Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492284
• Subject: NR_146784.2
• Aligned Length: 3582
• Identities: 3020
• Gaps: 561

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AGAACCCAGCTCTTCCCTACACGGTCGGCACATGCGCGGCAGCTCTTTTCCTTCTTCCTCCACTTCCCCTACCC  74

Query    1  ----------------------------------------------------ATGGCCGCCGCGGAGACCCAGT  22
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCACCGTCCGGGAGCCGCCGCCACCGCCGCCGAGGAGTCAGGAAGTTCAAGATGGCCGCCGCGGAGACCCAGT  148

Query   23  CGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGCTAATTCTGAAAAGAGTATAAATGAAGAAAATGGAGAAGTATCA  96
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGCTAATTCTGAAAAGAGTATAAATGAAGAAAATGGAGAAGTATCA  222

Query   97  GAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATAAACACAGAAGTAAACATAAGAAACA  170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATAAACACAGAAGTAAACATAAGAAACA  296

Query  171  TAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCATAAACATAAGAAACACAAAAGAAAAG  244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCATAAACATAAGAAACACAAAAGAAAAG  370

Query  245  AGGTTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAACTAAACTTGATGATTTAGCTTTGCTA  318
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGATTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAACTAAACTTGATGATTTAGCTTTGCTA  444

Query  319  GAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATGAGTTAATGGAAGGAAAGGTCCAGTC  392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATGAGTTAATGGAAGGAAAGGTCCAGTC  518

Query  393  TGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAGGGGGAAATTCATGAAAAGGCAAGAA  466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAGGGGGAAATTCATGAAAAGGCAAGAA  592

Query  467  ATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGAACTTGTGGACAATAAAATTACTACA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGAACTTGTGGACAATAAAATTACTACA  666

Query  541  AAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTGATAAAAAGAAAAGTAAGGGGGGTAT  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTGATAAAAAGAAAAGTAAGGGGGGTAT  740

Query  615  TGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAAAAATCTAAAAGCCCATCCAAAAGAA  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAAAAATCTAAAAGCCCATCCAAAAGAA  814

Query  689  GTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAGGCGATCTCAAGAGAAAATTGGTAAG  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAGGCGATCTCAAGAGAAAATTGGTAAG  888

Query  763  GCCAGATCTCCTACTGATGATAAGGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAATCAAAAGATAGGAAAAAATCCCCAAT  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCAGATCTCCTACTGATGATAAGGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAATCAAAAGATAGGAAAAAATCCCCAAT  962

Query  837  TATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCAGTTGATTTAAGAGGTAAATCCAAAG  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCAGTTGATTTAAGAGGTAAATCCAAAG  1036

Query  911  ACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGATAAAGAAAAGAAGCCAATTAAATCT  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGATAAAGAAAAGAAGCCAATTAAATCT  1110

Query  985  CCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAAGACCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAAG  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAAGACCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAAG  1184

Query 1059  AAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCACTTTTGAATGATAGAAGATCTAAGC  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCACTTTTGAATGATAGAAGATCTAAGC  1258

Query 1133  AGAGCAAATCCCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAGCCGATCCTTAGAAAGAAAACGACGA  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAGCAAATCCCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAGCCGATCCTTAGAAAGAAAACGACGA  1332

Query 1207  GAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATGATATCCTCAGTAGACGTGAAAGATC  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATGATATCCTCAGTAGACGTGAAAGATC  1406

Query 1281  AAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGTAGATCTCCCATTAGAAGGAGGTCTC  1354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGTAGATCTCCCATTAGAAGGAGGTCTC  1480

Query 1355  GTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTCCTCGGAGAAGGGACAGAGGTCGGAGG  1428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTCCTCGGAGAAGGGACAGAGGTCGGAGG  1554

Query 1429  AGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGACGAAGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGGA  1502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGACGAAGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGGA  1628

Query 1503  AGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAATCTTCGTCTGATGATAACCTTGAAG  1576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAATCTTCGTCTGATGATAACCTTGAAG  1702

Query 1577  ACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAGAATCCAAAGGCAGGCAATTGTTCAG  1650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAGAATCCAAAGGCAGGCAATTGTTCAG  1776

Query 1651  AAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAACCAAGCAGCCCCCAGAGCAGTACGAG  1724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAACCAAGCAGCCCCCAGAGCAGTACGAG  1850

Query 1725  AACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGATGTTAAAGAGTATGAACGGGAAAATG  1798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGATGTTAAAGAGTATGAACGGGAAAATG  1924

Query 1799  TTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGTTGAACAGAATAATGGTTCATCTCAG  1872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGTTGAACAGAATAATGGTTCATCTCAG  1998

Query 1873  AAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTGCTGCGTATTTTGATAGTGCTCGTCT  1946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTGCTGCGTATTTTGATAGTGCTCGTCT  2072

Query 1947  TCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGAGATAACTGGACCGATGCAGAAGGCT  2020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGAGATAACTGGACCGATGCAGAAGGCT  2146

Query 2021  ATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTATGGCTACACTGGGCAAGGTGTATTC  2094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTATGGCTACACTGGGCAAGGTGTATTC  2220

Query 2095  AGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGGCTGTAAAGATCATCAGAAACAATGA  2168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGGCTGTAAAGATCATCAGAAACAATGA  2294

Query 2169  GCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTTAATGATGCTGATCCTGATGACAAAT  2242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTTAATGATGCTGATCCTGATGACAAAT  2368

Query 2243  TTCATTGTCTGAGACTCTTCAGGCACTTCTATCACAAGCAGCATCTTTGTCTGGTATTCGAGCCTCTCAGCATG  2316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TTCATTGTCTGAGACTCTTCAGGCACTTCTATCACAAGCAGCATCTTTGTCTGGTATTCGAGCCTCTCAGCATG  2442

Query 2317  AACTTACGAGAGGTGTTAAAAAAATATGGTAAAGATGTTGGTCTTCATATTAAAGCTGTAAGATCCTATAGTCA  2390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AACTTACGAGAGGTGTTAAAAAAATATGGTAAAGATGTTGGTCTTCATATTAAAGCTGTAAGATCCTATAGTCA  2516

Query 2391  GCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCCTACATGCAGATATCAAGCCAGACAATATCC  2464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCCTACATGCAGATATCAAGCCAGACAATATCC  2590

Query 2465  TGGTTAATGAATCCAAAACTATTTTAAAGCTTTGCGATTTTGGGTCGGCTTCACATGTTGCGGATAATGACATA  2538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TGGTTAATGAATCCAAAACTATTTTAAAGCTTTGCGATTTTGGGTCGGCTTCACATGTTGCGGATAATGACATA  2664

Query 2539  ACACCTTATCTTGTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCTGAAATCATTATAGGTAAAAGCTATGACTATGGTATAGA  2612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  ACACCTTATCTTGTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCTGAAATCATTATAGGTAAAAGCTATGACTATGGTATAGA  2738

Query 2613  TATGTGGTCTGTAGGTTGCACCTTATACGAACTCTATACTGGAAAAATTTTATTCCCTGGCAAAACCAATAACC  2686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TATGTGGTCTGTAGGTTGCACCTTATACGAACTCTATACTGGAAAAATTTTATTCCCTGGCAAAACCAATAACC  2812

Query 2687  ATATGCTGAAGCTTGCAATGGATCTCAAAGGAAAGATGCCAAATAAGATGATTCGAAAAGGTGTGTTCAAAGAT  2760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  ATATGCTGAAGCTTGCAATGGATCTCAAAGGAAAGATGCCAAATAAGATGATTCGAAAAGGTGTGTTCAAAGAT  2886

Query 2761  CAGCATTTTGATCAAAATCTCAACTTCATGTACATAGAAGTTGATAAAGTAACAGAGAGGGAGAAAGTTACTGT  2834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CAGCATTTTGATCAAAATCTCAACTTCATGTACATAGAAGTTGATAAAGTAACAGAGAGGGAGAAAGTTACTGT  2960

Query 2835  TATGAGCACCATTAATCCAACTAAGGACCTGTTGGCTGACTTGATTGGGTGCCAGAGACTTCCTGAAGACCAAC  2908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TATGAGCACCATTAATCCAACTAAGGACCTGTTGGCTGACTTGATTGGGTGCCAGAGACTTCCTGAAGACCAAC  3034

Query 2909  GTAAGAAAGTACACCAGCTAAAGGACTTGTTGGACCAGATTCTGATGTTGGACCCAGCTAAACGAATTAGCATC  2982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  GTAAGAAAGTACACCAGCTAAAGGACTTGTTGGACCAGATTCTGATGTTGGACCCAGCTAAACGAATTAGCATC  3108

Query 2983  AACCAGGCCCTACAGCACGCCTTCATCCAGGAAAAAATT-----------------------------------  3021
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct 3109  AACCAGGCCCTACAGCACGCCTTCATCCAGGAAAAAATTTAAACAAGATGAAGAAACTCCAAGGGTTTGAGTAA  3182

Query 3022  --------------------------------------------------------------------------  3021
                                                                                      
Sbjct 3183  ATACAAAGACTGAAGAAATTTCACAGCAGTTTATTAATGCATAAACCTTCCACTCTTGAACAAAGCAGCTGCTT  3256

Query 3022  --------------------------------------------------------------------------  3021
                                                                                      
Sbjct 3257  TTTAAAAGCGAGAAAAAGGAAAACGGGGCACAGGCCATTCGACGCCTTCTCCAAGGGGTCTGATTTGCTGAGAC  3330

Query 3022  --------------------------------------------------------------------------  3021
                                                                                      
Sbjct 3331  ACCAGCTTCACCTTCTTAACAAGGTGCAGCTCAGTGGAAGATGATGACAACCAGAAGACATGAGCTAAGGGTAA  3404

Query 3022  --------------------------------------------------------------------------  3021
                                                                                      
Sbjct 3405  GGGACTGTTCTGAAGAACCTTTCCATTTAGTGATCAAGATATGGAAGCTGATTTCTGAAAATGCTCAGTGTGTA  3478

Query 3022  --------------------------------------------------------------------------  3021
                                                                                      
Sbjct 3479  CTCTAATTATTTATGGTACCATTTGAATTGTAACTTGCATTTTAGCAGTGCATGTTTCTAATTGACTTACTGGG  3552

Query 3022  ------------------------------  3021
                                          
Sbjct 3553  AAACTGAATAAAATATGCCTCTTATTATCA  3582