Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492273
• Subject: XM_005265709.2
• Aligned Length: 675
• Identities: 517
• Gaps: 40

Alignment

Query   1  -----ATGAGCTTCCTCTTCA--------------GCAGCCGCTCTTCTAAAACATTCAAACCAAAGAAGAATA  55
                |.|||||.|    |.|              |.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct   1  ATGGAAGGAGCTAC----TGATGTGAATGAAAGTGGTAGTCGCTCTTCTAAAACTTTTAAACCAAAGAAGAACA  70

Query  56  TCCCTGAAGGATCTCATCAGTATGAACTCTTAAAACATGCAGAAGCAACTCTAGGAAGTGGGAA---TCTGA-G  125
           |.||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||   ||.|| |
Sbjct  71  TTCCAGAGGGTTCTCACCAGTATGAGCTCTTAAAACACGCAGAAGCCACACTTGGCAGTGGCAACCTTCGGATG  144

Query 126  ACAAGCTGTTATGTTGCCTGAGGGAGAGGATCTCAATGAATGGATTGCTGTGAACACTGTGGATTTCTTTAACC  199
               |||||.|||.|.|||||.||.||.|||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 145  ----GCTGTCATGCTTCCTGAAGGGGAAGATCTCAATGAATGGGTTGCAGTTAACACTGTGGATTTCTTCAATC  214

Query 200  AGATCAACATGTTATATGGAACTATTACAGAATTCTGCACTGAAGCAAGCTGTCCAGTCATGTCTGCAGGTCCG  273
           |||||||||||.|.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||..||.||||||||.|||||.||.||.||.
Sbjct 215  AGATCAACATGCTTTATGGAACTATCACAGACTTCTGTACAGAAGAGAGTTGTCCAGTGATGTCAGCTGGCCCA  288

Query 274  AGATATGAATATCACTGGGCAGATGGTACTAATATTAAAAAGCCAATCAAATGTTCTGCACCAAAATACATTGA  347
           |.||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 289  AAATATGAGTATCATTGGGCAGATGGAACGAACATAAAGAAACCTATTAAGTGCTCTGCACCAAAGTATATTGA  362

Query 348  CTATTTGATGACTTGGGTTCAAGATCAGCTTGATGATGAAACTCTTTTTCCTTCTAAGATTGGTGTCCCATTTC  421
           .||.|||||||||||||||||.||.|||.|.||||||||.||..|.|||||.||.||.||||||||||| .|||
Sbjct 363  TTACTTGATGACTTGGGTTCAGGACCAGTTGGATGATGAGACGTTATTTCCATCAAAAATTGGTGTCCC-GTTC  435

Query 422  CCAAA-AACTTTATGTCTGTGGCAAAGACTATTCTAAAGCGTCTGTTCAGGGTTTATGCCCATATTTATCACCA  494
           ||||| ||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 436  CCAAAGAATTTCATGTCTGTGGCAAAAACTATACTCAAACGCCTCTTTAGGGTTTATGCTCACATTTATCATCA  509

Query 495  GCACTTTGATTCTGTGATGCAGCTGCAAGAGGAGGCCCACCTCAACACCTCCTTTAAGCACTTTATTTTCTTTG  568
           |||.|||||..|||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 510  GCATTTTGACCCTGTGATCCAGCTTCAGGAGGAAGCACATCTAAATACATCTTTCAAGCACTTTATTTTTTTTG  583

Query 569  TTCAGGAGTTTAATCTGATTGATAGGCGTGAGCTGGCACCTCTTCAAGAATTAATAGAGAAACT----TGGACA  638
           |.|||||.||.||.||.||||||||..|.||.||.|||||.||.||||||.|.||.||.|||||    |   ||
Sbjct 584  TCCAGGAATTCAACCTTATTGATAGAAGAGAACTTGCACCACTCCAAGAACTGATTGAAAAACTCACCT---CA  654

Query 639  AAAGACAGA  647
           |||||||||
Sbjct 655  AAAGACAGA  663