Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000492210
Subject:
NM_023670.3
Aligned Length:
1737
Identities:
1595
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGAACAAACTGTATATCGGAAACCTCAGCGAGAACGCCGCCCCCTCGGACCTAGAAAGTATCTTCAAGGACGC  74
            |||||||||.||||.|||||.|||||||||||..||||||.||||.|||||||.||||||.|||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACAAATTGTACATCGGGAACCTCAGCGACCACGCCGGCCCCGCGGACCTGGAAAGTGTCTTCAAGGACGC  74

Query   75  CAAGATCCCGGTGTCGGGACCCTTCCTGGTGAAGACTGGCTACGCGTTCGTGGACTGCCCGGACGAGAGCTGGG  148
            .||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct   75  TAAGATCCCGGTGGCGGGCCCCTTCCTGGTGAAGACGGGCTACGCGTTCGTGGACTGCCCGGACGAGGGCTGGG  148

Query  149  CCCTCAAGGCCATCGAGGCGCTTTCAGGTAAAATAGAACTGCACGGGAAACCCATAGAAGTTGAGCACTCGGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCTCAAGGCCATCGAGGCGCTTTCAGGTAAAATGGAACTACATGGGAAACCGATGGAAGTTGAGCACTCGGTC  222

Query  223  CCAAAAAGGCAAAGGATTCGGAAACTTCAGATACGAAATATCCCGCCTCATTTACAGTGGGAGGTGCTGGATAG  296
            ||.|||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTAAACGGCAGAGGATTCGTAAACTTCAGATACGAAATATCCCGCCCCACTTACAATGGGAGGTGCTGGATAG  296

Query  297  TTTACTAGTCCAGTATGGAGTGGTGGAGAGCTGTGAGCAAGTGAACACTGACTCGGAAACTGCAGTTGTAAATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  TTTACTAGTCCAGTATGGAGTGGTGGAGAGCTGTGAGCAAGTGAACACGGATTCGGAAACGGCAGTTGTAAATG  370

Query  371  TAACCTATTCCAGTAAGGACCAAGCTAGACAAGCACTAGACAAACTGAATGGATTTCAGTTAGAGAATTTCACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  371  TAACCTATTCCAGTAAGGACCAAGCTAGACAAGCCTTAGACAAACTGAATGGATTCCAGTTAGAGAACTTCACC  444

Query  445  TTGAAAGTAGCCTATATCCCTGATGAAATGGCCGCCCAGCAAAACCCCTTGCAGCAGCCCCGAGGTCGCCGGGG  518
            |||||.||.|||||.|||||.|||||||..||.|||||||||||.||||.||..||||.|||.||.||||||||
Sbjct  445  TTGAAGGTTGCCTACATCCCAGATGAAACTGCTGCCCAGCAAAATCCCTCGCCACAGCTCCGGGGGCGCCGGGG  518

Query  519  GCTTGGGCAGAGGGGCTCCTCAAGGCAGGGGTCTCCAGGATCCGTATCCAAGCAGAAACCATGTGATTTGCCTC  592
            ||..||||||.|||||||.||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||..||||.|
Sbjct  519  GCCAGGGCAGCGGGGCTCATCCAGGCAGGCGTCTCCAGGATCGGTGTCCAAGCAGAAACCCTGTGACCTGCCAC  592

Query  593  TGCGCCTGCTGGTTCCCACCCAATTTGTTGGAGCCATCATAGGAAAAGAAGGTGCCACCATTCGGAACATCACC  666
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct  593  TGCGCCTGCTGGTTCCCACCCAGTTTGTTGGAGCCATTATAGGAAAAGAAGGTGCTACCATTCGCAACATCACA  666

Query  667  AAACAGACCCAGTCTAAAATCGATGTCCACCGTAAAGAAAATGCGGGGGCTGCTGAGAAGTCGATTACTATCCT  740
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  AAGCAGACCCAGTCTAAAATCGATGTCCATCGTAAGGAGAATACAGGGGCCGCGGAGAAGTCCATTACTATCCT  740

Query  741  CTCTACTCCTGAAGGCACCTCTGCGGCTTGTAAGTCTATTCTGGAGATTATGCATAAGGAAGCTCAAGATATAA  814
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCTACCCCTGAAGGCACCTCTGCAGCTTGTAAGTCTATTCTGGAGATTATGCATAAGGAAGCTCAAGATATAA  814

Query  815  AATTCACAGAAGAGATCCCCTTGAAGATTTTAGCTCATAATAACTTTGTTGGACGTCTTATTGGTAAAGAAGGA  888
            ||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  AATTCACAGAGGAGATTCCCTTGAAGATCTTAGCTCACAATAACTTTGTAGGCCGTCTCATTGGTAAAGAAGGA  888

Query  889  AGAAATCTTAAAAAAATTGAGCAAGACACAGACACTAAAATCACGATATCTCCATTGCAGGAATTGACGCTGTA  962
            |||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  889  AGAAACCTTAAAAAAATCGAGCAAGACACGGACACTAAAATCACAATATCTCCATTGCAGGAACTGACGCTGTA  962

Query  963  TAATCCAGAACGCACTATTACAGTTAAAGGCAATGTTGAGACATGTGCCAAAGCTGAGGAGGAGATCATGAAGA  1036
            .|||||.||||||||.||||||||.|||||||.|||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  963  CAATCCGGAACGCACCATTACAGTGAAAGGCAGTGTTGAGACGTGTGCCAAGGCGGAGGAGGAAATAATGAAGA  1036

Query 1037  AAATCAGGGAGTCTTATGAAAATGATATTGCTTCTATGAATCTTCAAGCACATTTAATTCCTGGATTAAATCTG  1110
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  AGATCAGGGAGTCTTATGAAAATGATATTGCTTCCATGAATCTTCAAGCACATTTAATCCCTGGATTAAATCTG  1110

Query 1111  AACGCCTTGGGTCTGTTCCCACCCACTTCAGGGATGCCACCTCCCACCTCAGGGCCCCCTTCAGCCATGACTCC  1184
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1111  AATGCCTTGGGTCTGTTCCCACCCACGTCAGGGATGCCACCTCCCACCTCAGGGCCCCCTTCAACCCTGACTCC  1184

Query 1185  TCCCTACCCGCAGTTTGAGCAATCAGAAACGGAGACTGTTCATCTGTTTATCCCAGCTCTATCAGTCGGTGCCA  1258
            |||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||
Sbjct 1185  TCCCTACCCACAATTTGAGCAATCAGAGACGGAGACTGTGCATCTGTTTATTCCCGCCCTGTCCGTTGGCGCCA  1258

Query 1259  TCATCGGCAAGCAGGGCCAGCACATCAAGCAGCTTTCTCGCTTTGCTGGAGCTTCAATTAAGATTGCTCCAGCA  1332
            ||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 1259  TCATTGGCAAGCAGGGCCAACACATCAAACAGCTTTCTCGCTTTGCGGGAGCTTCGATTAAGATCGCTCCAGCC  1332

Query 1333  GAAGCACCAGATGCTAAAGTGAGGATGGTGATTATCACTGGACCACCAGAGGCTCAGTTCAAGGCTCAGGGAAG  1406
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAGCACCAGATGCTAAAGTGCGGATGGTGATTATCACTGGACCACCAGAGGCTCAGTTCAAGGCTCAGGGAAG  1406

Query 1407  AATTTATGGAAAAATTAAAGAAGAAAACTTTGTTAGTCCTAAAGAAGAGGTGAAACTTGAAGCTCATATCAGAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407  AATTTATGGAAAAATTAAAGAAGAAAACTTTGTTAGTCCTAAAGAAGAGGTGAAACTTGAAGCTCACATCAGAG  1480

Query 1481  TGCCATCCTTTGCTGCTGGCAGAGTTATTGGAAAAGGAGGCAAAACGGTGAATGAACTTCAGAATTTGTCAAGT  1554
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||||||
Sbjct 1481  TGCCGTCCTTTGCTGCTGGCAGAGTTATTGGGAAAGGAGGCAAAACGGTGAATGAGCTCCAGAGTTTATCAAGT  1554

Query 1555  GCAGAAGTTGTTGTCCCTCGTGACCAGACACCTGATGAGAATGACCAAGTGGTTGTCAAAATAACTGGTCACTT  1628
            ||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555  GCTGAAGTTGTCGTCCCCCGTGACCAGACACCTGATGAGAATGATCAAGTAGTTGTCAAAATAACTGGCCACTT  1628

Query 1629  CTATGCTTGCCAGGTTGCCCAGAGAAAAATTCAGGAAATTCTGACTCAGGTAAAGCAGCACCAACAACAGAAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1629  CTATGCTTGCCAGGTTGCCCAGAGGAAAATTCAGGAAATTCTGACTCAGGTAAAGCAGCACCAGCAGCAGAAAG  1702

Query 1703  CTCTGCAAAGTGGACCACCTCAGTCAAGACGGAAG  1737
            |||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703  CTCTGCAGAGTGGACCACCTCAGTCAAGGCGGAAG  1737