Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492187
• Subject: XM_005256863.1
• Aligned Length: 2958
• Identities: 2828
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGACACTCCTGGGGTCTGAGCATTCCTTGCTGATTAGGAGCAAGTTCAGATCAGTTTTACAGTTAAGACTTCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACACTCCTGGGGTCTGAGCATTCCTTGCTGATTAGGAGCAAGTTCAGATCAGTTTTACAGTTAAGACTTCA  74

Query   75  ACAAAGAAGGACCCAGGAACAACTGGCTAACCAAGGCATAATACCACCACTGAAACGTCCAGCTGAATTCCATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACAAAGAAGGACCCAGGAACAACTGGCTAACCAAGGCATAATACCACCACTGAAACGTCCAGCTGAATTCCATG  148

Query  149  AGCAAAGAAAACATTTGGATAGTGACAAGGCTAAAAATTCCCTGAAGCGCAAAGCCAGAAACAGGTGCAACAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCAAAGAAAACATTTGGATAGTGACAAGGCTAAAAATTCCCTGAAGCGCAAAGCCAGAAACAGGTGCAACAGT  222

Query  223  GCCGACTTGGTTAATATGCACATACTCCAAGCTTCCACTGCAGAGAGGTCCATTCCAACTGCTCAGATGAAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCGACTTGGTTAATATGCACATACTCCAAGCTTCCACTGCAGAGAGGTCCATTCCAACTGCTCAGATGAAGCT  296

Query  297  GAAAAGAGCCCGACTCGCCGATGATCTCAATGAAAAAATTGCTCTACGACCAGGGCCACTGGAGCTGGTGGAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAAAGAGCCCGACTCGCCGATGATCTCAATGAAAAAATTGCTCTACGACCAGGGCCACTGGAGCTGGTGGAAA  370

Query  371  AAAACATTCTTCCTGTGGATTCTGCTGTGAAAGAGGCCATAAAAGGTAACCAGGTGAGTTTCTCCAAATCCACG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAACATTCTTCCTGTGGATTCTGCTGTGAAAGAGGCCATAAAAGGTAACCAGGTGAGTTTCTCCAAATCCACG  444

Query  445  GATGCTTTTGCCTTTGAAGAGGACAGCAGCAGCGATGGGCTTTCTCCGGATCAGACTCGAAGTGAAGACCCCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGCTTTTGCCTTTGAAGAGGACAGCAGCAGCGATGGGCTTTCTCCGGATCAGACTCGAAGTGAAGACCCCCA  518

Query  519  AAACTCAGCGGGATCCCCGCCAGACGCTAAAGCCTCAGATACCCCTTCGACAGGTTCTCTGGGGACAAACCAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAACTCAGCGGGATCCCCGCCAGACGCTAAAGCCTCAGATACCCCTTCGACAGGTTCTCTGGGGACAAACCAGG  592

Query  593  ATCTTGCTTCTGGCTCAGAAAATGACAGAAATGACTCAGCCTCACAGCCCAGCCACCAGTCAGATGCGGGGAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCTTGCTTCTGGCTCAGAAAATGACAGAAATGACTCAGCCTCACAGCCCAGCCACCAGTCAGATGCGGGGAAG  666

Query  667  CAGGGGCTTGGCCCCCCCAGCACCCCCATAGCCGTGCATGCTGCTGTAAAGTCCAAATCCTTGGGTGACAGTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGGGCTTGGCCCCCCCAGCACCCCCATAGCCGTGCATGCTGCTGTAAAGTCCAAATCCTTGGGTGACAGTAA  740

Query  741  GAACCGCCACAAAAAGCCCAAGGACCCCAAGCCAAAGGTGAAGAAGCTTAAATATCACCAGTACATTCCCCCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAACCGCCACAAAAAGCCCAAGGACCCCAAGCCAAAGGTGAAGAAGCTTAAATATCACCAGTACATTCCCCCAG  814

Query  815  ACCAGAAGGCAGAGAAGTCCCCTCCACCTATGGACTCAGCCTACGCTCGGCTGCTCCAGCAACAGCAGCTGTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCAGAAGGCAGAGAAGTCCCCTCCACCTATGGACTCAGCCTACGCTCGGCTGCTCCAGCAACAGCAGCTGTTC  888

Query  889  CTGCAGCTCCAAATCCTCAGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACACCGGTTCAGCTACCTAGGGATGCACCAAGC  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGCAGCTCCAAATCCTCAGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACACCGATTCAGCTACCTAGGGATGCACCAAGC  962

Query  963  TCAGCTTAAGGAACCAAATGAACAGATGGTCAGAAATCCAAACTCTTCTTCAACGCCACTGAGCAATACCCCCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAGCTTAAGGAACCAAATGAACAGATGGTCAGAAATCCAAACTCTTCTTCAACGCCACTGAGCAATACCCCCT  1036

Query 1037  TGTCTCCTGTCAAAAACAGTTTTTCTGGACAAACTGGTGTCTCTTCTTTCAAACCAGGCCCACTCCCACCTAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGTCTCCTGTCAAAAACAGTTTTTCTGGACAAACTGGTGTCTCTTCTTTCAAACCAGGCCCACTCCCACCTAAC  1110

Query 1111  CTGGATGATCTGAAGGTCTCTGAATTAAGACAACAGCTTCGAATTCGGGGCTTGCCTGTGTCAGGCACCAAAAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGGATGATCTGAAGGTCTCTGAATTAAGACAACAGCTTCGAATTCGGGGCTTGCCTGTGTCAGGCACCAAAAC  1184

Query 1185  GGCTCTCATGGACCGGCTTCGACCCTTCCAGGACTGCTCTGGCAACCCAGTGCCGAACTTTGGGGATATAACGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCTCTCATGGACCGGCTTCGACCCTTCCAGGACTGCTCTGGCAACCCAGTGCCGAACTTTGGGGATATAACGA  1258

Query 1259  CTGTCACTTTTCCTGTCACACCCAACACGCTGCCCAATTACCAGTCTTCCTCTTCTACCAGTGCCCTGTCCAAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGTCACTTTTCCTGTCACACCCAACACGCTGCCCAATTACCAGTCTTCCTCTTCTACCAGTGCCCTGTCCAAC  1332

Query 1333  GGCTTCTACCACTTTGGCAGCACCAGCTCCAGCCCCCCGATCTCCCCAGCCTCCTCTGACCTGTCAGTCGCTGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCTTCTACCACTTTGGCAGCACCAGCTCCAGCCCCCCGATCTCCCCAGCCTCCTCTGACCTGTCAGTCGCTGG  1406

Query 1407  GTCCCTGCCGGACACCTTCAATGATGCCTCCCCCTCCTTCGGCCTGCACCCGTCCCCAGTCCACGTGTGCACGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTCCCTGCCGGACACCTTCAATGATGCCTCCCCCTCCTTCGGCCTGCACCCGTCCCCAGTCCACGTGTGCACGG  1480

Query 1481  AGGAAAGTCTCATGAGCAGCCTGAATGGGGGCTCTGTTCCTTCTGAGCTGGATGGGCTGGACTCCGAGAAGGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGAAAGTCTCATGAGCAGCCTGAATGGGGGCTCTGTTCCTTCTGAGCTGGATGGGCTGGACTCCGAGAAGGAC  1554

Query 1555  AAGATGCTGGTGGAGAAGCAGAAGGTGATCAATGAACTCACCTGGAAACTCCAGCAAGAGCAGAGGCAGGTGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGATGCTGGTGGAGAAGCAGAAGGTGATCAATGAACTCACCTGGAAACTCCAGCAAGAGCAGAGGCAGGTGGA  1628

Query 1629  GGAGCTGAGGATGCAGCTTCAGAAGCAGAAAAGGAATAACTGTTCAGAGAAGAAGCCGCTGCCTTTCCTGGCTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGAGCTGAGGATGCAGCTTCAGAAGCAGAAAAGGAATAACTGTTCAGAGAAGAAGCCGCTGCCTTTCCTGGCTG  1702

Query 1703  CCTCCATCAAGCAGGAAGAGGCTGTCTCCAGCTGTCCTTTTGCATCCCAAGTACCTGTGAAAAGACAAAGCAGC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCTCCATCAAGCAGGAAGAGGCTGTCTCCAGCTGTCCTTTTGCATCCCAAGTACCTGTGAAAAGACAAAGCAGC  1776

Query 1777  AGCTCAGAGTGTCACCCACCGGCTTGTGAAGCTGCTCAACTCCAGCCTCTTGGAAATGCTCATTGTGTGGAGTC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGCTCAGAGTGTCACCCACCGGCTTGTGAAGCTGCTCAACTCCAGCCTCTTGGAAATGCTCATTGTGTGGAGTC  1850

Query 1851  CTCAGATCAAACCAATGTACTTTCTTCCACATTTCTCAGCCCCCAGTGTTCCCCTCAGCATTCACCGCTGGGGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTCAGATCAAACCAATGTACTTTCTTCCACATTTCTCAGCCCCCAGTGTTCCCCTCAGCATTCACCGCTGGGGG  1924

Query 1925  CTGTGAAAAGCCCACAGCACATCAGTTTGCCCCCATCACCCAACAACCCTCACTTTCTGCCCTCATCCTCCGGG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTGTGAAAAGCCCACAGCACATCAGTTTGCCCCCATCACCCAACAACCCTCACTTTCTGCCCTCATCCTCCGGG  1998

Query 1999  GCCCAGGGAGAAGGGCACAGGGTCTCCTCGCCCATCAGCAGCCAGGTGTGCACTGCACAGAACTCAGGAGCACA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCCCAGGGAGAAGGGCACAGGGTCTCCTCGCCCATCAGCAGCCAGGTGTGCACTGCACAGAACTCAGGAGCACA  2072

Query 2073  CGATGGCCATCCTCCAAGCTTCTCTCCCCATTCTTCCAGCCTCCACCCGCCCTTCTCTGGAGCCCAAGCAGACA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CGATGGCCATCCTCCAAGCTTCTCTCCCCATTCTTCCAGCCTCCACCCGCCCTTCTCTGGAGCCCAAGCAGACA  2146

Query 2147  GCAGTCATGGTGCCGGGGGAAACCCTTGTCCCAAAAGCCCATGTGTACAGCAAAAGATGGCTGGTTTACACTCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct 2147  GCAGTCATGGTGCCGGGGGAAACCCTTGTCCCAAAAGCCCATGTGTACAGCAAA--------------------  2200

Query 2221  TCTGATAAGGTGGGGCCAAAGTTTTCAATTCCATCCCCAACTTTTTCTAAGTCAAGTTCAGCAATTTCAGAGGT  2294
                                                                                      
Sbjct 2201  --------------------------------------------------------------------------  2200

Query 2295  AACACAGCCTCCATCCTATGAAGATGCCGTAAAGCAGCAAATGACCCGGAGTCAGCAGATGGATGAACTCCTGG  2368
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2201  -----------------------------------AGCAAATGACCCGGAGTCAGCAGATGGATGAACTCCTGG  2239

Query 2369  ACGTGCTTATTGAAAGCGGAGAAATGCCAGCAGACGCTAGAGAGGATCACTCATGTCTTCAAAAAGTCCCAAAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2240  ACGTGCTTATTGAAAGCGGAGAAATGCCAGCAGACGCTAGAGAGGATCACTCATGTCTTCAAAAAGTCCCAAAG  2313

Query 2443  ATACCCAGATCTTCCCGAAGTCCAACTGCTGTCCTCACCAAGCCCTCGGCTTCCTTTGAACAAGCCTCTTCAGG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2314  ATACCCAGATCTTCCCGAAGTCCAACTGCTGTCCTCACCAAGCCCTCGGCTTCCTTTGAACAAGCCTCTTCAGG  2387

Query 2517  CAGCCAGATCCCCTTTGATCCCTATGCCACCGACAGTGATGAGCATCTTGAAGTCTTATTAAATTCCCAGAGCC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2388  CAGCCAGATCCCCTTTGATCCCTATGCCACCGACAGTGATGAGCATCTTGAAGTCTTATTAAATTCCCAGAGCC  2461

Query 2591  CCCTAGGAAAGATGAGTGATGTCACCCTTCTAAAAATTGGGAGCGAAGAGCCTCACTTTGATGGGATAATGGAT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2462  CCCTAGGAAAGATGAGTGATGTCACCCTTCTAAAAATTGGGAGCGAAGAGCCTCACTTTGATGGGATAATGGAT  2535

Query 2665  GGATTCTCTGGGAAGGCTGCAGAAGACCTCTTCAATGCACATGAGATCTTGCCAGGCCCCCTCTCTCCAATGCA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2536  GGATTCTCTGGGAAGGCTGCAGAAGACCTCTTCAATGCACATGAGATCTTGCCAGGCCCCCTCTCTCCAATGCA  2609

Query 2739  GACACAGTTTTCACCCTCTTCTGTGGACAGCAATGGGCTGCAGTTAAGCTTCACTGAATCTCCCTGGGAAACCA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2610  GACACAGTTTTCACCCTCTTCTGTGGACAGCAATGGGCTGCAGTTAAGCTTCACTGAATCTCCCTGGGAAACCA  2683

Query 2813  TGGAGTGGCTGGACCTCACTCCGCCAAATTCCACACCAGGCTTTAGCGCCCTCACCACCAGCAGCCCCAGCATC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2684  TGGAGTGGCTGGACCTCACTCCGCCAAATTCCACACCAGGCTTTAGCGCCCTCACCACCAGCAGCCCCAGCATC  2757

Query 2887  TTCAACATCGATTTCCTGGATGTCACTGATCTCAATTTGAATTCTTCCATGGACCTTCACTTGCAGCAGTGG  2958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2758  TTCAACATCGATTTCCTGGATGTCACTGATCTCAATTTGAATTCTTCCATGGACCTTCACTTGCAGCAGTGG  2829