Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492193
• Subject: XM_006538545.3
• Aligned Length: 1589
• Identities: 1317
• Gaps: 40

Alignment

Query    1  ATGGGCTGTGTGTTCTGCAAGAAATTGGAGCCGGTGGCCACGGCCAAGGAGGATGCTGGCCTGGAAGGGGACTT  74
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.|      |..||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGTGTGTTCTGCAAGAAGTTGGAGCCTG------CATCCAAGGAGGATGTGGGCCTGGAAGGGGACTT  68

Query   75  CAGAAGCTACGGGGCAGCAGACCACTATGGGCCTGACCCCACT-AAGGCCCGGCCTGCATCC-TCATTTGCCCA  146
            |.|.|||.|...|||.|.|||.|.||||...|||||||||||| |||| ||||.||.|.||| ||.||      
Sbjct   69  CCGGAGCCAAACGGCTGAAGAACGCTATTTCCCTGACCCCACTCAAGG-CCGGACTTCGTCCGTCTTT------  135

Query  147  CATCCCCAACTACAGCAACTTCTCCTCTCAGGCCATCAACCCTGGCTTCCTTGATAGTGGCACCATCAGGGGTG  220
                                     .|||||.|||.||.|||||..|||||..|.|.|||||.|||.||..|..
Sbjct  136  -------------------------CCTCAGCCCACCAGCCCTGCTTTCCTCAACACTGGCAACATGAGAAGCA  184

Query  221  TGTCAGGGATTGGGGTGACCCTGTTCATTGCCCTGTATGACTATGAGGCTCGAACTGAGGATGACCTCACCTTC  294
            |.|||||||..||.||||||.|.|||.|.||||||||.|||||||||||..|.||.|.||||||||||||||||
Sbjct  185  TCTCAGGGACCGGAGTGACCATATTCGTCGCCCTGTACGACTATGAGGCCAGGACAGGGGATGACCTCACCTTC  258

Query  295  ACCAAGGGCGAGAAGTTCCACATCCTGAACAATACTGAAGGTGACTGGTGGGAGGCTCGGTCTCTCAGCTCCGG  368
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||...||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  259  ACCAAAGGCGAGAAGTTCCACATCCTGAACAATACGGAGTATGACTGGTGGGAGGCTCGCTCCCTGAGCTCCGG  332

Query  369  AAAAACTGGCTGCATTCCCAGCAACTACGTGGCCCCTGTTGACTCAATCCAAGCTGAAGAGTGGTACTTTGGAA  442
            |.|.|..||||...|||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  333  ACACAGAGGCTATGTTCCCAGCAACTATGTTGCTCCTGTGGATTCCATCCAGGCTGAAGAGTGGTACTTCGGAA  406

Query  443  AGATTGGGAGAAAGGATGCAGAGAGGCAGCTGCTTTCACCAGGCAACCCCCAGGGGGCCTTTCTCATTCGGGAA  516
            ||||..|.|||||||||||||||||||||||.||.||..|.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  407  AGATCAGTAGAAAGGATGCAGAGAGGCAGCTTCTGTCCTCTGGTAACCCCCAGGGGGCCTTTCTCATTCGGGAA  480

Query  517  AGCGAGACCACCAAAGGTGCCTACTCCCTGTCCATCCGGGACTGGGATCAGACCAGAGGCGATCATGTGAAGCA  590
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||.||||||||||||..|.|||||
Sbjct  481  AGCGAGACCACCAAAGGGGCCTACTCCCTGTCCATCCGTGACTGGGACCAGAACAGAGGCGATCACATAAAGCA  554

Query  591  TTACAAGATCCGCAAACTGGACATGGGCGGCTACTACATCACCACACGGGTTCAGTTCAACTCGGTGCAGGAGC  664
            |||.||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||..|||||..||||..|.|||||.|
Sbjct  555  TTATAAGATCCGAAAGCTGGACACGGGCGGCTACTACATCACCACACGGGCCCAGTTTGACTCCATACAGGACC  628

Query  665  TGGTGCAGCACTACATGGAGGTGAATGACGGGCTGTGCAACCTGCTCATCGCGCCCTGCACCATCATGAAGCCG  738
            |.||||.||||||||||||.||||||||.||.||||||.||.||||.|..|||||.||.||||.||..|||||.
Sbjct  629  TAGTGCGGCACTACATGGAAGTGAATGATGGTCTGTGCTACTTGCTTACGGCGCCTTGTACCACCACTAAGCCC  702

Query  739  CAGACGCTGGGCCTGGCCAAGGACGCCTGGGAGATCAGCCGCAGCTCCATCACGCTGGAGCGCCGGCTGGGCAC  812
            |||||.||.||||||||||||||.||||||||||||..|||.|.||||||..|.|||||.|||.||||||||||
Sbjct  703  CAGACTCTAGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAGATCGACCGGAACTCCATAGCACTGGAACGCAGGCTGGGCAC  776

Query  813  CGGCTGCTTCGGGGATGTGTGGCTGGGCACGTGGAACGGCAGCACTAAGGTGGCGGTGAAGACGCTGAAGCCGG  886
            |||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  777  CGGCTGCTTTGGAGATGTGTGGCTGGGCACATGGAACTGCAGCACAAAGGTGGCAGTGAAGACGCTGAAGCCGG  850

Query  887  GCACCATGTCCCCGAAGGCCTTCCTGGAGGAGGCGCAGGTCATGAAGCTGCTGCGGCACGACAAGCTGGTGCAG  960
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  851  GCACCATGTCCCCGAAGGCATTCCTGGAGGAGGCACAGATCATGAAGCTGCTGAGGCACGACAAGCTGGTGCAG  924

Query  961  CTGTACGCCGTGGTGTCGGAGGAGCCCATCTACATCGTGACCGAGTTCATGTGTCACGGCAGCTTGCTGGATTT  1034
            |||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||..|.||.||||||||||||||
Sbjct  925  CTGTATGCGGTGGTGTCGGAGGAACCCATTTATATTGTGACAGAGTTCATGTGCTATGGTAGCTTGCTGGATTT  998

Query 1035  TCTCAAGAACCCAGAGGGCCAGGATTTGAGGCTGCCCCAATTGGTGGACATGGCAGCCCAGGTAGCTGAGGGCA  1108
            .||.|||.|.|.|||.||.|||.|.||||.|||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  999  CCTAAAGGATCGAGAAGGTCAGAACTTGATGCTGCCCCATCTAGTGGACATGGCTGCCCAGGTAGCCGAGGGCA  1072

Query 1109  TGGCCTACATGGAACGCATGAACTACATTCACCGCGACCTGAGGGCAGCCAACATCCTGGTTGGGGAGCGGCTG  1182
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||....||.
Sbjct 1073  TGGCCTACATGGAACGCATGAACTATATCCACCGAGACTTGAGGGCAGCCAACATCCTGGTGGGGGAATACCTA  1146

Query 1183  GCGTGCAAGATCGCAGACTTTGGCTTGGCGCGTCTCATCAAGGACGATGAGTACAACCCCTGCCAAGGTTCCAA  1256
            ...|||||||||||.|||||.||..||||.||.|||||..|||||.|||||||.||||||...|||||..||||
Sbjct 1147  ATATGCAAGATCGCTGACTTCGGGCTGGCACGCCTCATAGAGGACAATGAGTATAACCCCCAACAAGGAACCAA  1220

Query 1257  GTTCCCCATCAAGTGGACAGCCCCAGAAGCTGCCCTCTTTGGCAGATTCACCATCAAGTCAGACGTGTGGTCCT  1330
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||
Sbjct 1221  GTTCCCCATCAAGTGGACAGCCCCAGAGGCCGCCCTCTTTGGCAGATTCACTGTCAAATCAGACGTGTGGTCCT  1294

Query 1331  TTGGGATCCTGCTCACTGAGCTCATCACCAAGGGCCGAATCCCCTACCCAGGCATGAATAAACGGGAAGTGTTG  1404
            |||||||.|||||||||||.||.||||||||||||.||.|.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1295  TTGGGATTCTGCTCACTGAACTGATCACCAAGGGCAGAGTTCCCTACCCAGGTATGAACAACCGGGAAGTGTTG  1368

Query 1405  GAACAGGTGGAGCAGGGCTACCACATGCCGTGCCCTCCAGGCTGCCCAGCATCCCTGTACGAGGCCATGGAACA  1478
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||.||||||.||
Sbjct 1369  GAACAGGTGGAGCATGGCTACCACATGCCGTGCCCTCCAGGATGTCCTGCATCCCTGTATGAGGTCATGGAGCA  1442

Query 1479  GACCTGGCGTCTGGACCCGGAGGAGAGGCCTACCTTCGAGTACCTGCAGTCCTTCCTGGAGGACTACTTCACCT  1552
            |.|.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1443  GGCGTGGCGCCTGGATCCAGAGGAGAGGCCCACCTTTGAGTACCTGCAGTCTTTCCTGGAAGACTATTTCACCT  1516

Query 1553  CCGCTGAACCACAGTACCAGCCCGGGGATCAGACA  1587
            ||.|.|||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1517  CCACAGAACCACAGTACCAGCCTGGAGACCAGACA  1551