Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492245
• Subject: NM_173866.3
• Aligned Length: 1569
• Identities: 1387
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGCAGCGGGCGGCGGCGCTGGTCCGGCGGGGCTGTGGTCCCCGGACCCCCAGCTCCTGGGGCCGCAGCCAGAG  74
            |||||||||||.||||.||||||.||||||||||...|.|||||..||.|..||.||||||||||.||.||.||
Sbjct    1  ATGCAGCGGGCAGCGGTGCTGGTGCGGCGGGGCTCCTGCCCCCGCGCCTCGGGCCCCTGGGGCCGTAGTCACAG  74

Query   75  CAGCGCGGCCGCCGAGGCCTCGGCGGTGCTCAAGGTGCGGCCCGAGCGCAGCCGGCGCGAGCGCATCCTCACGC  148
            ||||||.||.|||||.||||||||||.||||||||||||.||.||||||||||..||.||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CAGCGCTGCAGCCGAAGCCTCGGCGGCGCTCAAGGTGCGACCGGAGCGCAGCCCTCGAGACCGCATCCTCACCC  148

Query  149  TGGAGTCCATGAACCCGCAGGTGAAGGCGGTGGAGTACGCCGTGCGGGGACCCATCGTGCTCAAGGCCGGCGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  TGGAGTCCATGAACCCGCAGGTGAAGGCGGTGGAGTACGCTGTGCGGGGACCCATCGTGCTCAAAGCCGGCGAG  222

Query  223  ATCGAGCTCGAGCTGCAGCGGGGTATCAAAAAGCCATTCACAGAGGTCATCCGAGCCAACATCGGGGACGCCCA  296
            ||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  223  ATCGAGATGGAGCTGCAGCGGGGTATCAAAAAACCATTCACTGAGGTAATCCGAGCCAACATTGGGGATGCCCA  296

Query  297  GGCTATGGGGCAGCAGCCAATCACCTTCCTCCGGCAGGTGATGGCACTATGCACCTACCCAAACCTGCTGGACA  370
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||..|||
Sbjct  297  TGCTATGGGCCAGCAGCCAATCACCTTCCTCCGTCAGGTGATGGCACTCTGCACCTACCCAAACCTACTAAACA  370

Query  371  GCCCCAGCTTCCCAGAAGATGCTAAGAAACGTGCCCGGCGGATCCTGCAGGCTTGTGGCGGGAACAGCCTGGGG  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||.
Sbjct  371  GCCCCAGCTTCCCAGAAGACGCTAAGAAACGAGCGCGGCGGATCCTGCAGGCTTGTGGTGGAAACAGCTTGGGA  444

Query  445  TCCTACAGTGCTAGCCAGGGTGTCAACTGCATCCGTGAAGATGTGGCTGCCTACATCACCAGGAGGGATGGCGG  518
            ||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||..|||||||||||.|||   ||
Sbjct  445  TCTTACAGTGCTAGCCAAGGCGTTAACTGTATCCGTGAAGATGTGGCAGCCTTTATCACCAGGAGAGAT---GG  515

Query  519  TGTGCCTGCGGACCCCGACAACATCTACCTGACCACGGGAGCTAGTGACGGCATTTCTACGATCCTGAAGATCC  592
            |||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.|||
Sbjct  516  TGTGCCTGCAGACCCAGACAACATTTACCTGACTACTGGAGCTAGCGACGGTATTTCTACAATCCTGAAGCTCC  589

Query  593  TCGTCTCCGGGGGCGGCAAGTCACGGACAGGTGTGATGATCCCCATCCCACAATATCCCCTCTATTCAGCTGTC  666
            |.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||.|.||.||.||.|||
Sbjct  590  TGGTCTCCGGTGGTGGCAAGTCACGGACCGGCGTGATGATTCCCATCCCCCAGTATCCCTTGTACTCCGCGGTC  663

Query  667  ATCTCTGAGCTCGACGCCATCCAGGTGAATTACTACCTGGACGAGGAGAACTGCTGGGCGCTGAATGTGAATGA  740
            |||||||||||||||||..|.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||..||||||||.|.||
Sbjct  664  ATCTCTGAGCTCGACGCGGTGCAGGTCAACTACTATCTGGATGAAGAGAACTGCTGGGCTTTGAATGTGGACGA  737

Query  741  GCTCCGGCGGGCGGTGCAGGAGGCCAAAGACCACTGTGATCCTAAGGTGCTCTGCATAATCAACCCTGGGAACC  814
            ||||||||||||..|||.|.|.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct  738  GCTCCGGCGGGCATTGCGGCAAGCCAAAGACCACTGTGACCCTAAAGTTCTCTGCATTATCAACCCCGGAAACC  811

Query  815  CCACAGGCCAGGTACAAAGCAGAAAGTGCATAGAAGATGTGATCCACTTTGCCTGGGAAGAGAAGCTCTTTCTC  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  812  CCACAGGCCAGGTACAAAGCAGAAAGTGCATAGAAGATGTGATTCACTTTGCCTGGGAAGAGAAGCTTTTTCTC  885

Query  889  CTGGCTGATGAGGTGTACCAGGACAACGTGTACTCTCCAGATTGCAGATTCCACTCCTTCAAGAAGGTGCTGTA  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  886  CTGGCTGATGAGGTGTACCAGGACAACGTGTACTCTCCAGACTGCAGATTCCACTCGTTTAAGAAAGTGCTTTA  959

Query  963  CGAGATGGGGCCCGAGTACTCCAGCAACGTGGAGCTCGCCTCCTTCCACTCCACCTCCAAGGGCTACATGGGCG  1036
            |.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  CCAGATGGGGCACGAGTACTCCAGCAACGTGGAGCTCGCCTCCTTCCACTCCACCTCCAAGGGCTACATGGGCG  1033

Query 1037  AGTGTGGTTACAGAGGAGGCTACATGGAGGTGATCAACCTGCACCCTGAGATCAAGGGCCAGCTGGTGAAGCTG  1110
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1034  AGTGTGGCTACAGAGGGGGCTACATGGAGGTGATCAATTTGCACCCCGAGATCAAAGGCCAGCTGGTGAAGCTA  1107

Query 1111  CTGTCGGTGCGCCTGTGCCCCCCAGTGTCTGGGCAGGCCGCCATGGACATTGTCGTGAACCCCCCGGTGGCAGG  1184
            ||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||...||||
Sbjct 1108  CTCTCGGTTCGCCTCTGTCCGCCAGTGTCAGGACAGGCCGCCATGGACATTGTTGTGAATCCACCGGAACCAGG  1181

Query 1185  AGAGGAGTCCTTTGAGCAATTCAGCCGAGAGAAGGAGTCGGTCCTGGGTAATCTGGCCAAAAAAGCAAAGCTGA  1258
            |||||||||||||||||||||||||.|.||.||.||.|..|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  AGAGGAGTCCTTTGAGCAATTCAGCAGGGAAAAAGAATTCGTCCTTGGTAATCTGGCCAAAAAAGCAAAGCTGA  1255

Query 1259  CGGAAGACCTGTTTAACCAAGTCCCAGGAATTCACTGCAACCCCTTGCAGGGGGCCATGTACGCCTTCCCTCGG  1332
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1256  CAGAAGATCTGTTTAACCAAGTCCCAGGGATCCAGTGCAACCCCTTGCAAGGAGCTATGTATGCGTTCCCTCGG  1329

Query 1333  ATCTTCATTCCTGCCAAAGCTGTGGAGGCTGCTCAGGCCCATCAAATGGCTCCAGACATGTTCTACTGCATGAA  1406
            ||..||||.||||||||.||.||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  ATTCTCATCCCTGCCAAGGCCGTGGAGGCAGCTCAGTCCCATAAAATGGCTCCAGACATGTTCTACTGCATGAA  1403

Query 1407  GCTCCTGGAGGAGACTGGCATCTGTGTCGTGCCCGGCAGTGGCTTTGGGCAGAGGGAAGGCACTTACCACTTCA  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 1404  GCTCCTGGAGGAGACTGGCATCTGTGTCGTGCCTGGCAGTGGCTTTGGGCAGCGAGAAGGCACTTACCACTTCA  1477

Query 1481  GGATGACTATCCTCCCTCCAGTGGAGAAGCTGAAAACGGTGCTGCAGAAGGTGAAAGACTTCCACATCAACTTC  1554
            |.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||.|.||.|||
Sbjct 1478  GAATGACCATTCTCCCTCCGGTGGATAAACTGAAGACCGTGCTCCACAAGGTGAAAGACTTTCACCTGAAGTTC  1551

Query 1555  CTGGAGAAGTACGCG  1569
            ||||||.|||||.|.
Sbjct 1552  CTGGAGCAGTACTCA  1566