Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492306
• Subject: NM_001145281.2
• Aligned Length: 1392
• Identities: 941
• Gaps: 441

Alignment

Query    1  ATGTCAGATGCTCAGCTCGGTCCCCTCCGCCTGACGCTCCTCTCTGTCTCAGCCAGGACTGGTTTCTGTAAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACAGCAGGAGCTGTGGCAGCGGCGAAAGGAAGCGGCTGAGGCGCTTGGAACCCGAAAAGTCTCGGTGCTCCTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTACCTCGCACAGCGGTGCCCGCCCGGCCGTCAGTACCATGGACAGCAGCGCTGCCCCCACGAACGCCAGCAAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TGCACTGATGCCTTGGCGTACTCAAGTTGCTCCCCAGCACCCAGCCCCGGTTCCTGGGTCAACTTGTCCCACTT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGATGGCAACCTGTCCGACCCATGTGGTCCGAACCGCACCGACCTGGGCGGGAGAGACAGCCTGTGCCCTCCGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCGGCAGTCCCTCCATGATCACGG------CCATCACGATCATGGCCCTCTACTCCATCGTGTGCGTGGTGGGG  438
                          |||||.|.||      ||||||..|.||..||                            
Sbjct    1  --------------ATGATGAGGGCTAAATCCATCAGCACCAAAGC----------------------------  32

Query  439  CTCTTCGGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACACCAAGATGAAGACTGCCACCAACATCTACAT  512
                |.||||.|  |||                 .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   33  ----TGGGAAGC--CCT-----------------CCAGATACACCAAGATGAAGACTGCCACCAACATCTACAT  83

Query  513  TTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGCCCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAA  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   84  TTTCAACCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGCCCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAA  157

Query  587  CATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATAGATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  158  CATGGCCATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATAGATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTC  231

Query  661  ACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCACCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCC  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  232  ACCCTCTGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCACCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCC  305

Query  735  CCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTTCAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGG  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  306  CCGAAATGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTTCAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGG  379

Query  809  CTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACATTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAAC  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  380  CTACAACAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACATTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAAC  453

Query  883  CTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGTGCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGAT  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  454  CTGCTGAAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGTGCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGAT  527

Query  957  GATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAGAAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCA  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  528  GATCTTGCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAGAAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCA  601

Query 1031  GGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACTCCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCC  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  602  GGATGGTGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACTCCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCC  675

Query 1105  TTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCACTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAG  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  676  TTGGTTACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCACTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAG  749

Query 1179  CTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCAAACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAA  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  750  CTGCCTCAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCAAACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAA  823

Query 1253  CCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAGAACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAAT  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  824  CCTCTTCCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAGAACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAAT  897

Query 1327  ACAGTGGATAGAACTAATCATCAGCTAGAAAATCTGGAAGCAGAAACTGCTCCGTTGCCC  1386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  898  ACAGTGGATAGAACTAATCATCAGCTAGAAAATCTGGAAGCAGAAACTGCTCCGTTGCCC  957