Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492193
• Subject: XR_946583.3
• Aligned Length: 2411
• Identities: 1583
• Gaps: 828

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  CTGCCCAGCAGGGGCGGCGGTCAGAGGCGGGCAGCACCCCAGTTCTCCCCGCACGCCGGCACTCGCGGCTGCTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GAGCCCCGGCTGGCTCACCCCGGGGCCGGGCAGAATTGGGCTCCAGGTCTCTGACCCCTCCCAAGGATCATGCC  148

Query    1  ------------------------------------------------ATGGGCTGTGTGTTCTGCAAGAAATT  26
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAGCCCCACTGACCCAGGAGTAGGGGCCTAAGGGCAGGGAACCTGGAATGGGCTGTGTGTTCTGCAAGAAATT  222

Query   27  GGAGCCGGTGGCCACGGCCAAGGAGGATGCTGGCCTGGAAGGGGACTTCAGAAGCTACGGGGCAGCAGACCACT  100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGAGCCGGTGGCCACGGCCAAGGAGGATGCTGGCCTGGAAGGGGACTTCAGAAGCTACGGGGCAGCAGACCACT  296

Query  101  ATGGGCCTGACCCCACTAAGGCCCGGCCTGCATCCTCATTTGCCCACATCCCCAACTACAGCAACTTCTCCTCT  174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATGGGCCTGACCCCACTAAGGCCCGGCCTGCATCCTCATTTGCCCACATCCCCAACTACAGCAACTTCTCCTCT  370

Query  175  CAGGCCATCAACCCTGGCTTCCTTGATAGTGGCACCATCAGGGGTGTGTCAGGGATTGGGGTGACCCTGTTCAT  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGGCCATCAACCCTGGCTTCCTTGATAGTGGCACCATCAGGGGTGTGTCAGGGATTGGGGTGACCCTGTTCAT  444

Query  249  TGCCCTGTATGACTATGAGGCTCGAACTGAGGATGACCTCACCTTCACCAAGGGCGAGAAGTTCCACATCCTGA  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCCCTGTATGACTATGAGGCTCGAACTGAGGATGACCTCACCTTCACCAAGGGCGAGAAGTTCCACATCCTGA  518

Query  323  ACAATACTGAAGGTGACTGGTGGGAGGCTCGGTCTCTCAGCTCCGGAAAAACTGGCTGCATTCCCAGCAACTAC  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAATACTGAAGGTGACTGGTGGGAGGCTCGGTCTCTCAGCTCCGGAAAAACTGGCTGCATTCCCAGCAACTAC  592

Query  397  GTGGCCCCTGTTGACTCAATCCAAGCTGAAGAGTGGTACTTTGGAAAGATTGGGAGAAAGGATGCAGAGAGGCA  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGGCCCCTGTTGACTCAATCCAAGCTGAAGAGTGGTACTTTGGAAAGATTGGGAGAAAGGATGCAGAGAGGCA  666

Query  471  GCTGCTTTCACCAGGCAACCCCCAGGGGGCCTTTCTCATTCGGGAAAGCGAGACCACCAAAGGTGCCTACTCCC  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTGCTTTCACCAGGCAACCCCCAGGGGGCCTTTCTCATTCGGGAAAGCGAGACCACCAAAGGTGCCTACTCCC  740

Query  545  TGTCCATCCGGGACTGGGATCAGACCAGAGGCGATCATGTGAAGCATTACAAGATCCGCAAACTGGACATGGGC  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTCCATCCGGGACTGGGATCAGACCAGAGGCGATCATGTGAAGCATTACAAGATCCGCAAACTGGACATGGGC  814

Query  619  GGCTACTACATCACCACACGGGTTCAGTTCAACTCGGTGCAGGAGCTGGTGCAGCACTACATGGAGGTGAATGA  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTACTACATCACCACACGGGTTCAGTTCAACTCGGTGCAGGAGCTGGTGCAGCACTACATGGAGGTGAATGA  888

Query  693  CGGGCTGTGCAACCTGCTCATCGCGCCCTGCACCATCATGAAGCCGCAGACGCTGGGCCTGGCCAAGGACGCCT  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGGGCTGTGCAACCTGCTCATCGCGCCCTGCACCATCATGAAGCCGCAGACGCTGGGCCTGGCCAAGGACGCCT  962

Query  767  GGGAGATCAGCCGCAGCTCCATCACGCTGGAGCGCCGGCTGGGCACCGGCTGCTTCGGGGATGTGTGGCTGGGC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGAGATCAGCCGCAGCTCCATCACGCTGGAGCGCCGGCTGGGCACCGGCTGCTTCGGGGATGTGTGGCTGGGC  1036

Query  841  ACGTGGAACGGCAGCACTAAGGTGGCGGTGAAGACGCTGAAGCCGGGCACCATGTCCCCGAAGGCCTTCCTGGA  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACGTGGAACGGCAGCACTAAGGTGGCGGTGAAGACGCTGAAGCCGGGCACCATGTCCCCGAAGGCCTTCCTGGA  1110

Query  915  GGAGGCGCAGGTCATGAAGCTGCTGCGGCACGACAAGCTGGTGCAGCTGTACGCCGTGGTGTCGGAGGAGCCCA  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGAGGCGCAGGTCATGAAGCTGCTGCGGCACGACAAGCTGGTGCAGCTGTACGCCGTGGTGTCGGAGGAGCCCA  1184

Query  989  TCTACATCGTGACCGAGTTCATGTGTCACGGCAGCTTGCTGGATTTTCTCAAGAACCCAGAGGGCCAGGATTTG  1062
            |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTACATCGTGACCGAGTTCATGTGTCAC----GCTTGCTGGATTTTCTCAAGAACCCAGAGGGCCAGGATTTG  1254

Query 1063  AGGCTGCCCCAATTGGTGGACATGGCAGCCCAGGTAGCTGAGGGCATGGCCTACATGGAACGCATGAACTACAT  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  AGGCTGCCCCAATTGGTGGACATGGCAGCCCAGGTAGCTGAGGGCATGGCCTACATGGAACGCATGAACTACAT  1328

Query 1137  TCACCGCGACCTGAGGGCAGCCAACATCCTGGTTGGGGAGCGGCTGGCGTGCAAGATCGCAGACTTTGGCTTGG  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  TCACCGCGACCTGAGGGCAGCCAACATCCTGGTTGGGGAGCGGCTGGCGTGCAAGATCGCAGACTTTGGCTTGG  1402

Query 1211  CGCGTCTCATCAAGGACGATGAGTACAACCCCTGCCAAGGTTCCAAGTTCCCCATCAAGTGGACAGCCCCAGAA  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  CGCGTCTCATCAAGGACGATGAGTACAACCCCTGCCAAGGTTCCAAGTTCCCCATCAAGTGGACAGCCCCAGAA  1476

Query 1285  GCTGCCCTCTTTGGCAGATTCACCATCAAGTCAGACGTGTGGTCCTTTGGGATCCTGCTCACTGAGCTCATCAC  1358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  GCTGCCCTCTTTGGCAGATTCACCATCAAGTCAGACGTGTGGTCCTTTGGGATCCTGCTCACTGAGCTCATCAC  1550

Query 1359  CAAGGGCCGAATCCCCTACCCAGGCATGAATAAACGGGAAGTGTTGGAACAGGTGGAGCAGGGCTACCACATGC  1432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  CAAGGGCCGAATCCCCTACCCAGGCATGAATAAACGGGAAGTGTTGGAACAGGTGGAGCAGGGCTACCACATGC  1624

Query 1433  CGTGCCCTCCAGGCTGCCCAGCATCCCTGTACGAGGCCATGGAACAGACCTGGCGTCTGGACCCGGAGGAGAGG  1506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  CGTGCCCTCCAGGCTGCCCAGCATCCCTGTACGAGGCCATGGAACAGACCTGGCGTCTGGACCCGGAGGAGAGG  1698

Query 1507  CCTACCTTCGAGTACCTGCAGTCCTTCCTGGAGGACTACTTCACCTCCGCTGAACCACAGTACCAGCCCGGGGA  1580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  CCTACCTTCGAGTACCTGCAGTCCTTCCTGGAGGACTACTTCACCTCCGCTGAACCACAGTACCAGCCCGGGGA  1772

Query 1581  TCAGACA-------------------------------------------------------------------  1587
            |||||||                                                                   
Sbjct 1773  TCAGACATAGCCTGTCCGGGCATCAACCCTCTCTGGCGGTGGCCACCAGTCCTTGCCAATCCCCAGAGCTGTTC  1846

Query 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587
                                                                                      
Sbjct 1847  TTCCAAAGCCCCCAGGCTGGCTTAGAACCCCATAGAGTCCTAGCATCACCGAGGACGTGGCTGCTCTGACACCA  1920

Query 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587
                                                                                      
Sbjct 1921  CCTAGGGCAACCTACTTGTTTTACAGATGGGGCAAAAGGAGGCCCAGAGCTGATCTCTCATCCGCTCTGGCCCC  1994

Query 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587
                                                                                      
Sbjct 1995  AAGCACTATTTCTTCCTTTTCCACTTAGGCCCCTACATGCCTGTAGCCTTTCTCACTCCATCCCCACCCAAAGT  2068

Query 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587
                                                                                      
Sbjct 2069  GCTCAGACCTTGTCTAGTTATTTATAAAACTGTATGTACCTCCCTCACTTCTCTCCTATCACTGCTTTCCTACT  2142

Query 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587
                                                                                      
Sbjct 2143  CTCCTTTTATCTCACTCTAGTCCAGGTGCCAAGAATTTCCCTTCTACCCTCTATTCTCTTGTGTCTGTAAGTTA  2216

Query 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587
                                                                                      
Sbjct 2217  CAAAGTCAGGAAAAGTCTTGGCTGGACCCCTTTCCTGCTGGGTGGATGCAGTGGTCCAGGACTGGGGTCTGGGC  2290

Query 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587
                                                                                      
Sbjct 2291  CCAGGTTTGAGGGAGAAGGTTGCAGAGCACTTCCCACCTCTCTGAATAGTGTGTATGTGTTGGTTTATTGATTC  2364

Query 1588  -------------------------------------------  1587
                                                       
Sbjct 2365  TGTAAATAAGTAAAATGACAATATGAATCCTCAAACCATGAAA  2407