Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492172
• Subject: XM_017007207.1
• Aligned Length: 2061
• Identities: 1934
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  ATGCTGAAATTCCAAGAGGCAGCTAAGTGTGTGAGTGGATCAACAGCCATTTCCACTTATCCAAAGACCTTGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGAAATTCCAAGAGGCAGCTAAGTGTGTGAGTGGATCAACAGCCATTTCCACTTATCCAAAGACCTTGAT  74

Query   75  TGCAAGAAGATACGTGCTTCAACAAAAACTTGGCAGTGGAAGTTTTGGAACTGTCTATCTGGTTTCAGACAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCAAGAAGATACGTGCTTCAACAAAAACTTGGCAGTGGAAGTTTTGGAACTGTCTATCTGGTTTCAGACAAGA  148

Query  149  AAGCCAAACGAGGAGAGGAATTAAAGGTACTTAAGGAAATATCTGTTGGAGAACTAAATCCAAATGAAACTGTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGCCAAACGAGGAGAGGAATTAAAGGTACTTAAGGAAATATCTGTTGGAGAACTAAATCCAAATGAAACTGTA  222

Query  223  CAGGCCAATTTGGAAGCCCAACTCCTCTCCAAGCTGGACCACCCAGCCATTGTCAAGTTCCATGCAAGTTTTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGCCAATTTGGAAGCCCAACTCCTCTCCAAGCTGGACCACCCAGCCATTGTCAAGTTCCATGCAAGTTTTGT  296

Query  297  GGAGCAAGATAATTTCTGCATTATCACGGAGTACTGTG------------------------------------  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct  297  GGAGCAAGATAATTTCTGCATTATCACGGAGTACTGTGAGGACCTCTCCAAGGAGAACTGCAAACCACTGCTCA  370

Query  335  --------------------------------------------------------------------------  334
                                                                                      
Sbjct  371  ATGAAATAAAAGAGGACACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCAATATCGTGAAA  444

Query  335  ----------------AGGGCCGAGATCTGGACGATAAAATTCAGGAATATAAACAAGCTGGAAAAATCTTTCC  392
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGGCCATACTGCCCAAGGGCCGAGATCTGGACGATAAAATTCAGGAATATAAACAAGCTGGAAAAATCTTTCC  518

Query  393  AGAAAATCAAATAATAGAATGGTTTATCCAGCTGCTGCTGGGAGTTGACTACATGCATGAGAGGAGGATACTTC  466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAAATCAAATAATAGAATGGTTTATCCAGCTGCTGCTGGGAGTTGACTACATGCATGAGAGGAGGATACTTC  592

Query  467  ATCGAGACTTAAAGTCAAAGAATGTATTTCTGAAAAATAATCTCCTTAAAATTGGAGATTTTGGAGTTTCTCGA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCGAGACTTAAAGTCAAAGAATGTATTTCTGAAAAATAATCTCCTTAAAATTGGAGATTTTGGAGTTTCTCGA  666

Query  541  CTTCTAATGGGATCCTGTGACCTGGCCACAACTTTAACTGGAACTCCCCATTATATGAGTCCTGAGGCTCTGAA  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTCTAATGGGATCCTGTGACCTGGCCACAACTTTAACTGGAACTCCCCATTATATGAGTCCTGAGGCTCTGAA  740

Query  615  ACACCAAGGCTATGACACAAAGTCGGACATCTGGTCACTGGCATGCATTTTGTATGAGATGTGCTGCATGAATC  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACACCAAGGCTATGACACAAAGTCGGACATCTGGTCACTGGCATGCATTTTGTATGAGATGTGCTGCATGAATC  814

Query  689  ATGCATTCGCTGGCTCCAATTTCTTATCCATTGTTTTAAAAATTGTTGAAGGTGACACACCTTCTCTCCCTGAG  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGCATTCGCTGGCTCCAATTTCTTATCCATTGTTTTAAAAATTGTTGAAGGTGACACACCTTCTCTCCCTGAG  888

Query  763  AGATATCCAAAAGAACTAAATGCCATCATGGAAAGCATGTTGAACAAGAATCCTTCATTAAGACCATCTGCTAT  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGATATCCAAAAGAACTAAATGCCATCATGGAAAGCATGTTGAACAAGAATCCTTCATTAAGACCATCTGCTAT  962

Query  837  CGAAATTTTAAAAATCCCTTACCTTGATGAGCAGCTACAGAACCTAATGTGTAGATATTCAGAAATGACTCTGG  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGAAATTTTAAAAATCCCTTACCTTGATGAGCAGCTACAGAACCTAATGTGTAGATATTCAGAAATGACTCTGG  1036

Query  911  AAGACAAAAATTTGGATTGTCAGAAGGAGGCTGCTCATATAATTAATGCCATGCAAAAAAGGATCCACCTGCAG  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGACAAAAATTTGGATTGTCAGAAGGAGGCTGCTCATATAATTAATGCCATGCAAAAAAGGATCCACCTGCAG  1110

Query  985  ACTCTGAGGGCACTGTCAGAAGTACAGAAAATGACGCCAAGAGAAAGGATGCGGCTGAGGAAGCTCCAGGCGGC  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTCTGAGGGCACTGTCAGAAGTACAGAAAATGACGCCAAGAGAAAGGATGCGGCTGAGGAAGCTCCAGGCGGC  1184

Query 1059  TGATGAGAAAGCCAGGAAGCTGAAAAAGATTGTGGAAGAAAAATATGAAGAAAATAGCAAACGAATGCAAGAAT  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGATGAGAAAGCCAGGAAGCTGAAAAAGATTGTGGAAGAAAAATATGAAGAAAATAGCAAACGAATGCAAGAAT  1258

Query 1133  TGAGATCTCGGAACTTTCAGCAGCTGAGTGTTGATGTACTCCATGAAAAAACACATTTAAAAGGAATGGAAGAA  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGAGATCTCGGAACTTTCAGCAGCTGAGTGTTGATGTACTCCATGAAAAAACACATTTAAAAGGAATGGAAGAA  1332

Query 1207  AAGGAGGAGCAACCTGAGGGAAGACTTTCTTGTTCACCCCAGGACGAGGATGAAGAGAGGTGGCAAGGCAGGGA  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGAGGAGCAACCTGAGGGAAGACTTTCTTGTTCACCCCAGGACGAGGATGAAGAGAGGTGGCAAGGCAGGGA  1406

Query 1281  AGAGGAATCTGATGAACCAACTTTAGAGAACCTGCCTGAGTCTCAGCCTATTCCTTCCATGGACCTCCACGAAC  1354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAGGAATCTGATGAACCAACTTTAGAGAACCTGCCTGAGTCTCAGCCTATTCCTTCCATGGACCTCCACGAAC  1480

Query 1355  TTGAATCAATTGTAGAGGATGCCACATCTGACCTTGGATACCATGAGATCCCAGAAGACCCACTTGTGGCTGAA  1428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTGAATCAATTGTAGAGGATGCCACATCTGACCTTGGATACCATGAGATCCCAGAAGACCCACTTGTGGCTGAA  1554

Query 1429  GAGTACTACGCTGATGCATTTGATTCCTATTGTGTAGAGAGTGATGAGGAGGAAGAAGAAATAGCGTTAGAAAG  1502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGTACTACGCTGATGCATTTGATTCCTATTGTGAAGAGAGTGATGAGGAGGAAGAAGAAATAGCGTTAGAAAG  1628

Query 1503  ACCAGAGAAAGAAATCAGGAATGAGGGATCCCAGCCTGCTTACAGAACAAACCAACAGGACAGTGATATCGAAG  1576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACCAGAGAAAGAAATCAGGAATGAGGGATCCCAGCCTGCTTACAGAACAAACCAACAGGACAGTGATATCGAAG  1702

Query 1577  CGTTGGCCAGGTGTTTGGAAAATGTCCTGGGTTGCACTTCTCTAGACACAAAGACCATCACCACCATGGCTGAA  1650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGTTGGCCAGGTGTTTGGAAAATGTCCTGGGTTGCACTTCTCTAGACACAAAGACCATCACCACCATGGCTGAA  1776

Query 1651  GACATGTCCCCAGGACCACCAATTTTCAACAGTGTGATGGCCAGGACCAAGATGAAACGCATGAGGGAATCAGC  1724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GACATGTCCCCAGGACCACCAATTTTCAACAGTGTGATGGCCAGGACCAAGATGAAACGCATGAGGGAATCAGC  1850

Query 1725  CATGCAGAAGCTGGGGACAGAAGTATTTGAAGAGGTCTATAATTACCTCAAGAGAGCAAGGCATCAGAATGCTA  1798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CATGCAGAAGCTGGGGACAGAAGTATTTGAAGAGGTCTATAATTACCTCAAGAGAGCAAGGCATCAGAATGCTA  1924

Query 1799  GCGAAGCAGAGATCCGCGAGTGTTTGGAAAAAGTGGTGCCTCAAGCCAGCGACTGTTTTGAAGTGGACCAGCTC  1872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCGAAGCAGAGATCCGCGAGTGTTTGGAAAAAGTGGTGCCTCAAGCCAGCGACTGTTTTGAAGTGGACCAGCTC  1998

Query 1873  CTGTACTTTGAAGAGCAGTTGCTGATCACGATGGGAAAAGAACCTACTCTCCAGAACCATCTC  1935
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTGTACTTTGAAGAGCAGTTGCTGATCACGATGGGAAAAGAACCTACTCTCCAGAACCATCTC  2061