGGCCAGCGCCGCAGCGCCAGCCGCGACAGTCTCAAGGGCGG  3758

Query 3198  CGGCGCGCTGGAGAAGGAGAGCCATCGCCGCTCGTACCCGCTCAACGCCGCCAGCCTAAACGGCGCCCCCAAGG  3271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3759  CGGCGCGCTGGAGAAGGAGAGCCATCGCCGCTCGTACCCGCTCAACGCCGCCAGCCTAAACGGCGCCCCCAAGG  3832

Query 3272  GGGGCAAGTACGACGACGTCACCCTGATGGGCGCGGAGGTAGCCAGCGGCGGCTGCATGAAGACCGGACTCTGG  3345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3833  GGGGCAAGTACGACGACGTCACCCTGATGGGCGCGGAGGTAGCCAGCGGCGGCTGCATGAAGACCGGACTCTGG  3906

Query 3346  AAGAGCGAAACTACCGTC  3363
            ||||||||||||||||||
Sbjct 3907  AAGAGCGAAACTACCGTC  3924