Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492280
• Subject: XM_006516363.1
• Aligned Length: 879
• Identities: 628
• Gaps: 159

Alignment

Query   1  ATGGTTTGTGGGCGCCAGTTGTCTGGCGCCGGGAGTGAGACCCTAAAACAAAGAAGAACACAAATCATGTCCCG  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  AGGACTTCCAAAGCAGAAACCGATAGAAGGTGTTAAACAAGTTATAGTTGTGGCTT----CTGGAAAGGGTGGA  144
                                                          .||.|||||    |||           
Sbjct   1  -----------------------------------------------ATGCGGCTTTCTCCTG-----------  16

Query 145  GTCGGAAAATCTACTA----CAGC---AGTGAATCTTGCAC-TTGCACTAGCAGCGAACGATTCGTCCAAGGCC  210
             ||    .||| |.|    ||||   || |||..|||||| .||||||    |.|||  |.| |||||||||.
Sbjct  17  --CG----CTCT-CCACGCTCAGCGGGAG-GAACTTTGCACAGTGCACT----GTGAA--ACT-GTCCAAGGCG  75

Query 211  ATTGGTTTGCTAGATGTGGATGTGTATGGACCTTCAGTTCCAAAGATGATGAATCTGAAAGGAAATCCGGAATT  284
           .||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.||||.|||||||||.|||||
Sbjct  76  GTTGGCTTGTTAGATGTGGATGTGTATGGTCCTTCCATTCCAAAGATGATGAACCTGAGAGGAAATCCAGAATT  149

Query 285  ATCACAGAGCAACCTAATGAGGCCTCTCTTGAATTATGGTATTGCTTGTATGTCTATGGGCTTTCTGGTTGAAG  358
           |||||..|..|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 150  ATCACCAAATAACCTAATGAGGCCTCTTTTGAATTATGGTATTGCTTGTATGTCAATGGGCTTTTTGGTTGAAG  223

Query 359  AAAGTGAACCAGTAGTTTGGAGAGGCCTTATGGTAATGTCGGCCATTGAGAAATTGTTGAGGCAGGTAGATTGG  432
           |.|.||..|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 224  AGACTGCGCCACTTGTTTGGAGAGGCCTTATGGTAATGTCAGCCATTGAGAAATTATTGAGACAGGTTGATTGG  297

Query 433  GGTCAACTGGACTACTTAGTTGTAGACATGCCACCAGGAACTGGAGATGTGCAGTTATCAGTCTCACAGACTAT  506
           |||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.|.|||
Sbjct 298  GGTCAGCTGGACTATTTAGTTGTGGACATGCCACCAGGAACAGGAGACGTGCAGCTGTCAGTTTCACAAAATAT  371

Query 507  TCCTATAACAGGTGCTGTGATTGTCTCCACGCCCCAGGACATCGCATTGATGGATGCACACAAGGGTGCTGAGA  580
           |||.||..||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 372  TCCCATTTCAGGTGCTGTGATTGTCTCCACACCTCAGGACATTGCACTGATGGATGCACACAAGGGTGCGGAGA  445

Query 581  TGTTTCGCAGAGTCCACGTGCCCGTCCTTGGCCTTGTCCAAAACATGAGTGTTTTCCAGTGTCCAAAATGTAAA  654
           |||||||.|.||||.|.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 446  TGTTTCGGAAAGTCAATGTGCCTGTTCTTGGTCTTGTCCAAAACATGAGTGTCTTCCAGTGTCCAAAATGTAAA  519

Query 655  CACAAAACTCATATTTTTGGTGCTGATGGTGCAAGGAAACTAGCACAGACCCTTGGTCTTGAAGTTCTAGGAGA  728
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 520  CACAAAACTCATATTTTTGGTGCTGATGGTGCAAGAAAACTAGCACAGACCCTTGATCTTGATGTTCTAGGAGA  593

Query 729  CATTCCCTTACACCTTAATATAAGGGAAGCTTCAGATACAGGCCAGCCAATTGTGTTTTCACAGCCTGAAAGTG  802
           ..|||||||.|||||.|.|||||||||||||||.||||..||.||.|||.||||.|||||.|||||||.|||||
Sbjct 594  TGTTCCCTTGCACCTCAGTATAAGGGAAGCTTCGGATATGGGTCAACCAGTTGTCTTTTCTCAGCCTGGAAGTG  667

Query 803  ATGAGGCCAAAGCTTACTTGAGGATTGCTGTGGAAGTGGTAAGAAGATTGCCATCACCTTCAGAA  867
           |||||||||||||||||.||...||||||...||||||||.|||||||||...|||.||.|||||
Sbjct 668  ATGAGGCCAAAGCTTACCTGCATATTGCTTCCGAAGTGGTGAGAAGATTGAAGTCATCTCCAGAA  732